MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum sp. 1910b

Total Repeats: 29284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022093	AT	3	6	1454	1459	50 %	50 %	0 %	0 %	530779605
2	NC_022093	GACAG	2	10	1490	1499	40 %	0 %	40 %	20 %	530779605
3	NC_022093	AGA	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530779605
4	NC_022093	TAG	2	6	1710	1715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530779605
5	NC_022093	TTC	2	6	1719	1724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779605
6	NC_022093	GCC	2	6	1850	1855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530779605
7	NC_022093	ACC	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530779605
8	NC_022093	A	6	6	1903	1908	100 %	0 %	0 %	0 %	530779605
9	NC_022093	AGG	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530779605
10	NC_022093	TG	3	6	1967	1972	0 %	50 %	50 %	0 %	530779605
11	NC_022093	CGG	2	6	1992	1997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530779605
12	NC_022093	GTCT	2	8	2011	2018	0 %	50 %	25 %	25 %	530779605
13	NC_022093	GAC	2	6	2030	2035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530779605
14	NC_022093	GAG	2	6	2066	2071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530779605
15	NC_022093	CAG	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530779605
16	NC_022093	A	6	6	2121	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	530779605
17	NC_022093	AGT	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530779605
18	NC_022093	AGA	2	6	2262	2267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530779605
19	NC_022093	TAT	2	6	2293	2298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530779605
20	NC_022093	T	7	7	2327	2333	0 %	100 %	0 %	0 %	530779606
21	NC_022093	ACT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530779606
22	NC_022093	T	6	6	2395	2400	0 %	100 %	0 %	0 %	530779606
23	NC_022093	AGT	2	6	2442	2447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530779606
24	NC_022093	CTT	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779606
25	NC_022093	CCT	2	6	2758	2763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779606
26	NC_022093	GCA	2	6	2934	2939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530779607
27	NC_022093	AGT	2	6	3017	3022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530779607
28	NC_022093	GGT	2	6	3090	3095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530779607
29	NC_022093	AGCTCG	2	12	3135	3146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	530779607
30	NC_022093	T	6	6	3172	3177	0 %	100 %	0 %	0 %	530779607
31	NC_022093	TCT	2	6	3332	3337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779607
32	NC_022093	TAT	2	6	3413	3418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530779607
33	NC_022093	CTG	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530779607
34	NC_022093	TCT	2	6	3522	3527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779607
35	NC_022093	TC	3	6	3549	3554	0 %	50 %	0 %	50 %	530779607
36	NC_022093	AAGA	2	8	3635	3642	75 %	0 %	25 %	0 %	530779607
37	NC_022093	ACCC	2	8	3644	3651	25 %	0 %	0 %	75 %	530779607
38	NC_022093	T	6	6	3655	3660	0 %	100 %	0 %	0 %	530779607
39	NC_022093	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779607
40	NC_022093	AT	3	6	3757	3762	50 %	50 %	0 %	0 %	530779607
41	NC_022093	AG	3	6	3800	3805	50 %	0 %	50 %	0 %	530779607
42	NC_022093	T	6	6	3836	3841	0 %	100 %	0 %	0 %	530779607
43	NC_022093	TCT	3	9	3843	3851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779607
44	NC_022093	GA	3	6	3871	3876	50 %	0 %	50 %	0 %	530779607
45	NC_022093	TTTG	2	8	3903	3910	0 %	75 %	25 %	0 %	530779607
46	NC_022093	AT	3	6	4128	4133	50 %	50 %	0 %	0 %	530779608
47	NC_022093	TCA	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530779608
48	NC_022093	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	530779608
49	NC_022093	ATGT	2	8	4312	4319	25 %	50 %	25 %	0 %	530779608
50	NC_022093	TCC	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779608
51	NC_022093	GAG	2	6	4343	4348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530779608
52	NC_022093	CT	3	6	4363	4368	0 %	50 %	0 %	50 %	530779608
53	NC_022093	GA	3	6	4421	4426	50 %	0 %	50 %	0 %	530779608
54	NC_022093	TC	3	6	4483	4488	0 %	50 %	0 %	50 %	530779608
55	NC_022093	CTT	2	6	4492	4497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779608
