MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus litoralis DSM 5473

Total Repeats: 39244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022084	T	6	6	57289	57294	0 %	100 %	0 %	0 %	530547535
1002	NC_022084	CTT	2	6	57338	57343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547535
1003	NC_022084	TGGAT	2	10	57390	57399	20 %	40 %	40 %	0 %	530547535
1004	NC_022084	TAA	2	6	57503	57508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547535
1005	NC_022084	AACA	2	8	57509	57516	75 %	0 %	0 %	25 %	530547535
1006	NC_022084	CAA	2	6	57517	57522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547535
1007	NC_022084	GAG	2	6	57629	57634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547535
1008	NC_022084	TTTCAT	2	12	57675	57686	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530547536
1009	NC_022084	GCATA	2	10	57706	57715	40 %	20 %	20 %	20 %	530547536
1010	NC_022084	GAA	2	6	57716	57721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547536
1011	NC_022084	AG	3	6	57787	57792	50 %	0 %	50 %	0 %	530547536
1012	NC_022084	AAG	2	6	57835	57840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547536
1013	NC_022084	TGG	2	6	57876	57881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530547536
1014	NC_022084	TCC	2	6	57919	57924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547536
1015	NC_022084	AAT	2	6	57925	57930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547536
1016	NC_022084	CTG	2	6	58007	58012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547536
1017	NC_022084	CTT	2	6	58016	58021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547536
1018	NC_022084	AACAA	2	10	58082	58091	80 %	0 %	0 %	20 %	530547536
1019	NC_022084	GAG	2	6	58151	58156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547536
1020	NC_022084	TTACT	2	10	58364	58373	20 %	60 %	0 %	20 %	530547536
1021	NC_022084	AGA	2	6	58378	58383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547536
1022	NC_022084	TCT	2	6	58473	58478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547536
1023	NC_022084	ATAA	2	8	58529	58536	75 %	25 %	0 %	0 %	530547536
1024	NC_022084	AG	3	6	58546	58551	50 %	0 %	50 %	0 %	530547536
1025	NC_022084	CCT	2	6	58560	58565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547536
1026	NC_022084	AAG	2	6	59082	59087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547537
1027	NC_022084	CAA	2	6	59099	59104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547537
1028	NC_022084	TAC	2	6	59202	59207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547537
1029	NC_022084	GAATT	2	10	59323	59332	40 %	40 %	20 %	0 %	530547537
1030	NC_022084	AGT	2	6	59340	59345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547537
1031	NC_022084	AGG	2	6	59456	59461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530547537
1032	NC_022084	AAT	2	6	59492	59497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547537
1033	NC_022084	TGT	2	6	59873	59878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547538
1034	NC_022084	TGG	2	6	59888	59893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530547538
1035	NC_022084	ATT	2	6	59961	59966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547538
1036	NC_022084	TAT	2	6	59982	59987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547538
1037	NC_022084	TAC	2	6	60000	60005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547538
1038	NC_022084	ATT	2	6	60061	60066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547538
1039	NC_022084	GATTG	2	10	60072	60081	20 %	40 %	40 %	0 %	530547538
1040	NC_022084	TAA	2	6	60184	60189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547538
1041	NC_022084	CATA	2	8	60264	60271	50 %	25 %	0 %	25 %	530547538
1042	NC_022084	AT	3	6	60289	60294	50 %	50 %	0 %	0 %	530547538
1043	NC_022084	TA	3	6	60324	60329	50 %	50 %	0 %	0 %	530547538
1044	NC_022084	GATA	2	8	60363	60370	50 %	25 %	25 %	0 %	530547538
1045	NC_022084	ATT	2	6	60532	60537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547538
1046	NC_022084	ATG	2	6	60550	60555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547538
1047	NC_022084	AAG	2	6	60560	60565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547538
1048	NC_022084	TGA	2	6	60569	60574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547538
1049	NC_022084	TAC	2	6	60585	60590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547538
1050	NC_022084	TGT	2	6	60608	60613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547538
1051	NC_022084	ACT	2	6	60628	60633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547538
1052	NC_022084	AAATTT	2	12	60663	60674	50 %	50 %	0 %	0 %	530547539
1053	NC_022084	TGT	2	6	60691	60696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547539
1054	NC_022084	TTC	2	6	60755	60760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547539
1055	NC_022084	CGA	2	6	60784	60789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530547539
1056	NC_022084	CAT	2	6	60918	60923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547539
1057	NC_022084	TTGG	2	8	60925	60932	0 %	50 %	50 %	0 %	530547539
1058	NC_022084	TAT	2	6	60933	60938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547539
1059	NC_022084	CAAAA	2	10	60951	60960	80 %	0 %	0 %	20 %	530547539
1060	NC_022084	CCA	2	6	61051	61056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530547539
1061	NC_022084	TTAT	2	8	61088	61095	25 %	75 %	0 %	0 %	530547539
1062	NC_022084	TCCA	2	8	61157	61164	25 %	25 %	0 %	50 %	530547539
1063	NC_022084	AGAT	2	8	61168	61175	50 %	25 %	25 %	0 %	530547539
