MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 2464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009486	ATC	2	6	60	65	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009486	GAG	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009486	GGA	2	6	1398	1403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009486	GAG	2	6	1413	1418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009486	ATTA	2	8	1426	1433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009486	ACCCC	2	10	1503	1512	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_009486	ACC	2	6	7591	7596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009486	CCT	2	6	10980	10985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009486	GT	3	6	10989	10994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009486	GAAA	2	8	11106	11113	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009486	TCT	2	6	11120	11125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009486	C	6	6	11171	11176	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_009486	C	6	6	11195	11200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_009486	T	7	7	11231	11237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009486	AGG	2	6	11300	11305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009486	TCC	2	6	26388	26393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009486	CTC	2	6	35107	35112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009486	AGG	2	6	35145	35150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009486	AC	3	6	40149	40154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009486	GTA	2	6	40179	40184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009486	GA	3	6	40237	40242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009486	TTC	2	6	42470	42475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009486	ATA	2	6	42491	42496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009486	GAA	2	6	43659	43664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009486	TGG	2	6	45034	45039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009486	A	6	6	45043	45048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009486	AGG	2	6	45052	45057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009486	TGG	2	6	46372	46377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009486	TTG	2	6	46387	46392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009486	ACA	2	6	50890	50895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009486	TCT	2	6	50901	50906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009486	AC	3	6	50924	50929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009486	TA	3	6	50933	50938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009486	A	6	6	50938	50943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009486	GTTT	2	8	50991	50998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009486	T	8	8	51003	51010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009486	GAA	2	6	51021	51026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009486	CCT	2	6	58772	58777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009486	TCTAT	2	10	58793	58802	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009486	TTGA	2	8	58808	58815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009486	AGG	2	6	58831	58836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009486	TGATA	2	10	68624	68633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009486	CT	3	6	68647	68652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009486	AT	4	8	68757	68764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009486	TCT	2	6	68775	68780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009486	TCT	2	6	68811	68816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009486	TG	3	6	68832	68837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009486	TTA	3	9	68844	68852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009486	AAG	2	6	68861	68866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009486	CTC	2	6	77380	77385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009486	TTA	2	6	77387	77392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009486	CCT	2	6	78791	78796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009486	TTC	2	6	79448	79453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009486	AGA	2	6	79483	79488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009486	AAC	2	6	80521	80526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009486	CCT	2	6	84541	84546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009486	TAA	2	6	93001	93006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009486	TG	3	6	94043	94048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009486	ACCG	2	8	94063	94070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009486	GTAA	2	8	94071	94078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009486	A	8	8	94077	94084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009486	TCA	2	6	98523	98528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009486	CTGTT	2	10	99527	99536	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009486	A	7	7	99541	99547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009486	ACC	2	6	100856	100861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009486	ATG	2	6	100881	100886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009486	CCT	2	6	102096	102101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009486	TCC	2	6	102879	102884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009486	A	8	8	102885	102892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009486	CTG	2	6	102915	102920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009486	CTC	2	6	103007	103012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009486	CTT	2	6	103034	103039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009486	T	6	6	105518	105523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009486	ATT	2	6	105549	105554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009486	CAA	2	6	105580	105585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009486	G	6	6	105713	105718	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009486	TTC	2	6	106443	106448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009486	TCA	2	6	106472	106477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009486	CACC	2	8	106508	106515	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_009486	CT	3	6	106538	106543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009486	AG	3	6	106554	106559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009486	ATC	2	6	106575	106580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009486	TGA	2	6	106630	106635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009486	CCT	2	6	110143	110148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009486	TC	5	10	111860	111869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009486	AGGG	2	8	111878	111885	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009486	AC	3	6	111888	111893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009486	TCCC	2	8	115638	115645	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_009486	AGTT	2	8	115649	115656	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009486	TGC	2	6	115660	115665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009486	AAC	2	6	115667	115672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009486	ATT	2	6	115680	115685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009486	GGA	2	6	115739	115744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009486	AGG	2	6	115750	115755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009486	CCT	2	6	116469	116474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009486	AAT	2	6	116515	