MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 5005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007404	CTT	2	6	2048137	2048142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_007404	CCG	2	6	2048143	2048148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_007404	CAAT	2	8	2048182	2048189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_007404	GCC	2	6	2048223	2048228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_007404	TCC	2	6	2048801	2048806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_007404	CG	3	6	2048852	2048857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_007404	CGA	2	6	2048877	2048882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_007404	AGC	2	6	2048921	2048926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_007404	GCCT	2	8	2049012	2049019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_007404	CA	3	6	2049029	2049034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_007404	G	6	6	2049113	2049118	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_007404	GGTC	2	8	2050132	2050139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_007404	AAG	2	6	2050197	2050202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_007404	GCAC	2	8	2050243	2050250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_007404	CGT	2	6	2050265	2050270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_007404	CCG	2	6	2050379	2050384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_007404	GCC	2	6	2051031	2051036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_007404	GCC	2	6	2051047	2051052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_007404	CGCTG	2	10	2051079	2051088	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3520	NC_007404	GTT	2	6	2052046	2052051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_007404	CCGCG	2	10	2052054	2052063	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3522	NC_007404	CGT	2	6	2052066	2052071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_007404	CGA	2	6	2052151	2052156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_007404	GAA	2	6	2052159	2052164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_007404	CAGCG	2	10	2052209	2052218	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3526	NC_007404	AAGCG	2	10	2052222	2052231	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3527	NC_007404	CGT	2	6	2052234	2052239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_007404	CCG	2	6	2052255	2052260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_007404	GC	3	6	2052343	2052348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_007404	TTG	2	6	2052352	2052357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_007404	GAA	2	6	2052365	2052370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_007404	AG	4	8	2052458	2052465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_007404	GCG	2	6	2052472	2052477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_007404	TCAA	2	8	2052492	2052499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_007404	CTT	2	6	2052523	2052528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_007404	AGG	2	6	2052534	2052539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_007404	CTCC	2	8	2053945	2053952	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3538	NC_007404	AACG	2	8	2053979	2053986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_007404	AAC	2	6	2054008	2054013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_007404	TGC	2	6	2054068	2054073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_007404	CGA	2	6	2054082	2054087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_007404	CGGC	2	8	2054090	2054097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_007404	GGA	2	6	2054741	2054746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_007404	GGC	2	6	2054790	2054795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_007404	CCA	2	6	2055441	2055446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_007404	ATGG	2	8	2055503	2055510	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_007404	A	6	6	2055582	2055587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_007404	TGG	2	6	2055599	2055604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_007404	GAC	2	6	2055628	2055633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_007404	GTT	2	6	2056187	2056192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_007404	T	7	7	2056224	2056230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_007404	TGC	2	6	2056275	2056280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_007404	GAT	2	6	2056375	2056380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_007404	AAT	2	6	2056411	2056416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_007404	TGCT	2	8	2056483	2056490	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_007404	TTG	2	6	2057135	2057140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_007404	TCA	2	6	2057196	2057201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_007404	TGT	2	6	2057379	2057384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_007404	GCA	2	6	2057391	2057396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_007404	CGC	2	6	2057422	2057427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_007404	GCC	2	6	2057659	2057664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_007404	GAA	2	6	2057695	2057700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_007404	GCC	2	6	2057711	2057716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_007404	GCCAC	2	10	2057777	2057786	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3565	NC_007404	ATG	2	6	2057788	2057793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_007404	GCG	2	6	2057800	2057805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_007404	AGG	2	6	2057842	2057847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_007404	CTG	2	6	2058861	2058866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_007404	ACC	2	6	2061173	2061178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_007404	GAA	2	6	2061303	2061308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_007404	GGC	3	9	2063671	2063679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_007404	GCC	2	6	2063727	2063732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_007404	CCG	2	6	2063736	2063741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_007404	CG	3	6	2063751	2063756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_007404	AC	3	6	2063803	2063808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_007404	GGC	3	9	2063895	2063903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_007404	G	6	6	2063923	2063928	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_007404	T	6	6	2065657	2065662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_007404	GCCGA	2	10	2065801	2065810	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3580	NC_007404	CGA	2	6	2065839	2065844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_007404	GCC	2	6	2065861	2065866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_007404	CGG	2	6	2065868	2065873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_007404	GCCC	2	8	2065889	2065896	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3584	NC_007404	GCA	2	6	2065909	2065914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_007404	CTT	2	6	2065922	2065927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_007404	GCC	2	6	2065965	2065970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_007404	AACG	2	8	2065986	2065993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_007404	GCC	2	6	2066030	2066035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_007404	GCC	2	6	2069017	2069022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_007404	CGG	2	6	2069053	2069058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_007404	GC	3	6	2069114	2069119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_007404	C	6	6	2069197	2069202	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3593	NC_007404	GTG	2	6	2069233	2069238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_007404	CG	3	6	2069239	2069244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_007404	CGC	2	6	2069249	2069254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_007404	TTA	2	6	2069265	2069270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_007404	GC	3	6	2069295	2069300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_007404	CTG	2	6	2069306	2069311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_007404	TTA	2	6	2069364	2069369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_007404	TCC	2	6	2069397	2069402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_007404	TGA	2	6	2072462	2072467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_007404	AGGCCG	2	12	2072472	2072483	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_007404	GC	3	6	2072836	2072841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_007404	GCCG	2	8	2072851	2072858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_007404	GGCC	2	8	2072864	2072871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_007404	AGG	2	6	2073309	2073314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_007404	GCCCG	2	10	2073339	2073348	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3608	NC_007404	CG	4	8	2073350	2073357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_007404	CGC	2	6	2073367	2073372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_007404	AGG	2	6	2073415	2073420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_007404	CGAA	2	8	2073463	2073470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_007404	GCTGC	2	10	2073473	2073482	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3613	NC_007404	AGC	2	6	2073511	2073516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_007404	TTCG	2	8	2074260	2074267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_007404	A	8	8	2074277	2074284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_007404	CGC	2	6	2074285	2074290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_007404	GAC	2	6	2074946	2074951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_007404	TCG	2	6	2074978	2074983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_007404	CCCGG	2	10	2075019	2075028	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3620	NC_007404	CGG	2	6	2075995	2076000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_007404	TCG	2	6	2076002	2076007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_007404	AGA	2	6	2076064	2076069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_007404	GC	3	6	2076090	2076095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_007404	AGCC	2	8	2076178	2076185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_007404	CGAGT	2	10	2076205	2076214	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3626	NC_007404	GCC	2	6	2076222	2076227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_007404	TGG	2	6	2077775	2077780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_007404	TA	3	6	2077817	2077822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_007404	G	6	6	2077868	2077873	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_007404	GC	4	8	2077882	2077889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3631	NC_007404	GCA	3	9	2077895	2077903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_007404	AGG	2	6	2077915	2077920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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