MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 79088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008312	CGA	2	6	75937	75942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_008312	GAA	2	6	75957	75962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008312	T	6	6	76038	76043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008312	ACA	2	6	76198	76203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_008312	ATTT	2	8	76204	76211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008312	A	6	6	76212	76217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008312	A	7	7	76275	76281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008312	A	8	8	76877	76884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008312	TGA	2	6	76941	76946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008312	AAC	2	6	76951	76956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_008312	A	6	6	77028	77033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008312	AT	3	6	77047	77052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008312	AGG	2	6	77053	77058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008312	A	6	6	77081	77086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008312	CAA	2	6	77102	77107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_008312	CGT	2	6	77184	77189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_008312	CAAA	2	8	77214	77221	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_008312	AT	3	6	77304	77309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008312	GTG	2	6	77344	77349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008312	ATG	2	6	77363	77368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008312	A	7	7	77430	77436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008312	TAG	2	6	77478	77483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008312	ACCA	2	8	77505	77512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_008312	GAA	2	6	78244	78249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008312	GAA	2	6	78268	78273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008312	A	7	7	78272	78278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008312	GTT	2	6	78307	78312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008312	A	6	6	78324	78329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008312	TGA	2	6	78330	78335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008312	A	8	8	81155	81162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008312	AC	3	6	81199	81204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_008312	ATT	2	6	81225	81230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008312	A	6	6	81314	81319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008312	A	7	7	81331	81337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008312	AATTA	2	10	81992	82001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008312	GAA	2	6	82013	82018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008312	AAG	2	6	82049	82054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008312	TAT	2	6	82081	82086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_008312	AG	3	6	82110	82115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008312	AATTA	2	10	82151	82160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008312	GAA	2	6	82172	82177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008312	AAG	2	6	82208	82213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008312	AGCT	2	8	82235	82242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_008312	ACTG	2	8	82264	82271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_008312	CAA	2	6	82301	82306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_008312	AAGCTA	2	12	82317	82328	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1047	NC_008312	AGC	2	6	82357	82362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_008312	A	6	6	82484	82489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008312	CAAT	2	8	84577	84584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_008312	ATA	2	6	84603	84608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008312	CAT	2	6	84631	84636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_008312	AAT	2	6	84639	84644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008312	TGG	2	6	84645	84650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008312	GTT	2	6	84666	84671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008312	ACA	2	6	84811	84816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_008312	TAA	2	6	84849	84854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008312	TA	3	6	84855	84860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008312	TTA	2	6	84861	84866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008312	TAA	2	6	84881	84886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008312	T	7	7	84887	84893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008312	TAA	2	6	86051	86056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008312	ATA	2	6	86063	86068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008312	ATA	2	6	86096	86101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008312	AAG	2	6	86123	86128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008312	A	7	7	86186	86192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008312	ATA	2	6	86204	86209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008312	AGT	2	6	86237	86242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008312	A	6	6	86256	86261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008312	TGA	2	6	86338	86343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008312	TTA	2	6	86349	86354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008312	A	6	6	86370	86375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008312	TAGT	2	8	86422	86429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008312	A	9	9	86448	86456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008312	TAAT	2	8	86590	86597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008312	A	7	7	86605	86611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008312	TCA	2	6	86612	86617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_008312	ATTA	2	8	86646	86653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008312	TGA	2	6	86657	86662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008312	TAT	2	6	86755	86760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008312	AAG	2	6	86776	86781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008312	ACA	2	6	86829	86834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_008312	TG	3	6	86859	86864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008312	CCA	2	6	86877	86882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_008312	TCC	2	6	86883	86888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_008312	AC	3	6	86893	86898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_008312	AG	3	6	86913	86918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008312	GTT	2	6	86970	86975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008312	TTG	2	6	87101	87106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008312	AGC	2	6	87345	87350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_008312	AAT	2	6	87398	87403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008312	ATA	2	6	87435	87440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008312	AAAAAC	2	12	87481	87492	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1094	NC_008312	ATTT	2	8	87495	87502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008312	A	8	8	87506	87513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008312	TCAA	2	8	