MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 1865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010741	TGAA	2	8	233278	233285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010741	AGGG	2	8	233287	233294	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010741	TGAAC	2	10	233310	233319	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
504	NC_010741	AG	3	6	233348	233353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010741	AGT	2	6	233362	233367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010741	GCGA	2	8	233369	233376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
507	NC_010741	GGA	2	6	233381	233386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010741	CG	3	6	233420	233425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_010741	GGTG	2	8	233437	233444	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010741	AAT	2	6	233446	233451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010741	AG	3	6	233488	233493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010741	CTG	2	6	233526	233531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_010741	CGG	2	6	233548	233553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010741	CAA	2	6	233697	233702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010741	GGT	2	6	233721	233726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010741	GCA	2	6	233766	233771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_010741	GTG	2	6	233825	233830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010741	CGT	2	6	233838	233843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_010741	GGA	2	6	233902	233907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010741	A	6	6	233925	233930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010741	AAAC	2	8	233965	233972	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_010741	TGCG	2	8	234123	234130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_010741	AGG	2	6	234228	234233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010741	AGC	2	6	234244	234249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_010741	TGA	2	6	234384	234389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010741	GAG	2	6	234402	234407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010741	AG	3	6	234424	234429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010741	AGG	2	6	234453	234458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010741	TTCC	2	8	234465	234472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_010741	CGT	2	6	234684	234689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010741	GTGCGA	2	12	234700	234711	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
532	NC_010741	AGGTT	2	10	234769	234778	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010741	AGGT	2	8	234806	234813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010741	GA	3	6	234837	234842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010741	AC	3	6	234869	234874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_010741	GGT	2	6	234986	234991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010741	AGAGG	2	10	235018	235027	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010741	TTGAA	2	10	235047	235056	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010741	CGG	2	6	235068	235073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_010741	AAG	2	6	235197	235202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_010741	GTA	2	6	235279	235284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010741	ACC	2	6	235340	235345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_010741	CCT	2	6	235428	235433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_010741	AGG	2	6	235504	235509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010741	GAG	2	6	235808	235813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010741	TAA	2	6	236049	236054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010741	ATT	2	6	236073	236078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010741	TCCTTC	2	12	236081	236092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_010741	TGG	2	6	236132	236137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010741	GAT	2	6	236190	236195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010741	GTAG	2	8	236215	236222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010741	CTC	2	6	236944	236949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_010741	TGCA	2	8	236967	236974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_010741	AGA	2	6	237760	237765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010741	AC	3	6	237788	237793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_010741	CTG	2	6	241415	241420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010741	GTA	2	6	241441	241446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010741	GA	3	6	241479	241484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010741	GT	3	6	242169	242174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010741	GT	3	6	242237	242242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010741	CTTT	2	8	242941	242948	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_010741	TG	3	6	242998	243003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_010741	GGCC	2	8	243026	243033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_010741	GGC	2	6	243038	243043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_010741	CTGT	2	8	243054	243061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_010741	GAG	2	6	243153	243158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010741	GGT	2	6	243160	243165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010741	TCCT	2	8	243450	243457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_010741	TGCC	2	8	244274	244281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_010741	TGT	2	6	244307	244312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010741	T	6	6	244312	244317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010741	ATA	2	6	246104	246109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010741	T	8	8	246506	246513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_010741	CGT	2	6	246528	246533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_010741	TG	3	6	246534	246539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010741	TG	3	6	246684	246689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_010741	TCGGT	2	10	246731	246740	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
