MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021508	CCG	2	6	809949	809954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444192
15502	NC_021508	CA	4	8	810021	810028	50 %	0 %	0 %	50 %	512444192
15503	NC_021508	GCA	2	6	810053	810058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444192
15504	NC_021508	GGT	2	6	810189	810194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444193
15505	NC_021508	CTT	2	6	810199	810204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444193
15506	NC_021508	CAC	2	6	810253	810258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444193
15507	NC_021508	CG	3	6	810259	810264	0 %	0 %	50 %	50 %	512444193
15508	NC_021508	CCA	2	6	810314	810319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444193
15509	NC_021508	ATC	2	6	810320	810325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444193
15510	NC_021508	CCCG	2	8	810349	810356	0 %	0 %	25 %	75 %	512444193
15511	NC_021508	TAT	2	6	810372	810377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444193
15512	NC_021508	TAC	3	9	810387	810395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444193
15513	NC_021508	GC	3	6	810558	810563	0 %	0 %	50 %	50 %	512444194
15514	NC_021508	CCTT	2	8	810612	810619	0 %	50 %	0 %	50 %	512444194
15515	NC_021508	CA	3	6	810751	810756	50 %	0 %	0 %	50 %	512444194
15516	NC_021508	CG	3	6	810823	810828	0 %	0 %	50 %	50 %	512444194
15517	NC_021508	GC	3	6	810968	810973	0 %	0 %	50 %	50 %	512444194
15518	NC_021508	GCAG	2	8	810999	811006	25 %	0 %	50 %	25 %	512444194
15519	NC_021508	CACC	2	8	811018	811025	25 %	0 %	0 %	75 %	512444194
15520	NC_021508	CCT	2	6	811036	811041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444194
15521	NC_021508	TCT	2	6	811186	811191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444194
15522	NC_021508	GC	3	6	811224	811229	0 %	0 %	50 %	50 %	512444194
15523	NC_021508	CTC	2	6	811331	811336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444194
15524	NC_021508	CTC	2	6	811532	811537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444194
15525	NC_021508	CGG	2	6	811560	811565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444194
15526	NC_021508	TCT	2	6	811581	811586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444194
15527	NC_021508	GAA	2	6	811589	811594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444194
15528	NC_021508	GCGAGC	2	12	811638	811649	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512444194
15529	NC_021508	AACG	2	8	811689	811696	50 %	0 %	25 %	25 %	512444194
15530	NC_021508	GTA	2	6	811796	811801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444194
15531	NC_021508	GGAC	2	8	811884	811891	25 %	0 %	50 %	25 %	512444194
15532	NC_021508	CAA	2	6	811918	811923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444194
15533	NC_021508	C	7	7	811943	811949	0 %	0 %	0 %	100 %	512444194
15534	NC_021508	AGAA	2	8	811955	811962	75 %	0 %	25 %	0 %	512444194
15535	NC_021508	CACGC	2	10	812056	812065	20 %	0 %	20 %	60 %	512444194
15536	NC_021508	CCG	2	6	812104	812109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444194
15537	NC_021508	AAT	2	6	812123	812128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444194
15538	NC_021508	C	7	7	812129	812135	0 %	0 %	0 %	100 %	512444194
15539	NC_021508	CCA	2	6	812236	812241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444194
15540	NC_021508	AGC	2	6	812262	812267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444194
15541	NC_021508	CTTCG	2	10	812291	812300	0 %	40 %	20 %	40 %	512444194
15542	NC_021508	TC	3	6	812362	812367	0 %	50 %	0 %	50 %	512444194
15543	NC_021508	TCC	2	6	812376	812381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444194
15544	NC_021508	TCG	2	6	812460	812465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444194
15545	NC_021508	CTC	2	6	812471	812476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444194
15546	NC_021508	TCT	2	6	812497	812502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444194
15547	NC_021508	TCC	2	6	812607	812612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444194
15548	NC_021508	CAG	2	6	812621	812626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444194
15549	NC_021508	CTT	2	6	812647	812652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444194
15550	NC_021508	CAT	2	6	812668	812673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444194
15551	NC_021508	TCC	2	6	812741	812746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444194
15552	NC_021508	A	7	7	812751	812757	100 %	0 %	0 %	0 %	512444194
15553	NC_021508	GAA	2	6	812858	812863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444194
15554	NC_021508	ACC	2	6	812982	812987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444194
15555	NC_021508	GAG	2	6	812990	812995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444194
15556	NC_021508	GA	3	6	813097	813102	50 %	0 %	50 %	0 %	512444194
15557	NC_021508	GAC	2	6	813166	813171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444194
15558	NC_021508	AATG	2	8	813232	813239	50 %	25 %	25 %	0 %	512444194
15559	NC_021508	CCT	2	6	813331	813336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444195
15560	NC_021508	AG	3	6	813347	813352	50 %	0 %	50 %	0 %	512444195
15561	NC_021508	AG	3	6	813430	813435	50 %	0 %	50 %	0 %	512444195
15562	NC_021508	GAA	2	6	813483	813488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444195
15563	NC_021508	CG	3	6	813495	813500	0 %	0 %	50 %	50 %	512444195
15564	NC_021508	ATA	2	6	813513	813518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444195
15565	NC_021508	AAC	2	6	813549	813554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444195
15566	NC_021508	AGG	2	6	813617	813622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444195
15567	NC_021508	CG	3	6	813624	813629	0 %	0 %	50 %	50 %	512444195
15568	NC_021508	CTT	2	6	813704	813709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444195
