MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_021508	AAG	2	6	1015930	1015935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444372
19502	NC_021508	CCGT	2	8	1015943	1015950	0 %	25 %	25 %	50 %	512444372
19503	NC_021508	CATA	2	8	1016054	1016061	50 %	25 %	0 %	25 %	512444372
19504	NC_021508	GAC	2	6	1016118	1016123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444372
19505	NC_021508	GAG	2	6	1016168	1016173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444372
19506	NC_021508	ATC	2	6	1016228	1016233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444372
19507	NC_021508	TGC	2	6	1016314	1016319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444372
19508	NC_021508	GCA	3	9	1016385	1016393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444372
19509	NC_021508	CGA	2	6	1016440	1016445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444372
19510	NC_021508	TGC	2	6	1016498	1016503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444372
19511	NC_021508	GC	3	6	1016515	1016520	0 %	0 %	50 %	50 %	512444372
19512	NC_021508	ACGCA	2	10	1016537	1016546	40 %	0 %	20 %	40 %	512444372
19513	NC_021508	A	8	8	1016546	1016553	100 %	0 %	0 %	0 %	512444372
19514	NC_021508	GAA	2	6	1016592	1016597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444372
19515	NC_021508	CGCA	2	8	1016602	1016609	25 %	0 %	25 %	50 %	512444372
19516	NC_021508	AGG	2	6	1016635	1016640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444372
19517	NC_021508	AGAC	2	8	1016643	1016650	50 %	0 %	25 %	25 %	512444372
19518	NC_021508	T	6	6	1016828	1016833	0 %	100 %	0 %	0 %	512444373
19519	NC_021508	GC	3	6	1016886	1016891	0 %	0 %	50 %	50 %	512444373
19520	NC_021508	T	8	8	1016955	1016962	0 %	100 %	0 %	0 %	512444373
19521	NC_021508	TAC	2	6	1017013	1017018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444373
19522	NC_021508	CTTT	2	8	1017059	1017066	0 %	75 %	0 %	25 %	512444373
19523	NC_021508	CGC	2	6	1017129	1017134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444373
19524	NC_021508	T	8	8	1017161	1017168	0 %	100 %	0 %	0 %	512444373
19525	NC_021508	AGT	2	6	1017185	1017190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444373
19526	NC_021508	TCT	2	6	1017217	1017222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444373
19527	NC_021508	CT	3	6	1017225	1017230	0 %	50 %	0 %	50 %	512444373
19528	NC_021508	TCG	2	6	1017246	1017251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444373
19529	NC_021508	CG	3	6	1017315	1017320	0 %	0 %	50 %	50 %	512444373
19530	NC_021508	CA	3	6	1017324	1017329	50 %	0 %	0 %	50 %	512444373
19531	NC_021508	TCT	2	6	1017339	1017344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444373
19532	NC_021508	ACTGAC	2	12	1017448	1017459	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512444373
19533	NC_021508	TTA	2	6	1017495	1017500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444373
19534	NC_021508	GCA	2	6	1017542	1017547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444373
19535	NC_021508	TGC	2	6	1017657	1017662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444373
19536	NC_021508	CTT	2	6	1017760	1017765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444373
19537	NC_021508	CTG	2	6	1017786	1017791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444373
19538	NC_021508	CAT	2	6	1017792	1017797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444373
19539	NC_021508	TC	3	6	1017799	1017804	0 %	50 %	0 %	50 %	512444373
19540	NC_021508	AGG	2	6	1017829	1017834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444373
19541	NC_021508	CTG	2	6	1017909	1017914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444373
19542	NC_021508	T	6	6	1017917	1017922	0 %	100 %	0 %	0 %	512444373
19543	NC_021508	CG	3	6	1018010	1018015	0 %	0 %	50 %	50 %	512444373
19544	NC_021508	AC	3	6	1018124	1018129	50 %	0 %	0 %	50 %	512444374
19545	NC_021508	TG	3	6	1018227	1018232	0 %	50 %	50 %	0 %	512444374
19546	NC_021508	AAC	2	6	1018234	1018239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444374
19547	NC_021508	G	6	6	1018295	1018300	0 %	0 %	100 %	0 %	512444374
19548	NC_021508	CG	3	6	1018364	1018369	0 %	0 %	50 %	50 %	512444374
19549	NC_021508	TTCT	2	8	1018380	1018387	0 %	75 %	0 %	25 %	512444374
