MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 4783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004113	GCA	2	6	2474349	2474354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_004113	TTA	2	6	2474373	2474378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_004113	GGT	2	6	2474430	2474435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_004113	ATTC	2	8	2476310	2476317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_004113	GTT	2	6	2476334	2476339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_004113	GGC	2	6	2476374	2476379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_004113	TAG	2	6	2476450	2476455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_004113	CAA	2	6	2476457	2476462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_004113	CTAT	2	8	2478290	2478297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4510	NC_004113	GTC	2	6	2481363	2481368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_004113	GAC	2	6	2481407	2481412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_004113	AGGG	2	8	2486156	2486163	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_004113	AAT	2	6	2486217	2486222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_004113	G	6	6	2487436	2487441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_004113	CTAA	2	8	2488459	2488466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_004113	A	6	6	2488515	2488520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_004113	CCG	2	6	2488521	2488526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_004113	TATGGT	2	12	2488532	2488543	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_004113	CTC	2	6	2488552	2488557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_004113	GCT	2	6	2488575	2488580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_004113	CTG	2	6	2488643	2488648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_004113	TTG	2	6	2488780	2488785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_004113	ATT	2	6	2488864	2488869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_004113	TCC	2	6	2489021	2489026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_004113	TGA	2	6	2489058	2489063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_004113	CAT	2	6	2489065	2489070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_004113	ACC	2	6	2489089	2489094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_004113	TC	3	6	2489159	2489164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_004113	CA	3	6	2489169	2489174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_004113	TAAA	2	8	2489673	2489680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_004113	AAT	2	6	2489984	2489989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_004113	ATG	2	6	2490006	2490011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_004113	CAG	2	6	2490051	2490056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_004113	CAT	2	6	2490082	2490087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_004113	AG	3	6	2490174	2490179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_004113	GTT	2	6	2490195	2490200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_004113	AGG	2	6	2491942	2491947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_004113	ACA	2	6	2495436	2495441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_004113	CTCA	2	8	2495455	2495462	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_004113	ACA	2	6	2495504	2495509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_004113	AGGTC	2	10	2495550	2495559	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4542	NC_004113	TC	3	6	2495563	2495568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_004113	TAAA	2	8	2495609	2495616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_004113	GAT	2	6	2495637	2495642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_004113	ATC	2	6	2495702	2495707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_004113	ATG	2	6	2495719	2495724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_004113	TTG	2	6	2495789	2495794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_004113	AATAA	2	10	2495844	2495853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_004113	GAA	2	6	2495905	2495910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_004113	ACA	2	6	2495969	2495974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_004113	AAGT	2	8	2495990	2495997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_004113	TTCT	2	8	2496003	2496010	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_004113	TCT	3	9	2496008	2496016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_004113	TTTC	2	8	2496034	2496041	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4555	NC_004113	T	6	6	2496042	2496047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_004113	ATCT	2	8	2496057	2496064	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_004113	GA	3	6	2496079	2496084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_004113	TAAT	2	8	2496086	2496093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_004113	ATT	2	6	2496099	2496104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_004113	CTTT	2	8	2496140	2496147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4561	NC_004113	TTG	2	6	2496189	2496194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_004113	TTG	2	6	2496209	2496214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_004113	GCG	2	6	2497258	2497263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_004113	A	6	6	2497324	2497329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_004113	GAA	2	6	2497345	2497350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_004113	GAA	2	6	2497420	2497425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_004113	TAA	2	6	2497426	2497431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_004113	TGC	2	6	2497461	2497466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_004113	ACG	2	6	2498163	2498168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_004113	CAGCGC	2	12	2498169	2498180	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4571	NC_004113	GCC	2	6	2498182	2498187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4572	NC_004113	TTC	2	6	2498250	2498255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_004113	AGA	2	6	2498258	2498263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_004113	CGA	2	6	2498283	2498288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_004113	ATC	2	6	2500437	2500442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_004113	TCA	2	6	2500461	2500466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_004113	GAA	2	6	2500469	2500474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_004113	CAG	2	6	2500485	2500490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_004113	AAG	2	6	2500505	2500510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_004113	TGGG	2	8	2500621	2500628	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_004113	GGA	2	6	2500631	2500636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_004113	AGC	2	6	2500637	2500642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_004113	AAC	2	6	2500696	2500701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_004113	AGGA	2	8	2500713	2500720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_004113	GCC	2	6	2500792	2500797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4586	NC_004113	ACC	2	6	2500852	2500857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_004113	TGG	2	6	2502648	2502653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_004113	CGATCG	2	12	2504274	