MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005838	TGGA	2	8	44	51	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005838	CGGTG	2	10	77	86	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_005838	CAA	2	6	89	94	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005838	GCG	2	6	149	154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005838	GCG	2	6	159	164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_005838	AGG	2	6	175	180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005838	GCG	2	6	216	221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_005838	CCCT	2	8	252	259	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_005838	GC	3	6	5199	5204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_005838	AGG	2	6	5231	5236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005838	TCC	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_005838	AAGG	2	8	5293	5300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005838	GGA	2	6	17706	17711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005838	CCT	2	6	17730	17735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_005838	GGCCCT	2	12	17742	17753	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005838	GGA	2	6	17823	17828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005838	GGA	2	6	17847	17852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005838	CCA	2	6	22579	22584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_005838	CTG	2	6	22589	22594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_005838	GA	3	6	22618	22623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005838	GGA	2	6	22624	22629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005838	CCG	2	6	22642	22647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_005838	CCT	2	6	22648	22653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_005838	CCG	2	6	22684	22689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_005838	TCC	3	9	22707	22715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_005838	TCCG	2	8	22747	22754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_005838	ACC	3	9	22766	22774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_005838	CGC	2	6	22783	22788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_005838	GCCC	2	8	22825	22832	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_005838	CGC	2	6	22949	22954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_005838	AGGG	2	8	25093	25100	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005838	GGAG	2	8	25134	25141	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005838	TCC	2	6	25152	25157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_005838	C	7	7	25172	25178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_005838	CGC	2	6	25642	25647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_005838	C	7	7	25667	25673	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_005838	G	6	6	27282	27287	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005838	GGC	2	6	27291	27296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_005838	AGG	3	9	27313	27321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005838	GGA	2	6	27329	27334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005838	GAG	2	6	27348	27353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005838	AG	3	6	27352	27357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005838	GCCCAG	2	12	27393	27404	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_005838	GA	3	6	27448	27453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005838	C	6	6	28717	28722	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_005838	G	6	6	28730	28735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005838	G	7	7	33892	33898	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005838	CG	3	6	33935	33940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_005838	GCC	2	6	33963	33968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_005838	C	6	6	33985	33990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_005838	GAG	2	6	34036	34041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005838	C	6	6	34051	34056	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_005838	CGG	2	6	35098	35103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005838	GTG	2	6	35142	35147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005838	AGG	2	6	35156	35161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005838	G	6	6	36478	36483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005838	C	6	6	36492	36497	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_005838	TTC	2	6	36501	36506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_005838	GGA	2	6	38298	38303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005838	GGGC	2	8	39623	39630	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_005838	CCT	2	6	40557	40562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_005838	GGA	2	6	40567	40572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005838	CCTC	2	8	40680	40687	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_005838	GAG	2	6	48832	48837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005838	ATC	2	6	49110	49115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005838	GCC	2	6	49148	49153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_005838	CCT	2	6	49158	49163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_005838	CTT	2	6	49212	49217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_005838	TAGGG	2	10	51548	51557	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005838	GCC	2	6	51625	51630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_005838	GGGC	2	8	53784	53791	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_005838	GGC	2	6	53873	53878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_005838	TCC	3	9	53884	53892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_005838	GCCC	2	8	53907	53914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_005838	AGAC	2	8	57537	57544	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_005838	TGG	2	6	58339	58344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005838	GAAGG	2	10	58345	58354	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005838	AGGTG	2	10	58397	58406	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005838	GAA	2	6	58407	58412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005838	AGG	2	6	58426	58431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005838	GGC	2	6	58463	58468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_005838	GCAG	2	8	58514	58521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_005838	CTG	2	6	58875	58880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005838	GGC	2	6	59288	59293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_005838	TCC	2	6	59311	59316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_005838	GGGCC	2	10	62352	62361	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_005838	GAA	2	6	64121	64126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005838	CCCCA	2	10	64151	64160	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
