MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021508	AAAC	2	8	786359	786366	75 %	0 %	0 %	25 %	512444165
15002	NC_021508	AG	3	6	786396	786401	50 %	0 %	50 %	0 %	512444165
15003	NC_021508	TAA	2	6	786429	786434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444165
15004	NC_021508	A	7	7	786499	786505	100 %	0 %	0 %	0 %	512444165
15005	NC_021508	A	6	6	786525	786530	100 %	0 %	0 %	0 %	512444165
15006	NC_021508	CAG	2	6	786531	786536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444165
15007	NC_021508	GCA	2	6	786590	786595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444165
15008	NC_021508	CCT	2	6	786598	786603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444165
15009	NC_021508	A	7	7	786634	786640	100 %	0 %	0 %	0 %	512444165
15010	NC_021508	A	7	7	786740	786746	100 %	0 %	0 %	0 %	512444165
15011	NC_021508	TAA	2	6	786782	786787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444165
15012	NC_021508	A	7	7	786786	786792	100 %	0 %	0 %	0 %	512444165
15013	NC_021508	CAA	2	6	786825	786830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444165
15014	NC_021508	AG	3	6	786956	786961	50 %	0 %	50 %	0 %	512444165
15015	NC_021508	CCG	2	6	786992	786997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444165
15016	NC_021508	A	8	8	787002	787009	100 %	0 %	0 %	0 %	512444165
15017	NC_021508	CTC	2	6	787075	787080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444166
15018	NC_021508	GCA	2	6	787124	787129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444166
15019	NC_021508	CCAC	2	8	787140	787147	25 %	0 %	0 %	75 %	512444166
15020	NC_021508	GAG	2	6	787149	787154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444166
15021	NC_021508	ACC	2	6	787291	787296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444166
15022	NC_021508	TCA	2	6	787340	787345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444166
15023	NC_021508	CA	3	6	787344	787349	50 %	0 %	0 %	50 %	512444166
15024	NC_021508	CTAT	2	8	787387	787394	25 %	50 %	0 %	25 %	512444167
15025	NC_021508	CAG	2	6	787395	787400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444167
15026	NC_021508	CCA	2	6	787412	787417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444167
15027	NC_021508	CGG	2	6	787458	787463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444167
15028	NC_021508	CAA	2	6	787511	787516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444167
15029	NC_021508	AGA	2	6	787662	787667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444167
15030	NC_021508	TG	3	6	787846	787851	0 %	50 %	50 %	0 %	512444167
15031	NC_021508	GGC	2	6	787852	787857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444167
15032	NC_021508	TGC	2	6	787861	787866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444167
15033	NC_021508	TCA	2	6	787922	787927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444167
15034	NC_021508	TGA	2	6	788030	788035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444167
15035	NC_021508	GCCG	2	8	788050	788057	0 %	0 %	50 %	50 %	512444167
15036	NC_021508	CGC	2	6	788078	788083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444167
15037	NC_021508	CG	3	6	788096	788101	0 %	0 %	50 %	50 %	512444167
15038	NC_021508	GAA	2	6	788121	788126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444167
15039	NC_021508	GC	3	6	788147	788152	0 %	0 %	50 %	50 %	512444167
15040	NC_021508	ACGC	2	8	788158	788165	25 %	0 %	25 %	50 %	512444167
15041	NC_021508	GCA	2	6	788193	788198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444168
15042	NC_021508	TTC	2	6	788201	788206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444168
15043	NC_021508	CTT	2	6	788234	788239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444168
15044	NC_021508	CG	4	8	788293	788300	0 %	0 %	50 %	50 %	512444168
15045	NC_021508	GC	3	6	788309	788314	0 %	0 %	50 %	50 %	512444168
15046	NC_021508	TCA	2	6	788355	788360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444168
15047	NC_021508	CGA	2	6	788362	788367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444168
15048	NC_021508	GC	3	6	788448	788453	0 %	0 %	50 %	50 %	512444168
15049	NC_021508	GC	3	6	788478	788483	0 %	0 %	50 %	50 %	512444168
15050	NC_021508	GC	3	6	788530	788535	0 %	0 %	50 %	50 %	512444168
15051	NC_021508	AGAA	2	8	788537	788544	75 %	0 %	25 %	0 %	512444168
15052	NC_021508	CA	3	6	788587	788592	50 %	0 %	0 %	50 %	512444168
15053	NC_021508	AGA	2	6	788622	788627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444168
15054	NC_021508	CAG	2	6	788689	788694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444168
15055	NC_021508	TCC	2	6	788712	788717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444168
15056	NC_021508	CG	3	6	788727	788732	0 %	0 %	50 %	50 %	512444168
15057	NC_021508	GCT	2	6	788746	788751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444168
15058	NC_021508	CTG	3	9	788807	788815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444168
15059	NC_021508	A	7	7	788841	788847	100 %	0 %	0 %	0 %	512444168
15060	NC_021508	GA	3	6	788929	788934	50 %	0 %	50 %	0 %	512444168
15061	NC_021508	TCA	2	6	788962	788967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444168
15062	NC_021508	ACC	3	9	788971	788979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444169
15063	NC_021508	ATC	2	6	789085	789090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444169
15064	NC_021508	CTG	2	6	789170	789175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444169
15065	NC_021508	GACT	2	8	789198	789205	25 %	25 %	25 %	25 %	512444169
15066	NC_021508	C	6	6	789250	789255	0 %	0 %	0 %	100 %	512444169
15067	NC_021508	CCTGCG	2	12	789272	789283	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512444169
15068	NC_021508	C	8	8	789296	789303	0 %	0 %	0 %	100 %	512444169
15069	NC_021508	GCT	2	6	789329	789334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444169
15070	NC_021508	AAC	2	6	789534	789539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444169
15071	NC_021508	ATC	2	6	789552	789557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444169
15072	NC_021508	TGAC	2	8	789577	789584	25 %	25 %	25 %	25 %	512444169
15073	NC_021508	CGG	2	6	789729	789734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444169
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15076	NC_021508	TCC	2	6	789953	789958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444170
