MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021508	CAA	2	6	733128	733133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444121
14002	NC_021508	AATT	2	8	733256	733263	50 %	50 %	0 %	0 %	512444121
14003	NC_021508	CGG	2	6	733292	733297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444121
14004	NC_021508	TTA	2	6	733360	733365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444121
14005	NC_021508	TTTTC	2	10	733460	733469	0 %	80 %	0 %	20 %	512444121
14006	NC_021508	TTTC	2	8	733488	733495	0 %	75 %	0 %	25 %	512444121
14007	NC_021508	TATTT	2	10	733630	733639	20 %	80 %	0 %	0 %	512444121
14008	NC_021508	AT	3	6	733663	733668	50 %	50 %	0 %	0 %	512444121
14009	NC_021508	AATG	2	8	733674	733681	50 %	25 %	25 %	0 %	512444121
14010	NC_021508	TCC	2	6	733723	733728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444121
14011	NC_021508	GCA	2	6	733792	733797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444121
14012	NC_021508	TTCC	2	8	733802	733809	0 %	50 %	0 %	50 %	512444121
14013	NC_021508	CGT	2	6	733885	733890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444121
14014	NC_021508	CTG	2	6	734066	734071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444121
14015	NC_021508	T	6	6	734181	734186	0 %	100 %	0 %	0 %	512444121
14016	NC_021508	ATC	2	6	734202	734207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444121
14017	NC_021508	ATC	2	6	734224	734229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444121
14018	NC_021508	CGC	2	6	734277	734282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444121
14019	NC_021508	TAA	2	6	734306	734311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444121
14020	NC_021508	CGCA	2	8	734340	734347	25 %	0 %	25 %	50 %	512444121
14021	NC_021508	CTT	2	6	734360	734365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444121
14022	NC_021508	CAAAA	2	10	734375	734384	80 %	0 %	0 %	20 %	512444121
14023	NC_021508	CAA	2	6	734489	734494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444121
14024	NC_021508	CCCCG	2	10	734512	734521	0 %	0 %	20 %	80 %	512444121
14025	NC_021508	TAA	2	6	734555	734560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444121
14026	NC_021508	CAA	2	6	734585	734590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444121
14027	NC_021508	ATCC	2	8	734592	734599	25 %	25 %	0 %	50 %	512444121
14028	NC_021508	TTC	2	6	734640	734645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444121
14029	NC_021508	ACT	2	6	734650	734655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444121
14030	NC_021508	AGC	2	6	734743	734748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444121
14031	NC_021508	T	6	6	734840	734845	0 %	100 %	0 %	0 %	512444121
14032	NC_021508	AGA	2	6	734847	734852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444121
14033	NC_021508	TTC	3	9	734905	734913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444121
14034	NC_021508	CAG	2	6	734925	734930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444121
14035	NC_021508	CGT	2	6	734972	734977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444121
14036	NC_021508	ACC	2	6	734983	734988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444121
14037	NC_021508	TCAA	2	8	735016	735023	50 %	25 %	0 %	25 %	512444121
14038	NC_021508	TCT	2	6	735038	735043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444121
14039	NC_021508	TCA	2	6	735046	735051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444121
14040	NC_021508	GC	3	6	735111	735116	0 %	0 %	50 %	50 %	512444121
14041	NC_021508	TTC	2	6	735120	735125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444121
14042	NC_021508	CAAGA	2	10	735173	735182	60 %	0 %	20 %	20 %	512444121
14043	NC_021508	GTA	2	6	735243	735248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444121
14044	NC_021508	GGA	2	6	735270	735275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444121
14045	NC_021508	AGCA	2	8	735312	735319	50 %	0 %	25 %	25 %	512444121
14046	NC_021508	CAG	2	6	735422	735427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444121
14047	NC_021508	AAGCGC	2	12	735477	735488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444121
14048	NC_021508	GAA	2	6	735532	735537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444121
14049	NC_021508	TCCA	2	8	735540	735547	25 %	25 %	0 %	50 %	512444121
14050	NC_021508	AAT	2	6	735554	735559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444121
14051	NC_021508	GC	3	6	735591	735596	0 %	0 %	50 %	50 %	512444121
14052	NC_021508	AGGG	2	8	735762	735769	25 %	0 %	75 %	0 %	512444122
