MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 2474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_006461	CCT	2	6	1489138	1489143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2003	NC_006461	C	6	6	1494884	1494889	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2004	NC_006461	C	7	7	1495956	1495962	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2005	NC_006461	G	6	6	1496833	1496838	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_006461	CGC	2	6	1499535	1499540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_006461	CCG	2	6	1500811	1500816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_006461	CCT	2	6	1502389	1502394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2009	NC_006461	ACC	2	6	1504925	1504930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2010	NC_006461	CTC	2	6	1512859	1512864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_006461	C	6	6	1512923	1512928	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2012	NC_006461	CGG	2	6	1512934	1512939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_006461	CCCA	2	8	1512957	1512964	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2014	NC_006461	GCG	2	6	1520433	1520438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_006461	GGGA	2	8	1522630	1522637	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_006461	AGG	2	6	1524889	1524894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_006461	TCCC	2	8	1529338	1529345	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2018	NC_006461	CTT	2	6	1529368	1529373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_006461	GGCG	2	8	1529385	1529392	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2020	NC_006461	C	6	6	1529402	1529407	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2021	NC_006461	GCG	2	6	1532101	1532106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_006461	G	6	6	1532118	1532123	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_006461	G	6	6	1534572	1534577	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_006461	C	9	9	1536638	1536646	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2025	NC_006461	G	6	6	1536659	1536664	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2038	NC_006461	G	7	7	1555790	1555796	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2043	NC_006461	C	6	6	1559046	1559051	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2044	NC_006461	AAAG	2	8	1561936	1561943	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_006461	G	7	7	1563979	1563985	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2062	NC_006461	C	6	6	1583591	1583596	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2063	NC_006461	C	7	7	1584605	1584611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2064	NC_006461	TCC	2	6	1589193	1589198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2066	NC_006461	TCC	2	6	1592322	1592327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2112	NC_006461	GT	3	6	1633494	1633499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_006461	CGT	2	6	1633531	1633536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2115	NC_006461	CGG	2	6	1633603	1633608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_006461	GAC	2	6	1633657	1633662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2121	NC_006461	GC	3	6	1633896	1633901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2134	NC_006461	AC	3	6	1634507	1634512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2242	NC_006461	GA	4	8	1683330	1683337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2249	NC_006461	AAGG	2	8	1697629	1697636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2252	NC_006461	GCG	2	6	1697690	1697695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2254	NC_006461	TAGGA	2	10	1708685	1708694	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2255	NC_006461	C	6	6	1716978	1716983	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2257	NC_006461	GGC	2	6	1718400	1718405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2264	NC_006461	GGA	2	6	1724880	1724885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2265	NC_006461	CCT	2	6	1728088	1728093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2400	NC_006461	GAC	2	6	1800043	1800048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2401	NC_006461	GCCCC	2	10	1800065	1800074	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2402	NC_006461	GAG	2	6	1800091	1800096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2403	NC_006461	G	6	6	1800096	1800101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2404	NC_006461	TCC	2	6	1800119	1800124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2405	NC_006461	GGC	2	6	1800141	1800146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2406	NC_006461	C	6	6	1800157	1800162	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2407	NC_006461	CCCG	2	8	1800195	1800202	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2408	NC_006461	GAG	2	6	1800211	1800216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2409	NC_006461	ACC	2	6	1800284	1800289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2410	NC_006461	C	6	6	1800288	1800293	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2411	NC_006461	G	7	7	1800313	1800319	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2412	NC_006461	GTC	2	6	1800322	1800327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2414	NC_006461	GC	3	6	1800388	1800393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2415	NC_006461	CGCC	2	8	1800396	1800403	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2416	NC_006461	CTC	2	6	1801389	1801394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2417	NC_006461	A	6	6	1801478	1801483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2418	NC_006461	A	6	6	1801499	1801504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2419	NC_006461	CGGCT	2	10	1801606	1801615	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2420	NC_006461	CGC	2	6	1801648	1801653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2421	NC_006461	CGG	2	6	1801732	1801737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2422	NC_006461	GAC	2	6	1801764	1801769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2423	NC_006461	CCT	2	6	1801840	1801845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2424	NC_006461	CCCTGG	2	12	1802479	1802490	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2425	NC_006461	ACG	2	6	1802512	1802517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2426	NC_006461	GCC	2	6	1802526	1802531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2427	NC_006461	AAT	2	6	1806001	1806006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2428	NC_006461	GGA	2	6	1806928	1806933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2429	NC_006461	CTG	2	6	1806948	1806953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2430	NC_006461	AAT	2	6	1807033	1807038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2431	NC_006461	CTC	3	9	1807070	1807078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2432	NC_006461	GGA	2	6	1807105	1807110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2433	NC_006461	CGC	2	6	1807117	1807122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2434	NC_006461	CCT	2	6	1807168	1807173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2435	NC_006461	GTG	2	6	1807376	1807381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2436	NC_006461	GC	3	6	1810653	1810658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2437	NC_006461	CCGCGG	2	12	1810669	1810680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2438	NC_006461	CCTC	2	8	1813845	1813852	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2439	NC_006461	CAC	2	6	1813881	1813886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2440	NC_006461	CTA	2	6	1816948	1816953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2441	NC_006461	TA	3	6	1819207	1819212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2442	NC_006461	A	6	6	1819233	1819238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2443	NC_006461	CCCG	2	8	1819264	1819271	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2444	NC_006461	CGC	2	6	1819288	1819293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2445	NC_006461	C	6	6	1822706	1822711	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2446	NC_006461	CCCG	2	8	1824128	1824135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2447	NC_006461	GGC	2	6	1824146	1824151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2448	NC_006461	AAG	2	6	1824823	1824828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2449	NC_006461	TCT	2	6	1825061	1825066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2450	NC_006461	CTTGC	2	10	1825070	1825079	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2451	NC_006461	AGG	2	6	1825087	1825092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2452	NC_006461	TC	4	8	1825104	1825111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2453	NC_006461	CTTC	2	8	1825129	1825136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2454	NC_006461	AGG	2	6	1825155	1825160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2455	NC_006461	CTGC	2	8	1825171	1825178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2458	NC_006461	CTT	2	6	1825279	1825284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2459	NC_006461	CACCT	2	10	1825286	1825295	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2460	NC_006461	CTTCC	2	10	1825339	1825348	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2461	NC_006461	TCT	2	6	1826099	1826104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2462	NC_006461	ATATT	2	10	1826127	1826136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2464	NC_006461	GGGTA	2	10	1831023	1831032	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2465	NC_006461	G	6	6	1831041	1831046	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2467	NC_006461	CCCGG	2	10	1840532	1840541	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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2470	NC_006461	CGCCCC	2	12	1841780	1841791	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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2472	NC_006461	G	7	7	1849580	1849586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2473	NC_006461	CAG	2	6	1849651	1849656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2474	NC_006461	CTA	3	9	1849722	1849730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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