MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Treponema denticola ATCC 35405 chromosome

Total Repeats: 5744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002967	TTAA	2	8	18	25	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002967	CTA	2	6	85	90	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002967	ATT	2	6	146	151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002967	CAA	2	6	153	158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002967	TAC	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002967	T	8	8	1602	1609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002967	AAT	2	6	1612	1617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002967	A	6	6	1627	1632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002967	CTT	2	6	4364	4369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002967	AGG	2	6	4372	4377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002967	A	7	7	6161	6167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002967	GATGG	2	10	9804	9813	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002967	TCA	2	6	9844	9849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002967	ATT	2	6	9912	9917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002967	T	6	6	9916	9921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002967	CTAT	2	8	9930	9937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002967	ACAA	2	8	9939	9946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_002967	TAA	2	6	9953	9958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002967	TTC	2	6	9978	9983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002967	AAT	2	6	9990	9995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002967	GAA	2	6	10874	10879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002967	TAAC	2	8	10885	10892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_002967	A	6	6	10908	10913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002967	T	6	6	10968	10973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002967	A	6	6	10987	10992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002967	A	6	6	13710	13715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002967	A	8	8	13747	13754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002967	CCT	2	6	14641	14646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_002967	AT	3	6	15302	15307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002967	TTA	2	6	15401	15406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002967	TA	4	8	15454	15461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002967	A	6	6	15475	15480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002967	TTTA	2	8	15501	15508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002967	A	6	6	15508	15513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002967	T	6	6	15530	15535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002967	T	7	7	16227	16233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002967	T	8	8	16259	16266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002967	AGG	2	6	16297	16302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002967	CTT	2	6	17797	17802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002967	AAGAT	2	10	18801	18810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002967	TGTTA	2	10	18811	18820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002967	CTA	2	6	18829	18834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002967	ATA	2	6	18844	18849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002967	A	6	6	18886	18891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002967	T	6	6	18904	18909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002967	ATA	2	6	21967	21972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002967	A	8	8	23119	23126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002967	TCC	2	6	23129	23134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_002967	GGAA	2	8	23141	23148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002967	ATT	2	6	23680	23685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002967	ATT	2	6	23710	23715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002967	A	6	6	25436	25441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002967	T	7	7	25466	25472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002967	A	8	8	25536	25543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002967	A	6	6	27958	27963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002967	T	7	7	31665	31671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002967	T	6	6	31707	31712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002967	TTCA	2	8	31772	31779	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_002967	T	6	6	31811	31816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002967	T	9	9	31819	31827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002967	CCT	2	6	31839	31844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_002967	T	6	6	31862	31867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002967	T	6	6	31899	31904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002967	AAT	2	6	34101	34106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002967	A	8	8	34114	34121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002967	TCC	2	6	36025	36030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_002967	TCC	2	6	37820	37825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_002967	TA	3	6	37834	37839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002967	ATT	2	6	37870	37875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002967	TTA	2	6	37969	37974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002967	GA	3	6	37997	38002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002967	ATG	2	6	38807	38812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002967	CTAT	2	8	38855	38862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_002967	CCT	2	6	39192	39197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_002967	ATT	2	6	39201	39206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002967	A	6	6	39221	39226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002967	A	6	6	39259	39264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002967	A	7	7	39273	39279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002967	TCC	2	6	41544	41549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_002967	CAG	2	6	41556	41561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_002967	TTA	2	6	41643	41648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002967	T	6	6	42141	42146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002967	CAA	2	6	42159	42164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_002967	CTT	2	6	42167	42172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_002967	AT	3	6	42181	42186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002967	CAT	2	6	42192	42197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002967	CCT	2	6	42896	42901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_002967	TAT	2	6	42920	42925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002967	ATA	2	6	42926	42931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002967	ATTA	2	8	42932	42939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002967	AAT	2	6	42949	42954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002967	TATT	2	8	42976	42983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002967	TTTCTT	2	12	43013	43024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_002967	TGT	2	6	43079	43084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002967	T	6	6	43111	43116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002967	TTA	2	6	44413	44418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002967	T	7	7	44425	44431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002967	TAT	2	6	45783	45788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002967	AGAA	2	8	47569	47576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002967	TTGCT	2	10	48716	48725	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_002967	TAAA	2	8	48760	48767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002967	A	6	6	48808	48813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002967	CTG	2	6	51726	51731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_002967	ATTG	2	8	53333	53340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002967	ATT	2	6	55212	55217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002967	AGGC	2	8	55229	55236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_002967	T	6	6	55240	55245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002967	T	6	6	55256	55261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002967	TATT	2	8	55951	55958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002967	ATT	2	6	55962	55967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002967	ATTA	2	8	55977	55984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002967	A	7	7	56003	56009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002967	TCC	2	6	57258	57263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_002967	A	6	6	57266	57271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002967	GATAG	2	10	57935	57944	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002967	AGA	2	6	57951	57956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002967	CGT	2	6	57999	58004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_002967	A	6	6	58120	58125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002967	TGC	2	6	58214	58219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002967	A	6	6	58230	58235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002967	ATT	2	6	59196	59201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002967	TCC	2	6	59215	59220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_002967	ATT	2	6	59230	59235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002967	AATA	2	8	59251	59258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002967	A	6	6	59269	59274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002967	TATT	2	8	59283	59290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002967	T	8	8	61352	61359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002967	T	6	6	65816	65821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002967	TAA	2	6	65825	65830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002967	AAT	2	6	65837	65842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002967	A	7	7	67073	67079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002967	ATTT	2	8	67088	67095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002967	TTA	2	6	67118	67123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002967	CA	3	6	67545	67550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_002967	A	6	6	67554	67559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002967	A	8	8	67577	67584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002967	TTATT	2	10	67942	67951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002967	ATTC	2	8	69103	69110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002967	TTC	2	6	69125	69130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_002967	CCG	2	6	69133	69138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_002967	A	8	8	69176	69183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002967	A	8	8	69186	69193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002967	AAT	2	6	69739	69744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002967	T	6	6	69775	69780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002967	T	6	6	69791	69796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002967	ATT	2	6	69845	69850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002967	GCA	2	6	72765	72770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_002967	A	6	6	72785	72790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002967	T	6	6	72792	72797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002967	AAT	2	6	72825	72830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002967	CCT	2	6	72904	72909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_002967	ATTA	2	8	75383	75390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002967	TTC	2	6	75393	75398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_002967	T	6	6	75417	75422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_002967	ATT	2	6	77729	77734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_002967	TAA	2	6	77774	77779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_002967	ATT	2	6	77784	77789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_002967	TAA	2	6	77844	77849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_002967	CTTT	2	8	78682	78689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_002967	T	8	8	78699	78706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_002967	ATT	2	6	80993	80998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_002967	TAA	2	6	81007	81012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_002967	T	6	6	81055	81060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_002967	TA	3	6	87502	87507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_002967	ATC	2	6	88823	88828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_002967	GCTCT	2	10	171907	171916	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
292	NC_002967	TAAAA	2	10	176287	176296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_002967	A	6	6	271371	271376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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