MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermobifida fusca YX chromosome

Total Repeats: 12378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007333	CGT	2	6	85	90	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007333	GCC	2	6	125	130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_007333	GCC	2	6	189	194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_007333	CACT	2	8	2130	2137	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007333	CGG	2	6	2141	2146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007333	TAC	2	6	2495	2500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007333	AG	3	6	2511	2516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007333	CGT	2	6	2634	2639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007333	GTG	2	6	2665	2670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007333	CCGT	2	8	2715	2722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007333	GTCG	2	8	2757	2764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007333	GTC	2	6	2775	2780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007333	AG	3	6	2787	2792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007333	CAC	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007333	GAC	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007333	GCC	2	6	4918	4923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_007333	CG	3	6	4952	4957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007333	GCC	2	6	4980	4985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007333	CAAC	2	8	6678	6685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007333	CGTT	3	12	6751	6762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007333	GCA	2	6	6888	6893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007333	GT	3	6	6937	6942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007333	CCG	2	6	6943	6948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007333	CCA	2	6	8968	8973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007333	CG	3	6	11592	11597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007333	GCC	2	6	11606	11611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007333	CCA	2	6	11616	11621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007333	TCA	2	6	11642	11647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007333	TTCGT	2	10	11654	11663	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007333	TCCTG	2	10	11676	11685	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_007333	GAA	2	6	12493	12498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007333	CGC	2	6	12741	12746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_007333	CAC	2	6	12802	12807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007333	TCA	2	6	12818	12823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007333	GCA	2	6	12851	12856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007333	GGC	2	6	12870	12875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007333	CTTC	2	8	12896	12903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007333	GAA	2	6	12934	12939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007333	GCC	2	6	12960	12965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007333	CCG	2	6	13037	13042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_007333	TGC	2	6	13100	13105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007333	TTCCT	2	10	13121	13130	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_007333	AGG	2	6	13138	13143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007333	TGG	2	6	13176	13181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007333	GGC	2	6	13212	13217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007333	CGG	2	6	13219	13224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007333	TCC	2	6	13321	13326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007333	CA	3	6	13362	13367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007333	GC	3	6	13405	13410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007333	CAG	2	6	13502	13507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007333	CCG	2	6	13522	13527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007333	AGC	2	6	13541	13546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007333	ACC	2	6	13547	13552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007333	TG	3	6	13717	13722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007333	CTT	2	6	13727	13732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007333	CTG	2	6	15890	15895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007333	GCA	2	6	18221	18226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007333	GTG	2	6	18990	18995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007333	TTG	2	6	19012	19017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007333	G	7	7	19017	19023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007333	CTG	2	6	19065	19070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007333	G	6	6	19078	19083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007333	TGGG	2	8	19131	19138	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007333	GTC	2	6	21513	21518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007333	GA	3	6	21539	21544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007333	AAGGA	2	10	21545	21554	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007333	GGC	2	6	21556	21561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007333	GCC	2	6	22906	22911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_007333	TAG	2	6	22999	23004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007333	CAG	2	6	23053	23058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007333	TG	3	6	23066	23071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007333	GGA	2	6	23132	23137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007333	CTC	2	6	23147	23152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_007333	GCT	2	6	23153	23158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007333	TCC	2	6	23190	23195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007333	TGT	3	9	23236	23244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007333	TCC	2	6	23285	23290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_007333	TG	3	6	23305	23310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007333	CGGG	2	8	23316	23323	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007333	GCCC	2	8	23324	23331	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_007333	TGG	2	6	23347	23352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007333	GCT	2	6	23354	23359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007333	AGC	2	6	23369	23374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007333	ACC	2	6	24827	24832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_007333	CCTT	2	8	24891	24898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007333	GTG	2	6	24902	24907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007333	G	7	7	25681	25687	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007333	CAG	2	6	27054	27059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007333	GACC	2	8	27092	27099	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007333	GGTC	2	8	27107	27114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007333	GCA	2	6	27183	27188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007333	GT	3	6	27210	27215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007333	GCT	2	6	27243	27248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007333	GTG	2	6	27260	27265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007333	CGG	2	6	27302	27307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007333	GGGCG	2	10	27318	27327	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007333	GGT	2	6	27328	27333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007333	CTTG	2	8	27343	27350	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007333	CCTT	2	8	27433	27440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007333	GCA	2	6	27453	27458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007333	CG	3	6	27480	27485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007333	CTC	2	6	28599	28604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_007333	