MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_021508	AAG	2	6	1121252	1121257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444463
21502	NC_021508	GC	3	6	1121263	1121268	0 %	0 %	50 %	50 %	512444463
21503	NC_021508	GCA	2	6	1121308	1121313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444463
21504	NC_021508	TAC	2	6	1121372	1121377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444463
21505	NC_021508	GGC	2	6	1121540	1121545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444463
21506	NC_021508	GTTT	2	8	1121608	1121615	0 %	75 %	25 %	0 %	512444463
21507	NC_021508	G	6	6	1122006	1122011	0 %	0 %	100 %	0 %	512444464
21508	NC_021508	GAG	2	6	1122033	1122038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444464
21509	NC_021508	CA	3	6	1122055	1122060	50 %	0 %	0 %	50 %	512444464
21510	NC_021508	CTG	2	6	1122208	1122213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444464
21511	NC_021508	AGA	2	6	1122230	1122235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444464
21512	NC_021508	C	6	6	1122298	1122303	0 %	0 %	0 %	100 %	512444464
21513	NC_021508	TGCA	2	8	1122353	1122360	25 %	25 %	25 %	25 %	512444464
21514	NC_021508	AC	3	6	1122361	1122366	50 %	0 %	0 %	50 %	512444464
21515	NC_021508	AAACC	2	10	1122452	1122461	60 %	0 %	0 %	40 %	512444464
21516	NC_021508	TCA	2	6	1122544	1122549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444464
21517	NC_021508	GT	3	6	1122664	1122669	0 %	50 %	50 %	0 %	512444465
21518	NC_021508	CGC	2	6	1122748	1122753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444465
21519	NC_021508	TCA	2	6	1122775	1122780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444465
21520	NC_021508	CTC	2	6	1122878	1122883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444465
21521	NC_021508	TCG	2	6	1122886	1122891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444465
21522	NC_021508	CTT	2	6	1123007	1123012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444465
21523	NC_021508	TTC	2	6	1123035	1123040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444465
21524	NC_021508	GT	3	6	1123048	1123053	0 %	50 %	50 %	0 %	512444465
21525	NC_021508	GC	3	6	1123074	1123079	0 %	0 %	50 %	50 %	512444465
21526	NC_021508	CTC	2	6	1123104	1123109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444465
21527	NC_021508	CTC	2	6	1123116	1123121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444465
21528	NC_021508	GGC	2	6	1123123	1123128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444465
21529	NC_021508	CTT	2	6	1123142	1123147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444465
21530	NC_021508	GGTG	2	8	1123247	1123254	0 %	25 %	75 %	0 %	512444465
21531	NC_021508	CTGC	2	8	1123283	1123290	0 %	25 %	25 %	50 %	512444465
21532	NC_021508	ACAA	2	8	1123300	1123307	75 %	0 %	0 %	25 %	512444465
21533	NC_021508	GGC	2	6	1123339	1123344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444465
21534	NC_021508	CCG	2	6	1123356	1123361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444465
21535	NC_021508	A	6	6	1123480	1123485	100 %	0 %	0 %	0 %	512444465
21536	NC_021508	CG	3	6	1123553	1123558	0 %	0 %	50 %	50 %	512444465
21537	NC_021508	CTT	2	6	1123565	1123570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444465
21538	NC_021508	GCAC	2	8	1123580	1123587	25 %	0 %	25 %	50 %	512444465
21539	NC_021508	CTT	2	6	1123595	1123600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444465
21540	NC_021508	ATT	2	6	1123608	1123613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444465
21541	NC_021508	T	8	8	1123684	1123691	0 %	100 %	0 %	0 %	512444465
21542	NC_021508	T	6	6	1123795	1123800	0 %	100 %	0 %	0 %	512444465
21543	NC_021508	TCG	2	6	1123834	1123839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444465
21544	NC_021508	CA	3	6	1123848	1123853	50 %	0 %	0 %	50 %	512444465
21545	NC_021508	ACC	2	6	1123933	1123938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444465
21546	NC_021508	TGCA	2	8	1123947	1123954	25 %	25 %	25 %	25 %	512444465
21547	NC_021508	TGCG	2	8	1124064	1124071	0 %	25 %	50 %	25 %	512444465
21548	NC_021508	CG	3	6	1124125	1124130	0 %	0 %	50 %	50 %	512444465
21549	NC_021508	CG	3	6	1124188	1124193	0 %	0 %	50 %	50 %	512444465
21550	NC_021508	TGCC	2	8	1124198	1124205	0 %	25 %	25 %	50 %	512444465
21551	NC_021508	GTC	2	6	1124259	1124264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444465
21552	NC_021508	GC	3	6	1124375	1124380	0 %	0 %	50 %	50 %	512444465
21553	NC_021508	CGC	2	6	1124403	1124408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444465
21554	NC_021508	TGG	2	6	1124480	1124485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444465
21555	NC_021508	CG	3	6	1124492	1124497	0 %	0 %	50 %	50 %	512444465
21556	NC_021508	AAG	2	6	1124526	1124531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444465
21557	NC_021508	GC	3	6	1124576	1124581	0 %	0 %	50 %	50 %	512444465
21558	NC_021508	TTC	2	6	1124683	1124688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444466
