MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021508	CG	3	6	141126	141131	0 %	0 %	50 %	50 %	512443616
2502	NC_021508	TC	3	6	141151	141156	0 %	50 %	0 %	50 %	512443616
2503	NC_021508	CTGC	2	8	141214	141221	0 %	25 %	25 %	50 %	512443616
2504	NC_021508	AGT	2	6	141463	141468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443616
2505	NC_021508	ACCT	2	8	141524	141531	25 %	25 %	0 %	50 %	512443616
2506	NC_021508	CTG	2	6	141544	141549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443616
2507	NC_021508	GAT	2	6	141566	141571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443616
2508	NC_021508	GCC	2	6	141641	141646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443616
2509	NC_021508	TCT	2	6	141753	141758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443616
2510	NC_021508	CAAT	2	8	141807	141814	50 %	25 %	0 %	25 %	512443616
2511	NC_021508	CAC	2	6	141849	141854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443616
2512	NC_021508	GAA	2	6	141959	141964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443616
2513	NC_021508	GGC	2	6	141991	141996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443616
2514	NC_021508	TCCA	2	8	142048	142055	25 %	25 %	0 %	50 %	512443616
2515	NC_021508	ATC	2	6	142068	142073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443616
2516	NC_021508	CGC	2	6	142109	142114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443616
2517	NC_021508	CAG	2	6	142135	142140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443616
2518	NC_021508	ACCAA	2	10	142270	142279	60 %	0 %	0 %	40 %	512443616
2519	NC_021508	GA	3	6	142297	142302	50 %	0 %	50 %	0 %	512443616
2520	NC_021508	ATG	2	6	142446	142451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443616
2521	NC_021508	ACG	2	6	142464	142469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443616
2522	NC_021508	T	6	6	142593	142598	0 %	100 %	0 %	0 %	512443616
2523	NC_021508	CAT	2	6	142636	142641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443616
2524	NC_021508	GC	3	6	142667	142672	0 %	0 %	50 %	50 %	512443616
2525	NC_021508	CG	3	6	142678	142683	0 %	0 %	50 %	50 %	512443616
2526	NC_021508	T	7	7	142727	142733	0 %	100 %	0 %	0 %	512443616
2527	NC_021508	AGCCA	2	10	142742	142751	40 %	0 %	20 %	40 %	512443616
2528	NC_021508	CCA	2	6	142756	142761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443616
2529	NC_021508	T	6	6	142787	142792	0 %	100 %	0 %	0 %	512443616
2530	NC_021508	TCT	2	6	142842	142847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443616
2531	NC_021508	CT	3	6	143055	143060	0 %	50 %	0 %	50 %	512443617
2532	NC_021508	GTT	2	6	143076	143081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443617
2533	NC_021508	TGA	2	6	143094	143099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443617
2534	NC_021508	CTG	2	6	143193	143198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443617
2535	NC_021508	TGC	2	6	143248	143253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443617
2536	NC_021508	CA	3	6	143295	143300	50 %	0 %	0 %	50 %	512443617
2537	NC_021508	CGC	2	6	143317	143322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443617
2538	NC_021508	TGCG	3	12	143330	143341	0 %	25 %	50 %	25 %	512443617
2539	NC_021508	GTT	2	6	143402	143407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443617
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2541	NC_021508	T	7	7	143482	143488	0 %	100 %	0 %	0 %	512443617
2542	NC_021508	CTT	2	6	143643	143648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443617
2543	NC_021508	T	9	9	143735	143743	0 %	100 %	0 %	0 %	512443617
2544	NC_021508	GC	3	6	143749	143754	0 %	0 %	50 %	50 %	512443617
2545	NC_021508	T	7	7	143764	143770	0 %	100 %	0 %	0 %	512443617
2546	NC_021508	CGG	2	6	143777	143782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443617
2547	NC_021508	TTC	2	6	143820	143825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443617
2548	NC_021508	TTA	2	6	143851	143856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443617
2549	NC_021508	GCG	2	6	143861	143866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443617
2550	NC_021508	GCG	2	6	143873	143878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443617
2551	NC_021508	CCG	2	6	143879	143884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443617
2552	NC_021508	GCAG	2	8	143926	143933	25 %	0 %	50 %	25 %	512443617
2553	NC_021508	T	6	6	144083	144088	0 %	100 %	0 %	0 %	512443617