14053	NC_021508	GTC	2	6	735792	735797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444122
14054	NC_021508	GCA	2	6	735820	735825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444122
14055	NC_021508	CA	3	6	735839	735844	50 %	0 %	0 %	50 %	512444122
14056	NC_021508	GCG	2	6	735871	735876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444122
14057	NC_021508	CG	3	6	735875	735880	0 %	0 %	50 %	50 %	512444122
14058	NC_021508	A	7	7	736035	736041	100 %	0 %	0 %	0 %	512444122
14059	NC_021508	GC	3	6	736081	736086	0 %	0 %	50 %	50 %	512444122
14060	NC_021508	CG	3	6	736147	736152	0 %	0 %	50 %	50 %	512444122
14061	NC_021508	CG	4	8	736267	736274	0 %	0 %	50 %	50 %	512444122
14062	NC_021508	CCA	2	6	736286	736291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444122
14063	NC_021508	CTGCA	2	10	736350	736359	20 %	20 %	20 %	40 %	512444122
14064	NC_021508	CTGC	2	8	736375	736382	0 %	25 %	25 %	50 %	512444122
14065	NC_021508	CAA	2	6	736433	736438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444122
14066	NC_021508	TGCATA	2	12	736444	736455	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512444122
14067	NC_021508	CGC	2	6	736503	736508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444122
14068	NC_021508	CA	3	6	736556	736561	50 %	0 %	0 %	50 %	512444122
14069	NC_021508	GCA	2	6	736586	736591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444122
14070	NC_021508	AC	3	6	736663	736668	50 %	0 %	0 %	50 %	512444122
14071	NC_021508	ACC	2	6	736701	736706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444122
14072	NC_021508	AC	3	6	736719	736724	50 %	0 %	0 %	50 %	512444122
14073	NC_021508	ACG	2	6	736815	736820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444122
14074	NC_021508	GT	3	6	736843	736848	0 %	50 %	50 %	0 %	512444122
14075	NC_021508	GC	3	6	736863	736868	0 %	0 %	50 %	50 %	512444122
14076	NC_021508	CAC	2	6	736938	736943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444122
14077	NC_021508	GCCAAT	2	12	736971	736982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512444123
14078	NC_021508	TAC	2	6	737040	737045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444123
14079	NC_021508	ACA	2	6	737088	737093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444123
14080	NC_021508	TCCC	2	8	737134	737141	0 %	25 %	0 %	75 %	512444123
14081	NC_021508	TA	3	6	737206	737211	50 %	50 %	0 %	0 %	512444123
14082	NC_021508	AGAA	2	8	737252	737259	75 %	0 %	25 %	0 %	512444123
14083	NC_021508	A	7	7	737276	737282	100 %	0 %	0 %	0 %	512444123
14084	NC_021508	A	6	6	737325	737330	100 %	0 %	0 %	0 %	512444123
14085	NC_021508	AC	3	6	737332	737337	50 %	0 %	0 %	50 %	512444123
14086	NC_021508	A	7	7	737382	737388	100 %	0 %	0 %	0 %	512444123
14087	NC_021508	GC	3	6	737479	737484	0 %	0 %	50 %	50 %	512444123
14088	NC_021508	A	6	6	737548	737553	100 %	0 %	0 %	0 %	512444123
14089	NC_021508	CAG	2	6	737611	737616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444123
14090	NC_021508	ACA	2	6	737621	737626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444123
14091	NC_021508	C	6	6	737765	737770	0 %	0 %	0 %	100 %	512444123
14092	NC_021508	AGC	2	6	737801	737806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444123
14093	NC_021508	CAC	2	6	737857	737862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444123
14094	NC_021508	AGCG	2	8	737909	737916	25 %	0 %	50 %	25 %	512444123
14095	NC_021508	GA	3	6	738066	738071	50 %	0 %	50 %	0 %	512444124
14096	NC_021508	ACCGTA	2	12	738104	738115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512444124
14097	NC_021508	CGG	2	6	738176	738181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444124
14098	NC_021508	TCG	2	6	738239	738244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444124
14099	NC_021508	CGCAC	2	10	738245	738254	20 %	0 %	20 %	60 %	512444124
14100	NC_021508	T	7	7	738277	738283	0 %	100 %	0 %	0 %	512444124
14101	NC_021508	A	6	6	738293	738298	100 %	0 %	0 %	0 %	512444124
14102	NC_021508	GTG	2	6	738305	738310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512444124
14103	NC_021508	GCA	2	6	738362	738367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444124
14104	NC_021508	CTT	2	6	738369	738374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444124
14105	NC_021508	CTGT	2	8	738381	738388	0 %	50 %	25 %	25 %	512444124
14106	NC_021508	TTC	2	6	738427	738432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444124
14107	NC_021508	TGC	2	6	738569	738574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444124
