MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 5005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007404	GCC	2	6	2300391	2300396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_007404	GAG	2	6	2301906	2301911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_007404	CT	3	6	2301925	2301930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_007404	CG	4	8	2304388	2304395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_007404	CCG	2	6	2304396	2304401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_007404	CCG	2	6	2304426	2304431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_007404	A	7	7	2304437	2304443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_007404	GC	3	6	2304444	2304449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_007404	A	7	7	2304455	2304461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_007404	TGT	2	6	2305771	2305776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_007404	TG	3	6	2305790	2305795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_007404	GCG	2	6	2306097	2306102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_007404	CG	3	6	2307475	2307480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_007404	CGG	2	6	2307484	2307489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_007404	CGG	2	6	2309070	2309075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_007404	C	6	6	2309889	2309894	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4017	NC_007404	ATCC	2	8	2310686	2310693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_007404	CGC	2	6	2311102	2311107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_007404	TTC	2	6	2311125	2311130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_007404	CCA	2	6	2311136	2311141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_007404	CCAG	2	8	2311186	2311193	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_007404	GTC	2	6	2311216	2311221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_007404	CTC	2	6	2311222	2311227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_007404	GCCG	2	8	2312498	2312505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_007404	CG	3	6	2312509	2312514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_007404	CTC	2	6	2313111	2313116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_007404	ATCC	2	8	2313351	2313358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_007404	GC	3	6	2313389	2313394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_007404	CGAT	2	8	2315928	2315935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_007404	AC	4	8	2316239	2316246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_007404	G	6	6	2316457	2316462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_007404	CGG	2	6	2316479	2316484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_007404	GTACC	2	10	2316493	2316502	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4034	NC_007404	CAT	2	6	2316521	2316526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_007404	GAC	2	6	2316556	2316561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_007404	GTC	2	6	2316601	2316606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_007404	ACGA	2	8	2316619	2316626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_007404	ACC	2	6	2316635	2316640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_007404	CGA	2	6	2317089	2317094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_007404	GGC	2	6	2317100	2317105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_007404	GGAAC	2	10	2319385	2319394	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4042	NC_007404	CGA	2	6	2319411	2319416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_007404	GA	4	8	2319468	2319475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_007404	CGG	2	6	2320076	2320081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_007404	CGC	2	6	2320093	2320098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_007404	GGGT	2	8	2320199	2320206	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_007404	AGC	2	6	2320238	2320243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_007404	GC	3	6	2320270	2320275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_007404	GC	3	6	2320283	2320288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_007404	AGG	2	6	2320317	2320322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_007404	GAC	2	6	2320758	2320763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_007404	ACA	2	6	2324230	2324235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_007404	CG	3	6	2324262	2324267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_007404	GCCC	2	8	2324300	2324307	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4055	NC_007404	CTTC	2	8	2324326	2324333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_007404	AC	3	6	2324352	2324357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_007404	CGGG	2	8	2324853	2324860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4058	NC_007404	AC	3	6	2324906	2324911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_007404	CG	4	8	2324914	2324921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_007404	CGA	2	6	2324937	2324942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_007404	CGG	2	6	2324982	2324987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_007404	CGC	2	6	2325575	2325580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_007404	CCGG	2	8	2325598	2325605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_007404	CGG	3	9	2325603	2325611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_007404	GCA	2	6	2325632	2325637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_007404	GC	3	6	2325651	2325656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_007404	CGT	2	6	2325660	2325665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_007404	CGC	2	6	2325669	2325674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4069	NC_007404	GC	4	8	2325978	2325985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4070	NC_007404	CGCC	2	8	2326329	2326336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4071	NC_007404	AGA	2	6	2327091	2327096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_007404	ATGC	2	8	2327165	2327172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_007404	CG	3	6	2327206	2327211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_007404	GCG	2	6	2327251	2327256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_007404	CGC	2	6	2327277	2327282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_007404	TTG	2	6	2327311	