19550	NC_021508	CTCC	2	8	1018394	1018401	0 %	25 %	0 %	75 %	512444374
19551	NC_021508	GC	3	6	1018453	1018458	0 %	0 %	50 %	50 %	512444374
19552	NC_021508	AC	3	6	1018461	1018466	50 %	0 %	0 %	50 %	512444374
19553	NC_021508	ATA	2	6	1018537	1018542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444374
19554	NC_021508	TCT	2	6	1018559	1018564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444374
19555	NC_021508	CAT	2	6	1018586	1018591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444374
19556	NC_021508	GCA	2	6	1018606	1018611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444374
19557	NC_021508	A	6	6	1018722	1018727	100 %	0 %	0 %	0 %	512444374
19558	NC_021508	CCA	2	6	1018729	1018734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444374
19559	NC_021508	ACA	2	6	1018742	1018747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444374
19560	NC_021508	A	7	7	1018850	1018856	100 %	0 %	0 %	0 %	512444374
19561	NC_021508	TCA	2	6	1018858	1018863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444374
19562	NC_021508	CGCA	2	8	1018869	1018876	25 %	0 %	25 %	50 %	512444374
19563	NC_021508	TCT	2	6	1018910	1018915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444374
19564	NC_021508	T	6	6	1018923	1018928	0 %	100 %	0 %	0 %	512444374
19565	NC_021508	GC	3	6	1018948	1018953	0 %	0 %	50 %	50 %	512444374
19566	NC_021508	CTC	2	6	1019153	1019158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444375
19567	NC_021508	T	6	6	1019177	1019182	0 %	100 %	0 %	0 %	512444375
19568	NC_021508	G	6	6	1019199	1019204	0 %	0 %	100 %	0 %	512444375
19569	NC_021508	CCCT	2	8	1019233	1019240	0 %	25 %	0 %	75 %	512444375
19570	NC_021508	CGAT	2	8	1019297	1019304	25 %	25 %	25 %	25 %	512444375
19571	NC_021508	GT	3	6	1019423	1019428	0 %	50 %	50 %	0 %	512444375
19572	NC_021508	CGT	2	6	1019434	1019439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444375
19573	NC_021508	CATC	2	8	1019479	1019486	25 %	25 %	0 %	50 %	512444375
19574	NC_021508	AACGC	2	10	1019563	1019572	40 %	0 %	20 %	40 %	512444375
19575	NC_021508	TCA	2	6	1019582	1019587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444375
19576	NC_021508	TTA	2	6	1019682	1019687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444375
19577	NC_021508	GCT	2	6	1019706	1019711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444375
19578	NC_021508	GCC	2	6	1019772	1019777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444375
19579	NC_021508	CA	4	8	1019925	1019932	50 %	0 %	0 %	50 %	512444375
19580	NC_021508	TGC	2	6	1019954	1019959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444375
19581	NC_021508	ATC	2	6	1019963	1019968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444375
19582	NC_021508	GC	4	8	1019990	1019997	0 %	0 %	50 %	50 %	512444375
19583	NC_021508	AC	3	6	1020055	1020060	50 %	0 %	0 %	50 %	512444375
19584	NC_021508	GCA	2	6	1020084	1020089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444375
19585	NC_021508	GCGCGT	2	12	1020095	1020106	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512444375
19586	NC_021508	A	6	6	1020138	1020143	100 %	0 %	0 %	0 %	512444375
19587	NC_021508	TAA	2	6	1020192	1020197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444375
19588	NC_021508	GCC	2	6	1020447	1020452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444376
19589	NC_021508	CGTG	2	8	1020469	1020476	0 %	25 %	50 %	25 %	512444376
19590	NC_021508	TG	4	8	1020475	1020482	0 %	50 %	50 %	0 %	512444376
19591	NC_021508	TGCG	2	8	1020514	1020521	0 %	25 %	50 %	25 %	512444376
19592	NC_021508	GATT	2	8	1020552	1020559	25 %	50 %	25 %	0 %	512444376
19593	NC_021508	AC	3	6	1020578	1020583	50 %	0 %	0 %	50 %	512444376
19594	NC_021508	TAC	2	6	1020618	1020623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444376
19595	NC_021508	CGT	2	6	1020815	1020820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444376
19596	NC_021508	ACA	2	6	1020837	1020842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444376
19597	NC_021508	AAG	2	6	1020868	1020873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444376
19598	NC_021508	ACC	2	6	1020902	1020907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444376
19599	NC_021508	CAA	2	6	1020949	1020954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444376
