MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 2625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010483	TTA	2	6	1513237	1513242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_010483	GCAC	2	8	1513264	1513271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2003	NC_010483	CTT	2	6	1513392	1513397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_010483	ACA	2	6	1513513	1513518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_010483	ATT	2	6	1513546	1513551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_010483	CCT	2	6	1513571	1513576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_010483	T	6	6	1513582	1513587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_010483	TAA	2	6	1513617	1513622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_010483	GTAA	2	8	1513650	1513657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_010483	CAG	2	6	1513685	1513690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_010483	AACCTG	2	12	1513737	1513748	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_010483	ATC	2	6	1513846	1513851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_010483	TCA	2	6	1513878	1513883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_010483	T	6	6	1513985	1513990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_010483	TATAAC	2	12	1513995	1514006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2016	NC_010483	GTC	2	6	1515856	1515861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_010483	TAA	2	6	1516013	1516018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_010483	ATC	2	6	1516024	1516029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_010483	GAA	2	6	1516051	1516056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_010483	CA	3	6	1516096	1516101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2021	NC_010483	TCC	2	6	1517822	1517827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2022	NC_010483	CCT	2	6	1520957	1520962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2023	NC_010483	TGA	2	6	1520986	1520991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_010483	A	6	6	1521026	1521031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_010483	GCT	2	6	1521035	1521040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_010483	ACCA	2	8	1521057	1521064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2027	NC_010483	CTC	2	6	1521078	1521083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2028	NC_010483	AAT	2	6	1521105	1521110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_010483	AAC	2	6	1521118	1521123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_010483	TCT	2	6	1521135	1521140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2031	NC_010483	CCT	2	6	1521152	1521157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2032	NC_010483	TAA	2	6	1521203	1521208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_010483	TTA	2	6	1521404	1521409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2035	NC_010483	ATA	2	6	1521558	1521563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_010483	ATG	2	6	1523258	1523263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_010483	TGA	2	6	1523710	1523715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_010483	GA	3	6	1523734	1523739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_010483	CAT	2	6	1523816	1523821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2041	NC_010483	AAC	2	6	1523892	1523897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_010483	TAT	2	6	1523985	1523990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_010483	CGTTG	2	10	1524000	1524009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2044	NC_010483	TCT	2	6	1524022	1524027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2046	NC_010483	TGA	2	6	1524081	1524086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_010483	ATG	2	6	1524107	1524112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_010483	T	6	6	1524117	1524122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_010483	TCAA	2	8	1524134	1524141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2050	NC_010483	AAC	3	9	1524199	1524207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_010483	AGA	2	6	1524222	1524227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_010483	TCC	2	6	1524256	1524261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2053	NC_010483	TCC	2	6	1524274	1524279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2054	NC_010483	TTC	2	6	1524291	1524296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_010483	TCCC	2	8	1524340	1524347	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2056	NC_010483	TGC	2	6	1524427	1524432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_010483	TAT	2	6	1524544	1524549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_010483	CAT	2	6	1524648	1524653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2061	NC_010483	CAG	2	6	1524690	1524695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_010483	T	6	6	1524862	1524867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_010483	GAA	2	6	1524903	1524908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_010483	A	6	6	1524937	1524942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_010483	TAT	2	6	1524943	1524948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_010483	TAT	2	6	1524997	1525002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2074	NC_010483	TC	3	6	1525307	1525312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2075	NC_010483	GGAA	2	8	1525337	1525344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2077	NC_010483	AAGGA	2	10	1525496	1525505	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_010483	AATAAG	2	12	1525572	1525583	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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2083	NC_010483	ATG	2	6	1529388	1529393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2084	NC_010483	GAG	2	6	1529447	1529452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2088	NC_010483	GA	3	6	1529627	1529632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_010483	CT	3	6	1529648	1529653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2090	NC_010483	TGTT	2	8	1529668	1529675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_010483	AAG	3	9	1529705	1529713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2093	NC_010483	TAT	2	6	1530627	1530632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_010483	TGA	2	6	1530703	1530708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_010483	TGG	2	6	1531508	1531513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2097	NC_010483	TCCC	2	8	1534359	1534366	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2098	NC_010483	AAT	2	6	1535061	1535066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_010483	AT	3	6	1535065	1535070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_010483	TA	3	6	1535079	1535084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_010483	CCT	2	6	1538735	1538740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2102	NC_010483	CA	3	6	1538769	1538774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2103	NC_010483	A	6	6	1538805	1538810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_010483	AC	3	6	1538845	1538850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2105	NC_010483	ACA	2	6	1538879	1538884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2106	NC_010483	AGA	2	6	1541151	1541156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_010483	A	6	6	1541165	1541170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_010483	AAACAG	2	12	1541180	1541191	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2109	NC_010483	A	6	6	1541217	1541222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_010483	GAA	2	6	1541230	1541235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_010483	T	8	8	1541265	1541272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_010483	TC	3	6	1541289	1541294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2113	NC_010483	TTTG	2	8	1541301	1541308	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2114	NC_010483	ACCA	2	8	1541594	1541601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2115	NC_010483	ATC	2	6	1541611	1541616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2119	NC_010483	TGG	2	6	1541883	1541888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2123	NC_010483	T	6	6	1542035	1542040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_010483	TC	3	6	1542053	1542058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2125	NC_010483	TTA	2	6	1542065	1542070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_010483	TC	3	6	1543729	1543734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2127	NC_010483	TTATTT	2	12	1543748	1543759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_010483	T	6	6	1543780	1543785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_010483	GAA	2	6	1543827	1543832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_010483	ACC	2	6	1543865	1543870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2132	NC_010483	ACC	2	6	1543934	1543939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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