MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pedis str. T A4

Total Repeats: 58203

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022097	T	6	6	23	28	0 %	100 %	0 %	0 %	530891925
2	NC_022097	ATT	2	6	37	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530891925
3	NC_022097	CAA	2	6	113	118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530891925
4	NC_022097	AAT	2	6	126	131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530891925
5	NC_022097	TTG	2	6	226	231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530891925
6	NC_022097	AACA	2	8	261	268	75 %	0 %	0 %	25 %	530891925
7	NC_022097	GAA	2	6	283	288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530891925
8	NC_022097	A	8	8	334	341	100 %	0 %	0 %	0 %	530891925
9	NC_022097	TGA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530891925
10	NC_022097	CAA	3	9	408	416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530891925
11	NC_022097	A	6	6	447	452	100 %	0 %	0 %	0 %	530891925
12	NC_022097	CCG	2	6	575	580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530891925
13	NC_022097	A	8	8	614	621	100 %	0 %	0 %	0 %	530891925
14	NC_022097	CGG	2	6	653	658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530891925
15	NC_022097	CTT	2	6	684	689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530891925
16	NC_022097	AAG	2	6	710	715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530891925
17	NC_022097	GAAA	2	8	745	752	75 %	0 %	25 %	0 %	530891925
18	NC_022097	CAAA	2	8	753	760	75 %	0 %	0 %	25 %	530891925
19	NC_022097	A	6	6	795	800	100 %	0 %	0 %	0 %	530891925
20	NC_022097	TCAA	2	8	816	823	50 %	25 %	0 %	25 %	530891925
21	NC_022097	A	7	7	891	897	100 %	0 %	0 %	0 %	530891925
22	NC_022097	A	6	6	948	953	100 %	0 %	0 %	0 %	530891925
23	NC_022097	TTC	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530891925
24	NC_022097	AGC	2	6	981	986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530891925
25	NC_022097	A	6	6	1021	1026	100 %	0 %	0 %	0 %	530891925
26	NC_022097	ATT	2	6	1105	1110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530891925
27	NC_022097	A	6	6	1112	1117	100 %	0 %	0 %	0 %	530891925
28	NC_022097	ATT	2	6	1127	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530891925
29	NC_022097	CATTTC	2	12	1137	1148	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530891925
30	NC_022097	A	6	6	1162	1167	100 %	0 %	0 %	0 %	530891925
31	NC_022097	CGG	2	6	1260	1265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530891925
32	NC_022097	ACA	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530891925
33	NC_022097	TAA	2	6	1296	1301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530891925
34	NC_022097	CCA	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530891925
35	NC_022097	TTTA	2	8	1926	1933	25 %	75 %	0 %	0 %	530891927
36	NC_022097	GCC	2	6	1973	1978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530891927
37	NC_022097	T	6	6	2027	2032	0 %	100 %	0 %	0 %	530891927
38	NC_022097	CGC	2	6	2146	2151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530891927
39	NC_022097	GT	3	6	2187	2192	0 %	50 %	50 %	0 %	530891927
40	NC_022097	T	6	6	2205	2210	0 %	100 %	0 %	0 %	530891927
41	NC_022097	CG	3	6	2257	2262	0 %	0 %	50 %	50 %	530891927
42	NC_022097	A	6	6	2414	2419	100 %	0 %	0 %	0 %	530891927
43	NC_022097	GTA	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530891927
44	NC_022097	CGC	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530891927
45	NC_022097	AT	3	6	2589	2594	50 %	50 %	0 %	0 %	530891927
46	NC_022097	ATGC	2	8	2661	2668	25 %	25 %	25 %	25 %	530891927
47	NC_022097	TA	3	6	2888	2893	50 %	50 %	0 %	0 %	530891927
48	NC_022097	AGCA	2	8	2930	2937	50 %	0 %	25 %	25 %	530891927
49	NC_022097	AAC	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530891927
50	NC_022097	T	6	6	3024	3029	0 %	100 %	0 %	0 %	530891927
51	NC_022097	ATC	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530891927
52	NC_022097	AAC	2	6	3048	3053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530891927
53	NC_022097	TTC	2	6	3056	3061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530891927
54	NC_022097	TAA	2	6	3083	3088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530891927
55	NC_022097	TCA	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530891927
56	NC_022097	T	6	6	3116	3121	0 %	100 %	0 %	0 %	530891927
57	NC_022097	TCC	2	6	3364	3369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530891928
58	NC_022097	TTA	2	6	3389	3394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530891928
59	NC_022097	T	7	7	3408	3414	0 %	100 %	0 %	0 %	530891928
60	NC_022097	A	6	6	3447	3452	100 %	0 %	0 %	0 %	530891928
61	NC_022097	TAAAA	2	10	3454	3463	80 %	20 %	0 %	0 %	530891928
62	NC_022097	AAC	3	9	3464	3472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530891928
63	NC_022097	TAA	2	6	3553	3558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530891929
64	NC_022097	ACG	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530891929
65	NC_022097	AGC	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530891929
66	NC_022097	AAT	2	6	3705	3710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530891929
67	NC_022097	AATT	2	8	3778	3785	50 %	50 %	0 %	0 %	530891929
68	NC_022097	A	7	7	3874	3880	100 %	0 %	0 %	0 %	530891929
69	NC_022097	T	6	6	3990	3995	0 %	100 %	0 %	0 %	530891929
70	NC_022097	GAA	2	6	4092	4097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530891929
