MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 21822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021508	A	6	6	679312	679317	100 %	0 %	0 %	0 %	512444078
13002	NC_021508	CAGG	2	8	679408	679415	25 %	0 %	50 %	25 %	512444078
13003	NC_021508	CCG	2	6	679418	679423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444078
13004	NC_021508	TGAG	2	8	679436	679443	25 %	25 %	50 %	0 %	512444078
13005	NC_021508	CGA	2	6	679458	679463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444078
13006	NC_021508	CA	3	6	679547	679552	50 %	0 %	0 %	50 %	512444078
13007	NC_021508	GAG	2	6	679558	679563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444078
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13009	NC_021508	CG	4	8	679583	679590	0 %	0 %	50 %	50 %	512444078
13010	NC_021508	GCA	2	6	679615	679620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444078
13011	NC_021508	GATG	2	8	679623	679630	25 %	25 %	50 %	0 %	512444078
13012	NC_021508	TTG	2	6	679636	679641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512444078
13013	NC_021508	CA	3	6	679713	679718	50 %	0 %	0 %	50 %	512444078
13014	NC_021508	CGCC	2	8	679815	679822	0 %	0 %	25 %	75 %	512444078
13015	NC_021508	CA	3	6	679865	679870	50 %	0 %	0 %	50 %	512444078
13016	NC_021508	TCA	2	6	679901	679906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444078
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13018	NC_021508	GC	4	8	679935	679942	0 %	0 %	50 %	50 %	512444078
13019	NC_021508	G	6	6	679949	679954	0 %	0 %	100 %	0 %	512444078
13020	NC_021508	CGC	2	6	680036	680041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444078
13021	NC_021508	CG	4	8	680063	680070	0 %	0 %	50 %	50 %	512444078
13022	NC_021508	CCA	2	6	680101	680106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444078
13023	NC_021508	CCG	2	6	680107	680112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444078
13024	NC_021508	GCG	2	6	680122	680127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512444078
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13027	NC_021508	CCTG	2	8	680315	680322	0 %	25 %	25 %	50 %	512444079
13028	NC_021508	TGC	2	6	680328	680333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444079
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13030	NC_021508	ACGC	2	8	680386	680393	25 %	0 %	25 %	50 %	512444079
13031	NC_021508	GCA	2	6	680414	680419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444079
13032	NC_021508	TCC	3	9	680438	680446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444079
13033	NC_021508	AC	3	6	680499	680504	50 %	0 %	0 %	50 %	512444079
13034	NC_021508	TGCACG	2	12	680562	680573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512444079
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13036	NC_021508	CAG	2	6	680597	680602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444079
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13041	NC_021508	CACG	2	8	680838	680845	25 %	0 %	25 %	50 %	512444079
13042	NC_021508	C	7	7	680868	680874	0 %	0 %	0 %	100 %	512444079
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13050	NC_021508	TTGC	2	8	681223	681230	0 %	50 %	25 %	25 %	512444079
13051	NC_021508	CGA	2	6	681255	681260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444079
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13053	NC_021508	ACG	2	6	681323	681328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444079
13054	NC_021508	CGA	2	6	681345	681350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444079
13055	NC_021508	CGGTGT	2	12	681360	681371	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512444079
13056	NC_021508	ACG	2	6	681407	681412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444079
13057	NC_021508	AGG	2	6	681551	681556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512444079
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13059	NC_021508	GCGCA	2	10	681580	681589	20 %	0 %	40 %	40 %	512444079
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13062	NC_021508	TCG	2	6	681702	681707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444079
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13064	NC_021508	CG	3	6	681861	681866	0 %	0 %	50 %	50 %	512444080
13065	NC_021508	CAC	2	6	681910	681915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512444080
