MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

< Previous12...32333435363738394041424344Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021508	ACC	2	6	889632	889637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444264
17002	NC_021508	TC	3	6	889719	889724	0 %	50 %	0 %	50 %	512444264
17003	NC_021508	CG	3	6	889758	889763	0 %	0 %	50 %	50 %	512444264
17004	NC_021508	A	6	6	889819	889824	100 %	0 %	0 %	0 %	512444264
17005	NC_021508	CCA	2	6	889845	889850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444264
17006	NC_021508	CCT	2	6	889878	889883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444264
17007	NC_021508	AC	3	6	889936	889941	50 %	0 %	0 %	50 %	512444264
17008	NC_021508	AG	4	8	890069	890076	50 %	0 %	50 %	0 %	512444264
17009	NC_021508	GCT	2	6	890093	890098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444264
17010	NC_021508	GCA	3	9	890108	890116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444264
17011	NC_021508	CCT	2	6	890204	890209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444264
17012	NC_021508	ACGCG	2	10	890256	890265	20 %	0 %	40 %	40 %	512444264
17013	NC_021508	TACG	2	8	890419	890426	25 %	25 %	25 %	25 %	512444265
17014	NC_021508	CAC	2	6	890435	890440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444265
17015	NC_021508	CG	3	6	890465	890470	0 %	0 %	50 %	50 %	512444265
17016	NC_021508	ACC	2	6	890494	890499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444265
17017	NC_021508	ATT	2	6	890569	890574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444265
17018	NC_021508	CG	3	6	890618	890623	0 %	0 %	50 %	50 %	512444265
17019	NC_021508	CCT	2	6	890642	890647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444265
17020	NC_021508	TGC	2	6	890671	890676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444265
17021	NC_021508	CGCA	2	8	890709	890716	25 %	0 %	25 %	50 %	512444265
17022	NC_021508	CTG	2	6	890729	890734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444265
17023	NC_021508	CGG	2	6	890798	890803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444265
17024	NC_021508	TCAC	2	8	890809	890816	25 %	25 %	0 %	50 %	512444265
17025	NC_021508	TGC	2	6	890905	890910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444265
17026	NC_021508	GAAA	2	8	890927	890934	75 %	0 %	25 %	0 %	512444265
17027	NC_021508	TCA	2	6	890936	890941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444265
17028	NC_021508	C	6	6	890948	890953	0 %	0 %	0 %	100 %	512444265
17029	NC_021508	TGC	2	6	891013	891018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444265
17030	NC_021508	TTC	2	6	891019	891024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444265
17031	NC_021508	CTT	3	9	891026	891034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444265
17032	NC_021508	GC	3	6	891051	891056	0 %	0 %	50 %	50 %	512444265
17033	NC_021508	ACC	2	6	891115	891120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444265
17034	NC_021508	AGCGC	2	10	891151	891160	20 %	0 %	40 %	40 %	512444265
17035	NC_021508	TCG	2	6	891354	891359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444266
17036	NC_021508	CCG	2	6	891463	891468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444266
17037	NC_021508	TCGTT	2	10	891622	891631	0 %	60 %	20 %	20 %	512444266
17038	NC_021508	ACTGC	2	10	891691	891700	20 %	20 %	20 %	40 %	512444266
17039	NC_021508	CGA	2	6	891703	891708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444266
17040	NC_021508	AGC	2	6	891840	891845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444266
17041	NC_021508	GC	3	6	891844	891849	0 %	0 %	50 %	50 %	512444266
17042	NC_021508	TCA	2	6	891886	891891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444266
17043	NC_021508	GA	3	6	891900	891905	50 %	0 %	50 %	0 %	512444266
17044	NC_021508	TGC	2	6	891930	891935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444266
17045	NC_021508	CAA	2	6	891958	891963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444266
17046	NC_021508	AAG	2	6	891993	891998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444266
17047	NC_021508	GC	3	6	892084	892089	0 %	0 %	50 %	50 %	512444266
17048	NC_021508	AGC	2	6	892091	892096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444266
17049	NC_021508	CTG	2	6	892315	892320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444267
17050	NC_021508	CACCTT	2	12	892445	892456	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	512444267
17051	NC_021508	GCA	2	6	892534	892539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444267
17052	NC_021508	ACT	2	6	892559	892564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444267
17053	NC_021508	A	6	6	892589	892594	100 %	0 %	0 %	0 %	512444267
17054	NC_021508	GCT	2	6	893047	893052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444268
17055	NC_021508	TC	3	6	893086	893091	0 %	50 %	0 %	50 %	512444268
17056	NC_021508	GC	4	8	893104	893111	0 %	0 %	50 %	50 %	512444268
17057	NC_021508	AGG	2	6	893118	893123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444268
17058	NC_021508	TGG	2	6	893158	893163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444268
17059	NC_021508	GTC	2	6	893186	893191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444268
17060	NC_021508	ACG	2	6	893232	893237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444268
17061	NC_021508	TCA	2	6	893257	893262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444268
