MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223 chromosome

Total Repeats: 8541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010321	ATA	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010321	TAT	2	6	17	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010321	TAAA	2	8	33	40	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010321	AGG	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010321	T	6	6	1449	1454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010321	TAA	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010321	ATT	2	6	1496	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010321	TCT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010321	ACT	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010321	CTTAT	2	10	1584	1593	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010321	TAT	2	6	1595	1600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010321	A	7	7	1613	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010321	T	6	6	2771	2776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010321	ACC	2	6	8731	8736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010321	T	6	6	8871	8876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010321	A	6	6	8877	8882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010321	TATAT	2	10	8920	8929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010321	TATAT	2	10	8936	8945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010321	AAT	2	6	9005	9010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010321	ATTTT	2	10	9023	9032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010321	ATAAA	2	10	9058	9067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010321	CTT	2	6	14489	14494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010321	ATA	2	6	14514	14519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010321	A	7	7	14594	14600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010321	T	7	7	14607	14613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010321	T	6	6	14629	14634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010321	ATT	2	6	14653	14658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010321	AAT	2	6	14670	14675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010321	TGC	2	6	14697	14702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010321	AG	3	6	14792	14797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010321	GGT	2	6	14800	14805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010321	CGG	2	6	14862	14867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010321	TTA	2	6	14873	14878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010321	GGT	2	6	14957	14962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010321	GGA	2	6	14970	14975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010321	AGG	2	6	16532	16537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010321	CGG	2	6	23910	23915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010321	GGAGAA	2	12	23980	23991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010321	AT	3	6	24006	24011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010321	T	6	6	24021	24026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010321	T	6	6	24052	24057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010321	AGG	2	6	24063	24068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010321	TGA	2	6	25797	25802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010321	AGG	2	6	25816	25821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010321	A	7	7	27029	27035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010321	ATT	2	6	27049	27054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010321	TA	3	6	27058	27063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010321	TAA	2	6	27076	27081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010321	AAG	2	6	28771	28776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010321	TTTG	2	8	30177	30184	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010321	T	7	7	30230	30236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010321	TTC	2	6	30285	30290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010321	ATC	2	6	30354	30359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010321	TTAA	2	8	30362	30369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010321	T	6	6	30380	30385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010321	CCT	2	6	30409	30414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010321	TAT	2	6	30422	30427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010321	TAAAAA	2	12	30455	30466	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010321	CCG	2	6	30469	30474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010321	TC	3	6	30662	30667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010321	AAT	2	6	30671	30676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010321	TAT	2	6	30687	30692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010321	AT	3	6	30697	30702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010321	A	7	7	30725	30731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010321	TTTG	2	8	30738	30745	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010321	GAG	2	6	30780	30785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010321	AGT	2	6	31332	31337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010321	AGT	2	6	31345	31350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010321	ATA	2	6	31351	31356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010321	A	6	6	31359	31364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010321	ATA	2	6	31366	31371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010321	AGT	2	6	31392	31397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010321	AG	3	6	31413	31418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010321	TGG	3	9	31420	31428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010321	ATT	2	6	31573	31578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010321	AT	3	6	32871	32876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010321	TA	3	6	32895	32900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010321	T	7	7	33054	33060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010321	CAAC	2	8	33066	33073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010321	CCT	2	6	33155	33160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010321	TAT	2	6	33173	33178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010321	TAT	2	6	33194	33199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010321	T	6	6	33199	33204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010321	T	6	6	33291	33296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010321	TTC	2	6	33303	33308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010321	TAT	2	6	33334	33339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010321	AT	3	6	33338	33343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010321	GTT	2	6	33507	33512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010321	T	6	6	34683	34688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010321	T	7	7	35480	35486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010321	GGA	2	6	35630	35635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010321	GAT	2	6	35681	35686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010321	TAA	2	6	35802	35807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010321	GA	3	6	35817	35822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010321	CAC	2	6	36253	36258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010321	TAT	2	6	36276	36281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010321	TATAA	2	10	36347	36356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010321	AGG	2	6	36383	36388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010321	TTA	2	6	36643	36648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010321	TTC	2	6	36658	36663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010321	AGG	2	6	36676	36681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010321	GAA	2	6	37043	37048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010321	TGA	2	6	37132	37137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010321	AT	3	6	37148	37153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010321	A	6	6	37181	37186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010321	AGG	2	6	37410	37415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010321	ATTTT	2	10	38518	38527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010321	TA	4	8	38533	38540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010321	AT	3	6	38548	38553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010321	A	6	6	38557	