MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223 chromosome

Total Repeats: 8541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010321	T	7	7	1056455	1056461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_010321	A	6	6	1056501	1056506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_010321	TAT	2	6	1056544	1056549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_010321	AT	3	6	1056548	1056553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_010321	TATTG	2	10	1056560	1056569	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_010321	TAATA	2	10	1056582	1056591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_010321	GAGG	2	8	1056615	1056622	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_010321	GGT	2	6	1057289	1057294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_010321	CTA	2	6	1058285	1058290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_010321	A	6	6	1058290	1058295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_010321	T	6	6	1058323	1058328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_010321	CTT	2	6	1059838	1059843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_010321	GCT	2	6	1059920	1059925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_010321	AAT	2	6	1059933	1059938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_010321	TTG	2	6	1059960	1059965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_010321	AAT	2	6	1059974	1059979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_010321	TTTAA	2	10	1059988	1059997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_010321	T	6	6	1060001	1060006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_010321	ACTAT	2	10	1060043	1060052	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4020	NC_010321	A	6	6	1060120	1060125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_010321	A	6	6	1060145	1060150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_010321	CCT	2	6	1060157	1060162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_010321	AGG	2	6	1060216	1060221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_010321	TCT	2	6	1061554	1061559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_010321	AAG	2	6	1061600	1061605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_010321	AATT	2	8	1061606	1061613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_010321	ACG	2	6	1061636	1061641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_010321	GAA	2	6	1061659	1061664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_010321	AAC	2	6	1061675	1061680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_010321	ACA	2	6	1061700	1061705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_010321	A	6	6	1061723	1061728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_010321	ATA	2	6	1061869	1061874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_010321	TTA	2	6	1061894	1061899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_010321	TAAG	2	8	1061923	1061930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_010321	ATA	2	6	1061936	1061941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_010321	TTG	2	6	1061959	1061964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_010321	TGA	2	6	1061965	1061970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_010321	ATA	2	6	1062012	1062017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_010321	GAGG	2	8	1062018	1062025	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_010321	TA	3	6	1062031	1062036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_010321	TAA	3	9	1062071	1062079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_010321	A	6	6	1064608	1064613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_010321	GAG	2	6	1066380	1066385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_010321	CCA	2	6	1066482	1066487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_010321	TTA	2	6	1066498	1066503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_010321	AT	3	6	1066510	1066515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_010321	A	6	6	1066530	1066535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_010321	ATT	2	6	1066597	1066602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_010321	T	6	6	1066601	1066606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_010321	CTT	2	6	1066613	1066618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_010321	GAA	2	6	1066633	1066638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_010321	T	7	7	1066652	1066658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_010321	A	7	7	1066659	1066665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_010321	ATTGG	2	10	1066759	1066768	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_010321	TA	3	6	1066781	1066786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_010321	A	7	7	1066795	1066801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_010321	GAA	2	6	1066839	1066844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_010321	GAG	2	6	1066849	1066854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_010321	AGAA	2	8	1069183	1069190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_010321	AT	3	6	1069249	1069254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_010321	T	6	6	1069268	1069273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_010321	TCCT	2	8	1071011	1071018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_010321	T	6	6	1071037	1071042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_010321	ATG	2	6	1071080	1071085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_010321	AAATT	2	10	1071089	1071098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_010321	AAAAAT	2	12	1071126	1071137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_010321	ATATT	2	10	1071179	1071188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_010321	A	6	6	1071194	1071199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_010321	TAA	2	6	1071665	1071670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_010321	TAA	2	6	1071675	1071680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_010321	TAA	2	6	1071685	1071690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_010321	TAA	2	6	1071695	1071700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_010321	T	6	6	1071718	1071723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4075	NC_010321	ATTA	2	8	1072456	1072463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4077	NC_010321	ATT	3	9	1073663	1073671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_010321	T	6	6	1073670	1073675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_010321	TAT	2	6	1074705	1074710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_010321	AGG	2	6	1074738	1074743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_010321	T	7	7	1074744	1074750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_010321	AGA	2	6	1075503	1075508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_010321	ATC	2	6	1075961	1075966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4085	NC_010321	ATT	2	6	1075982	1075987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_010321	T	6	6	1076024	1076029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_010321	T	6	6	1079006	1079011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_010321	A	7	7	1079020	1079026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_010321	T	6	6	1079084	1079089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_010321	AAACA	2	10	1079103	1079112	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4093	NC_010321	AGG	2	6	1080166	1080171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_010321	T	6	6	1081625	1081630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_010321	CATA	2	8	1081655	1081662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4098	NC_010321	GAA	2	6	1082131	1082136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_010321	AGG	2	6	1084274	1084279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4101	NC_010321	A	6	6	1086461	1086466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_010321	ATA	2	6	1086476	1086481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_010321	CTA	2	6	1086501	1086506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_010321	ACC	2	6	1097615	1097620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_010321	T	7	7	1098135	1098141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_010321	ATT	2	6	1098158	1098163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_010321	TAA	2	6	1098199	1098204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_010321	TAA	2	6	1098217	1098222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_010321	ATG	2	6	1098231	1098236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4111	NC_010321	CAC	2	6	1098410	1098415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_010321	TTG	2	6	1098442	1098447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_010321	GGAG	2	8	1099765	1099772	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_010321	TAT	2	6	1101590	1101595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_010321	TA	3	6	1101597	1101602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_010321	AAT	2	6	1101670	1101675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_010321	GGCAC	2	10	1101783	1101792	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4118	NC_010321	TAA	2	6	1102907	1102912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_010321	TAAAAA	2	12	1102936	1102947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_010321	AATA	2	8	1103685	1103692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_010321	A	6	6	1103716	1103721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_010321	GAA	2	6	1103763	1103768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_010321	TTC	2	6	1103790	1103795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_010321	TTTA	2	8	1103819	1103826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_010321	TGA	2	6	1106967	1106972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_010321	AAT	2	6	1111667	1111672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_010321	T	6	6	1111674	1111679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_010321	AGG	2	6	1111680	1111685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_010321	AAT	2	6	1111944	1111949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_010321	T	6	6	1112009	1112014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_010321	TTG	2	6	1112029	1112034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_010321	TAG	2	6	1112049	1112054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4134	NC_010321	AGG	2	6	1112562	1112567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4405	NC_010321	TCC	2	6	1234745	1234750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4406	NC_010321	A	6	6	1235548	1235553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4407	NC_010321	TTA	3	9	1235568	1235576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4436	NC_010321	A	9	9	1247075	1247083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4445	NC_010321	A	6	6	1251168	1251173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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