MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 5005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007404	CAA	2	6	363311	363316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_007404	CGG	2	6	363329	363334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_007404	TTG	2	6	363341	363346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_007404	GGC	2	6	364959	364964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_007404	CAG	2	6	365027	365032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_007404	CAT	2	6	365035	365040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_007404	T	6	6	365085	365090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007404	GCT	2	6	365170	365175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_007404	CGC	2	6	365182	365187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_007404	TCC	2	6	365192	365197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_007404	CCA	2	6	365321	365326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_007404	AGCC	2	8	365361	365368	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
513	NC_007404	CGT	2	6	365426	365431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_007404	GCAA	2	8	365496	365503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
515	NC_007404	T	6	6	365518	365523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007404	TAAT	2	8	365537	365544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_007404	GCG	2	6	365613	365618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_007404	GCG	2	6	367311	367316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_007404	GGC	2	6	367653	367658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_007404	AACG	2	8	367688	367695	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
521	NC_007404	TTCCG	2	10	367742	367751	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
522	NC_007404	ATAA	2	8	367770	367777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_007404	GTC	2	6	367797	367802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_007404	GGC	2	6	367851	367856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_007404	CG	3	6	369745	369750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_007404	TTCG	2	8	369784	369791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
527	NC_007404	G	6	6	369839	369844	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
528	NC_007404	GGC	2	6	370638	370643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_007404	C	6	6	370681	370686	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
530	NC_007404	CGC	2	6	370713	370718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_007404	G	6	6	370793	370798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007404	CAC	2	6	370809	370814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_007404	CGC	2	6	371720	371725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_007404	GC	3	6	373222	373227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_007404	C	6	6	373236	373241	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
536	NC_007404	G	6	6	373250	373255	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007404	GCGTTT	2	12	373293	373304	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
538	NC_007404	GGC	2	6	373317	373322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_007404	GAT	2	6	373341	373346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007404	GAGGC	2	10	375059	375068	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
541	NC_007404	G	6	6	385558	385563	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
542	NC_007404	T	6	6	385600	385605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007404	A	6	6	385689	385694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007404	TGTC	2	8	387705	387712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_007404	C	7	7	387782	387788	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
546	NC_007404	AGG	2	6	393664	393669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007404	T	8	8	393732	393739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_007404	GATCT	2	10	393794	393803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
549	NC_007404	GTC	2	6	393846	393851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_007404	GC	3	6	393886	393891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_007404	GCCCA	2	10	393917	393926	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
552	NC_007404	GCC	2	6	393935	393940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_007404	CCA	2	6	394308	394313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_007404	TAA	2	6	394347	394352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_007404	GGC	2	6	394459	394464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_007404	CCA	2	6	394874	394879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_007404	TGG	2	6	395049	395054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_007404	ACCGA	2	10	395093	395102	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
559	NC_007404	ACGCT	2	10	395452	395461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
560	NC_007404	T	6	6	395484	395489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_007404	TGCG	2	8	395505	395512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
562	NC_007404	CGCGT	2	10	395575	395584	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
563	NC_007404	TG	3	6	396111	396116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007404	TA	3	6	396134	396139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007404	TCG	2	6	396146	396151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_007404	TGCG	2	8	396180	396187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
567	NC_007404	ATCCT	2	10	396232	396241	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
568	NC_007404	CGG	2	6	398963	398968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_007404	CTCC	2	8	398977	398984	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
570	NC_007404	GACG	2	8	398994	399001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
571	NC_007404	GCC	2	6	399759	399764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_007404	CGC	2	6	399788	399793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_007404	CCA	2	6	400242	400247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_007404	GCGGG	2	10	400248	400257	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
575	NC_007404	TTCG	2	8	400755	400762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
576	NC_007404	CG	3	6	400773	400778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_007404	CG	3	6	400785	400790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_007404	CA	3	6	400821	400826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_007404	CT	3	6	400839	400844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_007404	ACA	2	6	401534	401539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_007404	TCA	2	6	401557	401562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_007404	TTC	2	6	401575	401580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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584	NC_007404	TGA	2	6	401678	401683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_007404	TCACCT	2	12	401716	401727	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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591	NC_007404	TTGC	2	8	401953	401960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
592	NC_007404	TATT	2	8	401967	401974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007404	GAG	2	6	402040	402045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_007404	ACG	2	6	402049	402054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_007404	CATC	2	8	405158	405165	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_007404	AG	3	6	405166	405171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_007404	GCGG	2	8	409159	409166	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
598	NC_007404	CAGGA	2	10	411146	411155	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
599	NC_007404	GGCG	2	8	412013	412020	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
600	NC_007404	CGG	2	6	412075	412080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_007404	GTCG	2	8	412098	412105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
602	NC_007404	CTTG	2	8	412141	412148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_007404	CCA	2	6	412188	412193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_007404	CCAG	2	8	415451	415458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_007404	GCC	2	6	415471	415476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_007404	GGC	2	6	415481	415486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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608	NC_007404	GC	3	6	416522	416527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_007404	CAT	2	6	416538	416543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_007404	GAG	2	6	416556	416561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007404	CA	3	6	418954	418959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_007404	TGGG	2	8	418979	418986	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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615	NC_007404	GCGG	2	8	419090	419097	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
616	NC_007404	TG	3	6	419224	419229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_007404	TAA	2	6	419241	419246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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620	NC_007404	CATG	2	8	420710	420717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_007404	GCCCG	2	10	420719	420728	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
622	NC_007404	CA	3	6	420836	420841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_007404	CGG	2	6	421775	421780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_007404	GAG	2	6	421798	421803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_007404	CGC	2	6	422991	422996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_007404	GGC	2	6	423006	423011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_007404	CGGC	2	8	423043	423050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_007404	CGG	2	6	423091	423096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_007404	CTC	2	6	423128	423133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_007404	CAG	2	6	423172	423177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_007404	GCC	2	6	423206	423211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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633	NC_007404	ACA	2	6	423798	423803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_007404	T	7	7	423809	423815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_007404	CAT	2	6	423824	423829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_007404	GCG	2	6	424246	424251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_007404	GCC	2	6	424263	424268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_007404	GT	3	6	424310	424315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_007404	AGC	2	6	424341	424346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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