MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermobifida fusca YX chromosome

Total Repeats: 12378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007333	CGC	2	6	246413	246418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_007333	GCA	2	6	246420	246425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_007333	GCT	2	6	246470	246475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_007333	G	6	6	246516	246521	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_007333	GCC	2	6	246566	246571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_007333	TGCGTA	2	12	246601	246612	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1007	NC_007333	GCC	2	6	246637	246642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_007333	GCC	2	6	246670	246675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_007333	CCG	2	6	246676	246681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_007333	CGC	2	6	246682	246687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_007333	CTC	2	6	246699	246704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_007333	GGC	3	9	246709	246717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_007333	GGC	2	6	246720	246725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_007333	TG	3	6	246741	246746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_007333	CA	3	6	246755	246760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_007333	CA	3	6	246781	246786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_007333	GCCTT	2	10	246799	246808	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_007333	ATC	2	6	246916	246921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_007333	TGC	2	6	246958	246963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_007333	GGT	2	6	246968	246973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_007333	ATC	2	6	246977	246982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_007333	AC	3	6	246999	247004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_007333	CGT	2	6	247346	247351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_007333	CTTC	2	8	247418	247425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_007333	TC	3	6	247956	247961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_007333	AGC	2	6	247986	247991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_007333	CGC	2	6	248029	248034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_007333	CAGTG	2	10	248129	248138	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1029	NC_007333	GCGG	2	8	248140	248147	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_007333	CG	4	8	248161	248168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_007333	GCG	2	6	248176	248181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_007333	G	6	6	248347	248352	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_007333	CTG	2	6	250674	250679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_007333	TC	3	6	251552	251557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_007333	CCG	2	6	252928	252933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_007333	GGA	2	6	252965	252970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_007333	AGGC	2	8	253030	253037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_007333	C	6	6	254745	254750	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1039	NC_007333	GGC	2	6	254904	254909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_007333	CCG	2	6	256245	256250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_007333	GGT	2	6	256678	256683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_007333	AGGG	2	8	256706	256713	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_007333	CGG	3	9	256714	256722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_007333	C	6	6	256742	256747	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1045	NC_007333	GGA	2	6	256907	256912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_007333	TAC	2	6	258558	258563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_007333	T	6	6	258600	258605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_007333	GGC	2	6	258614	258619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_007333	GGGC	2	8	258624	258631	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_007333	GT	3	6	259146	259151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_007333	GCT	2	6	259512	259517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_007333	CGG	2	6	259533	259538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_007333	CT	3	6	259964	259969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_007333	GAC	2	6	260737	260742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_007333	GT	3	6	260765	260770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_007333	GTGC	2	8	260776	260783	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_007333	TGA	2	6	260883	260888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_007333	GA	3	6	260887	260892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_007333	GTCT	2	8	260936	260943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_007333	GAC	2	6	260968	260973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_007333	GCCG	2	8	260978	260985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_007333	CGGC	2	8	261008	261015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_007333	GGC	2	6	261022	261027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_007333	GGT	2	6	261070	261075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_007333	CG	3	6	261077	261082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_007333	GGC	2	6	261083	261088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_007333	AGC	2	6	261144	261149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_007333	GCTT	2	8	261200	261207	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_007333	AAG	2	6	261221	261226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_007333	CGCA	2	8	261763	261770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_007333	TCA	2	6	261874	261879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_007333	GCA	2	6	262724	262729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_007333	CCG	2	6	262730	262735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_007333	CGG	2	6	262752	262757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_007333	CGC	2	6	262800	262805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_007333	GTG	2	6	262886	262891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_007333	GCC	3	9	262930	262938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_007333	GCC	2	6	262963	262968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_007333	GGA	2	6	262974	262979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_007333	GA	3	6	266765	266770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_007333	CG	3	6	268675	268680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_007333	GCC	2	6	268686	268691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_007333	CTG	2	6	268716	268721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_007333	TG	3	6	270332	270337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_007333	TCCC	2	8	270371	270378	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1086	NC_007333	GCG	2	6	270868	270873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_007333	GGA	2	6	270889	270894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_007333	CAG	2	6	270907	270912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_007333	TCG	2	6	270931	270936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_007333	CCGAT	2	10	272836	272845	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1091	NC_007333	CAA	2	6	272898	272903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_007333	GCTG	2	8	272915	272922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_007333	ATC	2	6	272959	272964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_007333	CACC	2	8	272989	272996	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1095	NC_007333	CGG	2	6	272998	273003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_007333	CCG	2	6	273014	273019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_007333	GGC	3	9	274125	274133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_007333	ACG	2	6	274149	274154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_007333	TGC	2	6	275238	275243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_007333	CGGC	2	8	275252	275259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_007333	GT	3	6	275301	275306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_007333	GCG	2	6	276489	276494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_007333	G	6	6	276514	276519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_007333	GC	3	6	276528	276533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_007333	AC	3	6	276535	276540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_007333	CCGG	2	8	276551	276558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_007333	TCC	2	6	277709	277714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_007333	GCCC	2	8	277791	277798	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1109	NC_007333	CTG	2	6	277800	277805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_007333	CAC	2	6	277835	277840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_007333	GC	3	6	278578	278583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_007333	GC	3	6	278689	278694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_007333	CA	3	6	279522	279527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_007333	CG	4	8	279579	279586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_007333	GGC	2	6	279597	279602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_007333	TCG	2	6	279614	279619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_007333	TCA	2	6	279621	279626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_007333	TG	3	6	279652	279657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_007333	CAC	2	6	281925	281930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_007333	GTT	2	6	281961	281966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_007333	GTC	3	9	282993	283001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_007333	GAG	2	6	283052	283057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_007333	GAG	2	6	283267	283272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_007333	GGA	2	6	283316	283321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_007333	AGG	2	6	283486	283491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_007333	GGC	2	6	284650	284655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_007333	GCG	2	6	285903	285908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_007333	G	6	6	285908	285913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_007333	GAA	2	6	286441	286446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_007333	TCC	2	6	286452	286457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_007333	ACC	2	6	286475	286480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_007333	CAA	2	6	286481	286486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_007333	CCCA	2	8	286545	286552	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1134	NC_007333	CA	3	6	286557	286562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1136	NC_007333	ATT	2	6	286650	286655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1402	NC_007333	GCG	2	6	406958	406963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1403	NC_007333	TCCCA	2	10	406983	406992	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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