AG	3	6	28613	28618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007333	GTG	2	6	28624	28629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007333	GCGG	2	8	28665	28672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007333	ACC	2	6	28704	28709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_007333	G	6	6	28729	28734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007333	GTG	2	6	28739	28744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007333	ATT	2	6	28780	28785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007333	CAT	2	6	28798	28803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007333	TAAAAC	2	12	28924	28935	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007333	GAAA	2	8	28968	28975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007333	CCCAG	2	10	29021	29030	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_007333	TCG	2	6	29060	29065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007333	CAC	2	6	29077	29082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007333	CGC	2	6	29097	29102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_007333	CTC	2	6	29104	29109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007333	GCA	2	6	29156	29161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007333	GCAG	2	8	29163	29170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007333	CCA	2	6	29199	29204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007333	CGC	3	9	29215	29223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_007333	GCC	2	6	29230	29235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_007333	GCC	2	6	29268	29273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_007333	TCG	2	6	29326	29331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007333	CGG	2	6	29357	29362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007333	GCA	2	6	29366	29371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007333	GC	3	6	29404	29409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007333	CAC	2	6	29418	29423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007333	CCGG	2	8	29432	29439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007333	TCG	2	6	29507	29512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007333	TCG	2	6	29539	29544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007333	CGG	2	6	29551	29556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007333	GTG	2	6	29590	29595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007333	CA	3	6	29672	29677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007333	CCA	2	6	29696	29701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007333	GTGC	2	8	29713	29720	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007333	GCTGTC	2	12	29735	29746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007333	CAAG	2	8	29890	29897	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007333	GAA	2	6	30479	30484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007333	CGC	2	6	31023	31028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_007333	ACC	2	6	31504	31509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_007333	TCG	2	6	31550	31555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007333	CGG	2	6	31560	31565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007333	AGCAGG	2	12	31768	31779	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_007333	TGA	2	6	31796	31801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_007333	AG	3	6	31959	31964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_007333	CGG	2	6	32082	32087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_007333	CGC	2	6	32112	32117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_007333	GA	3	6	32157	32162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_007333	CGG	2	6	34980	34985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_007333	CAG	2	6	35163	35168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_007333	TCG	2	6	36538	36543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_007333	CAG	2	6	37768	37773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_007333	CCG	2	6	37800	37805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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430	NC_007333	CG	3	6	104348	104353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
431	NC_007333	GCT	2	6	104607	104612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_007333	TGG	2	6	104726	104731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
433	NC_007333	TCA	2	6	104749	104754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_007333	GAG	3	9	104770	104778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_007333	GGC	2	6	107674	107679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_007333	CGA	2	6	107699	107704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_007333	ACC	2	6	108215	108220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
443	NC_007333	GCC	2	6	108223	108228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
444	NC_007333	CTG	2	6	108241	108246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_007333	CG	3	6	108397	108402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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453	NC_007333	GGC	2	6	108487	108492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_007333	GCC	2	6	108517	108522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_007333	AG	3	6	109913	109918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
462	NC_007333	GAG	2	6	109930	109935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
463	NC_007333	CTG	2	6	109954	109959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_007333	CAG	2	6	109978	109983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_007333	GC	3	6	110728	110733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
467	NC_007333	CTCTG	2	10	110763	110772	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
468	NC_007333	TGCGG	2	10	111906	111915	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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470	NC_007333	CTC	2	6	112136	112141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
471	NC_007333	GAG	2	6	112166	112171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
472	NC_007333	GGGCC	2	10	112202	112211	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
473	NC_007333	CGGCA	2	10	112281	112290	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
474	NC_007333	GGC	2	6	112365	112370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_007333	AAGG	2	8	112457	112464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
476	NC_007333	T	6	6	112518	112523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_007333	GAC	2	6	113776	113781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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479	NC_007333	AC	3	6	113843	113848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
480	NC_007333	CGGG	2	8	113853	113860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
481	NC_007333	CAG	2	6	115006	115011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_007333	GTG	2	6	115469	115474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
483	NC_007333	CCA	2	6	115507	115512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
484	NC_007333	CAGG	2	8	115524	115531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_007333	CGG	2	6	115621	115626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
486	NC_007333	GTG	2	6	116552	116557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
487	NC_007333	GCA	2	6	116622	116627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
488	NC_007333	CAG	2	6	117175	117180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_007333	CCT	2	6	119007	119012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
490	NC_007333	GCGG	2	8	119146	119153	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
491	NC_007333	GGA	2	6	119159	119164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
492	NC_007333	CTG	2	6	119176	119181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
493	NC_007333	GC	3	6	119222	119227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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