MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_021508	GGA	2	6	1041431	1041436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444397
20003	NC_021508	GGA	2	6	1041485	1041490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444397
20004	NC_021508	CTG	2	6	1041524	1041529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444397
20005	NC_021508	AAG	2	6	1041573	1041578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444397
20006	NC_021508	GGCT	2	8	1041584	1041591	0 %	25 %	50 %	25 %	512444397
20007	NC_021508	GGA	2	6	1041596	1041601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444397
20008	NC_021508	GCA	2	6	1041602	1041607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444397
20009	NC_021508	GCG	2	6	1041626	1041631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444397
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20012	NC_021508	GTCC	2	8	1041920	1041927	0 %	25 %	25 %	50 %	512444397
20013	NC_021508	GT	3	6	1041992	1041997	0 %	50 %	50 %	0 %	512444397
20014	NC_021508	CTG	2	6	1042031	1042036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444397
20015	NC_021508	GAAG	2	8	1042105	1042112	50 %	0 %	50 %	0 %	512444397
20016	NC_021508	TCG	2	6	1042143	1042148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444397
20017	NC_021508	GCA	2	6	1042169	1042174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444397
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20019	NC_021508	GCA	2	6	1042237	1042242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444397
20020	NC_021508	TCA	2	6	1042250	1042255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444397
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20035	NC_021508	C	7	7	1043280	1043286	0 %	0 %	0 %	100 %	512444399
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20116	NC_021508	ACC	2	6	1047295	1047300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444402
20117	NC_021508	GC	3	6	1047354	1047359	0 %	0 %	50 %	50 %	512444402
20118	NC_021508	A	6	6	1047382	1047387	100 %	0 %	0 %	0 %	512444402
20119	NC_021508	CACC	2	8	1047392	1047399	25 %	0 %	0 %	75 %	512444402
20120	NC_021508	CTA	2	6	1047432	1047437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444403
20121	NC_021508	GA	3	6	1047457	1047462	50 %	0 %	50 %	0 %	512444403
20122	NC_021508	T	6	6	1047520	1047525	0 %	100 %	0 %	0 %	512444403
20123	NC_021508	GC	5	10	1047624	1047633	0 %	0 %	50 %	50 %	512444403
20124	NC_021508	GCT	2	6	1047645	1047650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444403
20125	NC_021508	CCT	2	6	1047656	1047661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444403
20126	NC_021508	GAGC	2	8	1047681	1047688	25 %	0 %	50 %	25 %	512444403
20127	NC_021508	A	6	6	1047809	1047814	100 %	0 %	0 %	0 %	512444403
20128	NC_021508	TGA	2	6	1047913	1047918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444403
20129	NC_021508	TGCA	2	8	1047944	1047951	25 %	25 %	25 %	25 %	512444403
20130	NC_021508	AAAC	2	8	1047987	1047994	75 %	0 %	0 %	25 %	512444403
20131	NC_021508	CCG	2	6	1047996	1048001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444403
20132	NC_021508	CGC	2	6	1048020	1048025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444403
20133	NC_021508	CTTA	2	8	1048063	1048070	25 %	50 %	0 %	25 %	512444403
20134	NC_021508	AAC	2	6	1048084	1048089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444403
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20138	NC_021508	CG	4	8	1048400	1048407	0 %	0 %	50 %	50 %	512444404
20139	NC_021508	CGAT	2	8	1048543	1048550	25 %	25 %	25 %	25 %	512444404
20140	NC_021508	GA	3	6	1048592	1048597	50 %	0 %	50 %	0 %	512444404
20141	NC_021508	CAA	2	6	1048610	1048615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444404
20142	NC_021508	T	6	6	1048655	1048660	0 %	100 %	0 %	0 %	512444404
20143	NC_021508	T	7	7	1048694	1048700	0 %	100 %	0 %	0 %	512444404
20144	NC_021508	TCT	2	6	1048717	1048722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444404
20145	NC_021508	GCT	2	6	1048757	1048762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444404
20146	NC_021508	CTT	2	6	1048797	1048802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444404
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20149	NC_021508	GAA	2	6	1048979	1048984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444404
20150	NC_021508	AAG	2	6	1048990	1048995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444404
20151	NC_021508	ACC	2	6	1049008	1049013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444404
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20153	NC_021508	TGA	2	6	1049159	1049164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444405
20154	NC_021508	GC	3	6	1049204	1049209	0 %	0 %	50 %	50 %	512444405
20155	NC_021508	CTC	2	6	1049216	1049221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444405
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20158	NC_021508	CGGTA	2	10	1049482	1049491	20 %	20 %	40 %	20 %	512444405
