MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 4783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2006	NC_004113	CCTT	2	8	1143590	1143597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2012	NC_004113	CAG	2	6	1146541	1146546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2014	NC_004113	TAA	2	6	1147823	1147828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2129	NC_004113	CCCT	2	8	1189446	1189453	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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2132	NC_004113	AATA	2	8	1189540	1189547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_004113	AGTCA	2	10	1189614	1189623	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2134	NC_004113	TC	3	6	1190472	1190477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2135	NC_004113	CTG	2	6	1190608	1190613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_004113	A	6	6	1190732	1190737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_004113	CTCA	2	8	1190738	1190745	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2138	NC_004113	AGT	2	6	1193044	1193049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_004113	GAC	2	6	1193051	1193056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2140	NC_004113	CGC	2	6	1196302	1196307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2142	NC_004113	GT	3	6	1196403	1196408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2143	NC_004113	GCT	2	6	1196425	1196430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2146	NC_004113	GAT	2	6	1196629	1196634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_004113	CAAA	2	8	1196926	1196933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2148	NC_004113	GAT	2	6	1196975	1196980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2150	NC_004113	GTT	2	6	1197015	1197020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2152	NC_004113	GAG	2	6	1197122	1197127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2153	NC_004113	AAGTG	2	10	1197186	1197195	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2154	NC_004113	CTG	2	6	1197274	1197279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2157	NC_004113	TGA	2	6	1197413	1197418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2158	NC_004113	CCCG	2	8	1197502	1197509	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2159	NC_004113	CTG	2	6	1197526	1197531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2161	NC_004113	CAA	2	6	1197622	1197627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2162	NC_004113	GTT	2	6	1197643	1197648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2163	NC_004113	AGG	2	6	1197666	1197671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2164	NC_004113	GAG	2	6	1197750	1197755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2165	NC_004113	AAGTG	2	10	1197814	1197823	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2166	NC_004113	GGATT	2	10	1197891	1197900	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2167	NC_004113	TGCT	2	8	1197904	1197911	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2168	NC_004113	CCG	2	6	1197936	1197941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2169	NC_004113	CAC	2	6	1197951	1197956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2170	NC_004113	AGGC	2	8	1198018	1198025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2171	NC_004113	AGG	2	6	1198060	1198065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2174	NC_004113	AG	3	6	1198270	1198275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2175	NC_004113	TGCA	2	8	1198300	1198307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2176	NC_004113	G	6	6	1198337	1198342	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2177	NC_004113	C	6	6	1200161	1200166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2178	NC_004113	TAGA	2	8	1200195	1200202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2179	NC_004113	GACA	2	8	1200294	1200301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2183	NC_004113	TC	3	6	1201710	1201715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2190	NC_004113	T	6	6	1203103	1203108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2204	NC_004113	CT	3	6	1206229	1206234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2210	NC_004113	TGCT	2	8	1209494	1209501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2211	NC_004113	CGCT	2	8	1209513	1209520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2212	NC_004113	GCA	2	6	1209529	1209534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2217	NC_004113	GT	3	6	1209794	1209799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2218	NC_004113	CTG	2	6	1209811	1209816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2221	NC_004113	CAT	2	6	1217357	1217362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2222	NC_004113	GGT	2	6	1217363	1217368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2223	NC_004113	TGA	2	6	1217484	1217489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2224	NC_004113	C	6	6	1217513	1217518	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2225	NC_004113	GGT	2	6	1217597	1217602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2232	NC_004113	T	6	6	1226813	1226818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2233	NC_004113	ATTAA	2	10	1226893	1226902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2235	NC_004113	GC	3	6	1226945	1226950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2236	NC_004113	ACG	2	6	1226957	1226962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2239	NC_004113	TGA	2	6	1228241	1228246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2241	NC_004113	TGGT	2	8	1233701	1233708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2242	NC_004113	GCA	2	6	1233709	1233714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2243	NC_004113	GTG	2	6	1233783	1233788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_004113	GCG	2	6	1233816	1233821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2245	NC_004113	G	7	7	1233912	1233918	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2246	NC_004113	TTC	2	6	1233921	1233926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2247	NC_004113	CTT	2	6	1233930	1233935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2248	NC_004113	CCT	2	6	1238392	