MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 3758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008698	CTA	2	6	1991	1996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008698	TTC	2	6	2014	2019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008698	GA	3	6	2027	2032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008698	A	6	6	2050	2055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008698	AT	4	8	2098	2105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008698	AGA	2	6	6723	6728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008698	A	6	6	6733	6738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008698	TAT	2	6	6748	6753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008698	GAA	2	6	7395	7400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008698	CAC	2	6	7427	7432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008698	CTA	2	6	7433	7438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008698	TTG	2	6	7498	7503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008698	TGCC	2	8	7545	7552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008698	ATT	2	6	7594	7599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008698	GTA	2	6	7605	7610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008698	GAA	2	6	7672	7677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008698	GTT	2	6	7747	7752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008698	AGCT	2	8	9172	9179	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008698	CG	3	6	9181	9186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008698	TTA	2	6	9224	9229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008698	AG	3	6	9236	9241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008698	TCC	2	6	9948	9953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_008698	AGA	2	6	10480	10485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008698	CCG	2	6	10510	10515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_008698	TCA	2	6	10545	10550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008698	TTG	2	6	10566	10571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008698	GC	3	6	13387	13392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008698	CG	3	6	13445	13450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008698	CGG	2	6	13459	13464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008698	AGCC	2	8	13522	13529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008698	GAA	2	6	13532	13537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008698	GAA	2	6	13545	13550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008698	AGA	2	6	13656	13661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008698	ATT	2	6	13663	13668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008698	GAG	2	6	13686	13691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008698	AGG	2	6	15359	15364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008698	CTTG	2	8	16635	16642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008698	GTG	2	6	16706	16711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008698	G	6	6	20868	20873	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008698	A	6	6	20917	20922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008698	GTC	2	6	22922	22927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008698	GGT	2	6	22939	22944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008698	GAG	2	6	22956	22961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008698	CG	3	6	23397	23402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008698	AGTTT	3	15	23433	23447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008698	AG	3	6	23450	23455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008698	TTA	3	9	25743	25751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008698	A	6	6	26909	26914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008698	GC	3	6	26927	26932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008698	TC	3	6	35503	35508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008698	A	6	6	35536	35541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008698	GC	4	8	35557	35564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008698	TA	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008698	CGT	2	6	36500	36505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008698	TA	3	6	36517	36522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008698	AGCCC	2	10	37197	37206	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_008698	TA	3	6	37567	37572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008698	CTC	2	6	38249	38254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008698	TCA	2	6	38276	38281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008698	CGC	2	6	38338	38343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008698	GC	3	6	39128	39133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008698	A	6	6	40968	40973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008698	TGC	2	6	41382	41387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008698	ACTC	2	8	41415	41422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008698	TTTC	2	8	41437	41444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008698	GA	3	6	41456	41461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008698	A	6	6	41469	41474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008698	CG	3	6	42057	42062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008698	GGT	2	6	42115	42120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008698	CCG	2	6	42173	42178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008698	GAA	2	6	42626	42631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008698	CAA	2	6	42659	42664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008698	A	6	6	42673	42678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008698	T	6	6	42682	42687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008698	ATG	2	6	42737	42742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008698	GAG	2	6	42774	42779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008698	GGT	2	6	42787	42792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008698	CTT	2	6	42949	42954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008698	CCG	2	6	42981	42986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008698	AGG	2	6	43757	43762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008698	TG	3	6	43806	43811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008698	TTC	2	6	43820	43825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008698	T	6	6	43962	43967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008698	GCG	2	6	43975	43980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008698	TGTAT	2	10	43998	44007	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008698	ATTT	2	8	44072	44079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008698	CT	3	6	44147	44152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008698	GCAT	2	8	45504	45511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008698	CGCC	2	8	47092	47099	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_008698	ACCTT	2	10	48277	48286	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_008698	T	6	6	48811	48816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008698	AC	3	6	48826	48831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008698	ATT	2	6	52533	52538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008698	TA	3	6	52540	52545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008698	GAA	2	6	52559	52564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008698	CAAG	2	8	53644	53651	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008698	CT	3	6	53675	53680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008698	AT	4	8	56432	56439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008698	AG	3	6	56456	56461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008698	TA	3	6	58703	58708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008698	CTC	2	6	58987	58992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008698	TAAA	2	8	59040	59047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008698	TCA	2	6	63127	63132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008698	GTAA	2	8	63149	