MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 39244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022084	TGCCAT	2	12	196462	196473	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	530547693
3502	NC_022084	CGA	2	6	196563	196568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530547693
3503	NC_022084	CTT	2	6	196597	196602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547693
3504	NC_022084	GCTTT	2	10	196818	196827	0 %	60 %	20 %	20 %	530547693
3505	NC_022084	TAC	2	6	196849	196854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547693
3506	NC_022084	TCT	2	6	197014	197019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547694
3507	NC_022084	CTT	2	6	197087	197092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547694
3508	NC_022084	TCT	2	6	197160	197165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547694
3509	NC_022084	TAT	2	6	197190	197195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547694
3510	NC_022084	AAGT	2	8	197225	197232	50 %	25 %	25 %	0 %	530547694
3511	NC_022084	TCT	2	6	197240	197245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547694
3512	NC_022084	C	6	6	197246	197251	0 %	0 %	0 %	100 %	530547695
3513	NC_022084	GCG	2	6	197328	197333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530547695
3514	NC_022084	GCT	2	6	197335	197340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547695
3515	NC_022084	TGC	2	6	197351	197356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547695
3516	NC_022084	CT	3	6	197471	197476	0 %	50 %	0 %	50 %	530547695
3517	NC_022084	T	6	6	197488	197493	0 %	100 %	0 %	0 %	530547695
3518	NC_022084	GTTTT	2	10	197554	197563	0 %	80 %	20 %	0 %	530547695
3519	NC_022084	TTCC	2	8	197612	197619	0 %	50 %	0 %	50 %	530547695
3520	NC_022084	GAGCA	2	10	197624	197633	40 %	0 %	40 %	20 %	530547695
3521	NC_022084	CAG	2	6	197656	197661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530547695
3522	NC_022084	TGA	2	6	197690	197695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547695
3523	NC_022084	TC	3	6	197720	197725	0 %	50 %	0 %	50 %	530547695
3524	NC_022084	CTT	2	6	197738	197743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547695
3525	NC_022084	T	6	6	197746	197751	0 %	100 %	0 %	0 %	530547695
3526	NC_022084	CCG	2	6	197763	197768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530547695
3527	NC_022084	CTG	2	6	197785	197790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547695
3528	NC_022084	GA	3	6	197829	197834	50 %	0 %	50 %	0 %	530547695
3529	NC_022084	TCC	2	6	197859	197864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547695
3530	NC_022084	CCT	2	6	197920	197925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547695
3531	NC_022084	TTC	2	6	198173	198178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547696
3532	NC_022084	TC	4	8	198414	198421	0 %	50 %	0 %	50 %	530547696
3533	NC_022084	TCA	2	6	198522	198527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547696
3534	NC_022084	GTT	2	6	198612	198617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547696
3535	NC_022084	CGA	2	6	198679	198684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530547696
3536	NC_022084	AAC	2	6	198695	198700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547696
3537	NC_022084	GAA	2	6	198812	198817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547696
3538	NC_022084	CAA	2	6	198838	198843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547696
3539	NC_022084	CT	3	6	198868	198873	0 %	50 %	0 %	50 %	530547696
3540	NC_022084	T	7	7	198997	199003	0 %	100 %	0 %	0 %	530547697
3541	NC_022084	CAA	2	6	199043	199048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547697
3542	NC_022084	CTT	2	6	199090	199095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547697
3543	NC_022084	CTC	2	6	199109	199114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547697
3544	NC_022084	ATC	2	6	199123	199128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547697
3545	NC_022084	ATC	2	6	199171	199176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547697
3546	NC_022084	TCT	2	6	199200	199205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547697
3547	NC_022084	AGCA	2	8	199248	199255	50 %	0 %	25 %	25 %	530547697
3548	NC_022084	TTA	3	9	199268	199276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547697
3549	NC_022084	AATCT	2	10	199279	199288	40 %	40 %	0 %	20 %	530547697
3550	NC_022084	AAAC	2	8	199358	199365	75 %	0 %	0 %	25 %	530547697
3551	NC_022084	GAA	2	6	199422	199427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547697
3552	NC_022084	CAA	2	6	199449	199454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547697
3553	NC_022084	TAT	2	6	199488	199493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547697
3554	NC_022084	ATT	2	6	199507	199512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547697
3555	NC_022084	CTG	2	6	199601	199606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547697
3556	NC_022084	ATGT	2	8	199615	199622	25 %	50 %	25 %	0 %	530547697
3557	NC_022084	CTT	2	6	199790	199795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547697
3558	NC_022084	TCC	2	6	199813	199818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547697
3559	NC_022084	TTC	2	6	199847	199852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547697
3560	NC_022084	AT	3	6	200011	200016	50 %	50 %	0 %	0 %	530547697
3561	NC_022084	CGG	2	6	200075	200080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530547697
3562	NC_022084	TC	3	6	200088	200093	0 %	50 %	0 %	50 %	530547697
