MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 2625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010483	GAA	2	6	1821309	1821314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_010483	AGTC	2	8	1823105	1823112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_010483	GAA	2	6	1823119	1823124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_010483	GAAA	2	8	1839089	1839096	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_010483	ATT	2	6	1839151	1839156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_010483	T	7	7	1839205	1839211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_010483	GAC	2	6	1839489	1839494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_010483	CTA	2	6	1839510	1839515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_010483	ACT	2	6	1839601	1839606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_010483	TGA	2	6	1839607	1839612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_010483	CAT	2	6	1839674	1839679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_010483	TCG	2	6	1839718	1839723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_010483	TGG	2	6	1839758	1839763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_010483	ACA	2	6	1839804	1839809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_010483	GGAT	2	8	1839873	1839880	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_010483	ACCA	2	8	1839947	1839954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2517	NC_010483	GAA	2	6	1840034	1840039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_010483	GCT	2	6	1840074	1840079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_010483	TGG	2	6	1840113	1840118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_010483	GAA	2	6	1840135	1840140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_010483	AGG	2	6	1840160	1840165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_010483	AAC	2	6	1840194	1840199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_010483	AAT	3	9	1840235	1840243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_010483	TTC	2	6	1840322	1840327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_010483	GGA	2	6	1840330	1840335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_010483	GGA	2	6	1840366	1840371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_010483	TAG	2	6	1840424	1840429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_010483	ATCT	2	8	1840431	1840438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2529	NC_010483	A	6	6	1840503	1840508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_010483	GTA	2	6	1841518	1841523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_010483	CAG	2	6	1841541	1841546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_010483	GGT	2	6	1841576	1841581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_010483	TTC	2	6	1842188	1842193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_010483	CAG	2	6	1842294	1842299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_010483	A	6	6	1842300	1842305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_010483	T	7	7	1842358	1842364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_010483	AAG	2	6	1842367	1842372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_010483	AAG	2	6	1842421	1842426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_010483	T	6	6	1842455	1842460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_010483	TTG	2	6	1842464	1842469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_010483	TGA	2	6	1842478	1842483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_010483	CTT	2	6	1842577	1842582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_010483	AGG	2	6	1842600	1842605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_010483	A	6	6	1842608	1842613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_010483	TTG	2	6	1842842	1842847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_010483	GAA	2	6	1842857	1842862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_010483	CAC	2	6	1842907	1842912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2548	NC_010483	ATC	2	6	1842980	1842985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_010483	AAAT	2	8	1843001	1843008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_010483	GCG	2	6	1843048	1843053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_010483	ATA	2	6	1843126	1843131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_010483	TGA	2	6	1843161	1843166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_010483	A	6	6	1843171	1843176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_010483	GAA	3	9	1843225	1843233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_010483	TCTT	2	8	1843252	1843259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2556	NC_010483	GCT	2	6	1843265	1843270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_010483	TCT	2	6	1843329	1843334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_010483	ATT	2	6	1843395	1843400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_010483	CGATC	2	10	1843438	1843447	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2560	NC_010483	GA	3	6	1843462	1843467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_010483	TCA	2	6	1843635	1843640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_010483	A	6	6	1843733	1843738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_010483	GAA	2	6	1843780	1843785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_010483	CTGAA	2	10	1843839	1843848	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2565	NC_010483	AGT	2	6	1843927	1843932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_010483	CCA	2	6	1843995	1844000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2567	NC_010483	ACA	2	6	1844048	1844053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_010483	CATC	2	8	1844070	1844077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2569	NC_010483	AACA	2	8	1844085	1844092	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2570	NC_010483	TC	3	6	1844105	1844110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2571	NC_010483	AAT	2	6	1844144	1844149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_010483	GAG	2	6	1844207	1844212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_010483	A	6	6	1844215	1844220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_010483	TGC	2	6	1844254	1844259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_010483	TGC	2	6	1844305	1844310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_010483	AAG	2	6	1844323	1844328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_010483	GAA	2	6	1844384	1844389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_010483	CTC	2	6	1844398	1844403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_010483	TATC	2	8	1844420	1844427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2580	NC_010483	CTC	2	6	1844507	1844512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_010483	AG	3	6	1844521	1844526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_010483	CAA	2	6	1844597	1844602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_010483	AACA	2	8	1844623	1844630	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2584	NC_010483	AG	3	6	1844659	1844664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_010483	GAA	2	6	1844678	1844683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_010483	CTC	2	6	1844689	1844694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2587	NC_010483	TCT	2	6	1844706	1844711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_010483	GTT	2	6	1844723	1844728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_010483	CA	3	6	1846114	1846119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2590	NC_010483	T	6	6	1846171	1846176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_010483	TCC	2	6	1846251	1846256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2592	NC_010483	ATC	2	6	1846298	1846303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_010483	CGTT	2	8	1848238	1848245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2594	NC_010483	T	6	6	1848244	1848249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_010483	ATT	2	6	1848269	1848274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_010483	AAAT	2	8	1849055	1849062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_010483	AAT	2	6	1849066	1849071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_010483	AGA	2	6	1849085	1849090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_010483	T	6	6	1852007	1852012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_010483	AAGT	2	8	1852013	1852020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_010483	ATA	2	6	1852095	1852100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_010483	AGG	2	6	1852116	1852121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_010483	A	7	7	1853788	1853794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_010483	GCCC	2	8	1853817	1853824	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2605	NC_010483	GGGA	2	8	1853889	1853896	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_010483	CCT	2	6	1858195	1858200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_010483	A	7	7	1859712	1859718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_010483	CT	3	6	1859738	1859743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2609	NC_010483	ATT	2	6	1859817	1859822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_010483	TGA	2	6	1859834	1859839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_010483	AG	3	6	1859878	1859883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_010483	TGA	2	6	1859922	1859927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_010483	G	6	6	1859928	1859933	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_010483	CCT	2	6	1864340	1864345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_010483	GAT	2	6	1864356	1864361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_010483	ATC	2	6	1864377	1864382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_010483	AG	3	6	1864401	1864406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_010483	AT	3	6	1864490	1864495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_010483	AGG	2	6	1868301	1868306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_010483	AG	3	6	1868307	1868312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_010483	TCC	2	6	1872356	1872361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2622	NC_010483	ACC	2	6	1874368	1874373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2623	NC_010483	AAGG	2	8	1874411	1874418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_010483	AGG	2	6	1877433	1877438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_010483	GGGGT	2	10	1877635	1877644	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.