63156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008698	AGCCT	2	10	63158	63167	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_008698	A	6	6	63173	63178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008698	ATTG	2	8	64398	64405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008698	AAG	2	6	64428	64433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008698	CCG	2	6	64454	64459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_008698	T	7	7	64462	64468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008698	T	7	7	64480	64486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008698	T	6	6	65345	65350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008698	TTC	2	6	65516	65521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008698	AAC	2	6	65556	65561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008698	TCT	2	6	65590	65595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008698	TAA	2	6	65635	65640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008698	ATG	2	6	67485	67490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008698	CTG	2	6	67497	67502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008698	GC	3	6	70353	70358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008698	AAC	2	6	70419	70424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008698	A	7	7	70455	70461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008698	T	6	6	70465	70470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008698	CGT	2	6	70486	70491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008698	AGG	2	6	70684	70689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008698	TA	3	6	70690	70695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008698	T	6	6	70710	70715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008698	CAC	2	6	70769	70774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_008698	TAG	2	6	73031	73036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008698	TTA	2	6	74682	74687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008698	GGC	2	6	76773	76778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008698	TAA	2	6	78324	78329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008698	A	6	6	78787	78792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008698	TTA	2	6	78816	78821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008698	AGT	2	6	80214	80219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008698	GTG	2	6	80224	80229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008698	GAG	2	6	80254	80259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008698	TAC	2	6	80293	80298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008698	TAACG	2	10	80922	80931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008698	CGC	2	6	83980	83985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_008698	CG	4	8	84004	84011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008698	ACTC	2	8	84037	84044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008698	CTC	2	6	84120	84125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008698	CCT	2	6	84164	84169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_008698	CT	3	6	84175	84180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008698	CGT	2	6	84235	84240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008698	TCA	2	6	84242	84247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008698	GAAA	2	8	87102	87109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008698	CGTTT	2	10	87112	87121	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_008698	ACG	2	6	87131	87136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_008698	TTAT	2	8	88535	88542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_008698	TAC	2	6	90919	90924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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330	NC_008698	CGC	3	9	230306	230314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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429	NC_008698	AAGC	2	8	267485	267492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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432	NC_008698	TGG	2	6	267657	267662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
433	NC_008698	AGC	2	6	267672	267677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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435	NC_008698	CG	3	6	267723	267728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
436	NC_008698	GC	3	6	267759	267764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
437	NC_008698	TTA	2	6	267781	267786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_008698	GAA	2	6	267796	267801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_008698	GCG	2	6	267837	267842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_008698	CCA	2	6	267919	267924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
441	NC_008698	TTC	2	6	267947	267952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_008698	TGG	2	6	268012	268017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_008698	CG	3	6	268184	268189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
448	NC_008698	TC	3	6	268196	268201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
449	NC_008698	GAG	2	6	268205	268210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
450	NC_008698	GAG	2	6	268215	268220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
451	NC_008698	T	6	6	268237	268242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_008698	GC	3	6	268247	268252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
453	NC_008698	GTC	2	6	268307	268312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_008698	GGC	2	6	268342	268347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_008698	CCGG	2	8	268395	268402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
456	NC_008698	GGT	2	6	268841	268846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_008698	GTG	2	6	268926	268931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_008698	CTC	2	6	272585	272590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
462	NC_008698	CTT	2	6	273532	273537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_008698	AT	3	6	273542	273547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_008698	CCT	2	6	273580	273585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
465	NC_008698	AAGGC	2	10	273627	273636	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
466	NC_008698	GTT	2	6	273661	273666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
467	NC_008698	CTTCGA	2	12	273667	273678	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_008698	TCT	2	6	273688	273693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
469	NC_008698	CGA	2	6	273806	273811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_008698	GA	3	6	273810	273815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
471	NC_008698	TTC	2	6	273871	273876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_008698	TTC	2	6	274998	275003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
474	NC_008698	AGGC	2	8	275028	275035	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
475	NC_008698	TTTC	2	8	275069	275076	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
476	NC_008698	TTC	2	6	277509	277514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
477	NC_008698	CGC	2	6	278118	278123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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480	NC_008698	AG	3	6	279640	279645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
481	NC_008698	TAA	2	6	281212	281217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_008698	CA	3	6	281228	281233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
483	NC_008698	CT	3	6	281237	281242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
484	NC_008698	GC	3	6	282179	282184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
485	NC_008698	CA	3	6	282226	282231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
486	NC_008698	CGT	2	6	282250	282255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_008698	GCA	2	6	285847	285852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_008698	CCT	2	6	288207	288212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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