MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 1957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005835	CTT	2	6	564790	564795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_005835	GA	3	6	568052	568057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_005835	GTGTA	2	10	568069	568078	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
504	NC_005835	G	6	6	568079	568084	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
505	NC_005835	A	7	7	569702	569708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_005835	AAT	2	6	569720	569725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_005835	ACC	2	6	569790	569795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_005835	CCT	2	6	570269	570274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_005835	GA	3	6	570325	570330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_005835	CGAAC	2	10	579897	579906	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
511	NC_005835	AGG	2	6	579951	579956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_005835	C	6	6	586730	586735	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
513	NC_005835	CCT	2	6	586737	586742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_005835	CCT	2	6	586755	586760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_005835	CG	3	6	588775	588780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_005835	CTC	2	6	590507	590512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_005835	G	6	6	593157	593162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
518	NC_005835	GGA	2	6	593165	593170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_005835	C	6	6	598445	598450	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
520	NC_005835	C	6	6	598458	598463	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
521	NC_005835	GAA	2	6	598498	598503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_005835	GCC	2	6	598527	598532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_005835	CCT	2	6	599643	599648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_005835	GGA	2	6	600480	600485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_005835	GGC	2	6	600487	600492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_005835	CCT	2	6	600553	600558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_005835	CCT	2	6	602985	602990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_005835	GGT	2	6	602993	602998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_005835	AGG	3	9	603893	603901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_005835	GGA	2	6	603932	603937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_005835	TTCT	2	8	605900	605907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
532	NC_005835	C	6	6	605908	605913	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
533	NC_005835	CCCCGC	2	12	605925	605936	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
534	NC_005835	CTA	2	6	605949	605954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_005835	AGG	2	6	605969	605974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_005835	CCCCT	2	10	607194	607203	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
537	NC_005835	ACC	2	6	611057	611062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_005835	CCCAGG	2	12	611079	611090	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
539	NC_005835	AGG	3	9	613377	613385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_005835	GAC	2	6	613388	613393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_005835	GCG	2	6	613421	613426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_005835	AAGG	2	8	613921	613928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_005835	GGT	2	6	613930	613935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_005835	AGG	2	6	618633	618638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_005835	CCG	3	9	621628	621636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_005835	CGG	2	6	630306	630311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_005835	AGGG	2	8	632235	632242	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
548	NC_005835	GAG	2	6	634236	634241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_005835	AAG	2	6	639813	639818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_005835	GGA	2	6	639893	639898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_005835	GAA	2	6	639940	639945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_005835	GCC	2	6	639983	639988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_005835	GCC	2	6	639997	640002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_005835	CTC	2	6	640009	640014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_005835	CCA	2	6	640037	640042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_005835	CGG	2	6	640057	640062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_005835	CCG	2	6	640089	640094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_005835	CG	3	6	640117	640122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_005835	C	6	6	641838	641843	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
560	NC_005835	G	6	6	641854	641859	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
561	NC_005835	TGG	2	6	641868	641873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_005835	GCG	2	6	641874	641879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_005835	TCC	2	6	641964	641969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_005835	GAG	2	6	642068	642073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_005835	G	6	6	642077	642082	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
566	NC_005835	TTC	2	6	642190	642195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_005835	CAA	2	6	642208	642213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_005835	GCGCGT	2	12	646357	646368	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_005835	GAA	2	6	646396	646401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_005835	TGCG	2	8	646447	646454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
571	NC_005835	C	6	6	646507	646512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
572	NC_005835	AGG	2	6	646516	646521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_005835	ACGCGC	2	12	646525	646536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
574	NC_005835	CCTG	2	8	646569	646576	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
575	NC_005835	T	7	7	646627	646633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_005835	AGG	2	6	646652	646657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_005835	CTT	2	6	647484	647489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_005835	CGAGG	2	10	647625	647634	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
579	NC_005835	G	8	8	647661	647668	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
580	NC_005835	AGA	2	6	647669	647674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_005835	ACC	2	6	647711	647716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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583	NC_005835	A	6	6	647826	647831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_005835	CGCCCA	2	12	647893	647904	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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586	NC_005835	AT	3	6	647952	647957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_005835	TGA	2	6	647982	647987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_005835	ACA	2	6	648021	648026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_005835	GCC	2	6	648056	648061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_005835	A	6	6	648092	648097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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594	NC_005835	CGGG	2	8	648377	648384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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596	NC_005835	GCGA	2	8	648530	648537	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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603	NC_005835	CTG	2	6	648754	648759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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605	NC_005835	TCCT	2	8	649551	649558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_005835	TTC	2	6	651162	651167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_005835	TC	3	6	651175	651180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_005835	GCTTC	2	10	651786	651795	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
609	NC_005835	GAAG	2	8	651869	651876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_005835	AGG	2	6	651880	651885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_005835	C	6	6	653103	653108	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
612	NC_005835	G	6	6	653119	653124	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
613	NC_005835	TGG	2	6	653144	653149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_005835	GCG	2	6	653150	653155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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618	NC_005835	G	6	6	655694	655699	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
619	NC_005835	GCC	2	6	655707	655712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_005835	C	7	7	655711	655717	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
621	NC_005835	CTCC	2	8	656174	656181	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
622	NC_005835	CGG	2	6	656199	656204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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624	NC_005835	CGGC	2	8	657732	657739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_005835	CCT	2	6	661990	661995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_005835	T	6	6	662014	662019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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628	NC_005835	CG	3	6	664923	664928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_005835	GGT	2	6	670464	670469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_005835	TGGGG	2	10	677882	677891	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
632	NC_005835	GGC	2	6	679246	679251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_005835	CCG	2	6	679260	679265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_005835	GCC	2	6	679269	679274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_005835	GGC	2	6	679279	679284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_005835	C	6	6	681466	681471	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
637	NC_005835	TCC	2	6	681472	681477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_005835	GGC	2	6	681495	681500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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640	NC_005835	CCG	2	6	684507	684512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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