MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 5005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007404	CG	3	6	1822180	1822185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_007404	TCGGCT	2	12	1822193	1822204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_007404	CGC	2	6	1822230	1822235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_007404	GCG	2	6	1822264	1822269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_007404	GCG	2	6	1822325	1822330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_007404	GC	3	6	1822338	1822343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_007404	GCGCG	2	10	1825307	1825316	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3008	NC_007404	GGC	2	6	1825330	1825335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_007404	AGG	2	6	1825424	1825429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_007404	CGAG	2	8	1830384	1830391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_007404	GCG	2	6	1830836	1830841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_007404	CCG	2	6	1830859	1830864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_007404	CCGG	2	8	1833389	1833396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_007404	TCG	2	6	1833405	1833410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_007404	CG	3	6	1833417	1833422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_007404	CG	3	6	1833452	1833457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_007404	GCAG	2	8	1840018	1840025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_007404	TCT	2	6	1840033	1840038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_007404	GAC	2	6	1840047	1840052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_007404	GC	3	6	1840075	1840080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_007404	CGGCG	2	10	1840130	1840139	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3022	NC_007404	GCCG	2	8	1842302	1842309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_007404	CGG	2	6	1842343	1842348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_007404	GCAGG	2	10	1845551	1845560	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_007404	CTA	2	6	1845577	1845582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_007404	CTG	2	6	1845650	1845655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_007404	GGC	2	6	1845657	1845662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_007404	GAG	2	6	1845695	1845700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_007404	A	6	6	1845701	1845706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_007404	CTC	2	6	1846054	1846059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_007404	GCA	2	6	1846065	1846070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_007404	A	6	6	1846070	1846075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_007404	TTTTGT	2	12	1846101	1846112	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_007404	T	6	6	1846133	1846138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_007404	CAG	2	6	1846203	1846208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_007404	ACG	2	6	1846209	1846214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_007404	CG	3	6	1846213	1846218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_007404	GCC	2	6	1847539	1847544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_007404	TCG	2	6	1847585	1847590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_007404	ATTC	2	8	1847644	1847651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_007404	GACC	2	8	1847719	1847726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_007404	GCCC	2	8	1847768	1847775	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3043	NC_007404	ACC	2	6	1847789	1847794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_007404	CGC	2	6	1847860	1847865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_007404	CGC	2	6	1853493	1853498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_007404	ATG	2	6	1858322	1858327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_007404	AGC	2	6	1858340	1858345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_007404	CGT	2	6	1858408	1858413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_007404	GGA	2	6	1858415	1858420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_007404	GCG	2	6	1858426	1858431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_007404	GCA	2	6	1859234	1859239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_007404	AGCG	2	8	1859278	1859285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3053	NC_007404	GCTC	2	8	1859307	1859314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_007404	CGT	2	6	1859689	1859694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_007404	GAA	2	6	1859706	1859711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_007404	AAAT	2	8	1859772	1859779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_007404	CGT	2	6	1859845	1859850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_007404	A	6	6	1859856	1859861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_007404	CTA	2	6	1859953	1859958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_007404	GGT	2	6	1860004	1860009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_007404	GTC	2	6	1860024	1860029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_007404	GAA	2	6	1860152	1860157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_007404	GTT	2	6	1860166	1860171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_007404	AC	4	8	1860184	1860191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_007404	CGT	2	6	1860286	1860291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_007404	CGA	2	6	1860298	1860303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_007404	AGC	2	6	1860467	1860472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_007404	ACG	2	6	1860521	1860526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_007404	TGA	2	6	1860601	1860606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_007404	GGA	2	6	1860651	1860656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_007404	ACC	2	6	1860716	1860721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_007404	CTT	2	6	1860777	1860782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_007404	AGA	2	6	1860821	1860826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_007404	CTC	2	6	1860835	1860840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_007404	GAG	2	6	1860854	1860859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_007404	CCA	2	6	1860879	1860884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_007404	ACG	2	6	1860951	1860956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_007404	GCC	2	6	1861209	1861214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3079	NC_007404	TTA	2	6	1861324	1861329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_007404	CCA	2	6	1861341	1861346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_007404	TC	3	6	1861453	1861458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_007404	C	6	6	1861603	