20159	NC_021508	CCG	2	6	1049515	1049520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444405
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20165	NC_021508	GCGT	2	8	1049847	1049854	0 %	25 %	50 %	25 %	512444405
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20172	NC_021508	CGC	2	6	1050097	1050102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444405
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20175	NC_021508	TGC	2	6	1050397	1050402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444405
20176	NC_021508	GCA	2	6	1050413	1050418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444405
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20181	NC_021508	GAG	2	6	1050578	1050583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444405
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20185	NC_021508	CAC	2	6	1050666	1050671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444405
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20188	NC_021508	TGCG	2	8	1050707	1050714	0 %	25 %	50 %	25 %	512444405
20189	NC_021508	CATGTT	2	12	1050761	1050772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512444406
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20192	NC_021508	TTCGCC	2	12	1050833	1050844	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512444406
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20194	NC_021508	CG	3	6	1050893	1050898	0 %	0 %	50 %	50 %	512444406
20195	NC_021508	GC	3	6	1050930	1050935	0 %	0 %	50 %	50 %	512444406
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20199	NC_021508	CG	3	6	1051325	1051330	0 %	0 %	50 %	50 %	512444406
20200	NC_021508	CAGC	2	8	1051401	1051408	25 %	0 %	25 %	50 %	512444406
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20203	NC_021508	CCCGCT	2	12	1051527	1051538	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512444406
20204	NC_021508	GCT	2	6	1051544	1051549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444406
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20211	NC_021508	CGG	2	6	1051866	1051871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444406
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20215	NC_021508	GCC	3	9	1052081	1052089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444406
20216	NC_021508	CAC	2	6	1052113	1052118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444406
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20218	NC_021508	GCC	2	6	1052168	1052173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444406
20219	NC_021508	AGCGC	2	10	1052207	1052216	20 %	0 %	40 %	40 %	512444406
20220	NC_021508	CCCA	2	8	1052224	1052231	25 %	0 %	0 %	75 %	512444406
20221	NC_021508	ATG	2	6	1052239	1052244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444406
20222	NC_021508	AC	3	6	1052265	1052270	50 %	0 %	0 %	50 %	512444406
20223	NC_021508	GCC	2	6	1052276	1052281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444406
20224	NC_021508	ACC	2	6	1052299	1052304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444406
20225	NC_021508	CGC	2	6	1052394	1052399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444407
20226	NC_021508	CG	3	6	1052434	1052439	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
20227	NC_021508	TCC	2	6	1052448	1052453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444407
20228	NC_021508	CG	3	6	1052462	1052467	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
20229	NC_021508	GC	3	6	1052473	1052478	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
20230	NC_021508	CG	3	6	1052510	1052515	0 %	0 %	50 %	50 %	512444407
20231	NC_021508	TGC	2	6	1052535	1052540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444407
20232	NC_021508	TCTTGC	2	12	1052623	1052634	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512444407
20233	NC_021508	CTC	2	6	1052640	1052645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444407
20234	NC_021508	GCGCG	2	10	1052915	1052924	0 %	0 %	60 %	40 %	512444407
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20238	NC_021508	GCA	2	6	1053029	1053034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444407
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20349	NC_021508	CCT	2	6	1059397	1059402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444410
20350	NC_021508	GACC	2	8	1059415	1059422	25 %	0 %	25 %	50 %	512444410
20351	NC_021508	CTC	2	6	1059617	1059622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444411
20352	NC_021508	CCA	2	6	1059634	1059639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444411
20353	NC_021508	GCT	2	6	1059693	1059698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444411
20354	NC_021508	ATC	2	6	1059879	1059884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444411
20355	NC_021508	C	6	6	1059973	1059978	0 %	0 %	0 %	100 %	512444412
20356	NC_021508	CG	3	6	1059982	1059987	0 %	0 %	50 %	50 %	512444412