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13069	NC_021508	TAC	2	6	682011	682016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444080
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13072	NC_021508	GCAG	2	8	682158	682165	25 %	0 %	50 %	25 %	512444080
13073	NC_021508	GCCT	2	8	682171	682178	0 %	25 %	25 %	50 %	512444080
13074	NC_021508	CTA	2	6	682184	682189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444080
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13078	NC_021508	AAG	2	6	682363	682368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444080
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13086	NC_021508	CA	3	6	682496	682501	50 %	0 %	0 %	50 %	512444081
13087	NC_021508	A	7	7	682556	682562	100 %	0 %	0 %	0 %	512444081
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13090	NC_021508	TCA	2	6	682611	682616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512444081
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13092	NC_021508	T	6	6	682678	682683	0 %	100 %	0 %	0 %	512444081
13093	NC_021508	AT	3	6	682718	682723	50 %	50 %	0 %	0 %	512444081
13094	NC_021508	TC	3	6	682756	682761	0 %	50 %	0 %	50 %	512444081
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13101	NC_021508	CCAT	2	8	683265	683272	25 %	25 %	0 %	50 %	512444081
13102	NC_021508	TA	3	6	683337	683342	50 %	50 %	0 %	0 %	512444081
13103	NC_021508	T	6	6	683374	683379	0 %	100 %	0 %	0 %	512444081
13104	NC_021508	GACC	2	8	683392	683399	25 %	0 %	25 %	50 %	512444081
13105	NC_021508	C	9	9	683492	683500	0 %	0 %	0 %	100 %	512444081
13106	NC_021508	CTC	2	6	683503	683508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512444081
13107	NC_021508	CA	3	6	683530	683535	50 %	0 %	0 %	50 %	512444081
13108	NC_021508	CA	3	6	683548	683553	50 %	0 %	0 %	50 %	512444081
13109	NC_021508	TGA	2	6	683590	683595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444081
13110	NC_021508	CT	3	6	683610	683615	0 %	50 %	0 %	50 %	512444081
13111	NC_021508	GT	3	6	683746	683751	0 %	50 %	50 %	0 %	512444082
13112	NC_021508	CGC	2	6	683862	683867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512444082
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13116	NC_021508	TCT	2	6	684066	684071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512444082
13117	NC_021508	A	8	8	684155	684162	100 %	0 %	0 %	0 %	512444082
13118	NC_021508	TGA	2	6	684170	684175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444082
13119	NC_021508	GAGC	2	8	684211	684218	25 %	0 %	50 %	25 %	512444082
13120	NC_021508	A	10	10	684219	684228	100 %	0 %	0 %	0 %	512444082
13121	NC_021508	AAAC	2	8	684319	684326	75 %	0 %	0 %	25 %	512444082
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13123	NC_021508	GCA	2	6	684363	684368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444082
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13127	NC_021508	CG	3	6	684475	684480	0 %	0 %	50 %	50 %	512444082
13128	NC_021508	CG	4	8	684520	684527	0 %	0 %	50 %	50 %	512444082
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13152	NC_021508	A	7	7	685512	685518	100 %	0 %	0 %	0 %	512444082
13153	NC_021508	GCA	2	6	685557	685562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444082
13154	NC_021508	A	7	7	685581	685587	100 %	0 %	0 %	0 %	512444082
13155	NC_021508	CAG	2	6	685624	685629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512444082
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13244	NC_021508	TTTTC	2	10	690273	690282	0 %	80 %	0 %	20 %	512444085
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13486	NC_021508	GCAG	2	8	703139	703146	25 %	0 %	50 %	25 %	512444095
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13490	NC_021508	CTGCA	2	10	703263	703272	20 %	20 %	20 %	40 %	512444095
13491	NC_021508	AGA	2	6	703322	703327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512444095
13492	NC_021508	AAAC	2	8	703342	703349	75 %	0 %	0 %	25 %	512444095
13493	NC_021508	CTG	2	6	703371	703376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512444095
13494	NC_021508	CACC	2	8	703412	703419	25 %	0 %	0 %	75 %	512444095
13495	NC_021508	CACT	2	8	703421	703428	25 %	25 %	0 %	50 %	512444095
13496	NC_021508	ACCGA	2	10	703480	703489	40 %	0 %	20 %	40 %	512444095
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13498	NC_021508	GTA	2	6	703533	703538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512444095
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