14108	NC_021508	CAC	2	6	738597	738602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444124
14109	NC_021508	GCA	2	6	738692	738697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444124
14110	NC_021508	A	6	6	738805	738810	100 %	0 %	0 %	0 %	512444124
14111	NC_021508	T	6	6	738854	738859	0 %	100 %	0 %	0 %	512444124
14112	NC_021508	ACGC	2	8	739045	739052	25 %	0 %	25 %	50 %	512444124
14113	NC_021508	CAC	2	6	739065	739070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444124
14114	NC_021508	ACGGC	2	10	739095	739104	20 %	0 %	40 %	40 %	512444124
14115	NC_021508	CG	3	6	739114	739119	0 %	0 %	50 %	50 %	512444124
14116	NC_021508	AC	3	6	739132	739137	50 %	0 %	0 %	50 %	512444124
14117	NC_021508	TGC	2	6	739213	739218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444124
14118	NC_021508	CGA	2	6	739227	739232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444124
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14120	NC_021508	T	6	6	739283	739288	0 %	100 %	0 %	0 %	512444124
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14122	NC_021508	CCA	2	6	739331	739336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444124
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14124	NC_021508	CCT	2	6	739537	739542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444125
14125	NC_021508	CACT	2	8	739760	739767	25 %	25 %	0 %	50 %	512444125
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14137	NC_021508	GCT	2	6	740201	740206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444125
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14237	NC_021508	CT	3	6	745051	745056	0 %	50 %	0 %	50 %	512444131
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14240	NC_021508	TGCG	2	8	745211	745218	0 %	25 %	50 %	25 %	512444131
14241	NC_021508	CTG	2	6	745285	745290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444131
14242	NC_021508	A	6	6	745390	745395	100 %	0 %	0 %	0 %	512444132
14243	NC_021508	AGC	2	6	745406	745411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444132
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14245	NC_021508	GCA	2	6	745527	745532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444132
14246	NC_021508	AC	4	8	745573	745580	50 %	0 %	0 %	50 %	512444132
14247	NC_021508	TGC	2	6	745625	745630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444132
14248	NC_021508	ACT	2	6	745644	745649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444132
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14250	NC_021508	CGGA	2	8	745688	745695	25 %	0 %	50 %	25 %	512444132
14251	NC_021508	CGC	2	6	745724	745729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444132
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14256	NC_021508	CG	3	6	745872	745877	0 %	0 %	50 %	50 %	512444132
14257	NC_021508	CGT	2	6	745969	745974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444132
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14355	NC_021508	TCAA	2	8	751334	751341	50 %	25 %	0 %	25 %	512444137
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14359	NC_021508	TC	3	6	751499	751504	0 %	50 %	0 %	50 %	512444137
14360	NC_021508	CGA	2	6	751563	751568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444137
14361	NC_021508	CT	3	6	751578	751583	0 %	50 %	0 %	50 %	512444137
14362	NC_021508	A	6	6	751633	751638	100 %	0 %	0 %	0 %	512444137
14363	NC_021508	TGC	2	6	751706	751711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444137
14364	NC_021508	TCA	2	6	751766	751771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444137
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14367	NC_021508	AGC	2	6	752035	752040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444137
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14490	NC_021508	A	6	6	758569	758574	100 %	0 %	0 %	0 %	512444141
14491	NC_021508	CAA	2	6	758593	758598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444141
14492	NC_021508	TTC	2	6	758630	758635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444141
14493	NC_021508	AAT	2	6	758703	758708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444141
14494	NC_021508	TCC	2	6	758812	758817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444141
14495	NC_021508	GC	3	6	758865	758870	0 %	0 %	50 %	50 %	512444142
14496	NC_021508	TAAA	2	8	758880	758887	75 %	25 %	0 %	0 %	512444142
14497	NC_021508	ATTTA	2	10	758962	758971	40 %	60 %	0 %	0 %	512444142
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14499	NC_021508	T	10	10	759111	759120	0 %	100 %	0 %	0 %	512444142
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