MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 3758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008698	GGT	2	6	1161948	1161953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_008698	TGA	2	6	1164434	1164439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_008698	TTA	2	6	1164443	1164448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_008698	GGC	2	6	1164456	1164461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_008698	CGA	2	6	1164836	1164841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_008698	CCA	2	6	1168018	1168023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2507	NC_008698	AAGAA	2	10	1168056	1168065	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_008698	TA	3	6	1168071	1168076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_008698	TTCC	2	8	1168079	1168086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_008698	TA	3	6	1168106	1168111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_008698	TC	3	6	1169730	1169735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_008698	ACG	2	6	1171344	1171349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_008698	TC	4	8	1171871	1171878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_008698	GCC	2	6	1171884	1171889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_008698	CGA	2	6	1173623	1173628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_008698	TAAA	2	8	1173632	1173639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_008698	GC	3	6	1173653	1173658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_008698	TCC	3	9	1173722	1173730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_008698	GAA	2	6	1174996	1175001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_008698	ATG	2	6	1175025	1175030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_008698	CGG	2	6	1175136	1175141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_008698	AAG	2	6	1175237	1175242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_008698	AGCGT	2	10	1177033	1177042	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2524	NC_008698	C	6	6	1177054	1177059	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2525	NC_008698	CTC	2	6	1179298	1179303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2526	NC_008698	CG	3	6	1179367	1179372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_008698	TAA	2	6	1179417	1179422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_008698	TCCC	2	8	1179449	1179456	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2529	NC_008698	TTC	2	6	1179491	1179496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_008698	ATT	3	9	1179518	1179526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_008698	TTC	2	6	1179555	1179560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_008698	TTTC	2	8	1179566	1179573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2533	NC_008698	GTAAA	2	10	1179579	1179588	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_008698	TTA	2	6	1179593	1179598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_008698	T	11	11	1181773	1181783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_008698	TC	3	6	1181798	1181803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_008698	GAT	2	6	1186017	1186022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_008698	AG	3	6	1186057	1186062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_008698	GAG	2	6	1186066	1186071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_008698	TAGCT	2	10	1186079	1186088	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2541	NC_008698	CTT	2	6	1186110	1186115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_008698	TAA	3	9	1186159	1186167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_008698	AC	3	6	1186193	1186198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2544	NC_008698	CG	4	8	1190202	1190209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2545	NC_008698	TCA	2	6	1191439	1191444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_008698	GTTAA	2	10	1191486	1191495	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_008698	GGT	2	6	1191534	1191539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_008698	AAG	3	9	1191549	1191557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_008698	AAG	2	6	1191582	1191587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_008698	AGG	3	9	1191619	1191627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_008698	TAAA	2	8	1191649	1191656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_008698	T	6	6	1191658	1191663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_008698	CAC	2	6	1193386	1193391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_008698	A	6	6	1193403	1193408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_008698	T	6	6	1193417	1193422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_008698	TAA	2	6	1194839	1194844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_008698	TA	3	6	1194855	1194860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_008698	TA	3	6	1194917	1194922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_008698	CCCT	2	8	1195649	1195656	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2560	NC_008698	CG	3	6	1196683	1196688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2561	NC_008698	T	6	6	1196692	1196697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_008698	AGG	2	6	1197876	1197881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_008698	GT	3	6	1197915	1197920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_008698	CCT	2	6	1199170	1199175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_008698	AAG	2	6	1199213	1199218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_008698	T	6	6	1200739	1200744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_008698	AGAT	2	8	1200793	1200800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_008698	TCC	2	6	1202241	1202246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2569	NC_008698	CCG	2	6	1206026	1206031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_008698	CTT	2	6	1210701	1210706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_008698	ACCTCG	2	12	1210778	1210789	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2572	NC_008698	CTC	2	6	1210795	1210800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2573	NC_008698	GCAT	2	8	1210805	1210812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2574	NC_008698	GC	3	6	1210834	1210839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2575	NC_008698	CCA	2	6	1210845	1210850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2576	NC_008698	ATG	2	6	1210881	1210886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_008698	GTAC	2	8	1210926	1210933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2578	NC_008698	TGA	2	6	1213313	1213318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_008698	GGA	3	9	1215810	1215818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_008698	CTG	2	6	1218153	1218158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_008698	GTA	2	6	1218240	1218245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_008698	GGC	2	6	1218254	1218259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_008698	CGG	2	6	1219060	1219065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_008698	GAA	2	6	1219163	1219168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_008698	GTAA	2	8	1219356	1219363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_008698	AGG	2	6	1219482	1219487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_008698	CTG	2	6	1219490	1219495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_008698	GGC	2	6	1219498	1219503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_008698	CACC	2	8	1219562	1219569	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2590	NC_008698	AAG	2	6	1219686	1219691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_008698	TCG	2	6	1219708	1219713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_008698	GTC	2	6	1219714	1219719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_008698	GCT	2	6	1219835	1219840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_008698	AAG	2	6	1219855	1219860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_008698	GGA	2	6	1220026	1220031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2599	NC_008698	CTT	2	6	1220818	1220823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_008698	A	6	6	1220846	1220851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_008698	CCCA	2	8	1221532	1221539	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2602	NC_008698	GA	3	6	1221545	1221550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_008698	CCA	2	6	1221586	1221591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_008698	GCC	3	9	1221603	1221611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2605	NC_008698	CA	3	6	1221617	1221622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2606	NC_008698	C	6	6	1221636	1221641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2607	NC_008698	CCCG	2	8	1221678	1221685	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2608	NC_008698	CGG	2	6	1221691	1221696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_008698	CTC	2	6	1221759	1221764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_008698	AGGG	2	8	1221802	1221809	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_008698	C	6	6	1221841	1221846	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2612	NC_008698	GCCC	2	8	1221862	1221869	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2613	NC_008698	CGG	2	6	1221875	1221880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_008698	CGC	2	6	1221922	1221927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_008698	CCT	2	6	1221930	1221935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2616	NC_008698	CGG	2	6	1221956	1221961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_008698	CG	4	8	1222017	1222024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2618	NC_008698	CGC	2	6	1222037	1222042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2619	NC_008698	CGG	2	6	1222067	1222072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_008698	GCG	2	6	1222082	1222087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_008698	C	6	6	1222102	1222107	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2622	NC_008698	AGA	2	6	1222111	1222116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_008698	G	6	6	1222133	1222138	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_008698	GAG	2	6	1222235	1222240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2626	NC_008698	TTC	2	6	1222291	1222296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_008698	TTC	2	6	1222465	1222470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_008698	GGC	2	6	1225099	1225104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_008698	GA	3	6	1225129	1225134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_008698	GT	3	6	1227185	1227190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_008698	GGCGA	2	10	1227475	1227484	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2633	NC_008698	CCG	2	6	1227621	1227626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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