MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_021508	CA	3	6	861831	861836	50 %	0 %	0 %	50 %	512444239
16502	NC_021508	TTC	2	6	861884	861889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444239
16503	NC_021508	CG	4	8	861956	861963	0 %	0 %	50 %	50 %	512444239
16504	NC_021508	AGA	2	6	861976	861981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444239
16505	NC_021508	CAG	2	6	862052	862057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444239
16506	NC_021508	ATC	2	6	862097	862102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444239
16507	NC_021508	AG	3	6	862187	862192	50 %	0 %	50 %	0 %	512444240
16508	NC_021508	CA	3	6	862303	862308	50 %	0 %	0 %	50 %	512444240
16509	NC_021508	GT	3	6	862364	862369	0 %	50 %	50 %	0 %	512444240
16510	NC_021508	TG	3	6	862372	862377	0 %	50 %	50 %	0 %	512444240
16511	NC_021508	GC	4	8	862386	862393	0 %	0 %	50 %	50 %	512444240
16512	NC_021508	T	6	6	862494	862499	0 %	100 %	0 %	0 %	512444240
16513	NC_021508	CCT	2	6	862566	862571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444240
16514	NC_021508	GGC	2	6	862576	862581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444240
16515	NC_021508	GAT	2	6	862604	862609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444240
16516	NC_021508	A	7	7	862676	862682	100 %	0 %	0 %	0 %	512444240
16517	NC_021508	TGC	2	6	862782	862787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444240
16518	NC_021508	GCA	2	6	862902	862907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444240
16519	NC_021508	GC	3	6	862924	862929	0 %	0 %	50 %	50 %	512444240
16520	NC_021508	G	6	6	862936	862941	0 %	0 %	100 %	0 %	512444240
16521	NC_021508	TGA	3	9	863067	863075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444240
16522	NC_021508	CGCA	2	8	863236	863243	25 %	0 %	25 %	50 %	512444240
16523	NC_021508	CTCA	2	8	863324	863331	25 %	25 %	0 %	50 %	512444240
16524	NC_021508	A	6	6	863345	863350	100 %	0 %	0 %	0 %	512444240
16525	NC_021508	GCGCT	2	10	863435	863444	0 %	20 %	40 %	40 %	512444241
16526	NC_021508	CGCA	2	8	863483	863490	25 %	0 %	25 %	50 %	512444241
16527	NC_021508	CA	4	8	863496	863503	50 %	0 %	0 %	50 %	512444241
16528	NC_021508	ATG	2	6	863506	863511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444241
16529	NC_021508	T	6	6	863529	863534	0 %	100 %	0 %	0 %	512444241
16530	NC_021508	AC	3	6	863535	863540	50 %	0 %	0 %	50 %	512444241
16531	NC_021508	CACG	2	8	863592	863599	25 %	0 %	25 %	50 %	512444242
16532	NC_021508	GC	3	6	863621	863626	0 %	0 %	50 %	50 %	512444242
16533	NC_021508	GCATCT	2	12	863729	863740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512444242
16534	NC_021508	GT	3	6	863780	863785	0 %	50 %	50 %	0 %	512444242
16535	NC_021508	GAT	2	6	863809	863814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444242
16536	NC_021508	ATG	2	6	863815	863820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444242
16537	NC_021508	CAC	2	6	863869	863874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444242
16538	NC_021508	ACC	2	6	863894	863899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444242
16539	NC_021508	CGTGC	2	10	863917	863926	0 %	20 %	40 %	40 %	512444242
16540	NC_021508	TTCCA	2	10	863945	863954	20 %	40 %	0 %	40 %	512444242
16541	NC_021508	GCT	2	6	863966	863971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444242
16542	NC_021508	TCC	2	6	864013	864018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444242
16543	NC_021508	GT	3	6	864140	864145	0 %	50 %	50 %	0 %	512444242
16544	NC_021508	GC	3	6	864147	864152	0 %	0 %	50 %	50 %	512444242
16545	NC_021508	GC	3	6	864167	864172	0 %	0 %	50 %	50 %	512444242
16546	NC_021508	CCT	2	6	864207	864212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444242
16547	NC_021508	CAG	2	6	864234	864239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444242
16548	NC_021508	A	8	8	864316	864323	100 %	0 %	0 %	0 %	512444242
16549	NC_021508	CAA	3	9	864357	864365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444242
16550	NC_021508	CCTG	2	8	864377	864384	0 %	25 %	25 %	50 %	512444242
16551	NC_021508	GCA	2	6	864395	864400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444242
16552	NC_021508	TCA	2	6	864410	864415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444242
16553	NC_021508	TGT	3	9	864440	864448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444242
16554	NC_021508	AGC	2	6	864449	864454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444242
16555	NC_021508	CCT	2	6	864462	864467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444242
16556	NC_021508	CAG	3	9	864486	864494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444242
16557	NC_021508	CG	3	6	864564	864569	0 %	0 %	50 %	50 %	512444242
16558	NC_021508	CA	3	6	864594	864599	50 %	0 %	0 %	50 %	512444242
16559	NC_021508	GAA	2	6	864712	864717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444243
16560	NC_021508	AGCGC	2	10	864721	864730	20 %	0 %	40 %	40 %	512444243
16561	NC_021508	CTC	2	6	864765	864770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444243
16562	NC_021508	TG	3	6	864881	864886	0 %	50 %	50 %	0 %	512444243
16563	NC_021508	CG	3	6	864908	864913	0 %	0 %	50 %	50 %	512444243
16564	NC_021508	AGCG	2	8	864939	864946	25 %	0 %	50 %	25 %	512444243
16565	NC_021508	CCA	2	6	865019	865024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444243
16566	NC_021508	GCA	2	6	865046	865051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444243
16567	NC_021508	GTG	2	6	865077	865082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444243
