MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 2548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004551	CA	3	6	171576	171581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_004551	TGC	2	6	171602	171607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_004551	CCTA	2	8	171617	171624	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_004551	AAC	2	6	171632	171637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_004551	CA	3	6	171657	171662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_004551	ATC	2	6	171663	171668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_004551	GCC	2	6	171740	171745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_004551	TTA	2	6	171778	171783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004551	TGG	2	6	171814	171819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004551	CCTA	2	8	171835	171842	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_004551	GA	3	6	171881	171886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_004551	ATC	2	6	172759	172764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_004551	CTCC	2	8	172813	172820	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
514	NC_004551	CAG	2	6	172827	172832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_004551	TCTA	2	8	172837	172844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
516	NC_004551	TA	3	6	172919	172924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_004551	CA	3	6	173036	173041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_004551	AG	3	6	173048	173053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_004551	TAC	2	6	173139	173144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_004551	CAA	2	6	173176	173181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_004551	TAG	2	6	173243	173248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_004551	TA	3	6	173300	173305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004551	AT	3	6	173333	173338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_004551	AT	3	6	173342	173347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_004551	AG	3	6	173398	173403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_004551	CTT	2	6	173498	173503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_004551	ACC	2	6	173516	173521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_004551	TGG	2	6	173557	173562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_004551	CTGTG	2	10	173579	173588	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
530	NC_004551	GGC	2	6	173675	173680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_004551	CAA	2	6	173787	173792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_004551	AAC	2	6	173960	173965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_004551	TAG	2	6	173972	173977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_004551	ATC	2	6	173993	173998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_004551	CAG	2	6	174049	174054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_004551	TCTA	2	8	174059	174066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_004551	TA	3	6	174084	174089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_004551	TC	3	6	174098	174103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_004551	CCA	2	6	174120	174125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_004551	CA	3	6	174124	174129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_004551	TTG	2	6	174152	174157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004551	AAC	2	6	174183	174188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_004551	CAA	2	6	174195	174200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_004551	ATC	2	6	174227	174232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_004551	CTT	2	6	174320	174325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_004551	CCT	2	6	174361	174366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_004551	CCA	2	6	174372	174377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_004551	CA	3	6	174376	174381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_004551	TTG	2	6	174404	174409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004551	CTG	2	6	174454	174459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_004551	CA	3	6	174496	174501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_004551	TTC	2	6	174616	174621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_004551	TGC	2	6	174655	174660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_004551	CAA	2	6	174672	174677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_004551	AG	3	6	174693	174698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004551	TGG	2	6	174763	174768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_004551	TCTA	2	8	174793	174800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_004551	TA	4	8	174886	174893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004551	AGT	3	9	174895	174903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004551	CTT	2	6	174950	174955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_004551	TAC	2	6	174964	174969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_004551	AT	3	6	175104	175109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004551	AC	3	6	175146	175151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_004551	CA	3	6	175153	175158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_004551	CTG	2	6	175181	175186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_004551	GTG	2	6	175193	175198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004551	CA	3	6	175238	175243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_004551	AG	3	6	175250	175255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_004551	CCA	2	6	175259	175264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_004551	ATC	2	6	175269	175274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_004551	GCA	2	6	175277	175282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_004551	TC	3	6	175397	175402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_004551	CA	3	6	175445	175450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_004551	TTGTG	2	10	175473	175482	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004551	AT	3	6	175622	175627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004551	AC	4	8	175650	175657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_004551	CA	3	6	175673	175678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_004551	AG	3	6	175712	175717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_004551	AGG	2	6	175738	175743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_004551	GCA	2	6	175752	175757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_004551	CCTA	2	8	175846	175853	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_004551	ATC	2	6	175892	175897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_004551	GCA	2	6	175900	175905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_004551	TGG	2	6	175997	176002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_004551	CCA	2	6	176047	176052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_004551	CA	3	6	176051	176056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_004551	CCTA	2	8	176095	176102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_004551	CAA	2	6	176122	176127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_004551	CCA	2	6	176144	176149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_004551	CA	3	6	176148	176153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_004551	ATC	2	6	176154	176159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_004551	TCTA	2	8	176214	176221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_004551	AACCAT	2	12	176306	176317	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_004551	ACA	3	9	176322	176330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_004551	ACC	2	6	176382	176387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_004551	AC	3	6	176613	176618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_004551	ACC	2	6	176637	176642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_004551	A	6	6	176662	176667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004551	ACTGCA	2	12	176757	176768	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_004551	TGC	2	6	176816	176821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_004551	CTG	2	6	176884	176889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_004551	ACC	2	6	176999	177004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_004551	CA	3	6	177007	177012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_004551	CTT	2	6	177025	177030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_004551	TAGCC	2	10	177034	177043	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
606	NC_004551	TG	3	6	177297	177302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_004551	GT	3	6	177340	177345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_004551	TGTTAC	2	12	177368	177379	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
609	NC_004551	TTA	2	6	177388	177393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_004551	CGC	2	6	177437	177442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_004551	AAC	2	6	177446	177451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_004551	CGC	2	6	177510	177515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_004551	TTA	2	6	177638	177643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_004551	CCT	2	6	177692	177697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_004551	CGC	2	6	177701	177706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_004551	AAC	2	6	177710	177715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_004551	C	6	6	177731	177736	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
618	NC_004551	ATC	2	6	177742	177747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_004551	CTCC	2	8	177808	177815	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
620	NC_004551	TCTA	2	8	177833	177840	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_004551	CCTG	2	8	177921	177928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_004551	GC	3	6	177974	177979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_004551	CCT	2	6	178105	178110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_004551	AAC	2	6	178123	178128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_004551	AC	3	6	178177	178182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_004551	AC	3	6	178193	178198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_004551	AGC	2	6	178263	178268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_004551	TTA	2	6	181330	181335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_004551	TC	4	8	181346	181353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_004551	GT	3	6	181362	181367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_004551	GT	3	6	181381	181386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004551	AACA	2	8	181421	181428	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
633	NC_004551	GTA	2	6	181444	181449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_004551	TGT	2	6	181471	181476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_004551	ACAT	2	8	181477	181484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
636	NC_004551	TACA	2	8	181494	181501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
637	NC_004551	ACA	2	6	181532	181537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_004551	AACA	2	8	181547	181554	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
639	NC_004551	ACAAA	2	10	181577	181586	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
640	NC_004551	TCAT	2	8	181639	181646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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918	NC_004551	T	6	6	243635	243640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
919	NC_004551	ATC	2	6	243657	243662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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921	NC_004551	TTG	2	6	243690	243695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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941	NC_004551	ATT	2	6	263721	263726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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952	NC_004551	ATG	2	6	275174	275179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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