MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021508	GAA	2	6	836948	836953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444216
16002	NC_021508	GAA	2	6	836981	836986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444216
16003	NC_021508	GGA	3	9	836998	837006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444216
16004	NC_021508	GC	3	6	837011	837016	0 %	0 %	50 %	50 %	512444216
16005	NC_021508	GCC	2	6	837020	837025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444216
16006	NC_021508	GAA	2	6	837041	837046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444216
16007	NC_021508	GAA	2	6	837074	837079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444216
16008	NC_021508	GGA	3	9	837091	837099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444216
16009	NC_021508	GC	3	6	837104	837109	0 %	0 %	50 %	50 %	512444216
16010	NC_021508	GCC	2	6	837113	837118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444216
16011	NC_021508	AGC	2	6	837124	837129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444216
16012	NC_021508	GGA	2	6	837139	837144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444216
16013	NC_021508	CCG	2	6	837234	837239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444216
16014	NC_021508	GAA	2	6	837262	837267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444216
16015	NC_021508	GAG	2	6	837362	837367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444216
16016	NC_021508	TG	3	6	837536	837541	0 %	50 %	50 %	0 %	512444217
16017	NC_021508	TGAA	2	8	837617	837624	50 %	25 %	25 %	0 %	512444217
16018	NC_021508	GCT	2	6	837679	837684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444217
16019	NC_021508	ATC	2	6	837718	837723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444217
16020	NC_021508	GCC	2	6	837754	837759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444217
16021	NC_021508	A	6	6	837881	837886	100 %	0 %	0 %	0 %	512444217
16022	NC_021508	AGC	2	6	837929	837934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444217
16023	NC_021508	GA	3	6	837956	837961	50 %	0 %	50 %	0 %	512444217
16024	NC_021508	TAG	2	6	837965	837970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444217
16025	NC_021508	TC	3	6	838009	838014	0 %	50 %	0 %	50 %	512444217
16026	NC_021508	TCT	2	6	838097	838102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444217
16027	NC_021508	ACGC	2	8	838118	838125	25 %	0 %	25 %	50 %	512444217
16028	NC_021508	GTT	2	6	838198	838203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444217
16029	NC_021508	GAA	2	6	838204	838209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444217
16030	NC_021508	AGA	2	6	838218	838223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444217
16031	NC_021508	GC	3	6	838225	838230	0 %	0 %	50 %	50 %	512444217
16032	NC_021508	TGC	2	6	838395	838400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444217
16033	NC_021508	A	6	6	838433	838438	100 %	0 %	0 %	0 %	512444217
16034	NC_021508	TCG	2	6	838475	838480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444217
16035	NC_021508	GTG	2	6	838528	838533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444217
16036	NC_021508	ACT	2	6	838535	838540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444217
16037	NC_021508	ACG	2	6	838641	838646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444217
16038	NC_021508	TGG	2	6	838703	838708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444217
16039	NC_021508	AGG	2	6	838727	838732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444217
16040	NC_021508	CT	3	6	838774	838779	0 %	50 %	0 %	50 %	512444217
16041	NC_021508	GCT	2	6	838818	838823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444217
16042	NC_021508	AAG	2	6	838826	838831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444217
16043	NC_021508	CCG	2	6	838868	838873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444217
16044	NC_021508	CGC	2	6	838905	838910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444217
16045	NC_021508	A	8	8	839040	839047	100 %	0 %	0 %	0 %	512444217
16046	NC_021508	GC	3	6	839149	839154	0 %	0 %	50 %	50 %	512444217
16047	NC_021508	GGA	2	6	839172	839177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444217
16048	NC_021508	AAG	2	6	839194	839199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444217
16049	NC_021508	CG	3	6	839213	839218	0 %	0 %	50 %	50 %	512444217
16050	NC_021508	AAG	2	6	839347	839352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444217
16051	NC_021508	GGA	2	6	839367	839372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444217
16052	NC_021508	TTGA	2	8	839402	839409	25 %	50 %	25 %	0 %	512444217
16053	NC_021508	CACG	2	8	839492	839499	25 %	0 %	25 %	50 %	512444218
16054	NC_021508	CCA	2	6	839678	839683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444218
16055	NC_021508	CTC	2	6	839703	839708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444218
16056	NC_021508	ATC	2	6	839712	839717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444218
16057	NC_021508	CA	3	6	839771	839776	50 %	0 %	0 %	50 %	512444218
16058	NC_021508	AAAG	2	8	839851	839858	75 %	0 %	25 %	0 %	512444218
16059	NC_021508	TCA	2	6	839944	839949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444218