116520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009486	TCTGT	2	10	116546	116555	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009486	A	6	6	116593	116598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009486	TC	3	6	116608	116613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009486	CCT	2	6	119827	119832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_009486	CCT	2	6	123043	123048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009486	T	7	7	123154	123160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009486	AGG	2	6	123164	123169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009486	T	6	6	128836	128841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009486	ACC	2	6	131071	131076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_009486	AT	3	6	131096	131101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009486	CCT	2	6	132363	132368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_009486	AC	3	6	138156	138161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009486	TAAAAA	2	12	138170	138181	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009486	CCG	2	6	138185	138190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009486	T	6	6	138199	138204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009486	TCC	2	6	138208	138213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_009486	CCG	2	6	138227	138232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_009486	TCC	2	6	138272	138277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009486	T	6	6	138327	138332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009486	TG	3	6	138356	138361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009486	GTG	2	6	138767	138772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009486	CTC	2	6	139583	139588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009486	CCGG	2	8	140158	140165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009486	GATAC	2	10	140307	140316	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009486	C	6	6	141347	141352	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_009486	ATC	2	6	141623	141628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009486	ACC	2	6	142114	142119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009486	ATC	2	6	142166	142171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009486	CCA	2	6	145125	145130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009486	GAG	2	6	145158	145163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009486	AAG	2	6	145195	145200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009486	AAC	2	6	149620	149625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009486	ATC	2	6	155530	155535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009486	CCT	2	6	155536	155541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009486	TCA	2	6	155555	155560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009486	CAA	2	6	155578	155583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009486	AGT	2	6	155612	155617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009486	GGT	3	9	155641	155649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009486	AGG	2	6	157547	157552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009486	A	6	6	158686	158691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009486	TCC	2	6	158715	158720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009486	GCGT	2	8	158776	158783	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009486	AG	3	6	158813	158818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009486	GCA	2	6	160099	160104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009486	CCT	2	6	162097	162102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_009486	TGT	2	6	162135	162140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009486	AAT	2	6	162186	162191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009486	TTTTGT	2	12	163449	163460	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009486	AT	3	6	163467	163472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009486	GAA	2	6	163476	163481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009486	AT	3	6	169245	169250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009486	A	6	6	169252	169257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009486	GTT	2	6	169266	169271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_009486	CTTTT	2	10	173819	173828	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_009486	ACC	2	6	173850	173855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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160	NC_009486	CA	3	6	195091	195096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
161	NC_009486	CAACC	2	10	195130	195139	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
162	NC_009486	GCC	2	6	195175	195180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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164	NC_009486	TCT	2	6	195245	195250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_009486	CTC	2	6	195357	195362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_009486	CCT	2	6	198884	198889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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168	NC_009486	TAC	2	6	198907	198912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_009486	CCT	2	6	206651	206656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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173	NC_009486	CCTC	2	8	215294	215301	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
174	NC_009486	GAA	2	6	217859	217864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_009486	CCT	2	6	231938	231943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_009486	CGGGG	2	10	231963	231972	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
182	NC_009486	CCCG	2	8	233979	233986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
183	NC_009486	CCT	2	6	235001	235006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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193	NC_009486	CCT	2	6	253148	253153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
194	NC_009486	TAC	2	6	253166	253171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_009486	A	6	6	253187	253192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_009486	TGA	2	6	253214	253219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_009486	GGT	2	6	253281	253286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_009486	AGG	2	6	333282	333287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
271	NC_009486	CAC	2	6	340139	340144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_009486	TAT	2	6	340155	340160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_009486	GGGA	2	8	340168	340175	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
274	NC_009486	C	6	6	342649	342654	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
275	NC_009486	ATT	2	6	342753	342758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_009486	GCCT	2	8	343883	343890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
278	NC_009486	TTG	2	6	343894	343899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_009486	CCT	2	6	344461	344466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
280	NC_009486	GTT	2	6	344519	344524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_009486	TCAT	2	8	344544	344551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
282	NC_009486	T	6	6	344582	344587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_009486	TCA	2	6	344589	344594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_009486	CCT	3	9	459095	459103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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