89	NC_005838	GCC	2	6	66663	66668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_005838	GGCCT	2	10	66684	66693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_005838	AGG	2	6	68608	68613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005838	AGG	2	6	70473	70478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005838	GCA	2	6	72449	72454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_005838	CTC	2	6	72482	72487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_005838	AAG	2	6	72501	72506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005838	CAAC	2	8	72511	72518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_005838	TCC	2	6	72532	72537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_005838	GCC	2	6	72543	72548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_005838	GGC	2	6	72560	72565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_005838	GGC	2	6	72573	72578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_005838	CTTGC	2	10	72592	72601	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_005838	AGG	2	6	72609	72614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005838	TC	4	8	72626	72633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_005838	CTTC	2	8	72651	72658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_005838	AGG	2	6	72677	72682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005838	CTGC	2	8	72693	72700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_005838	GCC	2	6	72746	72751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_005838	CCT	2	6	72783	72788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_005838	CTT	2	6	72801	72806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_005838	CACCT	2	10	72808	72817	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_005838	CTTCC	2	10	72861	72870	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_005838	A	6	6	74889	74894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005838	AG	3	6	75923	75928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005838	AGG	2	6	75942	75947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005838	TCC	2	6	75963	75968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_005838	ACC	2	6	76030	76035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_005838	C	6	6	76034	76039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_005838	GCT	2	6	76116	76121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_005838	TCT	2	6	76122	76127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_005838	CTC	2	6	76128	76133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_005838	GCC	2	6	76271	76276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_005838	GCCC	2	8	77231	77238	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_005838	GGC	2	6	77288	77293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_005838	GGA	2	6	77319	77324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005838	CCCG	2	8	77348	77355	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_005838	GTC	2	6	77434	77439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_005838	ACGC	2	8	77469	77476	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_005838	CCT	2	6	78805	78810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_005838	TCACC	2	10	78811	78820	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_005838	CTT	2	6	78841	78846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_005838	AAAC	2	8	78920	78927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_005838	C	6	6	80852	80857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_005838	TGA	2	6	80893	80898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005838	ATC	2	6	80900	80905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_005838	TAACT	2	10	80925	80934	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_005838	TAA	2	6	80942	80947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005838	CAA	2	6	80952	80957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_005838	CGC	2	6	81027	81032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_005838	AGGGG	2	10	81078	81087	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005838	C	6	6	81142	81147	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_005838	AGGGG	2	10	81191	81200	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005838	CCGC	2	8	81225	81232	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_005838	GAA	2	6	81237	81242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005838	CTTCCC	2	12	81271	81282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_005838	AGGGG	2	10	84444	84453	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005838	GCC	2	6	84591	84596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_005838	CCT	2	6	85621	85626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_005838	CTTGC	2	10	85680	85689	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_005838	CTTC	2	8	85739	85746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_005838	AGG	2	6	85765	85770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_005838	CTGC	2	8	85781	85788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_005838	GCC	2	6	85834	85839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_005838	GGT	2	6	90344	90349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_005838	GGC	2	6	152697	152702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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429	NC_005838	GGA	2	6	183283	183288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
430	NC_005838	GCG	2	6	183305	183310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_005838	TCC	2	6	183332	183337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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433	NC_005838	GGT	2	6	183438	183443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_005838	TGG	2	6	184858	184863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_005838	G	6	6	187204	187209	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
449	NC_005838	GCCC	2	8	187635	187642	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
450	NC_005838	AAGG	2	8	187652	187659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
451	NC_005838	TCCC	2	8	189349	189356	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
452	NC_005838	CCA	3	9	189992	190000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_005838	CCA	3	9	190004	190012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
454	NC_005838	CCA	2	6	190046	190051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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462	NC_005838	ACCT	2	8	194439	194446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
463	NC_005838	CTT	2	6	194556	194561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_005838	ACC	2	6	199804	199809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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468	NC_005838	GCG	2	6	199899	199904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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472	NC_005838	GAG	2	6	200097	200102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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