38562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010321	AAT	2	6	38568	38573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010321	AAAAGC	2	12	38638	38649	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_010321	T	6	6	39060	39065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010321	AGC	2	6	39132	39137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010321	TAA	2	6	39167	39172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010321	TTTTA	2	10	39177	39186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010321	AGG	2	6	39219	39224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010321	AGA	2	6	40247	40252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010321	A	6	6	40261	40266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010321	AGG	2	6	40275	40280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010321	T	6	6	41998	42003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010321	AGG	2	6	42023	42028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010321	AAAG	2	8	43080	43087	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010321	ACT	2	6	43135	43140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010321	GA	3	6	43169	43174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010321	CAT	2	6	43184	43189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010321	AGG	2	6	43244	43249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010321	TCTTTT	2	12	43529	43540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010321	T	6	6	43537	43542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010321	TAA	2	6	43561	43566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010321	AAGCA	2	10	43600	43609	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010321	TTATTT	2	12	43615	43626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010321	A	6	6	43675	43680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010321	CCT	2	6	43766	43771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_010321	T	7	7	44473	44479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010321	A	6	6	44491	44496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010321	ACC	2	6	45162	45167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_010321	GAAG	2	8	45299	45306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010321	TGA	2	6	45327	45332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010321	GATG	2	8	45361	45368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010321	AT	3	6	45428	45433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010321	CAG	2	6	45541	45546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010321	AAGG	2	8	45579	45586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010321	AGG	2	6	45597	45602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010321	CCG	2	6	47033	47038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_010321	GTAC	2	8	47050	47057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010321	GGT	2	6	47058	47063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010321	AATAA	2	10	47078	47087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010321	CTG	2	6	47118	47123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_010321	T	6	6	47301	47306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_010321	T	7	7	65783	65789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_010321	A	6	6	65798	65803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_010321	TA	3	6	76388	76393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_010321	T	6	6	81771	81776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_010321	A	6	6	82134	82139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_010321	T	7	7	82157	82163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_010321	AT	3	6	82182	82187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_010321	A	6	6	82213	82218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_010321	AGAA	2	8	82270	82277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_010321	A	6	6	82392	82397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_010321	TA	3	6	114897	114902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_010321	AT	3	6	114915	114920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_010321	GGAG	2	8	115720	115727	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
446	NC_010321	AG	3	6	115726	115731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
447	NC_010321	GTC	2	6	121480	121485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
448	NC_010321	GAC	2	6	121518	121523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_010321	ATTTTT	2	12	121524	121535	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_010321	TAA	2	6	121578	121583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_010321	A	6	6	121607	121612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_010321	CCTA	2	8	121663	121670	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
453	NC_010321	CCTA	2	8	121731	121738	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_010321	CCTA	2	8	121798	121805	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
455	NC_010321	CCTA	2	8	121865	121872	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
456	NC_010321	CCTA	2	8	121931	121938	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
457	NC_010321	CCTA	2	8	121996	122003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
458	NC_010321	CCTA	2	8	122062	122069	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
459	NC_010321	CCTA	2	8	122129	122136	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
460	NC_010321	CCTA	2	8	122195	122202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
461	NC_010321	AAG	2	6	122248	122253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_010321	CCTA	2	8	122261	122268	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
463	NC_010321	CCG	2	6	122282	122287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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466	NC_010321	CCTA	2	8	122396	122403	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
467	NC_010321	GTTT	2	8	122451	122458	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
468	NC_010321	CCTA	2	8	122463	122470	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
469	NC_010321	CCTA	2	8	122529	122536	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
470	NC_010321	CGA	2	6	122556	122561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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472	NC_010321	CCTA	2	8	122597	122604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
473	NC_010321	CCTA	2	8	122663	122670	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
474	NC_010321	CCTA	2	8	122730	122737	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
475	NC_010321	CCTA	2	8	122798	122805	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
476	NC_010321	AGG	2	6	122846	122851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
477	NC_010321	CCTA	2	8	122866	122873	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
478	NC_010321	A	7	7	122902	122908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_010321	CTT	2	6	122968	122973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
481	NC_010321	TA	3	6	122974	122979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_010321	TAA	2	6	122982	122987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_010321	CCTA	2	8	122999	123006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
484	NC_010321	CTG	2	6	123035	123040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
485	NC_010321	CCTA	2	8	123066	123073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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487	NC_010321	CCTA	2	8	123133	123140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
488	NC_010321	CCTA	2	8	123199	123206	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
489	NC_010321	AC	3	6	123219	123224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
490	NC_010321	CCTA	2	8	123266	123273	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
491	NC_010321	CCTA	2	8	123333	123340	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
492	NC_010321	TTG	2	6	123372	123377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
493	NC_010321	AGTT	2	8	123387	123394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
494	NC_010321	CCTA	2	8	123400	123407	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
495	NC_010321	CCTA	2	8	123468	123475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
496	NC_010321	CCG	2	6	123505	123510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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500	NC_010321	CCTA	2	8	123605	123612	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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