MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021508	AC	3	6	759201	759206	50 %	0 %	0 %	50 %	512444142
14502	NC_021508	AT	3	6	759291	759296	50 %	50 %	0 %	0 %	512444142
14503	NC_021508	TAC	2	6	759304	759309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444142
14504	NC_021508	TC	3	6	759310	759315	0 %	50 %	0 %	50 %	512444142
14505	NC_021508	CGG	3	9	759348	759356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444142
14506	NC_021508	A	6	6	759485	759490	100 %	0 %	0 %	0 %	512444143
14507	NC_021508	GCC	2	6	759525	759530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444143
14508	NC_021508	CA	4	8	759550	759557	50 %	0 %	0 %	50 %	512444143
14509	NC_021508	GCT	2	6	759574	759579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444143
14510	NC_021508	TAA	2	6	759580	759585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444143
14511	NC_021508	AC	3	6	759597	759602	50 %	0 %	0 %	50 %	512444143
14512	NC_021508	CTT	2	6	759658	759663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444143
14513	NC_021508	CTG	2	6	759757	759762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444143
14514	NC_021508	TGC	2	6	759777	759782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444143
14515	NC_021508	T	6	6	759786	759791	0 %	100 %	0 %	0 %	512444143
14516	NC_021508	CAC	2	6	759801	759806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444143
14517	NC_021508	CCA	2	6	759877	759882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444143
14518	NC_021508	ATCTAG	2	12	759914	759925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512444143
14519	NC_021508	GAG	2	6	759935	759940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444143
14520	NC_021508	AGA	2	6	759960	759965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444143
14521	NC_021508	TGA	2	6	760093	760098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444143
14522	NC_021508	CAG	2	6	760103	760108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444143
14523	NC_021508	CATC	2	8	760168	760175	25 %	25 %	0 %	50 %	512444143
14524	NC_021508	CCT	2	6	760264	760269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444144
14525	NC_021508	ACT	2	6	760277	760282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444144
14526	NC_021508	CGC	2	6	760311	760316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444144
14527	NC_021508	CTC	2	6	760334	760339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444144
14528	NC_021508	AG	5	10	760353	760362	50 %	0 %	50 %	0 %	512444144
14529	NC_021508	CTG	2	6	760457	760462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444144
14530	NC_021508	TCT	2	6	760503	760508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444144
14531	NC_021508	T	8	8	760529	760536	0 %	100 %	0 %	0 %	512444144
14532	NC_021508	G	6	6	760628	760633	0 %	0 %	100 %	0 %	512444144
14533	NC_021508	CCTTA	2	10	760661	760670	20 %	40 %	0 %	40 %	512444144
14534	NC_021508	TCA	2	6	760686	760691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444144
14535	NC_021508	GGA	2	6	760733	760738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444144
14536	NC_021508	GCC	2	6	760757	760762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444144
14537	NC_021508	GTA	2	6	760764	760769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444144
14538	NC_021508	TAA	2	6	760816	760821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444144
14539	NC_021508	TGA	2	6	760846	760851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444144
14540	NC_021508	CG	3	6	760887	760892	0 %	0 %	50 %	50 %	512444144
14541	NC_021508	CCA	2	6	760963	760968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444144
14542	NC_021508	ATA	2	6	760971	760976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444144
14543	NC_021508	GTT	2	6	761172	761177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444144