3563	NC_022084	TGCAT	2	10	200104	200113	20 %	40 %	20 %	20 %	530547697
3564	NC_022084	CCG	2	6	200122	200127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530547697
3565	NC_022084	GAG	2	6	200136	200141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547697
3566	NC_022084	ATT	2	6	200143	200148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547697
3567	NC_022084	CGTTTG	2	12	200153	200164	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	530547697
3568	NC_022084	AGCAGA	2	12	200284	200295	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	530547697
3569	NC_022084	GA	3	6	200294	200299	50 %	0 %	50 %	0 %	530547697
3570	NC_022084	AGGAG	2	10	200447	200456	40 %	0 %	60 %	0 %	530547698
3571	NC_022084	GCT	2	6	200466	200471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547698
3572	NC_022084	TGGA	2	8	200620	200627	25 %	25 %	50 %	0 %	530547698
3573	NC_022084	AAG	2	6	200708	200713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547699
3574	NC_022084	GAT	2	6	200725	200730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547699
3575	NC_022084	A	6	6	200731	200736	100 %	0 %	0 %	0 %	530547699
3576	NC_022084	A	6	6	200806	200811	100 %	0 %	0 %	0 %	530547699
3577	NC_022084	AAG	2	6	200861	200866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547699
3578	NC_022084	ATTC	2	8	200872	200879	25 %	50 %	0 %	25 %	530547699
3579	NC_022084	AGA	2	6	200920	200925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547699
3580	NC_022084	GAG	2	6	200948	200953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547699
3581	NC_022084	CAG	3	9	201017	201025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530547699
3582	NC_022084	AAC	2	6	201056	201061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547699
3583	NC_022084	GAA	2	6	201078	201083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547699
3584	NC_022084	AGA	2	6	201196	201201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547699
3585	NC_022084	GAA	2	6	201328	201333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547699
3586	NC_022084	AG	3	6	201398	201403	50 %	0 %	50 %	0 %	530547699
3587	NC_022084	AG	3	6	201409	201414	50 %	0 %	50 %	0 %	530547699
3588	NC_022084	ATC	2	6	201428	201433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547699
3589	NC_022084	TGCT	2	8	201459	201466	0 %	50 %	25 %	25 %	530547699
3590	NC_022084	GAT	2	6	201499	201504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547699
3591	NC_022084	GA	4	8	201621	201628	50 %	0 %	50 %	0 %	530547700
3592	NC_022084	GAA	2	6	201660	201665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547700
3593	NC_022084	TGA	2	6	201739	201744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547700
3594	NC_022084	A	6	6	201786	201791	100 %	0 %	0 %	0 %	530547700
3595	NC_022084	GGA	2	6	201797	201802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547700
3596	NC_022084	TAA	3	9	201818	201826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547700
3597	NC_022084	GAA	2	6	201845	201850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547701
3598	NC_022084	AGA	2	6	201881	201886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547701
3599	NC_022084	TGAG	2	8	201914	201921	25 %	25 %	50 %	0 %	530547701
3600	NC_022084	A	6	6	201922	201927	100 %	0 %	0 %	0 %	530547701
3601	NC_022084	CT	3	6	201943	201948	0 %	50 %	0 %	50 %	530547701
3602	NC_022084	A	6	6	202012	202017	100 %	0 %	0 %	0 %	530547701
3603	NC_022084	ACA	2	6	202079	202084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547701
3604	NC_022084	A	6	6	202149	202154	100 %	0 %	0 %	0 %	530547701
3605	NC_022084	AGAA	2	8	202158	202165	75 %	0 %	25 %	0 %	530547701
3606	NC_022084	GAG	2	6	202205	202210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547701
3607	NC_022084	AC	3	6	202281	202286	50 %	0 %	0 %	50 %	530547702
3608	NC_022084	GGA	2	6	202434	202439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547702
3609	NC_022084	CTG	2	6	202476	202481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547702
3610	NC_022084	TGT	2	6	202516	202521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547702
3611	NC_022084	CCA	2	6	202564	202569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530547702
3612	NC_022084	AAGC	2	8	202585	202592	50 %	0 %	25 %	25 %	530547702
3613	NC_022084	TCTTCA	2	12	202593	202604	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530547702
3614	NC_022084	CT	3	6	202623	202628	0 %	50 %	0 %	50 %	530547702
3615	NC_022084	CCT	2	6	202685	202690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547702
3616	NC_022084	GAA	2	6	202751	202756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547702
3617	NC_022084	CTC	2	6	202766	202771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547702
3618	NC_022084	TCA	2	6	202845	202850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547702
3619	NC_022084	CTC	2	6	202892	202897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547702
3620	NC_022084	CT	3	6	202911	202916	0 %	50 %	0 %	50 %	530547702
3621	NC_022084	CTT	2	6	202960	202965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547702
3622	NC_022084	GTG	2	6	203033	203038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530547702
3623	NC_022084	GCCG	2	8	203050	203057	0 %	0 %	50 %	50 %	530547702
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3994	NC_022084	ACA	2	6	227876	227881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547726
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3999	NC_022084	CAT	2	6	228137	228142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547727
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