MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 79088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008312	A	6	6	43766	43771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008312	TTA	2	6	43774	43779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008312	TAG	2	6	43786	43791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008312	TCA	2	6	43801	43806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_008312	AT	3	6	43883	43888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008312	TC	3	6	43904	43909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_008312	ATT	2	6	43916	43921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008312	ATT	2	6	43926	43931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008312	AAAT	2	8	43988	43995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008312	AAT	2	6	44000	44005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008312	TCTT	2	8	44011	44018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_008312	CAG	2	6	44027	44032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_008312	A	8	8	44034	44041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008312	AT	3	6	44058	44063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008312	TTA	2	6	44095	44100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008312	CAA	2	6	44101	44106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008312	T	9	9	44146	44154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008312	A	7	7	44180	44186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008312	ATT	2	6	44207	44212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008312	A	6	6	44225	44230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008312	A	6	6	44270	44275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008312	T	6	6	44303	44308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008312	ATT	2	6	44369	44374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008312	AAT	2	6	44456	44461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008312	CG	4	8	44520	44527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_008312	TTG	2	6	44582	44587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008312	A	6	6	44607	44612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008312	A	7	7	44680	44686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008312	TAGTC	2	10	44691	44700	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
530	NC_008312	T	6	6	44751	44756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008312	CTT	2	6	44775	44780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_008312	T	7	7	44790	44796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008312	T	7	7	44798	44804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008312	T	7	7	44809	44815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008312	T	9	9	44825	44833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008312	TAA	2	6	44865	44870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008312	TAT	2	6	44879	44884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008312	T	8	8	44884	44891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008312	ATT	2	6	44985	44990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008312	TAG	2	6	45016	45021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008312	CCT	2	6	45093	45098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_008312	CT	3	6	45157	45162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_008312	TTC	2	6	45240	45245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_008312	TAA	2	6	45343	45348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008312	T	7	7	45361	45367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008312	GA	4	8	45383	45390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008312	A	7	7	45390	45396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008312	CTTT	2	8	45434	45441	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_008312	C	6	6	45464	45469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
550	NC_008312	AAG	2	6	45487	45492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008312	TAT	2	6	48142	48147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008312	ATAG	2	8	48183	48190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008312	GGT	2	6	48216	48221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008312	T	6	6	48266	48271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008312	TTA	2	6	48342	48347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008312	TTG	2	6	48394	48399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008312	TGC	2	6	48432	48437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008312	TC	3	6	48443	48448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_008312	ATT	2	6	48480	48485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008312	GCTT	2	8	48486	48493	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_008312	AGA	2	6	48494	48499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008312	AAG	2	6	48527	48532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008312	A	7	7	48543	48549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008312	GTATA	2	10	48586	48595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008312	AAG	2	6	48621	48626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008312	TAA	2	6	48712	48717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008312	TTC	2	6	48728	48733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_008312	A	6	6	48763	48768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008312	TGAAG	2	10	48780	48789	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008312	ATT	2	6	48844	48849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008312	AAC	2	6	48863	48868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_008312	AAC	2	6	49481	49486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_008312	TCT	2	6	49521	49526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_008312	AAT	2	6	49558	49563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008312	TAAG	2	8	49577	49584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008312	TGA	2	6	49595	49600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008312	AATT	2	8	49628	49635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008312	TAG	2	6	49685	49690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008312	CAA	2	6	49709	49714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_008312	AATT	2	8	49776	49783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008312	TTC	2	6	49826	49831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_008312	AT	3	6	49848	49853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008312	ATCA	2	8	49875	49882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_008312	TCT	2	6	49889	49894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_008312	TA	4	8	49920	49927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008312	T	7	7	49942	49948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008312	ATTCT	2	10	49972	49981	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
588	NC_008312	CTGTAA	2	12	49996	50007	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
589	NC_008312	T	6	6	50008	50013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008312	T	8	8	50029	50036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008312	GT	3	6	50052	50057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008312	GCA	2	6	50062	50067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_008312	T	9	9	50113	50121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008312	TAC	2	6	50128	50133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_008312	ATT	2	6	50159	50164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008312	T	6	6	50193	50198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_008312	ATC	2	6	50199	50204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_008312	TA	3	6	50217	50222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008312	TTC	2	6	50234	50239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_008312	CAT	2	6	50309	50314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_008312	TAA	2	6	50324	50329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008312	ATT	2	6	50393	50398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008312	ACT	3	9	50416	50424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_008312	CA	3	6	50450	50455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_008312	TAT	2	6	50456	50461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_008312	TA	5	10	50526	50535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008312	ACC	2	6	50552	50557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_008312	TG	3	6	50571	50576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008312	ATTTT	2	10	50612	50621	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008312	A	7	7	50626	50632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008312	AAT	3	9	50706	50714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008312	TGAA	2	8	50728	50735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008312	TAT	2	6	50743	50748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008312	TAA	2	6	50767	50772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008312	AT	3	6	50799	50804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008312	T	8	8	50804	50811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008312	ATT	2	6	50813	50818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008312	T	8	8	50873	50880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008312	ATC	2	6	50913	50918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_008312	TGA	2	6	50923	50928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008312	TTTA	2	8	50929	50936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008312	AT	3	6	50951	50956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008312	CTG	2	6	50958	50963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_008312	T	6	6	50999	51004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008312	ATT	2	6	51070	51075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008312	T	7	7	51150	51156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008312	TGTAT	2	10	51186	51195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008312	CTAT	2	8	51201	51208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_008312	T	8	8	51230	51237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008312	T	9	9	51258	51266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008312	CATT	2	8	51268	51275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_008312	TTG	2	6	51350	51355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008312	TC	3	6	51525	51530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_008312	AATT	2	8	51544	51551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008312	ACA	2	6	51567	51572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_008312	ATTT	2	8	51653	51660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008312	T	6	6	51705	51710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008312	ATT	2	6	51814	51819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_008312	TACTC	2	10	51848	51857	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
640	NC_008312	TACA	2	8	51892	51899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
641	NC_008312	T	8	8	51903	51910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_008312	CAT	2	6	52011	52016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_008312	ATT	2	6	52028	52033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_008312	CTA	2	6	52035	52040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_008312	TAA	2	6	52045	52050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_008312	TTC	2	6	52051	52056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_008312	AGG	2	6	52072	52077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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