MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 4783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004113	CAT	2	6	1684203	1684208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_004113	CCA	2	6	1684330	1684335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_004113	AG	3	6	1684341	1684346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_004113	TGCA	2	8	1684371	1684378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_004113	G	6	6	1684408	1684413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_004113	GCA	2	6	1684466	1684471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_004113	C	7	7	1684474	1684480	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3008	NC_004113	TACAA	2	10	1684527	1684536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3009	NC_004113	AATA	2	8	1693332	1693339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_004113	TCC	2	6	1693436	1693441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_004113	AAC	2	6	1696383	1696388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_004113	GATG	2	8	1696397	1696404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_004113	ATCCC	2	10	1696476	1696485	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3014	NC_004113	GGTTA	2	10	1696534	1696543	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_004113	CCT	2	6	1696669	1696674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_004113	CTT	2	6	1699209	1699214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_004113	TCC	2	6	1699230	1699235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_004113	G	6	6	1699253	1699258	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_004113	CTA	2	6	1699272	1699277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_004113	AGG	2	6	1699378	1699383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_004113	TCT	2	6	1700112	1700117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_004113	ACT	2	6	1700134	1700139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_004113	CCT	2	6	1701972	1701977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_004113	TTG	2	6	1701986	1701991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_004113	CTGG	2	8	1702046	1702053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_004113	CCG	2	6	1702086	1702091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_004113	AGT	2	6	1702094	1702099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_004113	CTG	2	6	1702156	1702161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_004113	CAA	2	6	1702213	1702218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_004113	GCA	2	6	1702270	1702275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_004113	ACC	2	6	1702332	1702337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_004113	AAGGG	2	10	1702357	1702366	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_004113	TTAT	2	8	1702371	1702378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_004113	AACTC	2	10	1704945	1704954	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3035	NC_004113	CTT	2	6	1704959	1704964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_004113	T	7	7	1704989	1704995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_004113	GGT	2	6	1711280	1711285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_004113	TGG	2	6	1711289	1711294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_004113	TGT	2	6	1714991	1714996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_004113	TTG	2	6	1715018	1715023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_004113	CCA	2	6	1715145	1715150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_004113	TCAAT	2	10	1715202	1715211	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3043	NC_004113	ATCC	2	8	1715268	1715275	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_004113	GCCA	2	8	1715280	1715287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_004113	TGG	2	6	1715299	1715304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_004113	GGT	2	6	1715435	1715440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_004113	ATTTT	2	10	1715476	1715485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_004113	TGA	2	6	1715691	1715696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_004113	CTGA	2	8	1715703	1715710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_004113	TGAG	2	8	1715722	1715729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_004113	GCG	2	6	1715794	1715799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_004113	GTT	2	6	1715817	1715822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_004113	AGC	2	6	1715867	1715872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_004113	ACA	2	6	1715888	1715893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_004113	TCA	2	6	1715911	1715916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_004113	CGG	2	6	1715977	1715982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_004113	TAG	2	6	1716037	1716042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_004113	CTA	2	6	1716064	1716069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_004113	GAT	2	6	1717093	1717098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_004113	AGG	2	6	1717241	1717246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_004113	AG	3	6	1717331	1717336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_004113	TC	3	6	1719348	1719353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_004113	CAT	2	6	1719366	1719371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_004113	AT	3	6	1719388	1719393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_004113	CAA	2	6	1719404	1719409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_004113	GAT	2	6	1719415	1719420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_004113	ATT	2	6	1719426	1719431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_004113	GA	3	6	1719450	1719455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_004113	CAG	2	6	1720441	1720446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_004113	GAT	2	6	1720476	1720481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_004113	TCG	2	6	1720503	1720508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_004113	CTGTC	2	10	1720509	1720518	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3073	NC_004113	AGAA	2	8	1722406	1722413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_004113	T	7	7	1722491	1722497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_004113	C	6	6	1729236	1729241	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3076	NC_004113	ATTTTA	2	12	1729245	1729256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_004113	AGC	2	6	1729294	1729299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_004113	GTG	2	6	1729315	1729320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_004113	CAA	2	6	1731954	1731959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_004113	CT	3	6	1731965	1731970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_004113	CAG	2	6	1731974	1731979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_004113	T	7	7	1732041	1732047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_004113	A	7	7	1733434	