MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 2474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006461	CCT	2	6	731465	731470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_006461	GTG	2	6	732541	732546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_006461	TGA	2	6	732547	732552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_006461	AAAG	2	8	732562	732569	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_006461	C	6	6	738890	738895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1006	NC_006461	GCC	2	6	738957	738962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_006461	A	6	6	740701	740706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_006461	CT	3	6	740723	740728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_006461	C	7	7	743156	743162	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1010	NC_006461	G	6	6	743177	743182	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_006461	GGT	2	6	744005	744010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_006461	CCTGGC	2	12	744033	744044	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_006461	TGGG	2	8	747878	747885	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_006461	A	7	7	752207	752213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_006461	CCTTC	2	10	752236	752245	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1016	NC_006461	TTG	2	6	752259	752264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_006461	TC	3	6	752271	752276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_006461	GAG	2	6	752361	752366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_006461	CGGG	2	8	752372	752379	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_006461	T	7	7	754310	754316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_006461	G	6	6	754320	754325	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_006461	CGG	2	6	755380	755385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_006461	GGA	2	6	761014	761019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_006461	AGG	2	6	761027	761032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_006461	TGG	2	6	761053	761058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_006461	G	6	6	761057	761062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_006461	CGG	2	6	762948	762953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_006461	TCCC	2	8	766022	766029	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1029	NC_006461	CGG	2	6	766101	766106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_006461	TAA	2	6	766109	766114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_006461	CCT	2	6	767473	767478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1033	NC_006461	ATG	2	6	767520	767525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_006461	CCT	2	6	771661	771666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_006461	TCC	2	6	771709	771714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1037	NC_006461	CTC	2	6	785031	785036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1041	NC_006461	G	6	6	785310	785315	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_006461	CCT	2	6	787597	787602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_006461	CGT	2	6	788283	788288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1045	NC_006461	G	6	6	788312	788317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_006461	C	6	6	788350	788355	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1047	NC_006461	TCC	2	6	789324	789329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1050	NC_006461	G	6	6	792384	792389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_006461	GCC	2	6	792393	792398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_006461	C	6	6	792397	792402	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1053	NC_006461	GCC	2	6	792912	792917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_006461	GA	3	6	792948	792953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_006461	CCT	2	6	802131	802136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_006461	GGC	2	6	802146	802151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_006461	CTC	2	6	803649	803654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_006461	G	6	6	803673	803678	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_006461	CCT	2	6	810122	810127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_006461	TAGGG	2	10	810145	810154	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_006461	GCC	2	6	813422	813427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_006461	AGG	2	6	813460	813465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_006461	TCC	2	6	819902	819907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_006461	CCT	2	6	820503	820508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_006461	TCC	2	6	822629	822634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_006461	GC	3	6	822686	822691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_006461	CCCT	2	8	822781	822788	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1074	NC_006461	CGC	2	6	822873	822878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1083	NC_006461	AGG	2	6	828111	828116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_006461	CCT	2	6	828614	828619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1099	NC_006461	GGC	2	6	829880	829885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1103	NC_006461	GAG	2	6	829987	829992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_006461	C	6	6	829993	829998	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1105	NC_006461	GAG	3	9	830026	830034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_006461	AGG	3	9	830045	830053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_006461	G	6	6	830079	830084	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_006461	TGG	2	6	830085	830090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_006461	AGCC	2	8	830099	830106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_006461	GAG	3	9	830134	830142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_006461	GGGA	2	8	830183	830190	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1117	NC_006461	GAG	2	6	830439	830444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_006461	CGC	2	6	830484	830489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_006461	CCGA	2	8	830511	830518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_006461	CAGGCC	2	12	830556	830567	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_006461	G	6	6	830591	830596	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_006461	GCG	2	6	830620	830625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_006461	GGCCCG	2	12	830631	830642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_006461	GCCA	2	8	830665	830672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_006461	AGG	3	9	830701	830709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1127	NC_006461	G	6	6	830717	830722	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_006461	AGG	2	6	830723	830728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_006461	GCCC	2	8	830750	830757	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1130	NC_006461	G	7	7	830763	830769	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_006461	GAG	2	6	830787	830792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1133	NC_006461	GAG	2	6	830835	830840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_006461	GCCGC	2	10	830842	830851	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1135	NC_006461	GAG	2	6	830868	830873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1409	NC_006461	CTCCA	2	10	1004780	1004789	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1410	NC_006461	TGGGG	2	10	1004890	1004899	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_006461	GCC	2	6	1006277	1006282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1414	NC_006461	GGC	2	6	1006287	1006292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1416	NC_006461	GGC	2	6	1008522	1008527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_006461	CCT	2	6	1011452	1011457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1419	NC_006461	CCCCG	2	10	1011553	1011562	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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1440	NC_006461	AGGG	2	8	1022846	1022853	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_006461	GCCCG	2	10	1022857	1022866	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1446	NC_006461	CTC	2	6	1023107	1023112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1454	NC_006461	CCT	2	6	1031232	1031237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1471	NC_006461	GCC	2	6	1031833	1031838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1472	NC_006461	CCT	3	9	1031841	1031849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1473	NC_006461	CCGGG	2	10	1031853	1031862	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1484	NC_006461	CCT	2	6	1037152	1037157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1485	NC_006461	G	6	6	1042064	1042069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1486	NC_006461	AGG	2	6	1044971	1044976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_006461	GAG	2	6	1056233	1056238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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