MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermosipho melanesiensis BI429 chromosome

Total Repeats: 4823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009616	T	7	7	1	7	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009616	A	6	6	14	19	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009616	TAA	2	6	26	31	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009616	ATT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009616	ATTT	2	8	61	68	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009616	TACA	2	8	100	107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009616	ATA	2	6	116	121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009616	A	7	7	136	142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009616	AGG	2	6	1503	1508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009616	A	6	6	1707	1712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009616	T	8	8	1743	1750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009616	TAA	2	6	1807	1812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009616	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009616	TTAA	2	8	1904	1911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009616	GAA	2	6	1937	1942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009616	TAA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009616	AGCTAT	2	12	1990	2001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009616	TCT	2	6	2029	2034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009616	ATA	2	6	2045	2050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009616	AAC	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009616	TTC	2	6	2265	2270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009616	ATT	2	6	2339	2344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009616	T	7	7	2359	2365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009616	AT	3	6	2388	2393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009616	TCAC	2	8	2438	2445	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009616	TC	4	8	2489	2496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009616	CTT	2	6	2508	2513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009616	ATG	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009616	AGAA	2	8	2569	2576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009616	A	6	6	2593	2598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009616	TTG	2	6	2625	2630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009616	ACCC	2	8	2673	2680	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_009616	CTA	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009616	GCA	2	6	2714	2719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009616	T	6	6	2747	2752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009616	AGA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009616	TCC	2	6	2807	2812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009616	TAT	2	6	2892	2897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009616	ATTT	2	8	2899	2906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009616	AGT	2	6	2936	2941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009616	CCA	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009616	CAA	2	6	3024	3029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009616	GTT	2	6	3088	3093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009616	ATT	2	6	3152	3157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009616	T	6	6	3156	3161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009616	A	8	8	3162	3169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009616	T	6	6	3192	3197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009616	ACAA	2	8	3199	3206	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009616	TAAA	2	8	3285	3292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009616	T	7	7	3299	3305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009616	AAT	2	6	3308	3313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009616	CAA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009616	T	6	6	3326	3331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009616	AAT	2	6	3348	3353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009616	GAA	2	6	3371	3376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009616	CAA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009616	TAAA	3	12	3394	3405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009616	A	6	6	3403	3408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009616	CCA	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009616	AT	3	6	3445	3450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009616	TCC	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009616	AAT	2	6	3504	3509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009616	A	6	6	3516	3521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009616	TTA	2	6	3526	3531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009616	TCA	2	6	3598	3603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009616	TCA	2	6	3613	3618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009616	GA	3	6	3623	3628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009616	TAT	2	6	3645	3650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009616	ACC	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009616	TTTA	2	8	3795	3802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009616	CTT	2	6	3803	3808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009616	CAA	2	6	3869	3874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009616	CAA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009616	TCT	2	6	4022	4027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009616	T	7	7	4032	4038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009616	TTAAA	2	10	4043	4052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009616	CTT	2	6	4136	4141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009616	CCT	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009616	ATT	2	6	4174	4179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009616	T	6	6	4178	4183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009616	CAG	2	6	4196	4201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009616	A	8	8	4235	4242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009616	A	6	6	4277	4282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009616	A	6	6	4338	4343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009616	AAC	2	6	4366	4371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009616	T	7	7	4442	4448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009616	A	8	8	4459	4466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009616	T	6	6	4485	4490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009616	A	6	6	4529	4534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009616	TTG	2	6	4560	4565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009616	ATC	2	6	4597	4602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009616	A	6	6	4612	4617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009616	GCA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009616	A	8	8	4674	4681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009616	A	6	6	4691	4696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009616	AT	3	6	4720	4725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009616	TTAA	2	8	4741	4748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009616	TTA	2	6	4795	4800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009616	A	6	6	4817	4822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009616	AGT	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009616	TTCT	2	8	4862	4869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009616	CCTG	2	8	4875	4882	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009616	T	6	6	4891	4896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009616	AATT	2	8	4908	4915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009616	AT	3	6	4934	4939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009616	CTGTAT	2	12	4955	4966	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_009616	T	6	6	4969	4974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009616	CAA	2	6	4976	4981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009616	AAT	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009616	CAA	2	6	5045	5050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009616	GAT	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009616	T	6	6	5080	5085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009616	CTT	2	6	5093	5098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009616	CTTTG	2	10	5107	5116	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009616	CTTC	2	8	5122	5129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009616	TAT	2	6	5151	5156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009616	TCC	2	6	5157	5162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009616	TTAA	2	8	5166	5173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009616	TGT	2	6	5181	5186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009616	AGT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009616	ATT	2	6	5202	5207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009616	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009616	T	6	6	5238	5243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009616	AT	3	6	5294	5299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009616	TTA	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009616	ATA	3	9	5333	5341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009616	T	6	6	5715	5720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009616	TAT	2	6	5722	5727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009616	AT	3	6	5732	5737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009616	A	7	7	5810	5816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009616	A	6	6	5826	5831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009616	A	6	6	5833	5838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009616	TCA	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009616	AACA	2	8	5907	5914	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009616	ATT	2	6	5919	5924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009616	A	7	7	5932	5938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009616	CTT	2	6	5961	5966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009616	T	7	7	5965	5971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009616	A	6	6	5972	5977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009616	TAT	2	6	6010	6015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009616	A	6	6	6056	6061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009616	AAC	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009616	A	6	6	6105	6110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009616	AAT	2	6	8131	8136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009616	AAGG	2	8	8137	8144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009616	CCT	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_009616	TAC	2	6	8181	8186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009616	CA	3	6	8199	8204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009616	TAG	2	6	8226	8231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009616	TCT	2	6	8248	8253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_009616	ACA	2	6	8302	8307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_009616	ATAA	2	8	8320	8327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009616	AT	3	6	8332	8337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009616	A	12	12	8369	8380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009616	TGAA	2	8	8387	8394	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_009616	ATT	2	6	8462	8467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_009616	TAAT	2	8	8539	8546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009616	TAA	2	6	8549	8554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009616	AT	3	6	8558	8563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009616	AATA	2	8	8570	8577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009616	TTA	2	6	8605	8610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_009616	AT	3	6	8681	8686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009616	AAT	2	6	8708	8713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_009616	AAC	2	6	13535	13540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_009616	G	6	6	62838	62843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_009616	AT	3	6	66543	66548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_009616	TTA	2	6	66597	66602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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