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15078	NC_021508	CAC	2	6	790039	790044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444170
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15085	NC_021508	ACC	2	6	790382	790387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444170
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15087	NC_021508	CCTGT	2	10	790563	790572	0 %	40 %	20 %	40 %	512444170
15088	NC_021508	TCC	2	6	790573	790578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444170
15089	NC_021508	CTC	2	6	790699	790704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444170
15090	NC_021508	ACGTGC	2	12	790730	790741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512444170
15091	NC_021508	GTA	2	6	790772	790777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444170
15092	NC_021508	GC	3	6	790891	790896	0 %	0 %	50 %	50 %	512444170
15093	NC_021508	AGC	2	6	790934	790939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444170
15094	NC_021508	ATA	2	6	790959	790964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444170
15095	NC_021508	AG	3	6	791122	791127	50 %	0 %	50 %	0 %	512444171
15096	NC_021508	A	6	6	791153	791158	100 %	0 %	0 %	0 %	512444171
15097	NC_021508	CCA	2	6	791169	791174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444171
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15099	NC_021508	CTG	2	6	791191	791196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444171
15100	NC_021508	CAACG	2	10	791224	791233	40 %	0 %	20 %	40 %	512444171
15101	NC_021508	GTA	2	6	791296	791301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444171
15102	NC_021508	CAC	2	6	791395	791400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444171
15103	NC_021508	GCA	2	6	791477	791482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444171
15104	NC_021508	ATC	2	6	791506	791511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444171
15105	NC_021508	CCG	2	6	791690	791695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444172
15106	NC_021508	CCCT	2	8	791704	791711	0 %	25 %	0 %	75 %	512444172
15107	NC_021508	GT	3	6	791740	791745	0 %	50 %	50 %	0 %	512444172
15108	NC_021508	GT	3	6	791880	791885	0 %	50 %	50 %	0 %	512444172
15109	NC_021508	CAA	2	6	791945	791950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444172
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15111	NC_021508	A	7	7	791995	792001	100 %	0 %	0 %	0 %	512444172
15112	NC_021508	TCA	2	6	792036	792041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444172
15113	NC_021508	CTT	2	6	792095	792100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444172
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15115	NC_021508	GCA	2	6	792225	792230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444172
15116	NC_021508	A	7	7	792281	792287	100 %	0 %	0 %	0 %	512444172
15117	NC_021508	GCC	2	6	792336	792341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444172
15118	NC_021508	CG	3	6	792343	792348	0 %	0 %	50 %	50 %	512444172
15119	NC_021508	GAT	2	6	792459	792464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444173
15120	NC_021508	CCTG	2	8	792467	792474	0 %	25 %	25 %	50 %	512444173
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15122	NC_021508	AGT	2	6	792592	792597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444173
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15244	NC_021508	GCC	2	6	798311	798316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444179
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15352	NC_021508	CAAA	2	8	803037	803044	75 %	0 %	0 %	25 %	512444184
15353	NC_021508	CGT	2	6	803147	803152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444184
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15357	NC_021508	CG	3	6	803213	803218	0 %	0 %	50 %	50 %	512444184
15358	NC_021508	CGT	2	6	803272	803277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444184
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15360	NC_021508	AAT	2	6	803327	803332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444184
15361	NC_021508	GC	3	6	803345	803350	0 %	0 %	50 %	50 %	512444184
15362	NC_021508	TAG	2	6	803536	803541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444184
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15364	NC_021508	GCA	2	6	803661	803666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444184
15365	NC_021508	T	6	6	803670	803675	0 %	100 %	0 %	0 %	512444184
15366	NC_021508	TGCA	2	8	803687	803694	25 %	25 %	25 %	25 %	512444184
15367	NC_021508	TTTCT	2	10	803726	803735	0 %	80 %	0 %	20 %	512444184
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15370	NC_021508	TCT	2	6	804056	804061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444185
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15374	NC_021508	TTGGAA	2	12	804166	804177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444185
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15383	NC_021508	ACC	2	6	804740	804745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444185
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15385	NC_021508	TCAT	2	8	804767	804774	25 %	50 %	0 %	25 %	512444185
15386	NC_021508	ATCGC	2	10	804788	804797	20 %	20 %	20 %	40 %	512444185
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15443	NC_021508	GC	3	6	807254	807259	0 %	0 %	50 %	50 %	512444188
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15471	NC_021508	GCA	2	6	808767	808772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444190
15472	NC_021508	CG	3	6	808815	808820	0 %	0 %	50 %	50 %	512444190
15473	NC_021508	CG	3	6	808823	808828	0 %	0 %	50 %	50 %	512444190
15474	NC_021508	A	7	7	808834	808840	100 %	0 %	0 %	0 %	512444190
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15478	NC_021508	CTG	2	6	808963	808968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444190
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15482	NC_021508	C	6	6	809264	809269	0 %	0 %	0 %	100 %	512444190
15483	NC_021508	GCC	2	6	809275	809280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444190
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15489	NC_021508	CCTT	2	8	809538	809545	0 %	50 %	0 %	50 %	512444191
15490	NC_021508	GAGCAA	2	12	809568	809579	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512444191
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