MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 3758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008698	GA	3	6	1636372	1636377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_008698	AGA	2	6	1636408	1636413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_008698	A	6	6	1636413	1636418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_008698	TTA	2	6	1636437	1636442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_008698	TC	3	6	1637305	1637310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_008698	AT	3	6	1637430	1637435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_008698	AAG	2	6	1637452	1637457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_008698	GC	3	6	1638249	1638254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_008698	CCG	2	6	1638287	1638292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_008698	GCC	2	6	1638332	1638337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_008698	TCC	2	6	1638343	1638348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_008698	GTA	2	6	1639055	1639060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_008698	CTC	2	6	1639071	1639076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_008698	GC	3	6	1639080	1639085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_008698	CTT	2	6	1639111	1639116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_008698	TTC	2	6	1639135	1639140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_008698	CAG	2	6	1639147	1639152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_008698	CCCG	2	8	1639899	1639906	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3519	NC_008698	AAG	2	6	1639921	1639926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_008698	AG	3	6	1639953	1639958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3522	NC_008698	CTC	2	6	1641305	1641310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_008698	GA	3	6	1641367	1641372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_008698	GC	3	6	1641410	1641415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_008698	GAA	2	6	1641416	1641421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_008698	CTGAG	2	10	1641452	1641461	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3534	NC_008698	GTG	2	6	1642850	1642855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3541	NC_008698	GGCG	2	8	1645688	1645695	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3546	NC_008698	AC	3	6	1648229	1648234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3552	NC_008698	A	7	7	1650024	1650030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3563	NC_008698	CAA	2	6	1654184	1654189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3603	NC_008698	GC	4	8	1670831	1670838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_008698	GGC	2	6	1670844	1670849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_008698	CG	4	8	1670900	1670907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_008698	GAA	2	6	1670939	1670944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3608	NC_008698	TAA	2	6	1670949	1670954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_008698	AG	3	6	1675704	1675709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_008698	CG	3	6	1676951	1676956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_008698	CCAG	2	8	1676988	1676995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_008698	A	6	6	1677027	1677032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_008698	AGC	2	6	1677050	1677055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3626	NC_008698	CTTTT	2	10	1678551	1678560	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3629	NC_008698	CG	4	8	1678717	1678724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_008698	GC	3	6	1678731	1678736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3631	NC_008698	GAG	2	6	1680333	1680338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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