71	NC_022097	A	6	6	4103	4108	100 %	0 %	0 %	0 %	530891929
72	NC_022097	ATT	2	6	4150	4155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530891929
73	NC_022097	T	6	6	4163	4168	0 %	100 %	0 %	0 %	530891929
74	NC_022097	ACAA	2	8	4175	4182	75 %	0 %	0 %	25 %	530891929
75	NC_022097	TAC	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530891929
76	NC_022097	GAT	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530891929
77	NC_022097	T	6	6	4329	4334	0 %	100 %	0 %	0 %	530891929
78	NC_022097	TTA	2	6	4380	4385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530891929
79	NC_022097	GCG	2	6	4405	4410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530891929
80	NC_022097	CGA	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530891929
81	NC_022097	GAA	2	6	4602	4607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530891929
82	NC_022097	GAAA	2	8	4643	4650	75 %	0 %	25 %	0 %	530891929
83	NC_022097	GGC	2	6	4737	4742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530891929
84	NC_022097	GAA	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530891929
85	NC_022097	GAA	2	6	4803	4808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530891929
86	NC_022097	ATT	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530891929
87	NC_022097	GGT	2	6	4816	4821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530891929
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89	NC_022097	TTCCC	2	10	4927	4936	0 %	40 %	0 %	60 %	530891929
90	NC_022097	AATTTT	2	12	4957	4968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530891929
91	NC_022097	GGC	2	6	5024	5029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530891930
92	NC_022097	ATT	2	6	5033	5038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530891930
93	NC_022097	ATTT	2	8	5044	5051	25 %	75 %	0 %	0 %	530891930
94	NC_022097	GCC	2	6	5063	5068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530891930
95	NC_022097	GCC	2	6	5093	5098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530891930
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97	NC_022097	T	7	7	5140	5146	0 %	100 %	0 %	0 %	530891930
98	NC_022097	GAA	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530891930
99	NC_022097	A	8	8	5157	5164	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
100	NC_022097	AG	3	6	5177	5182	50 %	0 %	50 %	0 %	530891930
101	NC_022097	A	7	7	5189	5195	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
102	NC_022097	T	6	6	5239	5244	0 %	100 %	0 %	0 %	530891930
103	NC_022097	GCA	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530891930
104	NC_022097	ACA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530891930
105	NC_022097	TCCC	2	8	5343	5350	0 %	25 %	0 %	75 %	530891930
106	NC_022097	CT	3	6	5353	5358	0 %	50 %	0 %	50 %	530891930
107	NC_022097	T	7	7	5451	5457	0 %	100 %	0 %	0 %	530891930
108	NC_022097	GCC	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530891930
109	NC_022097	CAA	2	6	5495	5500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530891930
110	NC_022097	GCC	2	6	5561	5566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530891930
111	NC_022097	AAT	2	6	5569	5574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530891930
112	NC_022097	A	6	6	5640	5645	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
113	NC_022097	A	7	7	5676	5682	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
114	NC_022097	TGC	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530891930
115	NC_022097	TTCA	2	8	5757	5764	25 %	50 %	0 %	25 %	530891930
116	NC_022097	GAA	2	6	5768	5773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530891930
117	NC_022097	CA	3	6	5790	5795	50 %	0 %	0 %	50 %	530891930
118	NC_022097	ATT	2	6	5801	5806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530891930
119	NC_022097	A	8	8	5807	5814	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
120	NC_022097	A	7	7	5848	5854	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
121	NC_022097	A	7	7	5875	5881	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
122	NC_022097	TTTA	2	8	5912	5919	25 %	75 %	0 %	0 %	530891930
123	NC_022097	CCG	2	6	5946	5951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530891930
124	NC_022097	GAAG	2	8	5993	6000	50 %	0 %	50 %	0 %	530891930
125	NC_022097	A	7	7	6030	6036	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
126	NC_022097	A	7	7	6110	6116	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
127	NC_022097	A	6	6	6234	6239	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
128	NC_022097	ATAAA	2	10	6306	6315	80 %	20 %	0 %	0 %	530891930
129	NC_022097	A	6	6	6313	6318	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
130	NC_022097	A	8	8	6388	6395	100 %	0 %	0 %	0 %	530891930
131	NC_022097	TA	3	6	6428	6433	50 %	50 %	0 %	0 %	530891931
132	NC_022097	A	7	7	6433	6439	100 %	0 %	0 %	0 %	530891931
133	NC_022097	GAA	2	6	6509	6514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530891931
134	NC_022097	A	6	6	6513	6518	100 %	0 %	0 %	0 %	530891931
135	NC_022097	AAT	2	6	6568	6573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530891931
136	NC_022097	AAT	2	6	6584	6589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530891931
137	NC_022097	A	6	6	6604	6609	100 %	0 %	0 %	0 %	530891931
138	NC_022097	TGCAA	2	10	6610	6619	40 %	20 %	20 %	20 %	530891931
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140	NC_022097	A	6	6	6691	6696	100 %	0 %	0 %	0 %	530891931
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