MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021508	ATGT	2	8	703673	703680	25 %	50 %	25 %	0 %	512444095
13502	NC_021508	ACG	2	6	703685	703690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444095
13503	NC_021508	GCG	2	6	703787	703792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444095
13504	NC_021508	AAAG	2	8	703846	703853	75 %	0 %	25 %	0 %	512444095
13505	NC_021508	A	6	6	703861	703866	100 %	0 %	0 %	0 %	512444095
13506	NC_021508	ACA	2	6	703925	703930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444095
13507	NC_021508	CA	3	6	703964	703969	50 %	0 %	0 %	50 %	512444095
13508	NC_021508	CGA	2	6	703982	703987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444095
13509	NC_021508	CAA	2	6	704168	704173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444095
13510	NC_021508	GCA	2	6	704213	704218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444095
13511	NC_021508	CAG	2	6	704366	704371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444095
13512	NC_021508	GAA	3	9	704567	704575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444096
13513	NC_021508	CTTT	2	8	704583	704590	0 %	75 %	0 %	25 %	512444096
13514	NC_021508	CAG	2	6	704594	704599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444096
13515	NC_021508	TTG	2	6	704610	704615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444096
13516	NC_021508	AAT	2	6	704621	704626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444096
13517	NC_021508	CCG	2	6	704673	704678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444096
13518	NC_021508	CGG	2	6	704695	704700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444096
13519	NC_021508	AACA	2	8	704704	704711	75 %	0 %	0 %	25 %	512444096
13520	NC_021508	CACG	2	8	704740	704747	25 %	0 %	25 %	50 %	512444096
13521	NC_021508	GC	3	6	704789	704794	0 %	0 %	50 %	50 %	512444096
13522	NC_021508	GC	3	6	704796	704801	0 %	0 %	50 %	50 %	512444096
13523	NC_021508	CA	3	6	704850	704855	50 %	0 %	0 %	50 %	512444096
13524	NC_021508	CTG	2	6	704856	704861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444096
13525	NC_021508	CAGTA	2	10	704937	704946	40 %	20 %	20 %	20 %	512444096
13526	NC_021508	ACG	2	6	705024	705029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444096
13527	NC_021508	A	7	7	705054	705060	100 %	0 %	0 %	0 %	512444096
13528	NC_021508	GAA	2	6	705068	705073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444096
13529	NC_021508	TGA	2	6	705157	705162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444096
13530	NC_021508	GTC	2	6	705358	705363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444096
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13532	NC_021508	GT	3	6	705492	705497	0 %	50 %	50 %	0 %	512444096
13533	NC_021508	AACAA	2	10	705564	705573	80 %	0 %	0 %	20 %	512444096
13534	NC_021508	CG	3	6	705580	705585	0 %	0 %	50 %	50 %	512444096
13535	NC_021508	GTT	2	6	705605	705610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444096
13536	NC_021508	GCAC	2	8	705635	705642	25 %	0 %	25 %	50 %	512444096
13537	NC_021508	GT	3	6	705655	705660	0 %	50 %	50 %	0 %	512444096
13538	NC_021508	GAA	2	6	705746	705751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444096
13539	NC_021508	GA	3	6	705781	705786	50 %	0 %	50 %	0 %	512444096
13540	NC_021508	CGC	2	6	705802	705807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444096
13541	NC_021508	GT	3	6	705828	705833	0 %	50 %	50 %	0 %	512444096
13542	NC_021508	GATC	2	8	705859	705866	25 %	25 %	25 %	25 %	512444096
13543	NC_021508	AAT	2	6	705961	705966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444096
13544	NC_021508	GC	3	6	706001	706006	0 %	0 %	50 %	50 %	512444096
13545	NC_021508	AT	4	8	706029	706036	50 %	50 %	0 %	0 %	512444096
13546	NC_021508	CTTT	2	8	706082	706089	0 %	75 %	0 %	25 %	512444096
13547	NC_021508	TGC	2	6	706104	706109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444096
13548	NC_021508	GAACA	2	10	706155	706164	60 %	0 %	20 %	20 %	512444096
13549	NC_021508	A	6	6	706164	706169	100 %	0 %	0 %	0 %	512444096
13550	NC_021508	ATC	2	6	706181	706186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444096
13551	NC_021508	AGA	2	6	706213	706218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444096
13552	NC_021508	AT	3	6	706285	706290	50 %	50 %	0 %	0 %	512444096
13553	NC_021508	AAC	2	6	706344	706349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512444097
13554	NC_021508	AGA	3	9	706362	706370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444097
13555	NC_021508	TAT	2	6	706413	706418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444097
13556	NC_021508	GC	3	6	706420	706425	0 %	0 %	50 %	50 %	512444097
13557	NC_021508	CGA	2	6	706491	706496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444097
13558	NC_021508	TCA	2	6	706550	706555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444097
13559	NC_021508	TCG	2	6	706568	706573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444097
13560	NC_021508	AGT	2	6	706650	706655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444097
13561	NC_021508	TACG	2	8	706659	706666	25 %	25 %	25 %	25 %	512444097
13562	NC_021508	GCA	2	6	706753	706758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444097
13563	NC_021508	CA	3	6	706757	706762	50 %	0 %	0 %	50 %	512444097
13564	NC_021508	CAC	2	6	706816	706821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444097
13565	NC_021508	CAAA	2	8	706824	706831	75 %	0 %	0 %	25 %	512444097
13566	NC_021508	A	7	7	706869	706875	100 %	0 %	0 %	0 %	512444097
13567	NC_021508	ACTG	2	8	706903	706910	25 %	25 %	25 %	25 %	512444097
13568	NC_021508	TCTG	2	8	707060	707067	0 %	50 %	25 %	25 %	512444098
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13573	NC_021508	AT	3	6	707348	707353	50 %	50 %	0 %	0 %	512444098
13574	NC_021508	CGG	2	6	707391	707396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444098