21559	NC_021508	GCG	2	6	1124738	1124743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444466
21560	NC_021508	GTGA	2	8	1124784	1124791	25 %	25 %	50 %	0 %	512444466
21561	NC_021508	GC	3	6	1124930	1124935	0 %	0 %	50 %	50 %	512444466
21562	NC_021508	GAT	2	6	1124950	1124955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444466
21563	NC_021508	CG	3	6	1124958	1124963	0 %	0 %	50 %	50 %	512444466
21564	NC_021508	T	6	6	1124978	1124983	0 %	100 %	0 %	0 %	512444466
21565	NC_021508	TGA	2	6	1124991	1124996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444466
21566	NC_021508	GTG	2	6	1125005	1125010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444466
21567	NC_021508	CG	3	6	1125036	1125041	0 %	0 %	50 %	50 %	512444466
21568	NC_021508	CG	5	10	1125057	1125066	0 %	0 %	50 %	50 %	512444466
21569	NC_021508	GGC	2	6	1125067	1125072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444466
21570	NC_021508	GC	3	6	1125081	1125086	0 %	0 %	50 %	50 %	512444466
21571	NC_021508	GC	3	6	1125105	1125110	0 %	0 %	50 %	50 %	512444466
21572	NC_021508	TGC	2	6	1125150	1125155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444466
21573	NC_021508	CGG	2	6	1125156	1125161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444466
21574	NC_021508	TTG	2	6	1125301	1125306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444466
21575	NC_021508	GGA	2	6	1125349	1125354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444466
21576	NC_021508	AGC	2	6	1125724	1125729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444467
21577	NC_021508	TCG	2	6	1125798	1125803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444467
21578	NC_021508	CAC	2	6	1125833	1125838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444467
21579	NC_021508	A	6	6	1125987	1125992	100 %	0 %	0 %	0 %	512444468
21580	NC_021508	TTA	2	6	1126066	1126071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444468
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21582	NC_021508	GGC	2	6	1126146	1126151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444468
21583	NC_021508	CGG	2	6	1126187	1126192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444468
21584	NC_021508	CAC	2	6	1126308	1126313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444468
21585	NC_021508	A	6	6	1126391	1126396	100 %	0 %	0 %	0 %	512444468
21586	NC_021508	CTG	2	6	1126416	1126421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444468
21587	NC_021508	CGG	2	6	1126430	1126435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444468
21588	NC_021508	GCTGAC	2	12	1126439	1126450	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512444468
21589	NC_021508	GGC	2	6	1126547	1126552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444468
21590	NC_021508	T	6	6	1126629	1126634	0 %	100 %	0 %	0 %	512444468
21591	NC_021508	A	6	6	1126638	1126643	100 %	0 %	0 %	0 %	512444468
21592	NC_021508	TGG	2	6	1126678	1126683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444468
21593	NC_021508	GGAA	2	8	1126694	1126701	50 %	0 %	50 %	0 %	512444468
21594	NC_021508	GGT	2	6	1126742	1126747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444468
21595	NC_021508	TGCACG	2	12	1126837	1126848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512444468
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21598	NC_021508	ACT	2	6	1126966	1126971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444468
21599	NC_021508	GC	3	6	1127058	1127063	0 %	0 %	50 %	50 %	512444468
21600	NC_021508	CCT	2	6	1127086	1127091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444468
21601	NC_021508	GGT	2	6	1127222	1127227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444468
21602	NC_021508	GGC	2	6	1127359	1127364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444468
21603	NC_021508	TG	3	6	1127429	1127434	0 %	50 %	50 %	0 %	512444468
21604	NC_021508	CGG	2	6	1127626	1127631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444469
21605	NC_021508	AATTTC	2	12	1127692	1127703	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512444469
21606	NC_021508	C	6	6	1127801	1127806	0 %	0 %	0 %	100 %	512444469
21607	NC_021508	A	6	6	1127821	1127826	100 %	0 %	0 %	0 %	512444469
21608	NC_021508	GCA	2	6	1127863	1127868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444469
21609	NC_021508	CAG	2	6	1127875	1127880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444469
21610	NC_021508	CCG	2	6	1127891	1127896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444469
21611	NC_021508	CG	4	8	1127895	1127902	0 %	0 %	50 %	50 %	512444469
21612	NC_021508	GCC	2	6	1127906	1127911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444469
21613	NC_021508	CGC	2	6	1127946	1127951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444469
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21616	NC_021508	A	6	6	1128042	1128047	100 %	0 %	0 %	0 %	512444470
21617	NC_021508	TGC	2	6	1128070	1128075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444470