17062	NC_021508	CTC	2	6	893279	893284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444268
17063	NC_021508	ACG	2	6	893364	893369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444268
17064	NC_021508	AGGTA	2	10	893449	893458	40 %	20 %	40 %	0 %	512444268
17065	NC_021508	CCT	2	6	893509	893514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444268
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17069	NC_021508	TCG	2	6	893682	893687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444268
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17073	NC_021508	CTC	2	6	893861	893866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444268
17074	NC_021508	TAG	2	6	893961	893966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444268
17075	NC_021508	A	7	7	893967	893973	100 %	0 %	0 %	0 %	512444268
17076	NC_021508	CCT	2	6	894010	894015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444268
17077	NC_021508	TGA	2	6	894031	894036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444268
17078	NC_021508	GCT	2	6	894056	894061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444268
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17081	NC_021508	CTT	2	6	894112	894117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444268
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17084	NC_021508	AC	3	6	894314	894319	50 %	0 %	0 %	50 %	512444268
17085	NC_021508	TTC	2	6	894342	894347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444268
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17088	NC_021508	CCGTT	2	10	894694	894703	0 %	40 %	20 %	40 %	512444268
17089	NC_021508	GGA	2	6	894731	894736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444268
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17091	NC_021508	CG	4	8	894831	894838	0 %	0 %	50 %	50 %	512444268
17092	NC_021508	CGC	2	6	894847	894852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444268
17093	NC_021508	CGTT	2	8	894948	894955	0 %	50 %	25 %	25 %	512444269
17094	NC_021508	GCC	2	6	894991	894996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444269
17095	NC_021508	GGAA	2	8	895004	895011	50 %	0 %	50 %	0 %	512444269
17096	NC_021508	TCCTT	2	10	895164	895173	0 %	60 %	0 %	40 %	512444270
17097	NC_021508	CCT	2	6	895174	895179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444270
17098	NC_021508	T	7	7	895368	895374	0 %	100 %	0 %	0 %	512444270
17099	NC_021508	GA	3	6	895383	895388	50 %	0 %	50 %	0 %	512444270
17100	NC_021508	GC	3	6	895413	895418	0 %	0 %	50 %	50 %	512444270
17101	NC_021508	TTCT	2	8	895458	895465	0 %	75 %	0 %	25 %	512444270
17102	NC_021508	GTA	2	6	895487	895492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444270
17103	NC_021508	CG	3	6	895546	895551	0 %	0 %	50 %	50 %	512444270
17104	NC_021508	A	6	6	895728	895733	100 %	0 %	0 %	0 %	512444270
17105	NC_021508	AGA	2	6	895759	895764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444270
17106	NC_021508	GC	3	6	895770	895775	0 %	0 %	50 %	50 %	512444270
17107	NC_021508	TAC	2	6	895802	895807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444270
17108	NC_021508	GCA	2	6	895902	895907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444270
17109	NC_021508	CTG	2	6	895998	896003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444271
17110	NC_021508	GC	3	6	896009	896014	0 %	0 %	50 %	50 %	512444271
17111	NC_021508	GC	3	6	896096	896101	0 %	0 %	50 %	50 %	512444271
17112	NC_021508	TCC	2	6	896160	896165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444271
17113	NC_021508	AGG	2	6	896173	896178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444271
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17116	NC_021508	TGG	2	6	896377	896382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444271
17117	NC_021508	AC	3	6	896416	896421	50 %	0 %	0 %	50 %	512444271
17118	NC_021508	CG	3	6	896457	896462	0 %	0 %	50 %	50 %	512444271
17119	NC_021508	ACA	2	6	896577	896582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444271
17120	NC_021508	CAGGTG	2	12	896649	896660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512444271
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17122	NC_021508	GTACA	2	10	896784	896793	40 %	20 %	20 %	20 %	512444271
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17245	NC_021508	CG	3	6	902461	902466	0 %	0 %	50 %	50 %	512444278
17246	NC_021508	CCGTC	2	10	902475	902484	0 %	20 %	20 %	60 %	512444278
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17252	NC_021508	AATT	2	8	902790	902797	50 %	50 %	0 %	0 %	512444278
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17488	NC_021508	GGCA	2	8	916508	916515	25 %	0 %	50 %	25 %	512444286
17489	NC_021508	ACC	2	6	916534	916539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444286
17490	NC_021508	A	6	6	916618	916623	100 %	0 %	0 %	0 %	512444286
17491	NC_021508	CTC	2	6	916668	916673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444286
17492	NC_021508	TGC	2	6	916734	916739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444286
17493	NC_021508	GC	3	6	916765	916770	0 %	0 %	50 %	50 %	512444286
17494	NC_021508	CG	3	6	916772	916777	0 %	0 %	50 %	50 %	512444286
17495	NC_021508	CGGCA	2	10	916781	916790	20 %	0 %	40 %	40 %	512444286
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17500	NC_021508	GC	3	6	917130	917135	0 %	0 %	50 %	50 %	512444286

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