1238397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2249	NC_004113	GCC	2	6	1238502	1238507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2250	NC_004113	ATAAA	2	10	1239791	1239800	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2251	NC_004113	AACAA	2	10	1239802	1239811	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2252	NC_004113	TAA	2	6	1239814	1239819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2253	NC_004113	AGG	2	6	1239831	1239836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2254	NC_004113	TCA	2	6	1240299	1240304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_004113	ATC	2	6	1240310	1240315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2256	NC_004113	GGC	2	6	1240333	1240338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2257	NC_004113	AGC	2	6	1240342	1240347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2258	NC_004113	AATTG	2	10	1240366	1240375	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2259	NC_004113	GA	4	8	1240387	1240394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2260	NC_004113	TC	3	6	1240465	1240470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2261	NC_004113	GGC	2	6	1240524	1240529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2262	NC_004113	GGC	2	6	1242912	1242917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2263	NC_004113	CCT	2	6	1243953	1243958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2264	NC_004113	CTTAG	2	10	1247540	1247549	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2265	NC_004113	GTA	2	6	1247602	1247607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2266	NC_004113	ATG	2	6	1247626	1247631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2268	NC_004113	GCT	2	6	1247708	1247713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2367	NC_004113	TAAAA	2	10	1287832	1287841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2374	NC_004113	CTCCC	2	10	1293358	1293367	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2375	NC_004113	GAA	2	6	1293410	1293415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2377	NC_004113	GTT	2	6	1293791	1293796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2378	NC_004113	A	7	7	1293816	1293822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2379	NC_004113	ACG	2	6	1296621	1296626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2380	NC_004113	GTT	2	6	1297615	1297620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2381	NC_004113	TTGA	2	8	1297627	1297634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2382	NC_004113	TCA	2	6	1300167	1300172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2383	NC_004113	ACT	2	6	1300325	1300330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2384	NC_004113	AG	3	6	1301790	1301795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2385	NC_004113	TCT	2	6	1304053	1304058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2386	NC_004113	AAC	2	6	1304070	1304075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2387	NC_004113	CTG	2	6	1308009	1308014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2388	NC_004113	G	6	6	1311138	1311143	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2389	NC_004113	TTC	2	6	1311189	1311194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2390	NC_004113	GCT	2	6	1311216	1311221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2391	NC_004113	TCA	2	6	1311505	1311510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2392	NC_004113	AAC	2	6	1313273	1313278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2393	NC_004113	CTG	2	6	1314544	1314549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2394	NC_004113	A	7	7	1315959	1315965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2395	NC_004113	CCT	2	6	1316552	1316557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2396	NC_004113	ATCT	2	8	1316620	1316627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2397	NC_004113	GAATA	2	10	1316640	1316649	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2398	NC_004113	TAT	2	6	1316659	1316664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2399	NC_004113	CTC	2	6	1320665	1320670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2400	NC_004113	TA	3	6	1320732	1320737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2401	NC_004113	CTTG	2	8	1320895	1320902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2402	NC_004113	AG	3	6	1321686	1321691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2403	NC_004113	C	7	7	1323974	1323980	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2404	NC_004113	AGGG	2	8	1323981	1323988	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2406	NC_004113	TC	3	6	1325141	1325146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2413	NC_004113	CTAA	2	8	1330678	1330685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2416	NC_004113	CCG	2	6	1335791	1335796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2423	NC_004113	CCT	2	6	1340952	1340957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2434	NC_004113	TTG	2	6	1354516	1354521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2435	NC_004113	GCT	2	6	1354522	1354527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2437	NC_004113	TAT	2	6	1355812	1355817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2439	NC_004113	AT	3	6	1356164	1356169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2440	NC_004113	ATT	2	6	1356178	1356183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2453	NC_004113	A	7	7	1369176	1369182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2454	NC_004113	GGTG	2	8	1369234	1369241	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2455	NC_004113	A	6	6	1369293	1369298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2472	NC_004113	TGA	2	6	1372408	1372413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2484	NC_004113	TGCCT	2	10	1381853	1381862	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2485	NC_004113	GCT	2	6	1381923	1381928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2490	NC_004113	CTGC	2	8	1387508	1387515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2493	NC_004113	G	6	6	1388877	1388882	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2494	NC_004113	ATT	2	6	1388903	1388908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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