MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 4125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002578	T	6	6	1122855	1122860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_002578	ATG	2	6	1124738	1124743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_002578	ATC	2	6	1124745	1124750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_002578	TGT	2	6	1129124	1129129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_002578	T	6	6	1129183	1129188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_002578	ATG	2	6	1129197	1129202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_002578	TCC	2	6	1129274	1129279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_002578	TA	4	8	1129295	1129302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_002578	A	6	6	1130199	1130204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_002578	TTA	2	6	1131489	1131494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_002578	TGC	2	6	1131521	1131526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_002578	CTTA	2	8	1132858	1132865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_002578	GAT	2	6	1132895	1132900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_002578	AT	3	6	1132927	1132932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_002578	ATAAC	2	10	1136450	1136459	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3016	NC_002578	AT	3	6	1136516	1136521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_002578	AGT	2	6	1136568	1136573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_002578	TCA	2	6	1136726	1136731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_002578	CAA	2	6	1136790	1136795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_002578	A	7	7	1137486	1137492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_002578	TAA	2	6	1140090	1140095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_002578	AG	3	6	1142346	1142351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_002578	TTTAG	2	10	1142367	1142376	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_002578	CTTCC	2	10	1142430	1142439	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3025	NC_002578	CAT	2	6	1142473	1142478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_002578	TGA	2	6	1142501	1142506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_002578	ATTC	2	8	1142518	1142525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_002578	GAT	2	6	1143682	1143687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_002578	ATA	2	6	1143692	1143697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_002578	ACT	2	6	1143736	1143741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_002578	AT	3	6	1144376	1144381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_002578	TTC	2	6	1144384	1144389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_002578	TAT	2	6	1146057	1146062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_002578	GCAG	2	8	1146111	1146118	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_002578	TTA	2	6	1148128	1148133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_002578	TAA	2	6	1148160	1148165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_002578	ACT	2	6	1148178	1148183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3039	NC_002578	GCC	2	6	1150693	1150698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_002578	ATA	2	6	1150699	1150704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_002578	T	6	6	1150761	1150766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_002578	CAA	2	6	1150777	1150782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_002578	ATAA	2	8	1154989	1154996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_002578	A	7	7	1155063	1155069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_002578	T	7	7	1155499	1155505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_002578	TA	3	6	1155508	1155513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_002578	TAA	2	6	1156829	1156834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_002578	ATTAT	2	10	1157331	1157340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_002578	CCA	2	6	1158697	1158702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_002578	TAA	2	6	1158704	1158709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_002578	CCG	2	6	1158715	1158720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_002578	TA	3	6	1158757	1158762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_002578	GAA	2	6	1158763	1158768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_002578	ATTA	2	8	1162306	1162313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_002578	GTTA	2	8	1162318	1162325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_002578	TTCA	2	8	1162365	1162372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3057	NC_002578	TGAATA	2	12	1162373	1162384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_002578	ATA	2	6	1165624	1165629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_002578	CCG	2	6	1165683	1165688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_002578	GCTCT	2	10	1165710	1165719	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3061	NC_002578	TCT	2	6	1165772	1165777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_002578	ATAACC	2	12	1165852	1165863	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_002578	TTG	2	6	1165880	1165885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_002578	CTA	2	6	1165923	1165928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_002578	AG	3	6	1165945	1165950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_002578	ACC	2	6	1165981	1165986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_002578	TGA	2	6	1167609	1167614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_002578	CAT	2	6	1167627	1167632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_002578	AGA	2	6	1167669	1167674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_002578	TCT	2	6	1168382	1168387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_002578	ATA	3	9	1168481	1168489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_002578	CCGG	2	8	1168504	1168511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_002578	GTC	2	6	1168525	1168530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_002578	ACC	2	6	1168564	1168569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_002578	ATA	2	6	1168637	1168642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_002578	T	6	6	1170689	1170694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_002578	TA	3	6	1174844	1174849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_002578	TC	3	6	1176859	1176864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_002578	AGG	2	6	1177536	1177541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_002578	TTC	2	6	1177569	1177574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_002578	CAT	2	6	1177576	1177581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_002578	TAT	2	6	1177641	1177646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_002578	A	6	6	1179270	1179275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_002578	AAT	2	6	1179278	1179283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_002578	CAT	2	6	1180689	1180694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_002578	AT	3	6	1180699	1180704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_002578	CCT	2	6	1185090	1185095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_002578	AT	4	8	1185134	1185141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_002578	ATG	2	6	1185181	1185186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_002578	GAT	3	9	1185193	1185201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_002578	AT	3	6	1185208	1185213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_002578	TAGCC	2	10	1185306	1185315	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3093	NC_002578	TCCC	2	8	1185372	1185379	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3094	NC_002578	CTT	2	6	1185384	1185389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_002578	TTA	2	6	1185412	1185417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_002578	ATT	2	6	1185458	1185463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_002578	TTTC	2	8	1186944	1186951	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_002578	CAT	2	6	1186970	1186975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_002578	AT	4	8	1187022	1187029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_002578	CTT	2	6	1188010	1188015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_002578	ATC	2	6	1188111	1188116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_002578	TTGC	2	8	1188132	1188139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_002578	CTA	2	6	1188145	1188150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_002578	TTC	2	6	1189631	1189636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_002578	ATCC	2	8	1189641	1189648	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_002578	TAT	2	6	1189658	1189663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_002578	CGAA	2	8	1190286	1190293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_002578	GTG	2	6	1190309	1190314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_002578	AC	3	6	1190335	1190340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_002578	TCAT	2	8	1191332	1191339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_002578	CAG	2	6	1191385	1191390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3113	NC_002578	AT	3	6	1192584	1192589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_002578	CTT	2	6	1192590	1192595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_002578	AAT	2	6	1192729	1192734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3117	NC_002578	CGC	2	6	1192865	1192870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_002578	TAGG	2	8	1192930	1192937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_002578	TAG	2	6	1192949	1192954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_002578	CT	3	6	1192981	1192986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_002578	GATG	2	8	1193739	1193746	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_002578	ATTC	2	8	1193791	1193798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_002578	GAT	2	6	1193808	1193813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_002578	AT	3	6	1193846	1193851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_002578	TA	3	6	1193864	1193869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_002578	AAT	2	6	1197282	1197287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_002578	CCATGA	2	12	1197357	1197368	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_002578	T	7	7	1197375	1197381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_002578	TAT	2	6	1197454	1197459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_002578	AT	3	6	1197458	1197463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_002578	ATA	2	6	1197477	1197482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_002578	TAAA	2	8	1197492	1197499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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