87543	87550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_008312	TGA	2	6	87681	87686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008312	AACT	2	8	87712	87719	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_008312	AGT	2	6	87743	87748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008312	TGG	2	6	87795	87800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008312	TAT	2	6	87882	87887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008312	AAG	2	6	87894	87899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008312	TAA	2	6	87931	87936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008312	TAA	2	6	87939	87944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_008312	TTC	2	6	87958	87963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_008312	AAT	2	6	88005	88010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008312	TAA	2	6	88059	88064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008312	ATAAAA	2	12	88117	88128	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008312	TAA	2	6	88140	88145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008312	TAT	2	6	88173	88178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008312	T	6	6	88217	88222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008312	T	8	8	88247	88254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008312	TAA	2	6	88355	88360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008312	TACA	2	8	88416	88423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_008312	A	6	6	88509	88514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008312	GTTTT	2	10	88515	88524	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008312	T	6	6	88527	88532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_008312	TAA	2	6	88593	88598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008312	T	6	6	88605	88610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008312	TTAATA	2	12	88657	88668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008312	AGT	2	6	88761	88766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008312	AAT	2	6	88853	88858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008312	TC	3	6	89072	89077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_008312	TA	3	6	89084	89089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008312	ATA	2	6	89111	89116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008312	AAC	2	6	89152	89157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008312	ATG	2	6	89243	89248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008312	AACTT	2	10	89325	89334	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1129	NC_008312	ATAA	2	8	89399	89406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008312	GCGATC	2	12	89490	89501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_008312	TCAA	2	8	89534	89541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_008312	GAAAG	2	10	89567	89576	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008312	ATTG	2	8	89613	89620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008312	ATGT	2	8	89670	89677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008312	TAC	2	6	89726	89731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_008312	TAT	2	6	89764	89769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008312	GAA	2	6	89787	89792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_008312	CTC	2	6	89794	89799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_008312	AGA	2	6	89813	89818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_008312	A	7	7	89840	89846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_008312	A	6	6	89881	89886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_008312	A	6	6	89953	89958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1177	NC_008312	T	6	6	91527	91532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_008312	ATT	2	6	109762	109767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_008312	AG	3	6	110428	110433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_008312	GCA	2	6	110446	110451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1425	NC_008312	A	7	7	110462	110468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_008312	GC	3	6	110494	110499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1427	NC_008312	ATT	2	6	110511	110516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_008312	TAGAT	2	10	110539	110548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_008312	ATTT	2	8	110570	110577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_008312	TGA	2	6	111583	111588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_008312	AATTTT	2	12	111599	111610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_008312	TAA	2	6	111636	111641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_008312	AT	3	6	111644	111649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_008312	TA	3	6	111684	111689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_008312	T	6	6	111690	111695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_008312	TAT	2	6	111705	111710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_008312	A	6	6	111751	111756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_008312	TTC	2	6	111821	111826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1439	NC_008312	TC	3	6	111825	111830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1440	NC_008312	GAA	2	6	111853	111858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_008312	A	6	6	111860	111865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_008312	T	6	6	111913	111918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_008312	TGAT	2	8	111941	111948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_008312	CTG	2	6	111953	111958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1445	NC_008312	ATA	2	6	111959	111964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_008312	TTTCTA	2	12	111988	111999	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1448	NC_008312	TAT	2	6	112055	112060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_008312	T	8	8	112067	112074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_008312	T	6	6	112091	112096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_008312	TA	3	6	112114	112119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_008312	ACT	2	6	112143	112148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1454	NC_008312	AT	3	6	112160	112165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_008312	T	7	7	112168	112174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_008312	ATT	2	6	112186	112191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_008312	T	6	6	112216	112221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_008312	AAC	2	6	112231	112236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1459	NC_008312	T	6	6	112262	112267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1460	NC_008312	TAA	2	6	112321	112326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1472	NC_008312	T	7	7	112672	112678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1473	NC_008312	TAA	2	6	112714	112719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1474	NC_008312	TTA	2	6	112824	112829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1477	NC_008312	T	7	7	112952	112958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1486	NC_008312	A	6	6	113260	113265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1487	NC_008312	ATA	2	6	115087	115092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1488	NC_008312	AAT	2	6	115093	115098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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