1861608	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3083	NC_007404	CTC	2	6	1861913	1861918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_007404	GAC	2	6	1861988	1861993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_007404	CTTT	2	8	1862014	1862021	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3086	NC_007404	GCT	2	6	1862030	1862035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_007404	GTT	2	6	1862120	1862125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_007404	TGTC	2	8	1862156	1862163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_007404	GTGA	2	8	1862252	1862259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_007404	GAG	2	6	1862288	1862293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_007404	ATC	2	6	1862419	1862424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_007404	CTA	2	6	1862446	1862451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_007404	TCGCTT	2	12	1862468	1862479	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_007404	GCA	2	6	1862609	1862614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_007404	CTT	2	6	1862627	1862632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_007404	TCGC	2	8	1862646	1862653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_007404	GCTC	2	8	1862658	1862665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_007404	ATGC	2	8	1862712	1862719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_007404	CTCCC	2	10	1862739	1862748	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3100	NC_007404	GGA	2	6	1862815	1862820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_007404	C	6	6	1862825	1862830	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3102	NC_007404	TCGC	2	8	1862983	1862990	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_007404	ACT	2	6	1862992	1862997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_007404	ACCC	2	8	1863064	1863071	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3105	NC_007404	CCA	2	6	1863207	1863212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_007404	ATC	2	6	1863264	1863269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_007404	CAC	2	6	1863301	1863306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_007404	TCA	2	6	1863324	1863329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_007404	TCA	2	6	1863387	1863392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_007404	CTT	2	6	1863405	1863410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_007404	CA	3	6	1863483	1863488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_007404	CA	3	6	1863493	1863498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_007404	GTG	2	6	1863552	1863557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_007404	CGA	2	6	1863577	1863582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_007404	TG	3	6	1863673	1863678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_007404	CGG	2	6	1863689	1863694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_007404	GCT	2	6	1863710	1863715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_007404	CCA	2	6	1863755	1863760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_007404	TGG	2	6	1863768	1863773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_007404	CTGG	2	8	1863776	1863783	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3121	NC_007404	TCCA	2	8	1863856	1863863	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_007404	CTT	2	6	1863873	1863878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_007404	GCA	2	6	1863905	1863910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_007404	AGG	2	6	1863924	1863929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_007404	CCT	2	6	1864006	1864011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_007404	CTAC	2	8	1864022	1864029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_007404	GT	3	6	1864065	1864070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_007404	TCC	2	6	1864285	1864290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_007404	CACGA	2	10	1864379	1864388	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3130	NC_007404	GAC	2	6	1864392	1864397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_007404	GCA	2	6	1864404	1864409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_007404	GGTA	2	8	1864471	1864478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_007404	CAT	2	6	1864509	1864514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3135	NC_007404	TCC	2	6	1864746	1864751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3137	NC_007404	GCT	2	6	1864936	1864941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_007404	CTT	2	6	1864961	1864966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3139	NC_007404	CTG	2	6	1864967	1864972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3141	NC_007404	CTT	2	6	1865045	1865050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_007404	CTG	2	6	1865104	1865109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3144	NC_007404	TCG	2	6	1865179	1865184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3154	NC_007404	CAA	2	6	1865633	1865638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3155	NC_007404	CAC	2	6	1865639	1865644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3161	NC_007404	CGAG	2	8	1867312	1867319	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3162	NC_007404	GGC	2	6	1867353	1867358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3165	NC_007404	CG	3	6	1868129	1868134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3166	NC_007404	CGCGA	2	10	1869685	1869694	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3172	NC_007404	GC	3	6	1873622	1873627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3173	NC_007404	GGGC	2	8	1873630	1873637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3174	NC_007404	GCC	2	6	1874673	1874678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3245	NC_007404	CGA	2	6	1907997	1908002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3248	NC_007404	GAC	2	6	1911283	1911288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3249	NC_007404	TTG	2	6	1911362	1911367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3252	NC_007404	GC	3	6	1916869	1916874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3253	NC_007404	GC	3	6	1916903	1916908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_007404	CG	3	6	1918961	1918966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3255	NC_007404	GC	3	6	1918993	1918998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3256	NC_007404	GGC	2	6	1919002	1919007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3258	NC_007404	GC	3	6	1919024	1919029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3259	NC_007404	GAG	2	6	1919079	1919084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_007404	AG	3	6	1919087	1919092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3262	NC_007404	CG	3	6	1919193	1919198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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