1733440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_004113	AGT	2	6	1733531	1733536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_004113	TTC	2	6	1733568	1733573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_004113	CCT	2	6	1733701	1733706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_004113	ATG	2	6	1733769	1733774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_004113	TGGC	2	8	1733782	1733789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_004113	GCT	2	6	1733860	1733865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_004113	TAG	2	6	1733873	1733878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_004113	GAT	2	6	1736628	1736633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_004113	CAA	2	6	1736776	1736781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_004113	AG	3	6	1737461	1737466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_004113	CGC	2	6	1739490	1739495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_004113	TGG	2	6	1739521	1739526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_004113	AGA	2	6	1741482	1741487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_004113	CAC	2	6	1741518	1741523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_004113	ATTA	2	8	1741619	1741626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_004113	CTATA	2	10	1741648	1741657	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3100	NC_004113	CAA	2	6	1741670	1741675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_004113	GTA	2	6	1741786	1741791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_004113	AAG	2	6	1743570	1743575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_004113	AGG	2	6	1743978	1743983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_004113	T	6	6	1747921	1747926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_004113	CAG	2	6	1748011	1748016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_004113	CCAGC	2	10	1751531	1751540	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3107	NC_004113	CT	3	6	1751576	1751581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_004113	AAC	2	6	1751591	1751596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_004113	GCGG	2	8	1751598	1751605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_004113	GTAT	2	8	1751695	1751702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_004113	TTA	2	6	1751716	1751721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_004113	TTA	2	6	1751726	1751731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_004113	CTGTG	2	10	1751760	1751769	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3114	NC_004113	TAC	2	6	1751774	1751779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_004113	A	9	9	1751808	1751816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_004113	ATAA	2	8	1751853	1751860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_004113	AT	3	6	1751861	1751866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_004113	A	6	6	1751882	1751887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_004113	GTA	2	6	1751897	1751902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_004113	CAG	2	6	1751933	1751938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_004113	AAC	2	6	1752517	1752522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_004113	A	6	6	1752544	1752549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_004113	GA	3	6	1752598	1752603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_004113	GGT	2	6	1753101	1753106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_004113	GCT	2	6	1753159	1753164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_004113	ATTT	2	8	1753203	1753210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_004113	TAT	2	6	1753235	1753240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_004113	G	6	6	1753291	1753296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_004113	GT	3	6	1753973	1753978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_004113	GA	3	6	1753983	1753988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_004113	GTT	2	6	1753992	1753997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_004113	TG	3	6	1755631	1755636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_004113	ATG	2	6	1756939	1756944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3136	NC_004113	GAG	2	6	1758012	1758017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3142	NC_004113	TTGC	2	8	1772346	1772353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3151	NC_004113	ACTCT	2	10	1775615	1775624	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3156	NC_004113	TAC	2	6	1778994	1778999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3253	NC_004113	TCG	2	6	1824508	1824513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_004113	GA	3	6	1826310	1826315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_004113	AGC	2	6	1828615	1828620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_004113	CT	3	6	1829033	1829038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3257	NC_004113	ATT	2	6	1829594	1829599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_004113	CAA	2	6	1829619	1829624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3259	NC_004113	AGG	2	6	1829628	1829633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_004113	AAC	2	6	1831726	1831731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_004113	T	7	7	1833004	1833010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_004113	GTT	2	6	1833028	1833033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3264	NC_004113	CG	3	6	1837153	1837158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3265	NC_004113	A	6	6	1837221	1837226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_004113	AGG	2	6	1837229	1837234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_004113	C	6	6	1837247	1837252	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3268	NC_004113	CA	3	6	1837315	1837320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3269	NC_004113	AG	3	6	1837321	1837326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_004113	GTT	2	6	1838483	1838488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3275	NC_004113	CGG	2	6	1843076	1843081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3287	NC_004113	TTC	2	6	1859727	1859732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3291	NC_004113	T	6	6	1859916	1859921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3387	NC_004113	T	6	6	1932624	1932629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3390	NC_004113	GACGCC	2	12	1935575	1935586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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3392	NC_004113	ACG	2	6	1938505	1938510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3394	NC_004113	ATA	2	6	1938905	1938910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3400	NC_004113	CTG	2	6	1941403	1941408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3401	NC_004113	CT	3	6	1942532	1942537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3402	NC_004113	T	6	6	1945087	1945092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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