16060	NC_021508	T	7	7	840020	840026	0 %	100 %	0 %	0 %	512444218
16061	NC_021508	CT	3	6	840064	840069	0 %	50 %	0 %	50 %	512444218
16062	NC_021508	CGT	2	6	840113	840118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444218
16063	NC_021508	AAT	2	6	840180	840185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444218
16064	NC_021508	AC	3	6	840268	840273	50 %	0 %	0 %	50 %	512444218
16065	NC_021508	A	6	6	840294	840299	100 %	0 %	0 %	0 %	512444218
16066	NC_021508	A	7	7	840304	840310	100 %	0 %	0 %	0 %	512444218
16067	NC_021508	GCA	2	6	840391	840396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444218
16068	NC_021508	TGC	2	6	840432	840437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444218
16069	NC_021508	ACTCC	2	10	840443	840452	20 %	20 %	0 %	60 %	512444218
16070	NC_021508	ACC	2	6	840459	840464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444218
16071	NC_021508	GAG	2	6	840502	840507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444218
16072	NC_021508	AAGG	2	8	840585	840592	50 %	0 %	50 %	0 %	512444218
16073	NC_021508	GGA	2	6	840613	840618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444218
16074	NC_021508	AG	3	6	840627	840632	50 %	0 %	50 %	0 %	512444218
16075	NC_021508	AGA	2	6	840652	840657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444218
16076	NC_021508	ATG	2	6	840667	840672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444218
16077	NC_021508	A	7	7	840705	840711	100 %	0 %	0 %	0 %	512444218
16078	NC_021508	CAA	2	6	840782	840787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444218
16079	NC_021508	AAAG	2	8	840847	840854	75 %	0 %	25 %	0 %	512444218
16080	NC_021508	TAA	2	6	840866	840871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444218
16081	NC_021508	CGT	2	6	840888	840893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444218
16082	NC_021508	GAC	2	6	840901	840906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444218
16083	NC_021508	GAA	2	6	840945	840950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444218
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16085	NC_021508	TCA	2	6	841019	841024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444218
16086	NC_021508	CCA	2	6	841098	841103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444218
16087	NC_021508	TTA	2	6	841168	841173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444218
16088	NC_021508	TC	3	6	841179	841184	0 %	50 %	0 %	50 %	512444218
16089	NC_021508	TG	3	6	841216	841221	0 %	50 %	50 %	0 %	512444219
16090	NC_021508	CTG	2	6	841335	841340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444219
16091	NC_021508	CCT	2	6	841401	841406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444219
16092	NC_021508	CCG	2	6	841491	841496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444219
16093	NC_021508	AGT	2	6	841638	841643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444219
16094	NC_021508	ACT	2	6	841665	841670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444219
16095	NC_021508	TGA	2	6	841675	841680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444219
16096	NC_021508	TGA	2	6	841748	841753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444219
16097	NC_021508	GCT	2	6	841889	841894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444219
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16099	NC_021508	CGC	2	6	841970	841975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444219
16100	NC_021508	GGAAA	2	10	841983	841992	60 %	0 %	40 %	0 %	512444219
16101	NC_021508	AGG	2	6	842005	842010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444219
16102	NC_021508	GCA	2	6	842023	842028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444219
16103	NC_021508	TGC	2	6	842119	842124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444220
16104	NC_021508	TCG	2	6	842155	842160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444220
16105	NC_021508	CTT	2	6	842166	842171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444220
16106	NC_021508	TCC	2	6	842173	842178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444220
16107	NC_021508	TAA	2	6	842188	842193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444220
16108	NC_021508	C	6	6	842242	842247	0 %	0 %	0 %	100 %	512444220
16109	NC_021508	GCT	2	6	842260	842265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444220
16110	NC_021508	CGT	2	6	842292	842297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444220
16111	NC_021508	CCTG	2	8	842311	842318	0 %	25 %	25 %	50 %	512444220
16112	NC_021508	AGA	2	6	842511	842516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444220
16113	NC_021508	ACC	2	6	842583	842588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444220
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16115	NC_021508	TGA	2	6	842633	842638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444220
16116	NC_021508	CG	3	6	842662	842667	0 %	0 %	50 %	50 %	512444220
16117	NC_021508	AAC	2	6	842676	842681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444220
16118	NC_021508	GAA	2	6	842758	842763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444220
16119	NC_021508	AGG	2	6	842793	842798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444220
16120	NC_021508	AAAC	2	8	842801	842808	75 %	0 %	0 %	25 %	512444220