1064	NC_022084	AAC	2	6	61226	61231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547539
1065	NC_022084	ACTTTA	2	12	61240	61251	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530547539
1066	NC_022084	TCT	2	6	61274	61279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547539
1067	NC_022084	GAA	2	6	61328	61333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547539
1068	NC_022084	GTT	2	6	61364	61369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547539
1069	NC_022084	TC	3	6	61407	61412	0 %	50 %	0 %	50 %	530547539
1070	NC_022084	TTG	2	6	61425	61430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547539
1071	NC_022084	CT	3	6	61467	61472	0 %	50 %	0 %	50 %	530547539
1072	NC_022084	CCT	2	6	61500	61505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547539
1073	NC_022084	ATATA	2	10	61514	61523	60 %	40 %	0 %	0 %	530547539
1074	NC_022084	CAA	2	6	61525	61530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547539
1075	NC_022084	CTT	2	6	61618	61623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547539
1076	NC_022084	A	6	6	61682	61687	100 %	0 %	0 %	0 %	530547539
1077	NC_022084	AAG	2	6	61697	61702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547539
1078	NC_022084	TTC	2	6	61816	61821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547540
1079	NC_022084	GTT	2	6	61859	61864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547540
1080	NC_022084	AGA	2	6	61886	61891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547540
1081	NC_022084	TCA	2	6	62076	62081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547541
1082	NC_022084	T	7	7	62148	62154	0 %	100 %	0 %	0 %	530547541
1083	NC_022084	AGAAGC	2	12	62251	62262	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	530547541
1084	NC_022084	A	6	6	62265	62270	100 %	0 %	0 %	0 %	530547541
1085	NC_022084	GAA	2	6	62335	62340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530547541
1086	NC_022084	TGA	2	6	62346	62351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547541
1087	NC_022084	CAA	2	6	62376	62381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547541
1088	NC_022084	TGAA	2	8	62508	62515	50 %	25 %	25 %	0 %	530547541
1089	NC_022084	A	6	6	62591	62596	100 %	0 %	0 %	0 %	530547542
1090	NC_022084	A	6	6	62606	62611	100 %	0 %	0 %	0 %	530547542
1091	NC_022084	TGA	2	6	62624	62629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547542
1092	NC_022084	GCT	2	6	62678	62683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547542
1093	NC_022084	ATT	2	6	62685	62690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547542
1094	NC_022084	TAA	2	6	62707	62712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530547542
1095	NC_022084	G	6	6	62756	62761	0 %	0 %	100 %	0 %	530547542
1096	NC_022084	GTT	2	6	62772	62777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530547542
1097	NC_022084	CTC	2	6	62905	62910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547542
1098	NC_022084	ATG	2	6	62955	62960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547542
1099	NC_022084	ATG	2	6	63123	63128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530547542
1100	NC_022084	A	6	6	63131	63136	100 %	0 %	0 %	0 %	530547542
1101	NC_022084	CTT	2	6	63177	63182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547543
1102	NC_022084	CTG	2	6	63208	63213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547543
1103	NC_022084	TC	4	8	63227	63234	0 %	50 %	0 %	50 %	530547543
1104	NC_022084	CAA	2	6	63237	63242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547543
1105	NC_022084	CTT	2	6	63372	63377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547543
1106	NC_022084	TTCT	2	8	63414	63421	0 %	75 %	0 %	25 %	530547543
1107	NC_022084	CTTT	2	8	63452	63459	0 %	75 %	0 %	25 %	530547543
1108	NC_022084	CTT	2	6	63570	63575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547543
1109	NC_022084	TAT	2	6	63580	63585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547543
1110	NC_022084	CTG	2	6	63705	63710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530547543
1111	NC_022084	ACT	2	6	63785	63790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547543
1112	NC_022084	TCT	2	6	63804	63809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547543
1113	NC_022084	ACT	2	6	63883	63888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547543
1114	NC_022084	CTATTT	2	12	64005	64016	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530547543
1115	NC_022084	T	6	6	64014	64019	0 %	100 %	0 %	0 %	530547543
1116	NC_022084	CTT	2	6	64020	64025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530547543
1117	NC_022084	AG	3	6	64176	64181	50 %	0 %	50 %	0 %	530547543
1118	NC_022084	TAC	2	6	64249	64254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530547543
1119	NC_022084	ACCT	2	8	64301	64308	25 %	25 %	0 %	50 %	530547544
1120	NC_022084	ATCC	2	8	64327	64334	25 %	25 %	0 %	50 %	530547544
1121	NC_022084	TAT	2	6	64412	64417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547544
1122	NC_022084	CAA	2	6	64447	64452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530547544
1123	NC_022084	AT	3	6	64514	64519	50 %	50 %	0 %	0 %	530547544
1124	NC_022084	ATT	2	6	64526	64531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530547544
1125	NC_022084	CCT	2	6	64644	64649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530547545
1126	NC_022084	T	6	6	64675	64680	0 %	100 %	0 %	0 %	530547545
1127	NC_022084	A	6	6	64683	64688	100 %	0 %	0 %	0 %	530547545
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