15569	NC_021508	TCA	2	6	813855	813860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444195
15570	NC_021508	CAA	2	6	813893	813898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444195
15571	NC_021508	TTC	2	6	813945	813950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444195
15572	NC_021508	TGA	2	6	813981	813986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444195
15573	NC_021508	CCTT	2	8	814057	814064	0 %	50 %	0 %	50 %	512444195
15574	NC_021508	AGC	2	6	814158	814163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444195
15575	NC_021508	TTC	2	6	814188	814193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444195
15576	NC_021508	TTC	3	9	814254	814262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444195
15577	NC_021508	CAC	2	6	814295	814300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444195
15578	NC_021508	GCAC	2	8	814615	814622	25 %	0 %	25 %	50 %	512444196
15579	NC_021508	ACG	3	9	814629	814637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444196
15580	NC_021508	CTT	2	6	814728	814733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444196
15581	NC_021508	CTC	2	6	814842	814847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444196
15582	NC_021508	CATA	2	8	814880	814887	50 %	25 %	0 %	25 %	512444196
15583	NC_021508	CTTC	2	8	814917	814924	0 %	50 %	0 %	50 %	512444196
15584	NC_021508	CAG	2	6	814979	814984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444196
15585	NC_021508	CTT	2	6	815061	815066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444196
15586	NC_021508	CTT	2	6	815073	815078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444196
15587	NC_021508	TCA	2	6	815095	815100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444196
15588	NC_021508	GCA	2	6	815156	815161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444196
15589	NC_021508	GAT	2	6	815171	815176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444196
15590	NC_021508	CTC	2	6	815223	815228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444196
15591	NC_021508	TCA	2	6	815275	815280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444196
15592	NC_021508	TCA	2	6	815302	815307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444196
15593	NC_021508	CG	3	6	815327	815332	0 %	0 %	50 %	50 %	512444196
15594	NC_021508	T	7	7	815447	815453	0 %	100 %	0 %	0 %	512444196
15595	NC_021508	CG	3	6	815502	815507	0 %	0 %	50 %	50 %	512444196
15596	NC_021508	TCG	2	6	815581	815586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444196
15597	NC_021508	CATCTT	2	12	815601	815612	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	512444196
15598	NC_021508	GAT	2	6	815619	815624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444196
15599	NC_021508	GAGAT	2	10	815716	815725	40 %	20 %	40 %	0 %	512444196
15600	NC_021508	TAA	2	6	815729	815734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444196
15601	NC_021508	CGT	2	6	815745	815750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444196
15602	NC_021508	CTAA	2	8	815770	815777	50 %	25 %	0 %	25 %	512444196
15603	NC_021508	TC	3	6	815876	815881	0 %	50 %	0 %	50 %	512444196
15604	NC_021508	GCA	2	6	815915	815920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444196
15605	NC_021508	TC	3	6	816008	816013	0 %	50 %	0 %	50 %	512444196
15606	NC_021508	CTT	2	6	816123	816128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444196
15607	NC_021508	AGT	2	6	816191	816196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444196
15608	NC_021508	ACCC	2	8	816215	816222	25 %	0 %	0 %	75 %	512444196
15609	NC_021508	CCT	2	6	816245	816250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444196
15610	NC_021508	GGT	2	6	816269	816274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444196
15611	NC_021508	TTGT	2	8	816283	816290	0 %	75 %	25 %	0 %	512444196
15612	NC_021508	CCT	2	6	816314	816319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444196
15613	NC_021508	GCT	2	6	816320	816325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444196
15614	NC_021508	TC	3	6	816457	816462	0 %	50 %	0 %	50 %	512444197
15615	NC_021508	TCG	2	6	816477	816482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444197
15616	NC_021508	T	6	6	816515	816520	0 %	100 %	0 %	0 %	512444197
15617	NC_021508	T	6	6	816522	816527	0 %	100 %	0 %	0 %	512444197
15618	NC_021508	T	6	6	816534	816539	0 %	100 %	0 %	0 %	512444197
15619	NC_021508	A	6	6	816603	816608	100 %	0 %	0 %	0 %	512444197
15620	NC_021508	TGCA	2	8	816652	816659	25 %	25 %	25 %	25 %	512444198
15621	NC_021508	TGA	2	6	816691	816696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444198
15622	NC_021508	CAG	2	6	816734	816739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444198
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15654	NC_021508	GAC	3	9	818436	818444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444200
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15744	NC_021508	GCT	2	6	823190	823195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444205
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15874	NC_021508	TCG	2	6	829966	829971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444212
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15881	NC_021508	CG	3	6	830123	830128	0 %	0 %	50 %	50 %	512444212
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15885	NC_021508	CTG	2	6	830334	830339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444212
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15935	NC_021508	GATT	2	8	832790	832797	25 %	50 %	25 %	0 %	512444213
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15980	NC_021508	GACG	2	8	835967	835974	25 %	0 %	50 %	25 %	512444215
15981	NC_021508	GAA	2	6	836016	836021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444215
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15986	NC_021508	GGA	2	6	836391	836396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444215
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