19600	NC_021508	CCA	2	6	1021075	1021080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444377
19601	NC_021508	GCAC	2	8	1021138	1021145	25 %	0 %	25 %	50 %	512444377
19602	NC_021508	CATAG	2	10	1021173	1021182	40 %	20 %	20 %	20 %	512444377
19603	NC_021508	GGA	2	6	1021185	1021190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444377
19604	NC_021508	A	6	6	1021190	1021195	100 %	0 %	0 %	0 %	512444377
19605	NC_021508	CG	3	6	1021273	1021278	0 %	0 %	50 %	50 %	512444377
19606	NC_021508	TGC	2	6	1021305	1021310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444377
19607	NC_021508	TCT	2	6	1021372	1021377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444377
19608	NC_021508	CCTG	2	8	1021408	1021415	0 %	25 %	25 %	50 %	512444377
19609	NC_021508	ACC	2	6	1021497	1021502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444377
19610	NC_021508	CCA	2	6	1021613	1021618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444377
19611	NC_021508	CG	4	8	1021621	1021628	0 %	0 %	50 %	50 %	512444377
19612	NC_021508	T	6	6	1021690	1021695	0 %	100 %	0 %	0 %	512444377
19613	NC_021508	CTG	2	6	1021716	1021721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444377
19614	NC_021508	AGGA	2	8	1021724	1021731	50 %	0 %	50 %	0 %	512444377
19615	NC_021508	GA	3	6	1021730	1021735	50 %	0 %	50 %	0 %	512444377
19616	NC_021508	GA	3	6	1021788	1021793	50 %	0 %	50 %	0 %	512444377
19617	NC_021508	AC	3	6	1021800	1021805	50 %	0 %	0 %	50 %	512444377
19618	NC_021508	CG	3	6	1021816	1021821	0 %	0 %	50 %	50 %	512444377
19619	NC_021508	TTCA	2	8	1021861	1021868	25 %	50 %	0 %	25 %	512444377
19620	NC_021508	ACGG	2	8	1021935	1021942	25 %	0 %	50 %	25 %	512444378
19621	NC_021508	CTTCT	2	10	1021981	1021990	0 %	60 %	0 %	40 %	512444378
19622	NC_021508	GC	3	6	1021991	1021996	0 %	0 %	50 %	50 %	512444378
19623	NC_021508	AGC	2	6	1022000	1022005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444378
19624	NC_021508	GCTC	2	8	1022012	1022019	0 %	25 %	25 %	50 %	512444378
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19627	NC_021508	CAT	2	6	1022259	1022264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444378
19628	NC_021508	CT	3	6	1022275	1022280	0 %	50 %	0 %	50 %	512444378
19629	NC_021508	CGC	2	6	1022392	1022397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444378
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19632	NC_021508	GGT	2	6	1022586	1022591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444378
19633	NC_021508	GA	3	6	1022596	1022601	50 %	0 %	50 %	0 %	512444378
19634	NC_021508	GCT	2	6	1022670	1022675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444378
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19639	NC_021508	CGT	2	6	1022878	1022883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444378
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19696	NC_021508	CG	4	8	1026118	1026125	0 %	0 %	50 %	50 %	512444379
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19708	NC_021508	GGA	2	6	1026792	1026797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444381
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19724	NC_021508	TGC	2	6	1027701	1027706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444382
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19727	NC_021508	CGC	2	6	1028161	1028166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444382
19728	NC_021508	CA	3	6	1028189	1028194	50 %	0 %	0 %	50 %	512444382
19729	NC_021508	CG	4	8	1028224	1028231	0 %	0 %	50 %	50 %	512444382
19730	NC_021508	AGAGA	2	10	1028605	1028614	60 %	0 %	40 %	0 %	512444383
19731	NC_021508	A	8	8	1028629	1028636	100 %	0 %	0 %	0 %	512444383
19732	NC_021508	ATC	2	6	1028787	1028792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444383
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19734	NC_021508	GCA	2	6	1028865	1028870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444383
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19870	NC_021508	CA	3	6	1035304	1035309	50 %	0 %	0 %	50 %	512444391
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19972	NC_021508	TCA	2	6	1040060	1040065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444396
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