20357	NC_021508	CA	3	6	1060028	1060033	50 %	0 %	0 %	50 %	512444412
20358	NC_021508	CTC	2	6	1060037	1060042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444412
20359	NC_021508	CAC	2	6	1060070	1060075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444412
20360	NC_021508	GCCACC	2	12	1060089	1060100	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	512444412
20361	NC_021508	GC	3	6	1060162	1060167	0 %	0 %	50 %	50 %	512444412
20362	NC_021508	GC	3	6	1060181	1060186	0 %	0 %	50 %	50 %	512444412
20363	NC_021508	GGTGA	2	10	1060201	1060210	20 %	20 %	60 %	0 %	512444412
20364	NC_021508	AGT	2	6	1060265	1060270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444412
20365	NC_021508	ACC	2	6	1060296	1060301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444412
20366	NC_021508	CG	3	6	1060322	1060327	0 %	0 %	50 %	50 %	512444412
20367	NC_021508	TGCG	2	8	1060391	1060398	0 %	25 %	50 %	25 %	512444412
20368	NC_021508	CA	3	6	1060405	1060410	50 %	0 %	0 %	50 %	512444412
20369	NC_021508	GCAGC	2	10	1060444	1060453	20 %	0 %	40 %	40 %	512444412
20370	NC_021508	CG	3	6	1060491	1060496	0 %	0 %	50 %	50 %	512444412
20371	NC_021508	CTGC	2	8	1060499	1060506	0 %	25 %	25 %	50 %	512444412
20372	NC_021508	GA	4	8	1060522	1060529	50 %	0 %	50 %	0 %	512444412
20373	NC_021508	A	6	6	1060551	1060556	100 %	0 %	0 %	0 %	512444412
20374	NC_021508	CGC	2	6	1060571	1060576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444412
20375	NC_021508	TG	3	6	1060588	1060593	0 %	50 %	50 %	0 %	512444412
20376	NC_021508	GGT	2	6	1060808	1060813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444413
20377	NC_021508	CTCA	2	8	1060815	1060822	25 %	25 %	0 %	50 %	512444413
20378	NC_021508	CTT	2	6	1060923	1060928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444413
20379	NC_021508	CTG	2	6	1060971	1060976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444413
20380	NC_021508	ACCTT	2	10	1061035	1061044	20 %	40 %	0 %	40 %	512444413
20381	NC_021508	AGTCT	2	10	1061046	1061055	20 %	40 %	20 %	20 %	512444413
20382	NC_021508	GTG	2	6	1061064	1061069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444413
20383	NC_021508	CTC	2	6	1061160	1061165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444413
20384	NC_021508	CGTAG	2	10	1061232	1061241	20 %	20 %	40 %	20 %	512444413
20385	NC_021508	CATCT	2	10	1061323	1061332	20 %	40 %	0 %	40 %	512444413
20386	NC_021508	CG	4	8	1061374	1061381	0 %	0 %	50 %	50 %	512444413
20387	NC_021508	GTT	2	6	1061415	1061420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444413
20388	NC_021508	A	6	6	1061423	1061428	100 %	0 %	0 %	0 %	512444413
20389	NC_021508	TGC	2	6	1061552	1061557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444413
20390	NC_021508	CT	3	6	1061589	1061594	0 %	50 %	0 %	50 %	512444413
20391	NC_021508	ATT	2	6	1061696	1061701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444413
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20395	NC_021508	TCCT	2	8	1061824	1061831	0 %	50 %	0 %	50 %	512444413
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20399	NC_021508	GCA	2	6	1061967	1061972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444413
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20405	NC_021508	TGC	2	6	1062516	1062521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444414
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20410	NC_021508	TC	3	6	1062706	1062711	0 %	50 %	0 %	50 %	512444414
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20412	NC_021508	GTA	2	6	1062718	1062723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444414
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20417	NC_021508	AGAA	2	8	1063084	1063091	75 %	0 %	25 %	0 %	512444415
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20421	NC_021508	ATCG	2	8	1063413	1063420	25 %	25 %	25 %	25 %	512444415
20422	NC_021508	TCA	2	6	1063519	1063524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444415
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20425	NC_021508	GTA	2	6	1063861	1063866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444416
20426	NC_021508	ACG	2	6	1063875	1063880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444416
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20428	NC_021508	GCC	2	6	1063930	1063935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444416
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20430	NC_021508	A	6	6	1064036	1064041	100 %	0 %	0 %	0 %	512444416
20431	NC_021508	ACT	2	6	1064087	1064092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444416
20432	NC_021508	A	7	7	1064163	1064169	100 %	0 %	0 %	0 %	512444416
20433	NC_021508	ATC	2	6	1064176	1064181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444416
20434	NC_021508	GTG	2	6	1064189	1064194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444416
20435	NC_021508	AGCG	2	8	1064221	1064228	25 %	0 %	50 %	25 %	512444416
20436	NC_021508	GT	3	6	1064246	1064251	0 %	50 %	50 %	0 %	512444416