56	NC_022093	CTT	2	6	4512	4517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779608
57	NC_022093	TCT	2	6	4569	4574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779609
58	NC_022093	GGC	2	6	4583	4588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530779609
59	NC_022093	ACA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530779609
60	NC_022093	CAT	2	6	4697	4702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530779609
61	NC_022093	TAG	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530779609
62	NC_022093	AATA	2	8	4829	4836	75 %	25 %	0 %	0 %	530779609
63	NC_022093	CTG	2	6	4852	4857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530779609
64	NC_022093	GC	3	6	4881	4886	0 %	0 %	50 %	50 %	530779609
65	NC_022093	TGG	2	6	4892	4897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530779609
66	NC_022093	CGT	2	6	4940	4945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530779609
67	NC_022093	TTC	2	6	4980	4985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779609
68	NC_022093	CCT	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779609
69	NC_022093	CTT	2	6	5147	5152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779609
70	NC_022093	T	6	6	5151	5156	0 %	100 %	0 %	0 %	530779609
71	NC_022093	CTT	2	6	5158	5163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779609
72	NC_022093	TA	3	6	5259	5264	50 %	50 %	0 %	0 %	530779609
73	NC_022093	TCT	2	6	5350	5355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779609
74	NC_022093	AGT	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530779610
75	NC_022093	CAAAC	2	10	5582	5591	60 %	0 %	0 %	40 %	530779610
76	NC_022093	GAA	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530779610
77	NC_022093	AT	3	6	5616	5621	50 %	50 %	0 %	0 %	530779610
78	NC_022093	GTA	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530779610
79	NC_022093	CCT	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779610
80	NC_022093	TAT	2	6	5763	5768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530779610
81	NC_022093	TG	3	6	5787	5792	0 %	50 %	50 %	0 %	530779610
82	NC_022093	GTT	2	6	5853	5858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530779610
83	NC_022093	TCT	2	6	5915	5920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779610
84	NC_022093	AGTCG	2	10	5940	5949	20 %	20 %	40 %	20 %	530779610
85	NC_022093	ACC	2	6	5963	5968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530779610
86	NC_022093	CCT	2	6	5982	5987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779610
87	NC_022093	GA	3	6	6093	6098	50 %	0 %	50 %	0 %	530779610
88	NC_022093	TCT	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779610
89	NC_022093	CGC	2	6	6137	6142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530779610
90	NC_022093	GA	3	6	6185	6190	50 %	0 %	50 %	0 %	530779610
91	NC_022093	CAA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530779610
92	NC_022093	GGCTT	2	10	6212	6221	0 %	40 %	40 %	20 %	530779610
93	NC_022093	GA	3	6	6226	6231	50 %	0 %	50 %	0 %	530779610
94	NC_022093	CTCTAC	2	12	6237	6248	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	530779610
95	NC_022093	AGAT	2	8	6260	6267	50 %	25 %	25 %	0 %	530779610
96	NC_022093	TC	3	6	6317	6322	0 %	50 %	0 %	50 %	530779610
97	NC_022093	GA	3	6	6358	6363	50 %	0 %	50 %	0 %	530779610
98	NC_022093	CAA	2	6	6464	6469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530779610
99	NC_022093	GTT	2	6	6502	6507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530779610
100	NC_022093	C	6	6	6584	6589	0 %	0 %	0 %	100 %	530779610
101	NC_022093	CAG	2	6	6750	6755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530779611
102	NC_022093	A	6	6	6779	6784	100 %	0 %	0 %	0 %	530779611
103	NC_022093	GA	3	6	6878	6883	50 %	0 %	50 %	0 %	530779611
104	NC_022093	A	6	6	6883	6888	100 %	0 %	0 %	0 %	530779611
105	NC_022093	CGG	2	6	6970	6975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530779611
106	NC_022093	TAC	3	9	7058	7066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530779611
107	NC_022093	CAA	2	6	7077	7082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530779611
108	NC_022093	GAA	2	6	7146	7151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530779611
109	NC_022093	TCT	2	6	7212	7217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779611
110	NC_022093	AAG	2	6	7250	7255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530779611