578	NC_010741	G	6	6	246750	246755	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010741	TG	3	6	254607	254612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_010741	T	7	7	254637	254643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010741	GAG	2	6	255048	255053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010741	TTG	2	6	255553	255558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010741	T	8	8	259045	259052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010741	GTTTGT	2	12	259129	259140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_010741	AGG	2	6	259146	259151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010741	GCA	2	6	262083	262088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_010741	GT	3	6	262110	262115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_010741	CT	3	6	262120	262125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_010741	TAA	2	6	262129	262134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010741	TGAA	2	8	262615	262622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_010741	GT	3	6	264088	264093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010741	AG	3	6	264106	264111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010741	CAC	2	6	266511	266516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_010741	GTC	2	6	266531	266536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010741	TTTC	2	8	266615	266622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_010741	TGC	2	6	266643	266648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010741	GT	3	6	266679	266684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010741	GT	3	6	268266	268271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010741	GCGCG	2	10	268330	268339	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
600	NC_010741	GCG	2	6	269301	269306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_010741	CTA	2	6	269309	269314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_010741	GAG	2	6	269349	269354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010741	GTTC	2	8	270491	270498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_010741	GT	3	6	271238	271243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010741	CA	3	6	271961	271966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_010741	GCTC	2	8	271969	271976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
607	NC_010741	TCC	2	6	271978	271983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_010741	CTT	2	6	272026	272031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010741	GC	3	6	273420	273425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_010741	CGTGA	2	10	273433	273442	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
611	NC_010741	GAGG	2	8	277663	277670	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010741	CGC	2	6	277819	277824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_010741	GCT	2	6	277847	277852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010741	CGG	2	6	277906	277911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010741	GC	3	6	278007	278012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_010741	C	6	6	278044	278049	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
617	NC_010741	GTG	2	6	279496	279501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010741	GGGA	2	8	279644	279651	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010741	AAT	2	6	279703	279708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010741	GAAC	2	8	279733	279740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_010741	TTG	2	6	279960	279965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010741	AC	3	6	280022	280027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_010741	GCA	2	6	280062	280067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_010741	CGA	2	6	280154	280159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_010741	GGGA	2	8	280171	280178	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
626	NC_010741	TGA	2	6	280188	280193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010741	CAG	2	6	280231	280236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_010741	GTT	2	6	280262	280267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010741	ATT	2	6	280272	280277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010741	CTG	2	6	280355	280360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_010741	GAA	2	6	280423	280428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010741	GAT	2	6	280457	280462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010741	CA	3	6	280518	280523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_010741	GAT	2	6	280672	280677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_010741	TGC	2	6	280759	280764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_010741	GTC	2	6	280771	280776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_010741	GTG	2	6	280845	280850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010741	GGA	2	6	280885	280890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_010741	TCA	2	6	280910	280915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_010741	AC	3	6	280936	280941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
641	NC_010741	AC	3	6	281105	281110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
642	NC_010741	AGGG	2	8	281165	281172	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
643	NC_010741	AGG	2	6	281196	281201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
644	NC_010741	CCT	2	6	281248	281253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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647	NC_010741	CCCTT	2	10	281350	281359	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
648	NC_010741	TAT	2	6	281453	281458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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650	NC_010741	GGT	2	6	281498	281503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
651	NC_010741	GGGTG	2	10	281525	281534	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
652	NC_010741	ATA	2	6	281554	281559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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662	NC_010741	GGTG	2	8	281878	281885	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
663	NC_010741	AAT	2	6	281887	281892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
664	NC_010741	AG	3	6	281929	281934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
665	NC_010741	CTG	2	6	281967	281972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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681	NC_010741	AGG	2	6	282894	282899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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751	NC_010741	GT	3	6	329092	329097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
752	NC_010741	CTA	2	6	329119	329124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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764	NC_010741	CA	3	6	333099	333104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
765	NC_010741	GGAA	2	8	333158	333165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
766	NC_010741	AGA	2	6	333204	333209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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771	NC_010741	AGC	2	6	333450	333455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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773	NC_010741	CACT	2	8	333501	333508	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
774	NC_010741	CTC	2	6	333513	333518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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777	NC_010741	GA	4	8	335994	336001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
778	NC_010741	CCCG	2	8	337238	337245	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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