MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 4783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004113	TCCT	2	8	235957	235964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_004113	GCG	2	6	235973	235978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_004113	TC	3	6	236107	236112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_004113	AAC	2	6	236146	236151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_004113	GCT	2	6	236173	236178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_004113	TC	3	6	236271	236276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_004113	TGG	2	6	236277	236282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_004113	GT	3	6	238314	238319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004113	C	6	6	238357	238362	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
510	NC_004113	TCAAAT	2	12	238364	238375	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
511	NC_004113	GT	3	6	238487	238492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_004113	GA	3	6	239371	239376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_004113	CTA	2	6	242783	242788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_004113	ATA	2	6	244472	244477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004113	AG	3	6	245739	245744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004113	AAG	2	6	245748	245753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_004113	A	6	6	245758	245763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004113	GAA	2	6	245766	245771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_004113	GTCG	2	8	245774	245781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
520	NC_004113	G	6	6	245789	245794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004113	TGC	2	6	245798	245803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_004113	C	6	6	245856	245861	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
523	NC_004113	TGCA	2	8	245891	245898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
524	NC_004113	CT	3	6	245923	245928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_004113	GAT	2	6	246059	246064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_004113	CCA	2	6	246078	246083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_004113	ATCCA	2	10	246096	246105	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
528	NC_004113	CCT	2	6	246133	246138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_004113	GGT	2	6	246249	246254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_004113	C	6	6	246280	246285	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
531	NC_004113	GAA	2	6	246291	246296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_004113	TCACT	2	10	246381	246390	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
533	NC_004113	TCC	2	6	246448	246453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_004113	ATC	2	6	246597	246602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_004113	AGA	2	6	246624	246629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_004113	CAT	2	6	246637	246642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_004113	GCAT	2	8	247196	247203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_004113	ATAAA	2	10	247266	247275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_004113	AT	3	6	247343	247348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004113	TTGGC	2	10	247383	247392	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
541	NC_004113	CTG	2	6	247462	247467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_004113	GCT	2	6	251095	251100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_004113	TCG	2	6	251109	251114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_004113	ACC	2	6	252154	252159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_004113	GCC	2	6	252162	252167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_004113	CATT	2	8	252191	252198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_004113	CTT	2	6	252881	252886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_004113	CCT	2	6	252935	252940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_004113	TCC	2	6	252946	252951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_004113	G	6	6	257019	257024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004113	C	7	7	257030	257036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
552	NC_004113	CCCT	2	8	257065	257072	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
553	NC_004113	CAT	2	6	257360	257365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_004113	GA	3	6	257376	257381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004113	AGGG	2	8	257393	257400	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004113	AAT	2	6	257454	257459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_004113	G	6	6	258673	258678	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004113	CCA	2	6	258729	258734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_004113	TGA	2	6	258749	258754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004113	TAG	2	6	258842	258847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_004113	TAT	2	6	262881	262886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004113	GCA	2	6	266319	266324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_004113	TAT	2	6	266348	266353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004113	GAT	2	6	267931	267936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_004113	T	7	7	267936	267942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_004113	T	6	6	267972	267977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004113	GAA	2	6	267999	268004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_004113	CT	3	6	272136	272141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_004113	ATTT	2	8	272147	272154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004113	ATTT	2	8	273486	273493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004113	TA	3	6	273501	273506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004113	TTG	2	6	273587	273592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004113	A	6	6	273617	273622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_004113	GAG	2	6	277187	277192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004113	TCAT	2	8	277199	277206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
576	NC_004113	A	6	6	277224	277229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_004113	TTTA	2	8	277231	277238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004113	AGA	2	6	279002	279007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_004113	ATA	2	6	279019	279024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_004113	GCCCC	2	10	279058	279067	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
581	NC_004113	GCC	2	6	279076	279081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_004113	GT	3	6	280462	280467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_004113	TGT	2	6	280483	280488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_004113	GTT	2	6	280503	280508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_004113	TTTC	2	8	281399	281406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_004113	AGG	2	6	281416	281421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_004113	GTG	2	6	282457	282462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_004113	T	6	6	282475	282480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_004113	A	6	6	283685	283690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_004113	TTA	2	6	283756	283761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_004113	GAG	2	6	284140	284145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_004113	GA	3	6	284292	284297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_004113	AATG	2	8	286743	286750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004113	GGATT	2	10	286784	286793	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
595	NC_004113	CAA	2	6	286796	286801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_004113	GCA	2	6	290708	290713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_004113	GAT	2	6	293427	293432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_004113	CAA	2	6	293446	293451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_004113	GTT	2	6	293467	293472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_004113	CCGAA	2	10	293545	293554	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
601	NC_004113	GAG	2	6	293574	293579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_004113	AAGTG	2	10	293638	293647	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004113	CTG	2	6	293726	293731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_004113	CAC	2	6	293774	293779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_004113	AGGC	2	8	293841	293848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
606	NC_004113	TGA	2	6	293865	293870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_004113	CCCG	2	8	293954	293961	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
608	NC_004113	CTG	2	6	293978	293983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_004113	GAT	2	6	294055	294060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_004113	CAA	2	6	294074	294079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_004113	GTT	2	6	294095	294100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_004113	AGG	2	6	294118	294123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_004113	GAG	2	6	294202	294207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_004113	AAGTG	2	10	294266	294275	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
615	NC_004113	GGATT	2	10	294343	294352	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
616	NC_004113	TGCT	2	8	294356	294363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
617	NC_004113	CCG	2	6	294388	294393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_004113	CAC	2	6	294403	294408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_004113	AGGC	2	8	294470	294477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
620	NC_004113	AGG	2	6	294512	294517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_004113	CAT	2	6	294585	294590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_004113	C	6	6	294623	294628	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
623	NC_004113	AG	3	6	294722	294727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_004113	TGCA	2	8	294752	294759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_004113	G	6	6	294789	294794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
626	NC_004113	C	6	6	296613	296618	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
627	NC_004113	ATT	2	6	296631	296636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_004113	TGA	2	6	296702	296707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_004113	CCT	2	6	296717	296722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_004113	TTC	2	6	296782	296787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_004113	T	6	6	296792	296797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004113	ATGG	2	8	296834	296841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_004113	GAT	2	6	297479	297484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_004113	CCA	2	6	297506	297511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_004113	AGG	2	6	300458	300463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004113	ACA	2	6	300490	300495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_004113	ACC	2	6	300575	300580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_004113	T	6	6	301063	301068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_004113	T	6	6	301072	301077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_004113	ATTTT	2	10	301078	301087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_004113	T	6	6	301084	301089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_004113	T	6	6	301093	301098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_004113	T	6	6	304562	304567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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