111	NC_022093	CTC	2	6	7280	7285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779611
112	NC_022093	GCC	2	6	7289	7294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530779611
113	NC_022093	CGG	2	6	7327	7332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530779611
114	NC_022093	TTC	2	6	7350	7355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779611
115	NC_022093	ATTT	2	8	7361	7368	25 %	75 %	0 %	0 %	530779611
116	NC_022093	CTA	2	6	7637	7642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530779611
117	NC_022093	CCT	2	6	7723	7728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779611
118	NC_022093	GAC	2	6	7754	7759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530779611
119	NC_022093	CCAC	2	8	7763	7770	25 %	0 %	0 %	75 %	530779611
120	NC_022093	ATT	2	6	7863	7868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530779611
121	NC_022093	TA	3	6	7901	7906	50 %	50 %	0 %	0 %	530779612
122	NC_022093	GTC	2	6	7938	7943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530779612
123	NC_022093	TC	3	6	8054	8059	0 %	50 %	0 %	50 %	530779612
124	NC_022093	TC	3	6	8403	8408	0 %	50 %	0 %	50 %	530779613
125	NC_022093	ATGC	2	8	8435	8442	25 %	25 %	25 %	25 %	530779613
126	NC_022093	AG	4	8	8465	8472	50 %	0 %	50 %	0 %	530779613
127	NC_022093	ACC	2	6	8560	8565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530779613
128	NC_022093	AT	3	6	8633	8638	50 %	50 %	0 %	0 %	530779613
129	NC_022093	CTC	2	6	8775	8780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779614
130	NC_022093	TCC	2	6	8791	8796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779614
131	NC_022093	TAA	2	6	8864	8869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530779614
132	NC_022093	CTT	2	6	8909	8914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779614
133	NC_022093	CCTC	2	8	8927	8934	0 %	25 %	0 %	75 %	530779614
134	NC_022093	CTT	2	6	8961	8966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779614
135	NC_022093	TCA	2	6	8990	8995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530779614
136	NC_022093	GAG	2	6	9190	9195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530779615
137	NC_022093	CGT	2	6	9236	9241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530779615
138	NC_022093	GCCT	2	8	9348	9355	0 %	25 %	25 %	50 %	530779615
139	NC_022093	CAA	2	6	9365	9370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530779615
140	NC_022093	TCT	2	6	9410	9415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779615
141	NC_022093	CTC	2	6	9426	9431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779615
142	NC_022093	CCTC	2	8	9464	9471	0 %	25 %	0 %	75 %	530779615
143	NC_022093	CTC	2	6	9480	9485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779615
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153	NC_022093	CCT	2	6	10305	10310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779615
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171	NC_022093	CTC	2	6	11257	11262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779616
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177	NC_022093	CCT	2	6	11568	11573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779617
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266	NC_022093	TTC	2	6	18072	18077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530779624
267	NC_022093	AAGA	2	8	18279	18286	75 %	0 %	25 %	0 %	530779624
268	NC_022093	GACATA	2	12	18291	18302	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	530779624
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270	NC_022093	GTT	2	6	18408	18413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530779624
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273	NC_022093	TATC	2	8	18713	18720	25 %	50 %	0 %	25 %	530779624
274	NC_022093	TCC	2	6	18762	18767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530779624
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280	NC_022093	AG	3	6	19147	19152	50 %	0 %	50 %	0 %	530779624
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283	NC_022093	GA	3	6	19347	19352	50 %	0 %	50 %	0 %	530779625
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287	NC_022093	GA	3	6	19623	19628	50 %	0 %	50 %	0 %	530779625
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391	NC_022093	GAC	2	6	25892	25897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530779635
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