2327316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_007404	CGG	2	6	2328525	2328530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_007404	GCC	2	6	2330434	2330439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_007404	CGA	2	6	2330471	2330476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_007404	CGGG	2	8	2330870	2330877	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_007404	CTG	2	6	2331598	2331603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_007404	CGG	2	6	2331634	2331639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_007404	CG	3	6	2331653	2331658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_007404	ACG	2	6	2331663	2331668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_007404	GTC	2	6	2331671	2331676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_007404	GC	3	6	2331683	2331688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_007404	GC	3	6	2331695	2331700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_007404	AGC	2	6	2331719	2331724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_007404	TC	3	6	2332135	2332140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_007404	A	6	6	2332145	2332150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_007404	GGAC	2	8	2332203	2332210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4092	NC_007404	GCCC	2	8	2332259	2332266	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4093	NC_007404	CCGA	2	8	2332334	2332341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_007404	GGC	2	6	2333554	2333559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_007404	GAT	2	6	2333904	2333909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4097	NC_007404	GT	3	6	2334770	2334775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_007404	CG	3	6	2334785	2334790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_007404	CG	3	6	2334798	2334803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_007404	GC	4	8	2335170	2335177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_007404	GC	3	6	2335193	2335198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_007404	A	6	6	2335604	2335609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_007404	CACG	2	8	2335616	2335623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_007404	GCC	2	6	2336082	2336087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_007404	AGG	2	6	2336094	2336099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_007404	TCC	2	6	2336535	2336540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_007404	GCC	2	6	2336551	2336556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_007404	CGG	2	6	2340476	2340481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_007404	GGC	2	6	2342108	2342113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_007404	CGG	2	6	2342144	2342149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_007404	GGC	2	6	2342182	2342187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_007404	CCG	3	9	2342193	2342201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_007404	CG	3	6	2342228	2342233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_007404	TGCA	2	8	2342234	2342241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_007404	CCG	2	6	2342252	2342257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_007404	CGC	2	6	2342325	2342330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_007404	CGG	2	6	2342386	2342391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_007404	T	7	7	2342403	2342409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_007404	C	6	6	2343185	2343190	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4120	NC_007404	T	6	6	2343237	2343242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_007404	GGA	2	6	2344579	2344584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_007404	GGAG	2	8	2346446	2346453	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_007404	GT	3	6	2349197	2349202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_007404	GTT	3	9	2349211	2349219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_007404	TCGC	2	8	2351868	2351875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_007404	CCG	2	6	2351890	2351895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_007404	CGC	2	6	2351902	2351907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_007404	TGAT	2	8	2351921	2351928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_007404	CGT	2	6	2351977	2351982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_007404	CGC	2	6	2351985	2351990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_007404	GGC	2	6	2351991	2351996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_007404	GCG	2	6	2352001	2352006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_007404	CTC	2	6	2353382	2353387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4134	NC_007404	TCCG	2	8	2353398	2353405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4223	NC_007404	CCG	2	6	2387500	2387505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4242	NC_007404	GC	3	6	2401122	2401127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4243	NC_007404	GCGCT	2	10	2401216	2401225	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4251	NC_007404	TCC	2	6	2402710	2402715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4252	NC_007404	C	6	6	2402714	2402719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4253	NC_007404	CGC	2	6	2402728	2402733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4254	NC_007404	GC	3	6	2402732	2402737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4255	NC_007404	CCGG	2	8	2402744	2402751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4256	NC_007404	CGCCA	2	10	2402752	2402761	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4257	NC_007404	GC	3	6	2402776	2402781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_007404	CTTG	2	8	2402814	2402821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4259	NC_007404	CTA	2	6	2402841	2402846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4261	NC_007404	A	6	6	2405458	2405463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_007404	GC	3	6	2414280	2414285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4263	NC_007404	GCC	2	6	2415276	2415281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4264	NC_007404	GC	3	6	2416081	2416086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4265	NC_007404	GC	3	6	2416124	2416129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4401	NC_007404	GAT	2	6	2527012	2527017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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