16568	NC_021508	GC	3	6	865092	865097	0 %	0 %	50 %	50 %	512444243
16569	NC_021508	C	6	6	865112	865117	0 %	0 %	0 %	100 %	512444243
16570	NC_021508	TGA	2	6	865168	865173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444243
16571	NC_021508	CGC	2	6	865218	865223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444243
16572	NC_021508	TGC	2	6	865499	865504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444243
16573	NC_021508	TCC	2	6	865595	865600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444244
16574	NC_021508	A	8	8	865660	865667	100 %	0 %	0 %	0 %	512444244
16575	NC_021508	CGG	2	6	865709	865714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444244
16576	NC_021508	CAATT	2	10	865766	865775	40 %	40 %	0 %	20 %	512444244
16577	NC_021508	CAC	2	6	865882	865887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444244
16578	NC_021508	CAT	2	6	865951	865956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444244
16579	NC_021508	CAA	2	6	865966	865971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444244
16580	NC_021508	A	7	7	866041	866047	100 %	0 %	0 %	0 %	512444244
16581	NC_021508	GAGG	2	8	866070	866077	25 %	0 %	75 %	0 %	512444244
16582	NC_021508	CTC	2	6	866090	866095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444244
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16584	NC_021508	TTG	2	6	866102	866107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444244
16585	NC_021508	GTCT	2	8	866111	866118	0 %	50 %	25 %	25 %	512444244
16586	NC_021508	ATTC	2	8	866126	866133	25 %	50 %	0 %	25 %	512444244
16587	NC_021508	GCA	2	6	866211	866216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444244
16588	NC_021508	ACGG	2	8	866233	866240	25 %	0 %	50 %	25 %	512444244
16589	NC_021508	CGG	2	6	866252	866257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444244
16590	NC_021508	TCTT	2	8	866343	866350	0 %	75 %	0 %	25 %	512444244
16591	NC_021508	GCA	2	6	866352	866357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444244
16592	NC_021508	CA	4	8	866356	866363	50 %	0 %	0 %	50 %	512444244
16593	NC_021508	CTC	2	6	866365	866370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444244
16594	NC_021508	C	6	6	866370	866375	0 %	0 %	0 %	100 %	512444244
16595	NC_021508	TGC	2	6	866421	866426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444244
16596	NC_021508	A	6	6	866439	866444	100 %	0 %	0 %	0 %	512444244
16597	NC_021508	TTC	2	6	866678	866683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444244
16598	NC_021508	TGC	2	6	866701	866706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444244
16599	NC_021508	GC	3	6	866705	866710	0 %	0 %	50 %	50 %	512444244
16600	NC_021508	CGTA	2	8	866737	866744	25 %	25 %	25 %	25 %	512444244
16601	NC_021508	T	6	6	866848	866853	0 %	100 %	0 %	0 %	512444244
16602	NC_021508	C	6	6	866957	866962	0 %	0 %	0 %	100 %	512444244
16603	NC_021508	CTG	2	6	867101	867106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444244
16604	NC_021508	CCA	2	6	867113	867118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444244
16605	NC_021508	TTTC	2	8	867130	867137	0 %	75 %	0 %	25 %	512444244
16606	NC_021508	TCG	2	6	867144	867149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444244
16607	NC_021508	C	9	9	867152	867160	0 %	0 %	0 %	100 %	512444244
16608	NC_021508	CA	3	6	867228	867233	50 %	0 %	0 %	50 %	512444244
16609	NC_021508	C	6	6	867274	867279	0 %	0 %	0 %	100 %	512444244
16610	NC_021508	CG	3	6	867289	867294	0 %	0 %	50 %	50 %	512444244
16611	NC_021508	CGTA	2	8	867317	867324	25 %	25 %	25 %	25 %	512444244
16612	NC_021508	GAT	2	6	867364	867369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444244
16613	NC_021508	GTG	2	6	867372	867377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444244
16614	NC_021508	CA	3	6	867467	867472	50 %	0 %	0 %	50 %	512444244
16615	NC_021508	GC	3	6	867473	867478	0 %	0 %	50 %	50 %	512444244
16616	NC_021508	AAC	2	6	867666	867671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444244
16617	NC_021508	AAT	2	6	867715	867720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444244
16618	NC_021508	CA	3	6	867775	867780	50 %	0 %	0 %	50 %	512444244
16619	NC_021508	TGCCG	2	10	867824	867833	0 %	20 %	40 %	40 %	512444244
16620	NC_021508	TCG	2	6	867837	867842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444244
16621	NC_021508	GTT	2	6	867941	867946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444244
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16623	NC_021508	CAA	2	6	868036	868041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444245
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16868	NC_021508	CCTA	2	8	880427	880434	25 %	25 %	0 %	50 %	512444256
16869	NC_021508	GCG	2	6	880447	880452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444256
16870	NC_021508	GCT	2	6	880515	880520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444256
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16874	NC_021508	TGA	2	6	880669	880674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444256
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16876	NC_021508	GAG	2	6	880755	880760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444256
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16880	NC_021508	CG	3	6	880870	880875	0 %	0 %	50 %	50 %	512444256
16881	NC_021508	CAA	2	6	880946	880951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444256
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