2504285	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_004113	GAAG	2	8	2504329	2504336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_004113	CAACTC	2	12	2504397	2504408	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_004113	GGCAAA	2	12	2505650	2505661	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4592	NC_004113	ATCAA	2	10	2505662	2505671	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4593	NC_004113	TCAA	2	8	2505728	2505735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4594	NC_004113	CAG	2	6	2505744	2505749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_004113	GCA	2	6	2505750	2505755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_004113	CAG	2	6	2509907	2509912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_004113	TGT	2	6	2511804	2511809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_004113	ATG	2	6	2511921	2511926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_004113	ACT	2	6	2513694	2513699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_004113	GA	3	6	2514000	2514005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_004113	CTG	2	6	2514038	2514043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_004113	GGTCA	2	10	2516146	2516155	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4603	NC_004113	GCG	2	6	2517377	2517382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_004113	CT	4	8	2517427	2517434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_004113	CG	3	6	2517435	2517440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_004113	CGCC	2	8	2517443	2517450	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4607	NC_004113	CTGTGC	2	12	2517475	2517486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_004113	ATC	2	6	2518013	2518018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_004113	T	6	6	2518226	2518231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_004113	AGC	2	6	2518239	2518244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_004113	GA	3	6	2520101	2520106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_004113	A	6	6	2520114	2520119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_004113	AGA	2	6	2521792	2521797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_004113	CAAAG	2	10	2522289	2522298	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4615	NC_004113	GGC	2	6	2522326	2522331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_004113	CAG	2	6	2522345	2522350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_004113	C	6	6	2523690	2523695	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4618	NC_004113	ATT	2	6	2523856	2523861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_004113	GGGTT	2	10	2523875	2523884	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_004113	GGGA	2	8	2523916	2523923	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_004113	CT	3	6	2523927	2523932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_004113	ACA	2	6	2523967	2523972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_004113	TGTT	2	8	2524478	2524485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_004113	GAC	2	6	2524498	2524503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_004113	T	6	6	2524690	2524695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_004113	CCA	2	6	2524777	2524782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_004113	G	6	6	2526659	2526664	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_004113	GAT	2	6	2527523	2527528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_004113	TGA	2	6	2527544	2527549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_004113	TGG	2	6	2527575	2527580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_004113	GTT	2	6	2527625	2527630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_004113	CGCT	2	8	2527685	2527692	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4633	NC_004113	TTA	2	6	2527865	2527870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_004113	ATTT	2	8	2527950	2527957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4638	NC_004113	CTG	2	6	2529987	2529992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4644	NC_004113	T	8	8	2530208	2530215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4665	NC_004113	GAGT	2	8	2543875	2543882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4746	NC_004113	TCC	2	6	2572692	2572697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4747	NC_004113	CAC	2	6	2575636	2575641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4748	NC_004113	ATA	2	6	2575649	2575654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4749	NC_004113	CGG	2	6	2576478	2576483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4751	NC_004113	CAAAA	2	10	2577932	2577941	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4753	NC_004113	ATG	2	6	2578033	2578038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4755	NC_004113	GCTT	2	8	2581794	2581801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4756	NC_004113	CATT	2	8	2581835	2581842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4757	NC_004113	CG	3	6	2581849	2581854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4758	NC_004113	AGGGAT	2	12	2581903	2581914	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_004113	TG	4	8	2581945	2581952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4760	NC_004113	AGT	2	6	2582022	2582027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4761	NC_004113	CAA	2	6	2582033	2582038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4762	NC_004113	ACAGGG	2	12	2582050	2582061	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4763	NC_004113	AGCC	2	8	2582072	2582079	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4764	NC_004113	AGA	2	6	2582086	2582091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4765	NC_004113	TTG	2	6	2582157	2582162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4766	NC_004113	CTTA	2	8	2583129	2583136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4767	NC_004113	CTG	2	6	2583218	2583223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4768	NC_004113	CAA	2	6	2583226	2583231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4769	NC_004113	GCA	2	6	2583242	2583247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4770	NC_004113	AAT	2	6	2583261	2583266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4771	NC_004113	A	6	6	2590174	2590179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4772	NC_004113	TTCA	2	8	2591447	2591454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4773	NC_004113	ACTG	2	8	2592282	2592289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4774	NC_004113	T	6	6	2593508	2593513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4775	NC_004113	ATTG	2	8	2593522	2593529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4776	NC_004113	GA	3	6	2593552	2593557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4777	NC_004113	CAA	2	6	2593565	2593570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4778	NC_004113	GA	3	6	2593613	2593618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4779	NC_004113	C	6	6	2593632	2593637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4780	NC_004113	AGG	2	6	2593640	2593645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4781	NC_004113	ATT	2	6	2593697	2593702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4782	NC_004113	GCT	2	6	2593731	2593736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4783	NC_004113	TC	4	8	2593748	2593755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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