2554	NC_021508	A	6	6	144098	144103	100 %	0 %	0 %	0 %	512443617
2555	NC_021508	TCG	2	6	144114	144119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443617
2556	NC_021508	ATTT	2	8	144123	144130	25 %	75 %	0 %	0 %	512443617
2557	NC_021508	CTTC	2	8	144255	144262	0 %	50 %	0 %	50 %	512443617
2558	NC_021508	GAA	2	6	144268	144273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443617
2559	NC_021508	AGGA	2	8	144279	144286	50 %	0 %	50 %	0 %	512443617
2560	NC_021508	TG	3	6	144353	144358	0 %	50 %	50 %	0 %	512443617
2561	NC_021508	AGA	2	6	144412	144417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443617
2562	NC_021508	AC	3	6	144460	144465	50 %	0 %	0 %	50 %	512443617
2563	NC_021508	GCT	2	6	144466	144471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443617
2564	NC_021508	ACA	2	6	144527	144532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443617
2565	NC_021508	GCG	2	6	144541	144546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443617
2566	NC_021508	GAT	2	6	144647	144652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443617
2567	NC_021508	GCA	2	6	144721	144726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443617
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2569	NC_021508	TC	3	6	144833	144838	0 %	50 %	0 %	50 %	512443617
2570	NC_021508	TGA	2	6	144874	144879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443617
2571	NC_021508	TG	3	6	144999	145004	0 %	50 %	50 %	0 %	512443617
2572	NC_021508	TCTT	2	8	145026	145033	0 %	75 %	0 %	25 %	512443617
2573	NC_021508	GTT	2	6	145075	145080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443617
2574	NC_021508	TG	3	6	145118	145123	0 %	50 %	50 %	0 %	512443617
2575	NC_021508	TC	3	6	145131	145136	0 %	50 %	0 %	50 %	512443617
2576	NC_021508	AGA	2	6	145171	145176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443617
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2578	NC_021508	AGTG	2	8	145207	145214	25 %	25 %	50 %	0 %	512443617
2579	NC_021508	GCA	2	6	145216	145221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443617
2580	NC_021508	TAC	2	6	145241	145246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443617
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2582	NC_021508	CG	3	6	145328	145333	0 %	0 %	50 %	50 %	512443617
2583	NC_021508	TGC	2	6	145354	145359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443617
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2585	NC_021508	ATG	2	6	145380	145385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443617
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2587	NC_021508	GCAGC	2	10	145456	145465	20 %	0 %	40 %	40 %	512443617
2588	NC_021508	GCC	2	6	145538	145543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443617
2589	NC_021508	CAAA	2	8	145551	145558	75 %	0 %	0 %	25 %	512443617
2590	NC_021508	CGT	2	6	145655	145660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443618
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2593	NC_021508	TG	3	6	145788	145793	0 %	50 %	50 %	0 %	512443618
2594	NC_021508	GGGA	2	8	145828	145835	25 %	0 %	75 %	0 %	512443618
2595	NC_021508	ATA	2	6	145927	145932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443618
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2597	NC_021508	GAG	2	6	146145	146150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443618
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2599	NC_021508	GC	3	6	146249	146254	0 %	0 %	50 %	50 %	512443618
2600	NC_021508	GCAC	2	8	146264	146271	25 %	0 %	25 %	50 %	512443618
2601	NC_021508	TG	3	6	146299	146304	0 %	50 %	50 %	0 %	512443618
2602	NC_021508	GCG	2	6	146394	146399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443618
2603	NC_021508	GC	4	8	146403	146410	0 %	0 %	50 %	50 %	512443618
2604	NC_021508	T	6	6	146439	146444	0 %	100 %	0 %	0 %	512443618
2605	NC_021508	GAG	2	6	146457	146462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443618
2606	NC_021508	CG	3	6	146466	146471	0 %	0 %	50 %	50 %	512443618
2607	NC_021508	GAT	2	6	146568	146573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443618
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2609	NC_021508	AGG	2	6	146626	146631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443618
2610	NC_021508	GGAA	2	8	146632	146639	50 %	0 %	50 %	0 %	512443618
2611	NC_021508	T	6	6	146667	146672	0 %	100 %	0 %	0 %	512443618