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13580	NC_021508	CTG	2	6	708192	708197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444098
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13589	NC_021508	CA	4	8	708988	708995	50 %	0 %	0 %	50 %	512444100
13590	NC_021508	TGC	2	6	709004	709009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444100
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13593	NC_021508	AC	3	6	709137	709142	50 %	0 %	0 %	50 %	512444100
13594	NC_021508	ACT	2	6	709162	709167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444100
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13596	NC_021508	GCA	2	6	709283	709288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444100
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13599	NC_021508	TACA	2	8	709414	709421	50 %	25 %	0 %	25 %	512444100
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13601	NC_021508	GCAT	2	8	709472	709479	25 %	25 %	25 %	25 %	512444100
13602	NC_021508	TCCT	2	8	709486	709493	0 %	50 %	0 %	50 %	512444100
13603	NC_021508	TTC	2	6	709531	709536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444100
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13606	NC_021508	GCACG	2	10	709635	709644	20 %	0 %	40 %	40 %	512444100
13607	NC_021508	GTA	2	6	709649	709654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444100
13608	NC_021508	TGC	2	6	709657	709662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444100
13609	NC_021508	GAG	2	6	709686	709691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444100
13610	NC_021508	GCA	2	6	709769	709774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444100
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13612	NC_021508	A	6	6	709975	709980	100 %	0 %	0 %	0 %	512444100
13613	NC_021508	AGC	2	6	710106	710111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444101
13614	NC_021508	CTT	2	6	710168	710173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444101
13615	NC_021508	GCGCC	2	10	710204	710213	0 %	0 %	40 %	60 %	512444101
13616	NC_021508	ACC	2	6	710258	710263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444101
13617	NC_021508	CA	3	6	710329	710334	50 %	0 %	0 %	50 %	512444101
13618	NC_021508	CCA	2	6	710338	710343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444101
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13622	NC_021508	CA	3	6	710683	710688	50 %	0 %	0 %	50 %	512444101
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13744	NC_021508	TTCT	2	8	720110	720117	0 %	75 %	0 %	25 %	512444108
13745	NC_021508	TC	3	6	720126	720131	0 %	50 %	0 %	50 %	512444108
13746	NC_021508	CCTGTA	2	12	720171	720182	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512444108
13747	NC_021508	TAC	2	6	720193	720198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444108
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13749	NC_021508	ATG	2	6	720254	720259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444108
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13752	NC_021508	AG	3	6	720417	720422	50 %	0 %	50 %	0 %	512444108
13753	NC_021508	TAT	2	6	720472	720477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444108
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13756	NC_021508	CG	3	6	720525	720530	0 %	0 %	50 %	50 %	512444108
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13764	NC_021508	TGT	2	6	720756	720761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444108
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13865	NC_021508	GC	3	6	726587	726592	0 %	0 %	50 %	50 %	512444114
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13973	NC_021508	GA	3	6	732014	732019	50 %	0 %	50 %	0 %	512444120
13974	NC_021508	AAT	2	6	732056	732061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444120
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13977	NC_021508	TGC	2	6	732139	732144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444121
13978	NC_021508	ACGT	2	8	732190	732197	25 %	25 %	25 %	25 %	512444121
13979	NC_021508	CATG	2	8	732209	732216	25 %	25 %	25 %	25 %	512444121
13980	NC_021508	GAA	2	6	732218	732223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444121
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13983	NC_021508	CCAG	2	8	732388	732395	25 %	0 %	25 %	50 %	512444121
13984	NC_021508	CCA	2	6	732488	732493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444121
13985	NC_021508	ATA	2	6	732499	732504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444121
13986	NC_021508	GC	3	6	732521	732526	0 %	0 %	50 %	50 %	512444121
13987	NC_021508	CTC	2	6	732531	732536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444121
13988	NC_021508	CACAG	2	10	732538	732547	40 %	0 %	20 %	40 %	512444121
13989	NC_021508	TATT	2	8	732661	732668	25 %	75 %	0 %	0 %	512444121
13990	NC_021508	TCA	2	6	732736	732741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444121
13991	NC_021508	ATA	2	6	732759	732764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512444121
13992	NC_021508	TC	3	6	732792	732797	0 %	50 %	0 %	50 %	512444121
13993	NC_021508	TTC	2	6	732810	732815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444121
13994	NC_021508	GCTT	2	8	732870	732877	0 %	50 %	25 %	25 %	512444121
13995	NC_021508	T	6	6	732898	732903	0 %	100 %	0 %	0 %	512444121
13996	NC_021508	TCG	2	6	732925	732930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444121
13997	NC_021508	ATT	2	6	732991	732996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512444121
13998	NC_021508	T	8	8	733003	733010	0 %	100 %	0 %	0 %	512444121
13999	NC_021508	AGG	2	6	733052	733057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444121
14000	NC_021508	TCA	2	6	733081	733086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444121

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