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20439	NC_021508	ACCG	2	8	1064447	1064454	25 %	0 %	25 %	50 %	512444416
20440	NC_021508	CA	3	6	1064458	1064463	50 %	0 %	0 %	50 %	512444416
20441	NC_021508	TGAG	2	8	1064562	1064569	25 %	25 %	50 %	0 %	512444416
20442	NC_021508	CAA	2	6	1064579	1064584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444417
20443	NC_021508	ATC	2	6	1064595	1064600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444417
20444	NC_021508	TC	3	6	1064621	1064626	0 %	50 %	0 %	50 %	512444417
20445	NC_021508	T	6	6	1064639	1064644	0 %	100 %	0 %	0 %	512444417
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20451	NC_021508	CG	3	6	1065013	1065018	0 %	0 %	50 %	50 %	512444417
20452	NC_021508	TGGG	2	8	1065046	1065053	0 %	25 %	75 %	0 %	512444417
20453	NC_021508	GGAA	2	8	1065072	1065079	50 %	0 %	50 %	0 %	512444417
20454	NC_021508	GC	3	6	1065138	1065143	0 %	0 %	50 %	50 %	512444417
20455	NC_021508	GC	3	6	1065195	1065200	0 %	0 %	50 %	50 %	512444417
20456	NC_021508	GTGG	2	8	1065201	1065208	0 %	25 %	75 %	0 %	512444417
20457	NC_021508	AC	3	6	1065274	1065279	50 %	0 %	0 %	50 %	512444417
20458	NC_021508	TAC	2	6	1065365	1065370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444417
20459	NC_021508	GC	3	6	1065523	1065528	0 %	0 %	50 %	50 %	512444417
20460	NC_021508	CTTC	2	8	1065540	1065547	0 %	50 %	0 %	50 %	512444417
20461	NC_021508	GCA	2	6	1065557	1065562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444417
20462	NC_021508	ACTT	2	8	1065651	1065658	25 %	50 %	0 %	25 %	512444418
20463	NC_021508	AGC	2	6	1065821	1065826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444418
20464	NC_021508	TC	3	6	1065853	1065858	0 %	50 %	0 %	50 %	512444418
20465	NC_021508	A	6	6	1065958	1065963	100 %	0 %	0 %	0 %	512444418
20466	NC_021508	TG	3	6	1065981	1065986	0 %	50 %	50 %	0 %	512444418
20467	NC_021508	CCA	2	6	1066002	1066007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444418
20468	NC_021508	TGT	2	6	1066066	1066071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444418
20469	NC_021508	GC	3	6	1066094	1066099	0 %	0 %	50 %	50 %	512444418
20470	NC_021508	ACC	2	6	1066172	1066177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444418
20471	NC_021508	TTG	2	6	1066178	1066183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444418
20472	NC_021508	CAT	3	9	1066245	1066253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444418
20473	NC_021508	TGC	2	6	1066269	1066274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444418
20474	NC_021508	CAA	2	6	1066284	1066289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444418
20475	NC_021508	ATG	2	6	1066321	1066326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444418
20476	NC_021508	ACT	2	6	1066346	1066351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444418
20477	NC_021508	TG	3	6	1066463	1066468	0 %	50 %	50 %	0 %	512444418
20478	NC_021508	ATT	2	6	1066498	1066503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444418
20479	NC_021508	GAA	2	6	1066549	1066554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444418
20480	NC_021508	CAA	2	6	1066572	1066577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444418
20481	NC_021508	CCG	2	6	1066712	1066717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444418
20482	NC_021508	CAAA	2	8	1066758	1066765	75 %	0 %	0 %	25 %	512444418
20483	NC_021508	GTC	2	6	1066780	1066785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444418
20484	NC_021508	CGT	2	6	1066925	1066930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444419
20485	NC_021508	TA	3	6	1066947	1066952	50 %	50 %	0 %	0 %	512444419
20486	NC_021508	ACC	2	6	1066982	1066987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444419
20487	NC_021508	GTAT	2	8	1066988	1066995	25 %	50 %	25 %	0 %	512444419
20488	NC_021508	GCG	2	6	1067027	1067032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444419
20489	NC_021508	AGA	2	6	1067090	1067095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444419
20490	NC_021508	TCT	2	6	1067101	1067106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444419
20491	NC_021508	TGT	2	6	1067114	1067119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444419
20492	NC_021508	GGTGCG	2	12	1067146	1067157	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512444419
20493	NC_021508	TG	3	6	1067171	1067176	0 %	50 %	50 %	0 %	512444419
20494	NC_021508	TCGG	2	8	1067177	1067184	0 %	25 %	50 %	25 %	512444419
20495	NC_021508	CTG	2	6	1067194	1067199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444419
20496	NC_021508	T	7	7	1067231	1067237	0 %	100 %	0 %	0 %	512444419
20497	NC_021508	CTC	2	6	1067297	1067302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444419
20498	NC_021508	TTTG	2	8	1067322	1067329	0 %	75 %	25 %	0 %	512444419
20499	NC_021508	TC	3	6	1067348	1067353	0 %	50 %	0 %	50 %	512444419
20500	NC_021508	AT	3	6	1067406	1067411	50 %	50 %	0 %	0 %	512444419

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