MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter tengcongensis MB4 chromosome

Total Repeats: 9024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003869	TAT	2	6	33	38	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003869	TAAA	2	8	61	68	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003869	AAC	2	6	85	90	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_003869	GTT	2	6	101	106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003869	GTT	2	6	124	129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003869	TATTT	2	10	149	158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003869	A	6	6	161	166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003869	T	7	7	181	187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003869	T	6	6	194	199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003869	T	6	6	237	242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003869	CAA	2	6	256	261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_003869	ATA	2	6	298	303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003869	AATTA	2	10	322	331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003869	ATT	2	6	337	342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003869	AGG	2	6	352	357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003869	AAT	2	6	1748	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003869	ATT	2	6	1791	1796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003869	CA	3	6	1802	1807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_003869	TAC	3	9	1854	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_003869	TGT	2	6	1870	1875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003869	A	6	6	1902	1907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003869	T	6	6	4376	4381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003869	TTG	2	6	6933	6938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003869	ACTAA	2	10	6996	7005	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_003869	CGCT	2	8	7064	7071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_003869	CAA	2	6	7125	7130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_003869	AC	3	6	7140	7145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_003869	T	6	6	7156	7161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003869	TAT	2	6	9642	9647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003869	TAT	2	6	9671	9676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003869	AAT	2	6	9686	9691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003869	TTTC	2	8	9716	9723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003869	CCCT	2	8	15172	15179	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_003869	TAT	2	6	15181	15186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003869	TCA	2	6	15228	15233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_003869	CAA	2	6	15234	15239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_003869	CTTA	2	8	15268	15275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003869	TAA	2	6	15299	15304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003869	ATT	2	6	15466	15471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003869	TTG	2	6	15491	15496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003869	GTT	2	6	15519	15524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003869	CTT	2	6	15537	15542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_003869	TCT	2	6	15594	15599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_003869	GAAGA	2	10	15637	15646	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003869	TTGAT	2	10	15661	15670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003869	CCT	2	6	16979	16984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_003869	AGG	2	6	17038	17043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003869	T	6	6	17050	17055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003869	T	6	6	17075	17080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003869	ATA	2	6	17126	17131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003869	A	6	6	17206	17211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003869	T	7	7	17219	17225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003869	T	6	6	17241	17246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003869	ACAA	2	8	17279	17286	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_003869	GAA	2	6	17364	17369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003869	AG	3	6	17405	17410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003869	GGT	2	6	17413	17418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003869	GGT	2	6	17580	17585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003869	G	6	6	17640	17645	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003869	AAAG	2	8	26497	26504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003869	CTTT	2	8	26516	26523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_003869	CCT	2	6	27597	27602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_003869	TAT	2	6	27610	27615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003869	TTG	2	6	27653	27658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003869	TAA	2	6	27663	27668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003869	A	7	7	27667	27673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003869	CCG	2	6	27675	27680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_003869	CTT	2	6	27743	27748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003869	TC	3	6	27854	27859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_003869	TAT	2	6	27892	27897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003869	ATTT	2	8	27935	27942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003869	GAG	2	6	27978	27983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003869	TAA	2	6	28537	28542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003869	AGT	2	6	28543	28548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003869	ATA	2	6	28549	28554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003869	AGT	2	6	28592	28597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003869	AG	3	6	28613	28618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003869	TGG	2	6	28620	28625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003869	GTG	2	6	28626	28631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003869	ATCC	2	8	28657	28664	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_003869	ATT	2	6	28776	28781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003869	AGG	3	9	28789	28797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003869	ATA	2	6	30105	30110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003869	GTG	2	6	30272	30277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003869	TACT	2	8	30382	30389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_003869	CCT	2	6	31628	31633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_003869	T	6	6	31708	31713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003869	AGG	2	6	31722	31727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003869	TCCC	2	8	31730	31737	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_003869	GTAG	2	8	31747	31754	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003869	AAAC	2	8	31767	31774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_003869	AGG	2	6	31788	31793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003869	CTT	2	6	33254	33259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_003869	TTTA	2	8	33279	33286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003869	TAA	2	6	33327	33332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003869	ACT	2	6	33351	33356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_003869	T	6	6	33371	33376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003869	TAT	2	6	33437	33442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003869	TTA	2	6	33498	33503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003869	GGC	2	6	33614	33619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_003869	T	6	6	33620	33625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003869	ATA	2	6	33657	33662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003869	AGCTAG	2	12	33736	33747	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_003869	T	7	7	33757	33763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003869	AGT	2	6	33800	33805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003869	TTG	2	6	33835	33840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003869	AAG	2	6	33845	33850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003869	A	7	7	33864	33870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003869	CT	3	6	33884	33889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_003869	TGG	2	6	33930	33935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003869	ATT	2	6	33973	33978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003869	A	6	6	33993	33998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003869	GTT	2	6	34059	34064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003869	TGT	2	6	34088	34093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003869	CTC	2	6	34216	34221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_003869	TGC	2	6	34223	34228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_003869	T	8	8	34230	34237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003869	ATT	2	6	34258	34263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003869	TAC	2	6	34347	34352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_003869	CT	3	6	34356	34361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_003869	CT	3	6	34365	34370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_003869	GTT	2	6	34371	34376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003869	T	6	6	34382	34387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003869	TGA	2	6	34402	34407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003869	TA	3	6	34536	34541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003869	GGA	2	6	34589	34594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003869	A	6	6	34611	34616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003869	TAT	2	6	34728	34733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003869	GACATA	2	12	34743	34754	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_003869	GATA	2	8	34755	34762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003869	AGC	2	6	34796	34801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_003869	CAC	2	6	34828	34833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_003869	ATG	2	6	34903	34908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003869	GAT	2	6	34931	34936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003869	CTA	2	6	34954	34959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_003869	AGAC	2	8	34979	34986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_003869	ATTT	2	8	34992	34999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003869	ACA	2	6	35097	35102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_003869	CTG	2	6	35173	35178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_003869	AG	4	8	35222	35229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003869	TCCTT	2	10	35243	35252	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_003869	TA	3	6	35271	35276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003869	ATA	2	6	35304	35309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003869	AATT	2	8	35366	35373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003869	TGG	2	6	35398	35403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003869	A	6	6	35503	35508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003869	ACAG	2	8	35561	35568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_003869	TAA	2	6	35611	35616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003869	AGA	2	6	35617	35622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003869	GAA	2	6	35714	35719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003869	TGA	2	6	35727	35732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_003869	CT	4	8	46209	46216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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