MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 4783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004113	CCTCTT	2	12	1988615	1988626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_004113	CAG	2	6	1991478	1991483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_004113	CGCC	2	8	1991536	1991543	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3504	NC_004113	A	6	6	1991558	1991563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_004113	TCTT	2	8	1994924	1994931	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_004113	CCCTG	2	10	1994987	1994996	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3507	NC_004113	CTCAA	2	10	1995009	1995018	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3508	NC_004113	G	6	6	1997490	1997495	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_004113	GATG	2	8	1997497	1997504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_004113	GA	3	6	1997551	1997556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_004113	GTC	2	6	1998823	1998828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_004113	GAC	2	6	1998912	1998917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_004113	CGTTGT	2	12	1998996	1999007	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3514	NC_004113	TGT	3	9	1999012	1999020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_004113	CCA	2	6	1999059	1999064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_004113	G	6	6	1999082	1999087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_004113	AGC	2	6	1999107	1999112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_004113	CAA	2	6	1999140	1999145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_004113	CAG	3	9	1999239	1999247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_004113	AGC	2	6	1999280	1999285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_004113	GCA	2	6	1999368	1999373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_004113	GTC	2	6	1999400	1999405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_004113	ATA	2	6	2002489	2002494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_004113	ACA	2	6	2002529	2002534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_004113	GGT	2	6	2005147	2005152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_004113	GTG	2	6	2005181	2005186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_004113	T	6	6	2005201	2005206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_004113	G	7	7	2005236	2005242	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_004113	GTT	2	6	2005249	2005254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_004113	ATC	2	6	2005306	2005311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_004113	GTCT	2	8	2006524	2006531	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3532	NC_004113	GAT	3	9	2007362	2007370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_004113	CAC	2	6	2010255	2010260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_004113	GAG	2	6	2010298	2010303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_004113	GAT	2	6	2010548	2010553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_004113	GGCT	2	8	2010555	2010562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_004113	TGG	2	6	2010576	2010581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_004113	TAAAGA	2	12	2010603	2010614	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_004113	G	6	6	2010651	2010656	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_004113	GAGAG	2	10	2010807	2010816	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_004113	CTGG	2	8	2012524	2012531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_004113	AAT	2	6	2017530	2017535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_004113	AT	3	6	2018745	2018750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_004113	TAGGGG	2	12	2018758	2018769	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_004113	ATG	2	6	2021104	2021109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_004113	TCCA	2	8	2021130	2021137	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_004113	G	6	6	2021243	2021248	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_004113	CGG	2	6	2021258	2021263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_004113	TTGA	2	8	2021327	2021334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_004113	GT	3	6	2022132	2022137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_004113	TAT	2	6	2022146	2022151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_004113	TAA	2	6	2024289	2024294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_004113	TGA	2	6	2027510	2027515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_004113	AGG	2	6	2028080	2028085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_004113	TGC	2	6	2028119	2028124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_004113	TC	3	6	2028562	2028567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_004113	TGC	2	6	2029311	2029316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_004113	GGGT	2	8	2030687	2030694	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_004113	CAA	2	6	2032808	2032813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_004113	GAAG	3	12	2036111	2036122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_004113	TAA	2	6	2037895	2037900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_004113	ATG	2	6	2039793	2039798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_004113	TC	3	6	2039812	2039817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_004113	CTA	2	6	2039908	2039913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_004113	TACT	2	8	2039988	2039995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3566	NC_004113	TAGTT	2	10	2039996	2040005	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_004113	G	7	7	2040043	2040049	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3569	NC_004113	CAG	2	6	2040134	2040139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_004113	TAA	2	6	2041364	2041369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_004113	AAC	2	6	2041423	2041428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_004113	TGT	2	6	2041434	2041439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_004113	AC	3	6	2041523	2041528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_004113	AAG	2	6	2041632	2041637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3578	NC_004113	TGT	2	6	2042789	2042794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_004113	TTGT	2	8	2042831	2042838	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_004113	GA	3	6	2047098	2047103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_004113	GTCG	2	8	2047905	2047912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3584	NC_004113	AACTC	2	10	2048860	2048869	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3585	NC_004113	TAA	2	6	2051166	2051171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_004113	AG	3	6	2052949	2052954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_004113	A	6	6	2052974	2052979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_004113	TGC	2	6	2053085	2053090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_004113	GATA	2	8	2053131	2053138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_004113	CTG	2	6	2057447	2057452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3594	NC_004113	ATT	2	6	2057516	2057521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_004113	ATC	2	6	2057529	2057534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_004113	AGGC	2	8	2057601	2057608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3598	NC_004113	A	6	6	2057658	2057663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_004113	TCC	2	6	2057686	2057691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_004113	CTG	2	6	2057701	2057706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_004113	GGA	2	6	2057766	2057771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_004113	AGC	2	6	2057827	2057832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_004113	GCG	2	6	2057842	2057847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_004113	GAG	2	6	2057857	2057862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_004113	TGC	2	6	2057865	2057870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3607	NC_004113	G	6	6	2057954	2057959	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_004113	GGCAA	2	10	2057961	2057970	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3609	NC_004113	GAG	2	6	2057987	2057992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_004113	TTG	2	6	2058010	2058015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_004113	TGCC	2	8	2058017	2058024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_004113	AGA	2	6	2061107	2061112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_004113	TTC	2	6	2061138	2061143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_004113	TTG	2	6	2061148	2061153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_004113	T	6	6	2061157	2061162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_004113	CT	3	6	2061196	2061201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_004113	GTCA	2	8	2061220	2061227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3619	NC_004113	T	6	6	2061241	2061246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_004113	TGA	2	6	2061249	2061254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_004113	TACC	2	8	2065148	2065155	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_004113	CAA	2	6	2065167	2065172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_004113	TTCA	2	8	2066435	2066442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_004113	TCC	2	6	2066443	2066448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_004113	TCC	2	6	2066457	2066462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_004113	T	6	6	2066519	2066524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_004113	CTC	2	6	2066549	2066554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_004113	CAG	2	6	2066573	2066578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_004113	ACC	2	6	2069131	2069136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_004113	GCG	2	6	2069157	2069162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_004113	GGCG	2	8	2069184	2069191	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3632	NC_004113	GGA	2	6	2070688	2070693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3636	NC_004113	GCT	2	6	2073155	2073160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3747	NC_004113	TAAAA	2	10	2145148	2145157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3760	NC_004113	TCC	2	6	2151578	2151583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3761	NC_004113	GTCAG	2	10	2151588	2151597	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3762	NC_004113	GCTC	2	8	2151756	2151763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3799	NC_004113	AGGG	2	8	2169480	2169487	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3800	NC_004113	AAT	2	6	2169541	2169546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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