16121	NC_021508	CGT	2	6	842870	842875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444220
16122	NC_021508	GA	3	6	842881	842886	50 %	0 %	50 %	0 %	512444220
16123	NC_021508	TCG	2	6	843076	843081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444220
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16125	NC_021508	GAA	3	9	843133	843141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444220
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16129	NC_021508	CGCA	2	8	843221	843228	25 %	0 %	25 %	50 %	512444220
16130	NC_021508	ACC	2	6	843244	843249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444220
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16193	NC_021508	CG	3	6	846628	846633	0 %	0 %	50 %	50 %	512444225
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16221	NC_021508	A	7	7	848083	848089	100 %	0 %	0 %	0 %	512444227
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16226	NC_021508	CA	4	8	848244	848251	50 %	0 %	0 %	50 %	512444227
16227	NC_021508	CAC	2	6	848293	848298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444227
16228	NC_021508	CCAA	2	8	848359	848366	50 %	0 %	0 %	50 %	512444227
16229	NC_021508	CG	3	6	848448	848453	0 %	0 %	50 %	50 %	512444227
16230	NC_021508	CTG	2	6	848482	848487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444227
16231	NC_021508	GAT	2	6	848511	848516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444227
16232	NC_021508	GTA	2	6	848603	848608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444227
16233	NC_021508	GA	3	6	848654	848659	50 %	0 %	50 %	0 %	512444227
16234	NC_021508	CG	5	10	848668	848677	0 %	0 %	50 %	50 %	512444227
16235	NC_021508	CCT	2	6	848708	848713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444227
16236	NC_021508	CAC	2	6	848722	848727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444227
16237	NC_021508	A	6	6	848798	848803	100 %	0 %	0 %	0 %	512444227
16238	NC_021508	A	7	7	848896	848902	100 %	0 %	0 %	0 %	512444227
16239	NC_021508	CGC	2	6	848921	848926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444227
16240	NC_021508	GCGTG	2	10	848928	848937	0 %	20 %	60 %	20 %	512444227
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16242	NC_021508	C	6	6	849096	849101	0 %	0 %	0 %	100 %	512444227
16243	NC_021508	CA	3	6	849133	849138	50 %	0 %	0 %	50 %	512444227
16244	NC_021508	C	6	6	849195	849200	0 %	0 %	0 %	100 %	512444227
16245	NC_021508	TACG	2	8	849211	849218	25 %	25 %	25 %	25 %	512444227
16246	NC_021508	GCA	2	6	849260	849265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444227
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16251	NC_021508	CGC	2	6	849466	849471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444227
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16256	NC_021508	CGTG	2	8	849615	849622	0 %	25 %	50 %	25 %	512444227
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16262	NC_021508	CGTT	2	8	849910	849917	0 %	50 %	25 %	25 %	512444228
16263	NC_021508	CG	3	6	849935	849940	0 %	0 %	50 %	50 %	512444228
16264	NC_021508	GACA	2	8	850040	850047	50 %	0 %	25 %	25 %	512444228
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16350	NC_021508	GCA	2	6	854604	854609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444233
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16352	NC_021508	CCG	2	6	854661	854666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444233
16353	NC_021508	GTTTT	2	10	854850	854859	0 %	80 %	20 %	0 %	512444234
16354	NC_021508	GTAC	2	8	854885	854892	25 %	25 %	25 %	25 %	512444234
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16360	NC_021508	GCT	2	6	855120	855125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444234
16361	NC_021508	GC	3	6	855166	855171	0 %	0 %	50 %	50 %	512444234
16362	NC_021508	AAG	2	6	855182	855187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444234
16363	NC_021508	CTCG	2	8	855234	855241	0 %	25 %	25 %	50 %	512444234
16364	NC_021508	CG	3	6	855300	855305	0 %	0 %	50 %	50 %	512444234
16365	NC_021508	GGT	2	6	855417	855422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444234
16366	NC_021508	CG	3	6	855481	855486	0 %	0 %	50 %	50 %	512444234
16367	NC_021508	CGAAG	2	10	855489	855498	40 %	0 %	40 %	20 %	512444234
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16369	NC_021508	AGCGC	2	10	855539	855548	20 %	0 %	40 %	40 %	512444234
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16399	NC_021508	A	6	6	856992	856997	100 %	0 %	0 %	0 %	512444236
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16489	NC_021508	GTG	2	6	861399	861404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444239
16490	NC_021508	CAT	3	9	861464	861472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444239
16491	NC_021508	A	6	6	861482	861487	100 %	0 %	0 %	0 %	512444239
16492	NC_021508	TCT	2	6	861509	861514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444239
16493	NC_021508	GC	3	6	861524	861529	0 %	0 %	50 %	50 %	512444239
16494	NC_021508	CGG	2	6	861534	861539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444239
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16497	NC_021508	A	6	6	861605	861610	100 %	0 %	0 %	0 %	512444239
16498	NC_021508	CACAA	2	10	861668	861677	60 %	0 %	0 %	40 %	512444239
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