MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermoplasma volcanium GSS1 chromosome

Total Repeats: 5173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002689	A	6	6	11	16	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002689	A	6	6	54	59	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002689	TAAGG	2	10	88	97	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002689	TTTAA	2	10	1217	1226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002689	AATT	2	8	1256	1263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002689	TA	3	6	1272	1277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002689	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002689	TTCA	2	8	1292	1299	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002689	AT	3	6	1300	1305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002689	AAATAT	2	12	1336	1347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002689	AGA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002689	TTAA	2	8	1362	1369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002689	TGA	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002689	AT	3	6	1403	1408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002689	A	6	6	4370	4375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002689	AT	3	6	5135	5140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002689	TTA	2	6	5141	5146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002689	T	6	6	5151	5156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002689	AT	3	6	5195	5200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002689	CAT	2	6	5201	5206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002689	TAA	2	6	5209	5214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002689	AT	3	6	5238	5243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002689	TTA	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002689	AT	3	6	5323	5328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002689	A	6	6	5413	5418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002689	AT	3	6	5510	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002689	TA	3	6	5521	5526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002689	AT	3	6	5527	5532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002689	CT	3	6	5548	5553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002689	ATA	2	6	7458	7463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002689	CATA	2	8	7580	7587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_002689	TAA	2	6	7607	7612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002689	TTA	2	6	7651	7656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002689	TAAA	2	8	7665	7672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002689	TGA	2	6	8656	8661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002689	CTA	2	6	8951	8956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002689	TAA	2	6	10152	10157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002689	GTG	2	6	10166	10171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002689	AAT	2	6	10207	10212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002689	ATA	2	6	12098	12103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002689	TAAAA	2	10	12652	12661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002689	AGT	2	6	13880	13885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002689	TTA	2	6	13899	13904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002689	CAG	2	6	13915	13920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002689	TTA	2	6	13948	13953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002689	TAC	2	6	13964	13969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_002689	CGT	2	6	13985	13990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002689	CTA	2	6	16279	16284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_002689	TGGC	2	8	16326	16333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_002689	ATT	2	6	19808	19813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002689	TA	4	8	19825	19832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002689	CT	3	6	21380	21385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002689	TTC	2	6	21423	21428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_002689	CTT	2	6	21439	21444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002689	ATT	2	6	22261	22266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002689	ATTA	2	8	22275	22282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002689	AG	3	6	22337	22342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002689	AT	3	6	22361	22366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002689	CAT	2	6	22389	22394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002689	TCCAC	2	10	22457	22466	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_002689	T	6	6	22531	22536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002689	CTTGAT	2	12	22538	22549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_002689	ATTAC	2	10	22613	22622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_002689	AAATA	2	10	22632	22641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002689	CAA	2	6	22649	22654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_002689	ATCT	2	8	23758	23765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_002689	AGT	2	6	23803	23808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002689	CAA	2	6	23872	23877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_002689	AT	4	8	23879	23886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002689	TAA	2	6	25803	25808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002689	ACC	2	6	25880	25885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_002689	T	6	6	27937	27942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002689	GCT	2	6	28016	28021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_002689	TC	3	6	28053	28058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002689	ACA	2	6	28121	28126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002689	ATA	2	6	28157	28162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002689	CTTT	2	8	28201	28208	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_002689	TTC	2	6	28233	28238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_002689	ATA	2	6	28245	28250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002689	GAC	2	6	28440	28445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_002689	A	8	8	28456	28463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002689	CCCTT	2	10	30826	30835	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_002689	CAA	2	6	32308	32313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_002689	AAT	2	6	32432	32437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002689	ATTAA	2	10	32461	32470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002689	A	6	6	34893	34898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002689	TCA	2	6	34910	34915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_002689	TAT	3	9	34916	34924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002689	AT	3	6	35065	35070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002689	AT	3	6	35077	35082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002689	CTA	2	6	35087	35092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_002689	A	6	6	35139	35144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002689	TACC	2	8	35151	35158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002689	A	7	7	35163	35169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002689	TTAA	2	8	35170	35177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002689	ATTA	2	8	36843	36850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002689	TCC	2	6	36858	36863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_002689	AGG	2	6	36875	36880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002689	A	6	6	36970	36975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002689	AAG	2	6	36993	36998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002689	AT	3	6	37136	37141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002689	TA	3	6	37145	37150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002689	AAAAGA	2	12	37173	37184	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002689	GCT	2	6	37201	37206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_002689	CAGAT	2	10	37285	37294	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_002689	AGA	2	6	37386	37391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002689	ATC	2	6	37419	37424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002689	ATGG	2	8	37442	37449	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002689	AATAAA	2	12	37531	37542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002689	TAA	2	6	37554	37559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002689	AGA	2	6	37686	37691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002689	TCA	2	6	38060	38065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_002689	CT	3	6	38069	38074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002689	TTA	2	6	38091	38096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002689	GAT	2	6	43062	43067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002689	TAA	2	6	43627	43632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002689	GTT	2	6	43650	43655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002689	ATA	2	6	43673	43678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002689	ATG	2	6	43732	43737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002689	TAT	2	6	43778	43783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002689	TAT	2	6	45142	45147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002689	CCT	2	6	45152	45157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_002689	T	6	6	45722	45727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002689	TAA	2	6	45747	45752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002689	TCAAT	2	10	45755	45764	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_002689	TCC	2	6	45792	45797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_002689	CA	3	6	45851	45856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_002689	AT	3	6	46005	46010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002689	ATTC	2	8	46058	46065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_002689	AAT	2	6	46079	46084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002689	AAAAAT	2	12	46100	46111	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002689	AT	3	6	46146	46151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002689	TGCA	2	8	46170	46177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_002689	GAA	2	6	46186	46191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002689	ATT	2	6	46192	46197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002689	ACA	2	6	46207	46212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_002689	AAT	2	6	46232	46237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002689	TAAATT	2	12	47354	47365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002689	TA	3	6	47445	47450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002689	GCA	2	6	49539	49544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_002689	AT	3	6	49561	49566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002689	ATA	2	6	49570	49575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002689	AAT	2	6	49583	49588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002689	TA	3	6	49595	49600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002689	AAC	2	6	49612	49617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_002689	TA	4	8	49626	49633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002689	TCAT	2	8	49644	49651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_002689	T	6	6	49658	49663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002689	TA	3	6	49701	49706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002689	TA	4	8	49721	49728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002689	ATT	2	6	56352	56357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002689	TTGCT	2	10	56401	56410	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_002689	TAC	2	6	58707	58712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_002689	GTA	2	6	58735	58740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_002689	CGC	2	6	60455	60460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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160	NC_002689	CTT	2	6	60658	60663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_002689	TAA	2	6	61910	61915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_002689	CTTA	2	8	62194	62201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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173	NC_002689	T	8	8	63499	63506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_002689	T	6	6	65250	65255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_002689	TA	4	8	65259	65266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_002689	T	7	7	68708	68714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_002689	AAT	2	6	68715	68720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_002689	AAT	2	6	68863	68868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_002689	A	6	6	96055	96060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_002689	T	6	6	97065	97070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_002689	ATG	2	6	97094	97099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_002689	TGTA	2	8	98929	98936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_002689	CAT	3	9	123259	123267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_002689	TATTT	2	10	123560	123569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_002689	TA	3	6	128889	128894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_002689	TA	3	6	128931	128936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_002689	AT	3	6	130732	130737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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