14544	NC_021508	GAC	2	6	761184	761189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444144
14545	NC_021508	AAT	2	6	761207	761212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444144
14546	NC_021508	CG	3	6	761218	761223	0 %	0 %	50 %	50 %	512444144
14547	NC_021508	CCG	2	6	761229	761234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444144
14548	NC_021508	GC	3	6	761354	761359	0 %	0 %	50 %	50 %	512444144
14549	NC_021508	TTC	2	6	761381	761386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444144
14550	NC_021508	AGA	2	6	761390	761395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444144
14551	NC_021508	CA	3	6	761834	761839	50 %	0 %	0 %	50 %	512444145
14552	NC_021508	CA	3	6	761857	761862	50 %	0 %	0 %	50 %	512444145
14553	NC_021508	C	6	6	761935	761940	0 %	0 %	0 %	100 %	512444145
14554	NC_021508	CG	6	12	761951	761962	0 %	0 %	50 %	50 %	512444145
14555	NC_021508	TACC	2	8	761985	761992	25 %	25 %	0 %	50 %	512444145
14556	NC_021508	C	6	6	762040	762045	0 %	0 %	0 %	100 %	512444145
14557	NC_021508	CCTG	2	8	762129	762136	0 %	25 %	25 %	50 %	512444145
14558	NC_021508	AC	3	6	762181	762186	50 %	0 %	0 %	50 %	512444145
14559	NC_021508	CGCTG	2	10	762211	762220	0 %	20 %	40 %	40 %	512444145
14560	NC_021508	TTC	2	6	762223	762228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444145
14561	NC_021508	CCT	2	6	762354	762359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444145
14562	NC_021508	CGG	2	6	762538	762543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444145
14563	NC_021508	CG	3	6	762549	762554	0 %	0 %	50 %	50 %	512444145
14564	NC_021508	GCA	2	6	762573	762578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444145
14565	NC_021508	AGA	2	6	762628	762633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444145
14566	NC_021508	AGC	2	6	762664	762669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444145
14567	NC_021508	A	6	6	762724	762729	100 %	0 %	0 %	0 %	512444145
14568	NC_021508	GTG	2	6	762745	762750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444145
14569	NC_021508	AC	3	6	762828	762833	50 %	0 %	0 %	50 %	512444145
14570	NC_021508	CGCC	2	8	762846	762853	0 %	0 %	25 %	75 %	512444145
14571	NC_021508	GCA	2	6	762869	762874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444145
14572	NC_021508	GAA	2	6	762908	762913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444145
14573	NC_021508	CCACAC	2	12	762982	762993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444145
14574	NC_021508	A	8	8	762999	763006	100 %	0 %	0 %	0 %	512444145
14575	NC_021508	GCAAA	2	10	763180	763189	60 %	0 %	20 %	20 %	512444146
14576	NC_021508	GC	3	6	763218	763223	0 %	0 %	50 %	50 %	512444146
14577	NC_021508	GCAC	2	8	763297	763304	25 %	0 %	25 %	50 %	512444146
14578	NC_021508	TTC	2	6	763309	763314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444146
14579	NC_021508	GCCCCT	2	12	763320	763331	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512444146
14580	NC_021508	CAC	2	6	763470	763475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444146
14581	NC_021508	CA	3	6	763514	763519	50 %	0 %	0 %	50 %	512444146
14582	NC_021508	C	6	6	763533	763538	0 %	0 %	0 %	100 %	512444146
14583	NC_021508	CGG	2	6	763641	763646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444146
14584	NC_021508	CGC	2	6	763677	763682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444146
14585	NC_021508	TACCA	2	10	763683	763692	40 %	20 %	0 %	40 %	512444146
14586	NC_021508	CTA	2	6	763701	763706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444146
14587	NC_021508	AAG	2	6	763754	763759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444146
14588	NC_021508	GCA	2	6	763993	763998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444147
14589	NC_021508	TCG	2	6	764105	764110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444147
14590	NC_021508	CG	4	8	764115	764122	0 %	0 %	50 %	50 %	512444147
14591	NC_021508	CG	4	8	764128	764135	0 %	0 %	50 %	50 %	512444147
