MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 5005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007404	TGGGT	2	10	605797	605806	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_007404	GC	3	6	608560	608565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_007404	GGC	2	6	608569	608574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_007404	A	6	6	608583	608588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_007404	GGC	3	9	608615	608623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_007404	CG	4	8	608628	608635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_007404	A	7	7	611056	611062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_007404	GCCG	2	8	611086	611093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_007404	GGA	2	6	611101	611106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_007404	ATT	2	6	611107	611112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_007404	CCG	2	6	611156	611161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_007404	ACG	2	6	615724	615729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_007404	GCG	2	6	615732	615737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_007404	CTT	2	6	615740	615745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_007404	AAC	2	6	615808	615813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_007404	TGC	2	6	615824	615829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_007404	CACG	2	8	616815	616822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_007404	GCT	2	6	616836	616841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_007404	CCG	2	6	617852	617857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_007404	T	6	6	619218	619223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_007404	GC	3	6	619685	619690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_007404	GCCC	2	8	623702	623709	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1023	NC_007404	GCC	2	6	626787	626792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_007404	GCCG	2	8	626798	626805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_007404	CGGC	2	8	628531	628538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_007404	G	6	6	628851	628856	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1030	NC_007404	GCG	2	6	628982	628987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1033	NC_007404	GCG	2	6	630138	630143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_007404	CGG	3	9	630144	630152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_007404	CG	3	6	630154	630159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1042	NC_007404	AG	3	6	636237	636242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_007404	GAA	2	6	636262	636267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1057	NC_007404	GC	3	6	660352	660357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_007404	CGGG	2	8	661547	661554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_007404	CTG	2	6	665605	665610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1061	NC_007404	GGGC	3	12	673594	673605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1064	NC_007404	GC	3	6	673659	673664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_007404	A	6	6	673674	673679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_007404	CCGC	2	8	675081	675088	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1070	NC_007404	CG	3	6	679252	679257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_007404	CCG	2	6	679273	679278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_007404	GGTC	2	8	681031	681038	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_007404	TGAT	2	8	682479	682486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_007404	GC	3	6	684239	684244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_007404	CG	4	8	684265	684272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_007404	GC	3	6	684296	684301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1098	NC_007404	GAGGT	2	10	684528	684537	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_007404	CG	3	6	684637	684642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_007404	CGA	2	6	684646	684651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_007404	AGCGC	2	10	684682	684691	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1102	NC_007404	GC	3	6	684705	684710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_007404	GCCGT	2	10	684747	684756	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1104	NC_007404	TGC	2	6	684763	684768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1106	NC_007404	CTG	2	6	684876	684881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_007404	GCGTC	2	10	684896	684905	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1108	NC_007404	CGAAGG	2	12	684943	684954	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1109	NC_007404	CGC	2	6	685031	685036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_007404	CG	3	6	685043	685048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_007404	GCG	2	6	685056	685061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_007404	CG	3	6	685069	685074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_007404	CGTGT	2	10	685079	685088	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_007404	TCG	3	9	685176	685184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_007404	TGA	2	6	685237	685242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_007404	GCA	3	9	685276	685284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_007404	GC	3	6	687643	687648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_007404	GCG	2	6	687676	687681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_007404	CGG	2	6	687682	687687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_007404	GC	3	6	687700	687705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_007404	CCT	2	6	687719	687724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_007404	C	6	6	687737	687742	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1125	NC_007404	C	7	7	687747	687753	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1127	NC_007404	CG	4	8	689328	689335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_007404	ACG	2	6	689369	689374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_007404	GCG	2	6	689407	689412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_007404	CTC	2	6	689954	689959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_007404	GTGG	2	8	689961	689968	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_007404	G	6	6	690506	690511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_007404	CGG	2	6	691027	691032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_007404	CGG	2	6	691051	691056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_007404	GC	3	6	691087	691092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_007404	TGG	2	6	691121	691126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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