21618	NC_021508	CCG	2	6	1128077	1128082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444470
21619	NC_021508	CCA	2	6	1128095	1128100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444470
21620	NC_021508	CGC	2	6	1128133	1128138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444470
21621	NC_021508	CA	3	6	1128150	1128155	50 %	0 %	0 %	50 %	512444470
21622	NC_021508	GC	3	6	1128171	1128176	0 %	0 %	50 %	50 %	512444470
21623	NC_021508	GCA	2	6	1128215	1128220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444470
21624	NC_021508	GCT	2	6	1128257	1128262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444470
21625	NC_021508	GC	5	10	1128305	1128314	0 %	0 %	50 %	50 %	512444470
21626	NC_021508	GTT	2	6	1128330	1128335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444470
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21629	NC_021508	C	7	7	1128516	1128522	0 %	0 %	0 %	100 %	512444470
21630	NC_021508	CAG	2	6	1128534	1128539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444470
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21632	NC_021508	C	6	6	1128644	1128649	0 %	0 %	0 %	100 %	512444470
21633	NC_021508	ACGC	2	8	1128667	1128674	25 %	0 %	25 %	50 %	512444470
21634	NC_021508	A	6	6	1128723	1128728	100 %	0 %	0 %	0 %	512444470
21635	NC_021508	CAC	2	6	1128774	1128779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444470
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21638	NC_021508	GCG	2	6	1129006	1129011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444471
21639	NC_021508	CGCAG	2	10	1129066	1129075	20 %	0 %	40 %	40 %	512444471
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21641	NC_021508	GC	3	6	1129097	1129102	0 %	0 %	50 %	50 %	512444471
21642	NC_021508	CAC	3	9	1129161	1129169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444471
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21645	NC_021508	CG	3	6	1129335	1129340	0 %	0 %	50 %	50 %	512444471
21646	NC_021508	TCG	2	6	1129352	1129357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444471
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21648	NC_021508	GC	3	6	1129394	1129399	0 %	0 %	50 %	50 %	512444471
21649	NC_021508	GGCT	2	8	1129417	1129424	0 %	25 %	50 %	25 %	512444471
21650	NC_021508	CAG	2	6	1129502	1129507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444471
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21654	NC_021508	CG	3	6	1129595	1129600	0 %	0 %	50 %	50 %	512444471
21655	NC_021508	CAT	2	6	1129653	1129658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444471
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21658	NC_021508	TAG	2	6	1129757	1129762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444471
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21684	NC_021508	CTG	2	6	1130889	1130894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444472
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21699	NC_021508	GAGC	2	8	1131840	1131847	25 %	0 %	50 %	25 %	512444472
21700	NC_021508	AAT	2	6	1131975	1131980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444472
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21710	NC_021508	CTG	2	6	1132446	1132451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444472
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21713	NC_021508	TGC	2	6	1132528	1132533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444472
21714	NC_021508	TCTG	2	8	1132709	1132716	0 %	50 %	25 %	25 %	512444472
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21720	NC_021508	TGT	2	6	1133038	1133043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444473
21721	NC_021508	TGCG	3	12	1133062	1133073	0 %	25 %	50 %	25 %	512444473
21722	NC_021508	ACG	2	6	1133112	1133117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444473
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21724	NC_021508	AC	3	6	1133152	1133157	50 %	0 %	0 %	50 %	512444473
21725	NC_021508	CAT	2	6	1133197	1133202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444473
21726	NC_021508	ACCGC	2	10	1133258	1133267	20 %	0 %	20 %	60 %	512444473
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21728	NC_021508	TC	3	6	1133327	1133332	0 %	50 %	0 %	50 %	512444473
21729	NC_021508	CCTGT	2	10	1133456	1133465	0 %	40 %	20 %	40 %	512444473
21730	NC_021508	CT	3	6	1133476	1133481	0 %	50 %	0 %	50 %	512444473
21731	NC_021508	TC	4	8	1133553	1133560	0 %	50 %	0 %	50 %	512444473
21732	NC_021508	CA	3	6	1133755	1133760	50 %	0 %	0 %	50 %	512444473
21733	NC_021508	CG	3	6	1133814	1133819	0 %	0 %	50 %	50 %	512444473
21734	NC_021508	CTT	2	6	1133829	1133834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444473
21735	NC_021508	CAA	2	6	1133838	1133843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444473
21736	NC_021508	ATC	2	6	1133963	1133968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444473
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