14592	NC_021508	TTTCCG	2	12	764174	764185	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512444147
14593	NC_021508	AC	3	6	764339	764344	50 %	0 %	0 %	50 %	512444147
14594	NC_021508	TCG	2	6	764402	764407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444147
14595	NC_021508	GACA	2	8	764415	764422	50 %	0 %	25 %	25 %	512444147
14596	NC_021508	GC	3	6	764488	764493	0 %	0 %	50 %	50 %	512444147
14597	NC_021508	TC	3	6	764498	764503	0 %	50 %	0 %	50 %	512444147
14598	NC_021508	AG	3	6	764542	764547	50 %	0 %	50 %	0 %	512444147
14599	NC_021508	TCC	2	6	764619	764624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444147
14600	NC_021508	AC	3	6	764643	764648	50 %	0 %	0 %	50 %	512444147
14601	NC_021508	CGA	2	6	764774	764779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444147
14602	NC_021508	TCCA	2	8	764784	764791	25 %	25 %	0 %	50 %	512444147
14603	NC_021508	GCC	2	6	764794	764799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444147
14604	NC_021508	AC	3	6	764822	764827	50 %	0 %	0 %	50 %	512444147
14605	NC_021508	CTGG	2	8	764879	764886	0 %	25 %	50 %	25 %	512444147
14606	NC_021508	GCC	2	6	764959	764964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444147
14607	NC_021508	C	7	7	764987	764993	0 %	0 %	0 %	100 %	512444147
14608	NC_021508	TGC	2	6	765011	765016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444147
14609	NC_021508	CA	3	6	765018	765023	50 %	0 %	0 %	50 %	512444147
14610	NC_021508	CAC	2	6	765027	765032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444147
14611	NC_021508	A	6	6	765050	765055	100 %	0 %	0 %	0 %	512444147
14612	NC_021508	CG	3	6	765076	765081	0 %	0 %	50 %	50 %	512444147
14613	NC_021508	CGTA	2	8	765162	765169	25 %	25 %	25 %	25 %	512444147
14614	NC_021508	AGGA	2	8	765173	765180	50 %	0 %	50 %	0 %	512444147
14615	NC_021508	TAA	2	6	765201	765206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444147
14616	NC_021508	CGC	2	6	765261	765266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444147
14617	NC_021508	CGCAG	2	10	765346	765355	20 %	0 %	40 %	40 %	512444147
14618	NC_021508	CCAGC	2	10	765365	765374	20 %	0 %	20 %	60 %	512444147
14619	NC_021508	AG	3	6	765429	765434	50 %	0 %	50 %	0 %	512444147
14620	NC_021508	CTT	2	6	765468	765473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444147
14621	NC_021508	GC	3	6	765540	765545	0 %	0 %	50 %	50 %	512444147
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14623	NC_021508	GC	3	6	765666	765671	0 %	0 %	50 %	50 %	512444147
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14871	NC_021508	GC	3	6	780018	780023	0 %	0 %	50 %	50 %	512444159
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14985	NC_021508	A	6	6	785725	785730	100 %	0 %	0 %	0 %	512444164
14986	NC_021508	GA	3	6	785749	785754	50 %	0 %	50 %	0 %	512444164
14987	NC_021508	A	7	7	785784	785790	100 %	0 %	0 %	0 %	512444164
14988	NC_021508	A	6	6	785801	785806	100 %	0 %	0 %	0 %	512444164
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14991	NC_021508	TGGA	2	8	785981	785988	25 %	25 %	50 %	0 %	512444164
14992	NC_021508	GTA	2	6	785993	785998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444164
14993	NC_021508	CT	3	6	786034	786039	0 %	50 %	0 %	50 %	512444164
14994	NC_021508	GCAA	2	8	786053	786060	50 %	0 %	25 %	25 %	512444164
14995	NC_021508	CTT	2	6	786129	786134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444164
14996	NC_021508	AAT	2	6	786211	786216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444164
14997	NC_021508	CTT	2	6	786240	786245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444164
14998	NC_021508	GCT	2	6	786281	786286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444165
14999	NC_021508	AAAC	2	8	786317	786324	75 %	0 %	0 %	25 %	512444165
15000	NC_021508	GAA	2	6	786341	786346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444165

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