2612	NC_021508	TG	3	6	146681	146686	0 %	50 %	50 %	0 %	512443618
2613	NC_021508	CG	3	6	146844	146849	0 %	0 %	50 %	50 %	512443619
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2617	NC_021508	TTC	2	6	147037	147042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443619
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2619	NC_021508	TGA	2	6	147192	147197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443619
2620	NC_021508	GCA	2	6	147213	147218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443619
2621	NC_021508	TG	3	6	147227	147232	0 %	50 %	50 %	0 %	512443619
2622	NC_021508	ACA	2	6	147239	147244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443619
2623	NC_021508	ATGG	2	8	147321	147328	25 %	25 %	50 %	0 %	512443619
2624	NC_021508	AGGC	2	8	147341	147348	25 %	0 %	50 %	25 %	512443619
2625	NC_021508	GCA	2	6	147384	147389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443619
2626	NC_021508	GTG	2	6	147396	147401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443619
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2628	NC_021508	CG	4	8	147421	147428	0 %	0 %	50 %	50 %	512443619
2629	NC_021508	GT	3	6	147456	147461	0 %	50 %	50 %	0 %	512443619
2630	NC_021508	GC	3	6	147478	147483	0 %	0 %	50 %	50 %	512443619
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2731	NC_021508	GGAA	2	8	153815	153822	50 %	0 %	50 %	0 %	512443627
2732	NC_021508	AGA	2	6	153861	153866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443627
2733	NC_021508	CAGCTG	2	12	153891	153902	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512443627
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2736	NC_021508	GAGT	2	8	154082	154089	25 %	25 %	50 %	0 %	512443627
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2739	NC_021508	CACT	2	8	154158	154165	25 %	25 %	0 %	50 %	512443627
2740	NC_021508	GCG	2	6	154422	154427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443628
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2742	NC_021508	GGTCT	2	10	154486	154495	0 %	40 %	40 %	20 %	512443628
2743	NC_021508	T	7	7	154543	154549	0 %	100 %	0 %	0 %	512443628
2744	NC_021508	TAC	2	6	154588	154593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443628
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2746	NC_021508	TC	3	6	154726	154731	0 %	50 %	0 %	50 %	512443628
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2748	NC_021508	GAA	2	6	154781	154786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443628
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2750	NC_021508	GCT	2	6	154848	154853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443628
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2752	NC_021508	CGT	2	6	154951	154956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443628
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2859	NC_021508	CTGT	2	8	159884	159891	0 %	50 %	25 %	25 %	512443632
2860	NC_021508	GC	3	6	159929	159934	0 %	0 %	50 %	50 %	512443632
2861	NC_021508	TGCG	2	8	159945	159952	0 %	25 %	50 %	25 %	512443632
2862	NC_021508	GAT	2	6	159988	159993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443632
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2864	NC_021508	C	6	6	160156	160161	0 %	0 %	0 %	100 %	512443632
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2867	NC_021508	CTTT	2	8	160194	160201	0 %	75 %	0 %	25 %	512443632
2868	NC_021508	AGC	3	9	160249	160257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443632
2869	NC_021508	A	6	6	160338	160343	100 %	0 %	0 %	0 %	512443632
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2989	NC_021508	AG	3	6	166031	166036	50 %	0 %	50 %	0 %	512443638
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2992	NC_021508	TGAG	2	8	166114	166121	25 %	25 %	50 %	0 %	512443638
2993	NC_021508	AGAGG	2	10	166244	166253	40 %	0 %	60 %	0 %	512443638
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2995	NC_021508	GCG	2	6	166351	166356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443638
2996	NC_021508	CG	3	6	166386	166391	0 %	0 %	50 %	50 %	512443638
2997	NC_021508	TG	3	6	166434	166439	0 %	50 %	50 %	0 %	512443638
2998	NC_021508	TG	3	6	166610	166615	0 %	50 %	50 %	0 %	512443638
2999	NC_021508	GAT	2	6	166713	166718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443638
3000	NC_021508	GC	3	6	166774	166779	0 %	0 %	50 %	50 %	512443638

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